MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA2

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017773	G	6	6	56	61	0 %	0 %	100 %	0 %	386844998
2	NC_017773	A	6	6	1921	1926	100 %	0 %	0 %	0 %	386844999
3	NC_017773	A	6	6	2976	2981	100 %	0 %	0 %	0 %	386845001
4	NC_017773	G	6	6	3245	3250	0 %	0 %	100 %	0 %	386845001
5	NC_017773	A	6	6	4560	4565	100 %	0 %	0 %	0 %	386845002
6	NC_017773	A	6	6	5504	5509	100 %	0 %	0 %	0 %	386845002
7	NC_017773	G	7	7	7796	7802	0 %	0 %	100 %	0 %	386845006
8	NC_017773	G	6	6	9159	9164	0 %	0 %	100 %	0 %	386845007
9	NC_017773	A	6	6	9195	9200	100 %	0 %	0 %	0 %	386845007
10	NC_017773	T	6	6	10334	10339	0 %	100 %	0 %	0 %	386845009
11	NC_017773	A	6	6	11549	11554	100 %	0 %	0 %	0 %	386845011
12	NC_017773	A	6	6	13196	13201	100 %	0 %	0 %	0 %	386845012
13	NC_017773	A	6	6	13424	13429	100 %	0 %	0 %	0 %	386845012
14	NC_017773	A	6	6	14500	14505	100 %	0 %	0 %	0 %	386845013
15	NC_017773	A	6	6	14667	14672	100 %	0 %	0 %	0 %	386845013
16	NC_017773	T	6	6	14725	14730	0 %	100 %	0 %	0 %	386845013
17	NC_017773	A	7	7	14933	14939	100 %	0 %	0 %	0 %	386845013
18	NC_017773	T	6	6	16263	16268	0 %	100 %	0 %	0 %	386845014
19	NC_017773	A	7	7	17265	17271	100 %	0 %	0 %	0 %	386845015
20	NC_017773	A	7	7	17914	17920	100 %	0 %	0 %	0 %	386845015
21	NC_017773	A	6	6	18098	18103	100 %	0 %	0 %	0 %	386845015
22	NC_017773	A	7	7	18607	18613	100 %	0 %	0 %	0 %	386845015
23	NC_017773	G	6	6	19167	19172	0 %	0 %	100 %	0 %	386845015
24	NC_017773	A	6	6	19666	19671	100 %	0 %	0 %	0 %	386845016
25	NC_017773	G	6	6	22331	22336	0 %	0 %	100 %	0 %	386845018
26	NC_017773	T	6	6	23940	23945	0 %	100 %	0 %	0 %	386845020
27	NC_017773	C	6	6	24098	24103	0 %	0 %	0 %	100 %	386845020
28	NC_017773	A	7	7	25403	25409	100 %	0 %	0 %	0 %	386845021
29	NC_017773	A	6	6	30519	30524	100 %	0 %	0 %	0 %	386845027
30	NC_017773	A	6	6	30915	30920	100 %	0 %	0 %	0 %	386845027
31	NC_017773	A	7	7	35323	35329	100 %	0 %	0 %	0 %	386845031
32	NC_017773	A	6	6	35729	35734	100 %	0 %	0 %	0 %	386845032
33	NC_017773	G	6	6	36214	36219	0 %	0 %	100 %	0 %	386845033
34	NC_017773	T	7	7	36537	36543	0 %	100 %	0 %	0 %	386845034
35	NC_017773	A	6	6	36809	36814	100 %	0 %	0 %	0 %	386845034
36	NC_017773	A	6	6	37034	37039	100 %	0 %	0 %	0 %	386845034
37	NC_017773	T	6	6	39858	39863	0 %	100 %	0 %	0 %	386845037
38	NC_017773	G	6	6	40269	40274	0 %	0 %	100 %	0 %	386845038
39	NC_017773	T	6	6	42392	42397	0 %	100 %	0 %	0 %	386845040
40	NC_017773	A	6	6	43402	43407	100 %	0 %	0 %	0 %	386845041
41	NC_017773	A	6	6	45410	45415	100 %	0 %	0 %	0 %	386845042
42	NC_017773	A	6	6	48274	48279	100 %	0 %	0 %	0 %	386845044
