MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA2

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017773	GA	3	6	106	111	50 %	0 %	50 %	0 %	386844998
2	NC_017773	GC	3	6	3758	3763	0 %	0 %	50 %	50 %	386845001
3	NC_017773	AT	3	6	6860	6865	50 %	50 %	0 %	0 %	386845005
4	NC_017773	TC	3	6	7695	7700	0 %	50 %	0 %	50 %	386845006
5	NC_017773	CG	3	6	8065	8070	0 %	0 %	50 %	50 %	386845006
6	NC_017773	GC	3	6	8283	8288	0 %	0 %	50 %	50 %	386845006
7	NC_017773	GC	3	6	9606	9611	0 %	0 %	50 %	50 %	386845008
8	NC_017773	GA	3	6	9766	9771	50 %	0 %	50 %	0 %	386845008
9	NC_017773	TG	3	6	10037	10042	0 %	50 %	50 %	0 %	386845009
10	NC_017773	TA	3	6	14495	14500	50 %	50 %	0 %	0 %	386845013
11	NC_017773	GA	3	6	14831	14836	50 %	0 %	50 %	0 %	386845013
12	NC_017773	GT	3	6	14970	14975	0 %	50 %	50 %	0 %	386845013
13	NC_017773	CG	3	6	15857	15862	0 %	0 %	50 %	50 %	386845014
14	NC_017773	AC	3	6	17395	17400	50 %	0 %	0 %	50 %	386845015
15	NC_017773	CT	3	6	17436	17441	0 %	50 %	0 %	50 %	386845015
16	NC_017773	GA	3	6	17735	17740	50 %	0 %	50 %	0 %	386845015
17	NC_017773	AC	3	6	17984	17989	50 %	0 %	0 %	50 %	386845015
18	NC_017773	AC	3	6	18215	18220	50 %	0 %	0 %	50 %	386845015
19	NC_017773	AG	3	6	20470	20475	50 %	0 %	50 %	0 %	386845016
20	NC_017773	GC	3	6	21599	21604	0 %	0 %	50 %	50 %	386845017
21	NC_017773	CG	3	6	24039	24044	0 %	0 %	50 %	50 %	386845020
22	NC_017773	CA	3	6	28745	28750	50 %	0 %	0 %	50 %	386845026
23	NC_017773	GT	3	6	29072	29077	0 %	50 %	50 %	0 %	386845026
24	NC_017773	CG	3	6	30096	30101	0 %	0 %	50 %	50 %	386845027
25	NC_017773	GC	3	6	30244	30249	0 %	0 %	50 %	50 %	386845027
26	NC_017773	TG	3	6	30294	30299	0 %	50 %	50 %	0 %	386845027
27	NC_017773	GC	3	6	30427	30432	0 %	0 %	50 %	50 %	386845027
28	NC_017773	GT	3	6	31114	31119	0 %	50 %	50 %	0 %	386845027
29	NC_017773	TC	3	6	32195	32200	0 %	50 %	0 %	50 %	386845029
30	NC_017773	GC	3	6	32513	32518	0 %	0 %	50 %	50 %	386845029
31	NC_017773	GC	3	6	32856	32861	0 %	0 %	50 %	50 %	386845030
32	NC_017773	GT	3	6	33140	33145	0 %	50 %	50 %	0 %	386845030
33	NC_017773	GC	3	6	33626	33631	0 %	0 %	50 %	50 %	386845030
34	NC_017773	GC	3	6	34276	34281	0 %	0 %	50 %	50 %	386845031
35	NC_017773	GC	3	6	34597	34602	0 %	0 %	50 %	50 %	386845031
36	NC_017773	GC	3	6	35451	35456	0 %	0 %	50 %	50 %	386845031
37	NC_017773	GC	3	6	36902	36907	0 %	0 %	50 %	50 %	386845034
38	NC_017773	CG	3	6	36949	36954	0 %	0 %	50 %	50 %	386845034
39	NC_017773	GC	3	6	37755	37760	0 %	0 %	50 %	50 %	386845035
40	NC_017773	AT	3	6	38278	38283	50 %	50 %	0 %	0 %	386845035
41	NC_017773	GC	3	6	38383	38388	0 %	0 %	50 %	50 %	386845035
42	NC_017773	GC	3	6	39624	39629	0 %	0 %	50 %	50 %	386845036
43	NC_017773	CG	3	6	40218	40223	0 %	0 %	50 %	50 %	386845038
44	NC_017773	TG	3	6	40590	40595	0 %	50 %	50 %	0 %	386845039
