MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017774	GTT	4	12	10	21	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858850
2	NC_017774	ATA	2	6	32	37	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858850
3	NC_017774	AGT	2	6	52	57	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858850
4	NC_017774	TCG	2	6	146	151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858850
5	NC_017774	TAA	2	6	156	161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858850
6	NC_017774	CAG	2	6	180	185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858850
7	NC_017774	AGT	2	6	250	255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858850
8	NC_017774	AAT	2	6	320	325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858850
9	NC_017774	TCA	2	6	335	340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858850
10	NC_017774	AAT	2	6	376	381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858850
11	NC_017774	GTC	2	6	400	405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858850
12	NC_017774	TAT	2	6	1778	1783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858851
13	NC_017774	TAG	2	6	1986	1991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858851
14	NC_017774	TTG	2	6	2008	2013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858851
15	NC_017774	ATT	3	9	2110	2118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858851
16	NC_017774	ATT	2	6	2207	2212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858851
17	NC_017774	TCT	2	6	2276	2281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858851
18	NC_017774	ATA	2	6	2420	2425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858851
19	NC_017774	CTT	2	6	2452	2457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858851
20	NC_017774	CTT	2	6	2481	2486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858851
21	NC_017774	TCT	2	6	2633	2638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858851
22	NC_017774	TCT	2	6	2729	2734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858852
23	NC_017774	AGT	2	6	2737	2742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858852
24	NC_017774	TCA	2	6	2783	2788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858852
25	NC_017774	CTT	2	6	2832	2837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858852
26	NC_017774	GTA	2	6	2928	2933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858852
27	NC_017774	ATT	2	6	2969	2974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858852
28	NC_017774	TAA	2	6	3012	3017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858852
29	NC_017774	GTA	2	6	3067	3072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858852
30	NC_017774	TAA	2	6	3075	3080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858852
31	NC_017774	GAA	2	6	3142	3147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858852
32	NC_017774	ACT	2	6	3308	3313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858853
33	NC_017774	TAG	2	6	3328	3333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858853
34	NC_017774	CCA	2	6	3347	3352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858853
35	NC_017774	AAT	2	6	3419	3424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858853
36	NC_017774	AGT	2	6	3480	3485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858853
37	NC_017774	TAC	2	6	3541	3546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858853
38	NC_017774	TCT	2	6	3552	3557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858853
39	NC_017774	AAG	2	6	3562	3567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858853
40	NC_017774	ATT	2	6	3641	3646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858853
41	NC_017774	ATG	2	6	3649	3654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858853
42	NC_017774	CCT	2	6	3738	3743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858853
43	NC_017774	TAG	2	6	3752	3757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858853
44	NC_017774	CAT	2	6	3778	3783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858853
45	NC_017774	GCA	2	6	3813	3818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858853
46	NC_017774	CAG	3	9	3886	3894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858853
47	NC_017774	CCT	2	6	4083	4088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858853
48	NC_017774	GCT	2	6	4089	4094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858853
49	NC_017774	TAC	2	6	4138	4143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858853
50	NC_017774	CTT	2	6	4243	4248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858853
51	NC_017774	TAT	2	6	4507	4512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858853
52	NC_017774	TTG	2	6	4669	4674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858854
53	NC_017774	TAA	2	6	4683	4688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858854
54	NC_017774	TTG	2	6	4744	4749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858854
55	NC_017774	TCA	2	6	4752	4757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858854
56	NC_017774	TCT	2	6	4771	4776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858855
57	NC_017774	ATG	2	6	4868	4873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858855
58	NC_017774	AAG	2	6	4999	5004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858855
59	NC_017774	ATC	2	6	5014	5019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858855
60	NC_017774	CTT	2	6	5274	5279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858856
61	NC_017774	TTC	2	6	5285	5290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858856
62	NC_017774	TAA	2	6	5311	5316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858856
63	NC_017774	TAC	2	6	5489	5494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858856
64	NC_017774	TTG	2	6	5530	5535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858856
65	NC_017774	TCT	2	6	5650	5655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858857
66	NC_017774	AGT	2	6	5664	5669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858857
67	NC_017774	TCT	2	6	5787	5792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858857
68	NC_017774	TAT	2	6	5888	5893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858857

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.