MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017775	AAT	2	6	324	329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858859
2	NC_017775	TTG	2	6	454	459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858859
3	NC_017775	CTT	2	6	461	466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858859
4	NC_017775	TTG	2	6	580	585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858859
5	NC_017775	ATG	2	6	622	627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858859
6	NC_017775	ATA	2	6	678	683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858859
7	NC_017775	TGA	2	6	704	709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858859
8	NC_017775	TTA	2	6	737	742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858859
9	NC_017775	TTG	2	6	2313	2318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858860
10	NC_017775	TGT	2	6	2323	2328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858860
11	NC_017775	ATT	2	6	2352	2357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858860
12	NC_017775	TAT	3	9	2360	2368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858860
13	NC_017775	TAT	2	6	2375	2380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858860
14	NC_017775	ACT	2	6	2385	2390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858860
15	NC_017775	TCT	2	6	2434	2439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858860
16	NC_017775	TAA	2	6	2475	2480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858860
17	NC_017775	TTC	2	6	2481	2486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858860
18	NC_017775	TAA	2	6	2576	2581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858860
19	NC_017775	ATG	2	6	2595	2600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858860
20	NC_017775	CTT	2	6	2657	2662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858860
21	NC_017775	TTG	2	6	2697	2702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858860
22	NC_017775	TTA	2	6	2788	2793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858860
23	NC_017775	TTC	2	6	3128	3133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858861
24	NC_017775	TCT	2	6	3180	3185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858861
25	NC_017775	TTA	2	6	3241	3246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858861
26	NC_017775	TAT	2	6	3347	3352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858862
27	NC_017775	CTC	2	6	3354	3359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858862
28	NC_017775	TAA	2	6	3376	3381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858862
29	NC_017775	GAA	2	6	3470	3475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858862
30	NC_017775	AAT	2	6	3552	3557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858862
31	NC_017775	AAT	2	6	3615	3620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858863
32	NC_017775	TCT	2	6	3637	3642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858863
33	NC_017775	CTT	2	6	3692	3697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858863
34	NC_017775	GAT	2	6	3802	3807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858863
35	NC_017775	ATT	2	6	3859	3864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858863
36	NC_017775	GAA	2	6	3907	3912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858863
37	NC_017775	TAA	2	6	3948	3953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858863
38	NC_017775	TTA	2	6	3959	3964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858863
39	NC_017775	TGA	2	6	3971	3976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858863
40	NC_017775	CTA	2	6	3980	3985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858863
41	NC_017775	GTT	2	6	3988	3993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858863
42	NC_017775	ATT	2	6	4060	4065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858863
43	NC_017775	ATT	2	6	4094	4099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858863
44	NC_017775	GAA	2	6	4120	4125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858863
45	NC_017775	CAG	2	6	4162	4167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858863
46	NC_017775	TGC	2	6	4206	4211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858863
47	NC_017775	TAT	2	6	4261	4266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858863
48	NC_017775	CAG	2	6	4431	4436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858864
49	NC_017775	AGG	2	6	4489	4494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858864
50	NC_017775	TAA	2	6	4526	4531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858864
51	NC_017775	TAG	2	6	4631	4636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858864
52	NC_017775	ATT	2	6	4728	4733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858864
53	NC_017775	TTC	2	6	4757	4762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858864
54	NC_017775	TGT	3	9	4775	4783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858864
55	NC_017775	GTA	2	6	4895	4900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858864

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.