43	NC_017773	A	6	6	48296	48301	100 %	0 %	0 %	0 %	386845044
44	NC_017773	A	8	8	48892	48899	100 %	0 %	0 %	0 %	386845045
45	NC_017773	T	6	6	48996	49001	0 %	100 %	0 %	0 %	386845046
46	NC_017773	T	8	8	52357	52364	0 %	100 %	0 %	0 %	386845046
47	NC_017773	C	9	9	53743	53751	0 %	0 %	0 %	100 %	386845048
48	NC_017773	A	6	6	54631	54636	100 %	0 %	0 %	0 %	386845048
49	NC_017773	C	6	6	55326	55331	0 %	0 %	0 %	100 %	386845049
50	NC_017773	A	6	6	55799	55804	100 %	0 %	0 %	0 %	386845050
51	NC_017773	T	7	7	55949	55955	0 %	100 %	0 %	0 %	386845050
52	NC_017773	T	6	6	56661	56666	0 %	100 %	0 %	0 %	386845052
53	NC_017773	T	6	6	56734	56739	0 %	100 %	0 %	0 %	386845052
54	NC_017773	G	6	6	57371	57376	0 %	0 %	100 %	0 %	386845052
55	NC_017773	A	6	6	57988	57993	100 %	0 %	0 %	0 %	386845053
56	NC_017773	A	6	6	61102	61107	100 %	0 %	0 %	0 %	386845057
57	NC_017773	C	6	6	61639	61644	0 %	0 %	0 %	100 %	386845058
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59	NC_017773	A	6	6	61901	61906	100 %	0 %	0 %	0 %	386845058
60	NC_017773	A	6	6	62371	62376	100 %	0 %	0 %	0 %	386845058
61	NC_017773	A	6	6	62539	62544	100 %	0 %	0 %	0 %	386845059
62	NC_017773	A	6	6	62651	62656	100 %	0 %	0 %	0 %	386845059
63	NC_017773	T	6	6	62846	62851	0 %	100 %	0 %	0 %	386845059
64	NC_017773	A	6	6	63200	63205	100 %	0 %	0 %	0 %	386845059
65	NC_017773	A	6	6	63257	63262	100 %	0 %	0 %	0 %	386845059
66	NC_017773	T	6	6	63359	63364	0 %	100 %	0 %	0 %	386845059
67	NC_017773	A	6	6	63712	63717	100 %	0 %	0 %	0 %	386845059
68	NC_017773	C	6	6	64225	64230	0 %	0 %	0 %	100 %	386845060
69	NC_017773	C	6	6	64758	64763	0 %	0 %	0 %	100 %	386845060
70	NC_017773	A	6	6	64824	64829	100 %	0 %	0 %	0 %	386845060
71	NC_017773	T	6	6	65142	65147	0 %	100 %	0 %	0 %	386845060
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79	NC_017773	G	6	6	68591	68596	0 %	0 %	100 %	0 %	386845062
80	NC_017773	T	7	7	69094	69100	0 %	100 %	0 %	0 %	386845062
81	NC_017773	T	6	6	70029	70034	0 %	100 %	0 %	0 %	386845063
82	NC_017773	T	6	6	72180	72185	0 %	100 %	0 %	0 %	386845065
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84	NC_017773	T	7	7	72477	72483	0 %	100 %	0 %	0 %	386845065
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89	NC_017773	A	6	6	73995	74000	100 %	0 %	0 %	0 %	386845066
90	NC_017773	A	6	6	74637	74642	100 %	0 %	0 %	0 %	386845068
91	NC_017773	A	6	6	74804	74809	100 %	0 %	0 %	0 %	386845068
92	NC_017773	T	6	6	74862	74867	0 %	100 %	0 %	0 %	386845068
93	NC_017773	A	7	7	74878	74884	100 %	0 %	0 %	0 %	386845068

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.