MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA2

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017773	AG	3	6	358	363	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017773	TA	3	6	4126	4131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017773	TA	3	6	4491	4496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017773	TG	3	6	5725	5730	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017773	AG	3	6	8386	8391	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017773	GA	3	6	10493	10498	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017773	TG	3	6	10659	10664	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017773	CT	3	6	12089	12094	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017773	CA	3	6	12166	12171	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017773	CT	3	6	12269	12274	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017773	AT	3	6	12299	12304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017773	GA	3	6	12369	12374	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017773	CA	3	6	12588	12593	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017773	CG	3	6	12598	12603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017773	TG	3	6	12652	12657	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017773	CT	3	6	12717	12722	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017773	TA	5	10	12907	12916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017773	CT	3	6	12982	12987	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017773	GT	3	6	15123	15128	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017773	AG	3	6	21853	21858	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017773	AC	3	6	27362	27367	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017773	GA	3	6	27550	27555	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017773	GA	3	6	30006	30011	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017773	TG	3	6	36039	36044	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017773	AT	3	6	48928	48933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017773	CA	3	6	52658	52663	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017773	GT	3	6	56620	56625	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017773	TA	3	6	57838	57843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017773	TA	3	6	57852	57857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017773	AT	4	8	57969	57976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017773	AT	4	8	58933	58940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017773	TG	3	6	59174	59179	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017773	CT	3	6	59285	59290	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017773	AG	3	6	65728	65733	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017773	CA	3	6	71180	71185	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017773	TA	3	6	71946	71951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017773	TA	3	6	72026	72031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017773	TA	3	6	72118	72123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017773	GA	3	6	74965	74970	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017773	TG	3	6	75105	75110	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017773	GT	3	6	75138	75143	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.