MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017775	ATA	4	12	22	33	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017775	AAG	2	6	39	44	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017775	CTT	2	6	70	75	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017775	TAT	2	6	245	250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017775	AAT	2	6	251	256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017775	AAT	2	6	324	329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858859
7	NC_017775	TTG	2	6	454	459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858859
8	NC_017775	CTT	2	6	461	466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858859
9	NC_017775	TTG	2	6	580	585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858859
10	NC_017775	ATG	2	6	622	627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858859
11	NC_017775	ATA	2	6	678	683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858859
12	NC_017775	TGA	2	6	704	709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858859
13	NC_017775	TTA	2	6	737	742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858859
14	NC_017775	ATT	2	6	989	994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017775	ATA	2	6	1138	1143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017775	TAA	2	6	1420	1425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017775	TTA	2	6	1430	1435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017775	TAT	2	6	1467	1472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017775	AAT	2	6	1504	1509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017775	TTG	2	6	1827	1832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017775	AAT	2	6	2062	2067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017775	TAA	2	6	2151	2156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017775	TTG	2	6	2313	2318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858860
24	NC_017775	TGT	2	6	2323	2328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858860
25	NC_017775	ATT	2	6	2352	2357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858860
26	NC_017775	TAT	3	9	2360	2368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858860
27	NC_017775	TAT	2	6	2375	2380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858860
28	NC_017775	ACT	2	6	2385	2390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858860
29	NC_017775	TCT	2	6	2434	2439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858860
30	NC_017775	TAA	2	6	2475	2480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858860
31	NC_017775	TTC	2	6	2481	2486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858860
32	NC_017775	TAA	2	6	2576	2581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858860
33	NC_017775	ATG	2	6	2595	2600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858860
34	NC_017775	CTT	2	6	2657	2662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858860
35	NC_017775	TTG	2	6	2697	2702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858860
36	NC_017775	TTA	2	6	2788	2793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858860
37	NC_017775	ATT	2	6	2931	2936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017775	ATG	2	6	2957	2962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017775	TGA	2	6	3015	3020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017775	AGG	2	6	3038	3043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017775	TTC	2	6	3128	3133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858861
42	NC_017775	TCT	2	6	3180	3185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858861
43	NC_017775	TTA	2	6	3241	3246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858861
44	NC_017775	AAG	2	6	3271	3276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017775	TAA	2	6	3278	3283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017775	TAT	2	6	3347	3352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858862
47	NC_017775	CTC	2	6	3354	3359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858862
48	NC_017775	TAA	2	6	3376	3381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858862
49	NC_017775	GAA	2	6	3470	3475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858862
50	NC_017775	AAT	2	6	3552	3557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858862
51	NC_017775	AAT	2	6	3615	3620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858863
52	NC_017775	TCT	2	6	3637	3642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858863
53	NC_017775	CTT	2	6	3692	3697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858863
54	NC_017775	GAT	2	6	3802	3807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858863
55	NC_017775	ATT	2	6	3859	3864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858863
56	NC_017775	GAA	2	6	3907	3912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858863
57	NC_017775	TAA	2	6	3948	3953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858863
58	NC_017775	TTA	2	6	3959	3964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858863
59	NC_017775	TGA	2	6	3971	3976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858863
60	NC_017775	CTA	2	6	3980	3985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858863
61	NC_017775	GTT	2	6	3988	3993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858863
62	NC_017775	ATT	2	6	4060	4065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858863
63	NC_017775	ATT	2	6	4094	4099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858863
64	NC_017775	GAA	2	6	4120	4125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858863
65	NC_017775	CAG	2	6	4162	4167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858863
66	NC_017775	TGC	2	6	4206	4211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858863
67	NC_017775	TAT	2	6	4261	4266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858863
68	NC_017775	CAG	2	6	4431	4436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858864
69	NC_017775	AGG	2	6	4489	4494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858864
70	NC_017775	TAA	2	6	4526	4531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858864
71	NC_017775	TAG	2	6	4631	4636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858864
72	NC_017775	ATT	2	6	4728	4733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858864
73	NC_017775	TTC	2	6	4757	4762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858864
74	NC_017775	TGT	3	9	4775	4783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858864
75	NC_017775	GTA	2	6	4895	4900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858864
76	NC_017775	TAG	2	6	4986	4991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017775	TAA	3	9	5008	5016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017775	TAT	2	6	5065	5070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.