MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017776	ATG	2	6	120	125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386644996
2	NC_017776	TCA	2	6	175	180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386644996
3	NC_017776	AAG	2	6	234	239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386644996
4	NC_017776	GTA	2	6	369	374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386644996
5	NC_017776	GAA	2	6	461	466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386644997
6	NC_017776	TTG	2	6	482	487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386644997
7	NC_017776	AAG	2	6	489	494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386644997
8	NC_017776	CTT	2	6	531	536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386644997
9	NC_017776	CAA	2	6	603	608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386644997
10	NC_017776	ATA	2	6	677	682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386644997
11	NC_017776	TTA	2	6	765	770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386644997
12	NC_017776	AAT	2	6	773	778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386644997
13	NC_017776	TGG	2	6	943	948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386644998
14	NC_017776	AGA	2	6	969	974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386644998
15	NC_017776	CGT	2	6	1037	1042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386644998
16	NC_017776	GGT	2	6	1118	1123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386644998
17	NC_017776	ACA	2	6	1130	1135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386644998
18	NC_017776	AGA	2	6	1174	1179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386644998
19	NC_017776	CAA	2	6	1221	1226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386644998
20	NC_017776	GGT	2	6	1238	1243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386644998
21	NC_017776	TTA	2	6	1411	1416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386644998
22	NC_017776	GAG	2	6	1454	1459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386644998
23	NC_017776	GAT	2	6	1505	1510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386644998
24	NC_017776	TTG	2	6	1593	1598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386644998
25	NC_017776	TAG	2	6	1639	1644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386644998
26	NC_017776	AAT	2	6	1818	1823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386644998
27	NC_017776	TGT	2	6	1829	1834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017776	ATT	2	6	1885	1890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017776	TGA	2	6	2770	2775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017776	GAT	2	6	3064	3069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386644999
31	NC_017776	AAT	2	6	3088	3093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386644999
32	NC_017776	TAA	2	6	3105	3110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386644999
33	NC_017776	AAG	2	6	3238	3243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386644999
34	NC_017776	TAG	2	6	3336	3341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386644999
35	NC_017776	ATA	2	6	3440	3445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386644999
36	NC_017776	ACA	2	6	3459	3464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386644999
37	NC_017776	AAT	2	6	3487	3492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386644999
38	NC_017776	ATA	2	6	3524	3529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386644999
39	NC_017776	TGG	2	6	3564	3569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386644999
40	NC_017776	GTC	2	6	3721	3726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386645000
41	NC_017776	TAC	2	6	3766	3771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386645000
42	NC_017776	TGT	2	6	3781	3786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386645000
43	NC_017776	GTT	2	6	3854	3859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386645000
44	NC_017776	AGA	2	6	3866	3871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386645000
45	NC_017776	GTG	2	6	3873	3878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386645000
46	NC_017776	AGT	3	9	3880	3888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386645000
47	NC_017776	CAT	2	6	3900	3905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386645000
48	NC_017776	TTA	2	6	4037	4042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386645000
49	NC_017776	TTC	2	6	4090	4095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386645000
50	NC_017776	ACA	2	6	4265	4270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386645001
51	NC_017776	ACT	2	6	4568	4573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386645001
52	NC_017776	ACT	2	6	4577	4582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386645001
53	NC_017776	GTT	2	6	4595	4600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386645001
54	NC_017776	AAT	2	6	4810	4815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386645001
55	NC_017776	AGA	2	6	4847	4852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386645001

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.