MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA2

Total Repeats: 120

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017773	G	6	6	56	61	0 %	0 %	100 %	0 %	386844998
2	NC_017773	A	6	6	1921	1926	100 %	0 %	0 %	0 %	386844999
3	NC_017773	A	6	6	2976	2981	100 %	0 %	0 %	0 %	386845001
4	NC_017773	G	6	6	3245	3250	0 %	0 %	100 %	0 %	386845001
5	NC_017773	A	6	6	4560	4565	100 %	0 %	0 %	0 %	386845002
6	NC_017773	A	6	6	5504	5509	100 %	0 %	0 %	0 %	386845002
7	NC_017773	G	7	7	7796	7802	0 %	0 %	100 %	0 %	386845006
8	NC_017773	G	6	6	9159	9164	0 %	0 %	100 %	0 %	386845007
9	NC_017773	A	6	6	9195	9200	100 %	0 %	0 %	0 %	386845007
10	NC_017773	T	6	6	10334	10339	0 %	100 %	0 %	0 %	386845009
11	NC_017773	A	6	6	11549	11554	100 %	0 %	0 %	0 %	386845011
12	NC_017773	T	6	6	12280	12285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017773	A	6	6	13196	13201	100 %	0 %	0 %	0 %	386845012
14	NC_017773	A	6	6	13424	13429	100 %	0 %	0 %	0 %	386845012
15	NC_017773	A	6	6	14429	14434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017773	A	6	6	14500	14505	100 %	0 %	0 %	0 %	386845013
17	NC_017773	A	6	6	14667	14672	100 %	0 %	0 %	0 %	386845013
18	NC_017773	T	6	6	14725	14730	0 %	100 %	0 %	0 %	386845013
19	NC_017773	A	7	7	14933	14939	100 %	0 %	0 %	0 %	386845013
20	NC_017773	T	6	6	16263	16268	0 %	100 %	0 %	0 %	386845014
21	NC_017773	A	7	7	17265	17271	100 %	0 %	0 %	0 %	386845015
22	NC_017773	A	7	7	17914	17920	100 %	0 %	0 %	0 %	386845015
23	NC_017773	A	6	6	18098	18103	100 %	0 %	0 %	0 %	386845015
24	NC_017773	A	7	7	18607	18613	100 %	0 %	0 %	0 %	386845015
25	NC_017773	G	6	6	19167	19172	0 %	0 %	100 %	0 %	386845015
26	NC_017773	A	6	6	19666	19671	100 %	0 %	0 %	0 %	386845016
27	NC_017773	A	6	6	21809	21814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017773	G	6	6	22331	22336	0 %	0 %	100 %	0 %	386845018
29	NC_017773	T	6	6	23940	23945	0 %	100 %	0 %	0 %	386845020
30	NC_017773	C	6	6	24098	24103	0 %	0 %	0 %	100 %	386845020
31	NC_017773	A	7	7	25403	25409	100 %	0 %	0 %	0 %	386845021
32	NC_017773	A	6	6	30519	30524	100 %	0 %	0 %	0 %	386845027
33	NC_017773	A	6	6	30915	30920	100 %	0 %	0 %	0 %	386845027
34	NC_017773	A	7	7	35323	35329	100 %	0 %	0 %	0 %	386845031
35	NC_017773	A	6	6	35729	35734	100 %	0 %	0 %	0 %	386845032
36	NC_017773	G	6	6	36214	36219	0 %	0 %	100 %	0 %	386845033
37	NC_017773	T	7	7	36537	36543	0 %	100 %	0 %	0 %	386845034
38	NC_017773	A	6	6	36809	36814	100 %	0 %	0 %	0 %	386845034
39	NC_017773	A	6	6	37034	37039	100 %	0 %	0 %	0 %	386845034
40	NC_017773	T	6	6	39858	39863	0 %	100 %	0 %	0 %	386845037
41	NC_017773	G	6	6	40269	40274	0 %	0 %	100 %	0 %	386845038
42	NC_017773	A	6	6	41434	41439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017773	T	6	6	42392	42397	0 %	100 %	0 %	0 %	386845040
44	NC_017773	A	6	6	43402	43407	100 %	0 %	0 %	0 %	386845041
45	NC_017773	A	8	8	44794	44801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017773	A	6	6	45410	45415	100 %	0 %	0 %	0 %	386845042
47	NC_017773	A	6	6	48274	48279	100 %	0 %	0 %	0 %	386845044
48	NC_017773	A	6	6	48296	48301	100 %	0 %	0 %	0 %	386845044
49	NC_017773	T	6	6	48353	48358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017773	A	8	8	48892	48899	100 %	0 %	0 %	0 %	386845045
51	NC_017773	T	6	6	48996	49001	0 %	100 %	0 %	0 %	386845046
52	NC_017773	T	8	8	52357	52364	0 %	100 %	0 %	0 %	386845046
53	NC_017773	T	6	6	53215	53220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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56	NC_017773	A	7	7	55227	55233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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58	NC_017773	A	6	6	55675	55680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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60	NC_017773	T	7	7	55949	55955	0 %	100 %	0 %	0 %	386845050
61	NC_017773	T	6	6	56625	56630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017773	T	6	6	56661	56666	0 %	100 %	0 %	0 %	386845052
63	NC_017773	T	6	6	56734	56739	0 %	100 %	0 %	0 %	386845052
64	NC_017773	G	6	6	57371	57376	0 %	0 %	100 %	0 %	386845052
65	NC_017773	A	6	6	57988	57993	100 %	0 %	0 %	0 %	386845053
66	NC_017773	A	7	7	58899	58905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017773	A	6	6	58944	58949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017773	A	7	7	59344	59350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017773	T	7	7	59410	59416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017773	A	7	7	59419	59425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017773	T	9	9	59511	59519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017773	A	6	6	60246	60251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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103	NC_017773	A	6	6	71896	71901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017773	A	6	6	71997	72002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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109	NC_017773	T	6	6	72594	72599	0 %	100 %	0 %	0 %	386845065
110	NC_017773	T	7	7	72804	72810	0 %	100 %	0 %	0 %	386845065
111	NC_017773	A	7	7	72985	72991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017773	A	7	7	73018	73024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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114	NC_017773	A	6	6	73995	74000	100 %	0 %	0 %	0 %	386845066
115	NC_017773	A	6	6	74514	74519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017773	A	6	6	74637	74642	100 %	0 %	0 %	0 %	386845068
117	NC_017773	A	6	6	74804	74809	100 %	0 %	0 %	0 %	386845068
118	NC_017773	T	6	6	74862	74867	0 %	100 %	0 %	0 %	386845068
119	NC_017773	A	7	7	74878	74884	100 %	0 %	0 %	0 %	386845068
120	NC_017773	A	7	7	75067	75073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.