45	NC_017773	GC	3	6	41041	41046	0 %	0 %	50 %	50 %	386845039
46	NC_017773	GC	3	6	42744	42749	0 %	0 %	50 %	50 %	386845040
47	NC_017773	TC	3	6	43084	43089	0 %	50 %	0 %	50 %	386845040
48	NC_017773	GC	4	8	43272	43279	0 %	0 %	50 %	50 %	386845041
49	NC_017773	GT	3	6	43333	43338	0 %	50 %	50 %	0 %	386845041
50	NC_017773	GC	3	6	45867	45872	0 %	0 %	50 %	50 %	386845042
51	NC_017773	GC	3	6	46312	46317	0 %	0 %	50 %	50 %	386845043
52	NC_017773	TC	3	6	47103	47108	0 %	50 %	0 %	50 %	386845044
53	NC_017773	CT	3	6	47359	47364	0 %	50 %	0 %	50 %	386845044
54	NC_017773	GC	3	6	47590	47595	0 %	0 %	50 %	50 %	386845044
55	NC_017773	GT	3	6	47721	47726	0 %	50 %	50 %	0 %	386845044
56	NC_017773	GA	3	6	48269	48274	50 %	0 %	50 %	0 %	386845044
57	NC_017773	GC	3	6	48800	48805	0 %	0 %	50 %	50 %	386845045
58	NC_017773	TC	3	6	48977	48982	0 %	50 %	0 %	50 %	386845046
59	NC_017773	GC	3	6	49222	49227	0 %	0 %	50 %	50 %	386845046
60	NC_017773	TG	3	6	49834	49839	0 %	50 %	50 %	0 %	386845046
61	NC_017773	CT	3	6	50362	50367	0 %	50 %	0 %	50 %	386845046
62	NC_017773	CA	3	6	50452	50457	50 %	0 %	0 %	50 %	386845046
63	NC_017773	TG	3	6	50612	50617	0 %	50 %	50 %	0 %	386845046
64	NC_017773	CG	3	6	51344	51349	0 %	0 %	50 %	50 %	386845046
65	NC_017773	TC	3	6	51620	51625	0 %	50 %	0 %	50 %	386845046
66	NC_017773	CA	3	6	51665	51670	50 %	0 %	0 %	50 %	386845046
67	NC_017773	GC	3	6	53559	53564	0 %	0 %	50 %	50 %	386845048
68	NC_017773	CT	3	6	54558	54563	0 %	50 %	0 %	50 %	386845048
69	NC_017773	CA	3	6	55433	55438	50 %	0 %	0 %	50 %	386845049
70	NC_017773	TA	3	6	55563	55568	50 %	50 %	0 %	0 %	386845049
71	NC_017773	GC	3	6	55920	55925	0 %	0 %	50 %	50 %	386845050
72	NC_017773	GC	3	6	56159	56164	0 %	0 %	50 %	50 %	386845051
73	NC_017773	CT	3	6	57449	57454	0 %	50 %	0 %	50 %	386845052
74	NC_017773	AG	3	6	58254	58259	50 %	0 %	50 %	0 %	386845054
75	NC_017773	AC	3	6	60002	60007	50 %	0 %	0 %	50 %	386845056
76	NC_017773	AT	3	6	61219	61224	50 %	50 %	0 %	0 %	386845057
77	NC_017773	TG	3	6	62583	62588	0 %	50 %	50 %	0 %	386845059
78	NC_017773	TG	3	6	62829	62834	0 %	50 %	50 %	0 %	386845059
79	NC_017773	CT	3	6	64601	64606	0 %	50 %	0 %	50 %	386845060
80	NC_017773	GC	3	6	68837	68842	0 %	0 %	50 %	50 %	386845062
81	NC_017773	AG	3	6	69604	69609	50 %	0 %	50 %	0 %	386845063
82	NC_017773	TC	3	6	69994	69999	0 %	50 %	0 %	50 %	386845063
83	NC_017773	GC	3	6	70662	70667	0 %	0 %	50 %	50 %	386845063
84	NC_017773	TG	3	6	73977	73982	0 %	50 %	50 %	0 %	386845066
85	NC_017773	AT	3	6	74151	74156	50 %	50 %	0 %	0 %	386845067
86	NC_017773	GA	3	6	74201	74206	50 %	0 %	50 %	0 %	386845067
87	NC_017773	GA	3	6	74246	74251	50 %	0 %	50 %	0 %	386845067
88	NC_017773	AT	3	6	74631	74636	50 %	50 %	0 %	0 %	386845068

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.