MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA2

Total Repeats: 961

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017773	CGA	2	6	182	187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844998
2	NC_017773	AAC	2	6	214	219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386844998
3	NC_017773	CTG	2	6	399	404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017773	TGA	2	6	543	548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017773	CTG	2	6	618	623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017773	TGC	2	6	704	709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844999
7	NC_017773	ATG	2	6	742	747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386844999
8	NC_017773	CAG	2	6	799	804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844999
9	NC_017773	GAA	2	6	875	880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386844999
10	NC_017773	GTG	2	6	888	893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386844999
11	NC_017773	GCG	2	6	979	984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844999
12	NC_017773	TGC	2	6	1027	1032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844999
13	NC_017773	AGC	2	6	1102	1107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844999
14	NC_017773	GTC	2	6	1108	1113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844999
15	NC_017773	CGC	2	6	1131	1136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386844999
16	NC_017773	TGT	2	6	1216	1221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386844999
17	NC_017773	CAA	2	6	1251	1256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386844999
18	NC_017773	GAC	2	6	1367	1372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844999
19	NC_017773	ATC	2	6	1446	1451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386844999
20	NC_017773	GAA	2	6	1596	1601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386844999
21	NC_017773	TTG	2	6	1702	1707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386844999
22	NC_017773	TCA	2	6	1731	1736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386844999
23	NC_017773	TAT	2	6	1752	1757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386844999
24	NC_017773	TCA	2	6	1784	1789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386844999
25	NC_017773	GCT	2	6	1837	1842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844999
26	NC_017773	CCT	2	6	2063	2068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386845000
27	NC_017773	TTC	2	6	2073	2078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386845000
28	NC_017773	GAA	2	6	2318	2323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386845000
29	NC_017773	GAA	2	6	2525	2530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386845000
30	NC_017773	TCG	2	6	2539	2544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845000
31	NC_017773	AGC	2	6	2576	2581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845000
32	NC_017773	CCT	2	6	2592	2597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386845000
33	NC_017773	CAG	2	6	2729	2734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845000
34	NC_017773	AGA	2	6	2753	2758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386845000
35	NC_017773	AGC	2	6	2777	2782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845000
36	NC_017773	TAA	2	6	2992	2997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386845001
37	NC_017773	GCC	2	6	3135	3140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845001
38	NC_017773	CCG	2	6	3226	3231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845001
39	NC_017773	CAA	2	6	3307	3312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386845001
40	NC_017773	CAG	2	6	3320	3325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845001
41	NC_017773	ATG	2	6	3343	3348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386845001
42	NC_017773	GCG	2	6	3395	3400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845001
43	NC_017773	TGC	2	6	3446	3451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845001
44	NC_017773	CGC	2	6	3454	3459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845001
45	NC_017773	GAT	2	6	3483	3488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386845001
46	NC_017773	GCT	2	6	3707	3712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845001
47	NC_017773	ACA	2	6	3841	3846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386845001
48	NC_017773	GCT	2	6	3875	3880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845001
49	NC_017773	GAA	3	9	3972	3980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386845001
50	NC_017773	GCT	2	6	4218	4223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017773	AGC	2	6	4231	4236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017773	CAG	2	6	4254	4259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017773	AGG	2	6	4313	4318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017773	CTT	2	6	4352	4357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017773	CAA	2	6	4576	4581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386845002
56	NC_017773	ACG	2	6	4623	4628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845002
57	NC_017773	ATT	2	6	4633	4638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386845002
58	NC_017773	GTG	2	6	4698	4703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845002
59	NC_017773	TAT	2	6	4719	4724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386845002
60	NC_017773	CTG	2	6	4801	4806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845002
61	NC_017773	TAT	2	6	4838	4843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386845002
62	NC_017773	CTG	2	6	4914	4919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845002
63	NC_017773	GGT	2	6	4937	4942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845002
64	NC_017773	CAT	2	6	5054	5059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386845002
65	NC_017773	AGC	2	6	5108	5113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845002
66	NC_017773	GTG	2	6	5130	5135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845002
67	NC_017773	TAG	2	6	5255	5260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386845002
68	NC_017773	TGG	2	6	5416	5421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845002
69	NC_017773	AAG	2	6	5458	5463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386845002
70	NC_017773	ACC	2	6	5519	5524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386845002
