MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 83

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017777	CTT	2	6	35	40	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017777	TCT	2	6	44	49	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017777	CCT	2	6	53	58	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_017777	CTG	2	6	462	467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859038
5	NC_017777	TCC	2	6	479	484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386859038
6	NC_017777	TGC	2	6	487	492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859038
7	NC_017777	GCA	2	6	524	529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386859038
8	NC_017777	CTG	2	6	534	539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859038
9	NC_017777	TGC	2	6	547	552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859038
10	NC_017777	TAG	2	6	558	563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859038
11	NC_017777	TGC	3	9	640	648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859038
12	NC_017777	CTT	2	6	654	659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859038
13	NC_017777	CAT	2	6	663	668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859038
14	NC_017777	CCA	2	6	677	682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386859038
15	NC_017777	ACA	2	6	758	763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386859038
16	NC_017777	CAA	2	6	765	770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386859038
17	NC_017777	TTA	2	6	809	814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859038
18	NC_017777	CTT	2	6	834	839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859038
19	NC_017777	CAC	2	6	846	851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386859038
20	NC_017777	GCT	2	6	881	886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859038
21	NC_017777	CTC	2	6	894	899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386859038
22	NC_017777	TTC	2	6	967	972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859038
23	NC_017777	CAT	2	6	1198	1203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859038
24	NC_017777	CAC	2	6	1204	1209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386859038
25	NC_017777	CAT	2	6	1210	1215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859038
26	NC_017777	CAC	2	6	1216	1221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_017777	CAT	3	9	1222	1230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017777	CTT	2	6	2218	2223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017777	TCT	2	6	2227	2232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017777	CCT	2	6	2236	2241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_017777	AAG	2	6	2301	2306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017777	TAT	2	6	2322	2327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017777	TGC	2	6	2569	2574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859039
34	NC_017777	TTC	2	6	2641	2646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859039
35	NC_017777	AGC	2	6	2656	2661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386859039
36	NC_017777	CTG	2	6	2700	2705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859039
37	NC_017777	CTG	2	6	2758	2763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859039
38	NC_017777	TCG	2	6	2775	2780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859039
39	NC_017777	CAG	2	6	2806	2811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386859039
40	NC_017777	TTG	2	6	2857	2862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386859040
41	NC_017777	TGC	4	12	2867	2878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859040
42	NC_017777	TAG	2	6	2953	2958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859040
43	NC_017777	ACT	2	6	2988	2993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859040
44	NC_017777	TTA	2	6	3024	3029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017777	CAC	2	6	3097	3102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386859041
46	NC_017777	GCT	2	6	3105	3110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859041
47	NC_017777	TAA	2	6	3148	3153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859041
48	NC_017777	CAA	2	6	3160	3165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386859041
49	NC_017777	CTT	3	9	3202	3210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859041
50	NC_017777	TCT	2	6	3238	3243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859041
51	NC_017777	CTT	2	6	3275	3280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859041
52	NC_017777	CAT	3	9	3419	3427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859041
53	NC_017777	CAT	2	6	3431	3436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859041
54	NC_017777	ATT	2	6	3441	3446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859041
55	NC_017777	CTT	2	6	3449	3454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859041
56	NC_017777	TCT	2	6	3472	3477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859041
57	NC_017777	CCT	2	6	3544	3549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_017777	ATT	2	6	3616	3621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017777	CTG	2	6	3721	3726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859042
60	NC_017777	CTA	2	6	3819	3824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859042
61	NC_017777	TGC	2	6	3835	3840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859042
62	NC_017777	CAC	2	6	3882	3887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386859042
63	NC_017777	CCT	2	6	3911	3916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386859042
64	NC_017777	CTG	3	9	3951	3959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859042
65	NC_017777	CCT	2	6	3998	4003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386859042
66	NC_017777	TGC	3	9	4126	4134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859042
67	NC_017777	CAT	2	6	4143	4148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859042
68	NC_017777	ATT	3	9	4159	4167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859042
69	NC_017777	ATA	2	6	4173	4178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859042
70	NC_017777	CTC	2	6	4203	4208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386859042
71	NC_017777	GTA	2	6	4223	4228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859042
72	NC_017777	ACT	2	6	4274	4279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859042
73	NC_017777	TCA	2	6	4313	4318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859042
74	NC_017777	TTA	2	6	4424	4429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859042
75	NC_017777	CTT	2	6	4443	4448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859042
76	NC_017777	TAA	2	6	4462	4467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859042
77	NC_017777	CTG	2	6	4485	4490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859042
78	NC_017777	TGC	2	6	4525	4530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859042
79	NC_017777	TCT	2	6	4536	4541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859042
80	NC_017777	CAG	2	6	4669	4674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386859042
81	NC_017777	TCC	2	6	4708	4713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386859042
82	NC_017777	CAT	3	9	4765	4773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859043
83	NC_017777	CTT	2	6	4787	4792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859043

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.