71	NC_017773	CTG	2	6	5721	5726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017773	TGC	2	6	5806	5811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017773	TGT	2	6	5909	5914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386845003
74	NC_017773	CGA	2	6	5972	5977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845003
75	NC_017773	AGG	2	6	6008	6013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386845003
76	NC_017773	TGA	2	6	6080	6085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386845003
77	NC_017773	GGC	2	6	6135	6140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845003
78	NC_017773	CTG	2	6	6151	6156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845003
79	NC_017773	CAA	2	6	6208	6213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386845003
80	NC_017773	ACA	2	6	6219	6224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386845003
81	NC_017773	GTG	2	6	6235	6240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845003
82	NC_017773	TGC	2	6	6533	6538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845004
83	NC_017773	TCT	2	6	6576	6581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386845004
84	NC_017773	CAG	2	6	6653	6658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017773	ATC	2	6	6661	6666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017773	GTC	2	6	6687	6692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017773	ATT	2	6	6713	6718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386845005
88	NC_017773	CAT	2	6	6776	6781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386845005
89	NC_017773	ATG	2	6	7339	7344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017773	TAG	2	6	7353	7358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017773	CTG	2	6	7373	7378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017773	TCA	2	6	7399	7404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017773	GAT	2	6	7461	7466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386845006
94	NC_017773	CAG	2	6	7482	7487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845006
95	NC_017773	CAG	2	6	7552	7557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845006
96	NC_017773	TCG	2	6	7602	7607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845006
97	NC_017773	CAA	2	6	7629	7634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386845006
98	NC_017773	CAA	2	6	7662	7667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386845006
99	NC_017773	TGA	2	6	7675	7680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386845006
100	NC_017773	AAC	2	6	7833	7838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386845006
101	NC_017773	TCA	2	6	7919	7924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386845006
102	NC_017773	CTG	2	6	8055	8060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845006
103	NC_017773	GCA	2	6	8109	8114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845006
104	NC_017773	GAT	2	6	8199	8204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386845006
105	NC_017773	ATG	2	6	8434	8439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386845007
106	NC_017773	TGT	2	6	8492	8497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386845007
107	NC_017773	CGA	2	6	8529	8534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845007
108	NC_017773	TGG	2	6	8617	8622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845007
109	NC_017773	TCA	2	6	8794	8799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386845007
110	NC_017773	CTT	2	6	8860	8865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386845007
111	NC_017773	TTG	2	6	8882	8887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386845007
112	NC_017773	ACG	2	6	8897	8902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845007
113	NC_017773	CAG	2	6	9110	9115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845007
114	NC_017773	GTA	2	6	9124	9129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386845007
115	NC_017773	GCG	2	6	9203	9208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845007
116	NC_017773	ATT	2	6	9210	9215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386845007
117	NC_017773	TCA	2	6	9277	9282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386845007
118	NC_017773	GTG	2	6	9299	9304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845007
119	NC_017773	TCT	2	6	9327	9332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386845007
120	NC_017773	GGT	2	6	9351	9356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845007
121	NC_017773	GCA	2	6	9385	9390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845007
122	NC_017773	TGC	2	6	9405	9410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845007
123	NC_017773	ACT	2	6	9459	9464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017773	ATT	2	6	9522	9527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386845008
125	NC_017773	CTG	2	6	9663	9668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845008
126	NC_017773	AAC	2	6	9887	9892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017773	CAG	2	6	9950	9955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017773	TAC	2	6	10004	10009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386845009
129	NC_017773	GTG	2	6	10033	10038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845009
130	NC_017773	GAT	2	6	10100	10105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386845009
131	NC_017773	TCT	2	6	10186	10191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386845009
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259	NC_017773	TGA	2	6	20640	20645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
260	NC_017773	GAA	2	6	20669	20674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
261	NC_017773	TCA	2	6	20722	20727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
262	NC_017773	ATC	2	6	20799	20804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
263	NC_017773	TCC	2	6	20898	20903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
264	NC_017773	ATG	2	6	21109	21114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386845017
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266	NC_017773	TCA	2	6	21154	21159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386845017
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280	NC_017773	TTA	2	6	22614	22619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_017773	CCA	2	6	37407	37412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386845035

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