MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Deinococcus gobiensis I-0 plasmid P3

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017771	CCAGGA	2	12	1909	1920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386854279
2	NC_017771	CAAGGC	2	12	3691	3702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386854281
3	NC_017771	GCAAGG	2	12	3711	3722	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386854281
4	NC_017771	GCGACC	2	12	5923	5934	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386854283
5	NC_017771	GTACGA	2	12	6526	6537	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386854284
6	NC_017771	CGGCAG	2	12	7855	7866	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386854284
7	NC_017771	CACCTC	2	12	11064	11075	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	386854285
8	NC_017771	AGCACC	2	12	15811	15822	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386854287
9	NC_017771	GGGCCA	2	12	17424	17435	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386854288
10	NC_017771	GACGCC	2	12	21782	21793	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386854292
11	NC_017771	TCGACG	2	12	29577	29588	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386854301
12	NC_017771	ACCTCG	2	12	32343	32354	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386854303
13	NC_017771	TGCTCA	2	12	32508	32519	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386854303
14	NC_017771	CAGGAG	2	12	33692	33703	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386854303
15	NC_017771	CTGTGG	2	12	37087	37098	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386854308
16	NC_017771	CTTGAG	2	12	39315	39326	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386854313
17	NC_017771	CTCCCC	2	12	39363	39374	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	386854313
18	NC_017771	GAGATA	2	12	40818	40829	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386854313
19	NC_017771	CCGCCA	2	12	41170	41181	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386854314
20	NC_017771	CGCTCA	2	12	41875	41886	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386854315
21	NC_017771	GGACCT	2	12	44194	44205	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386854319
22	NC_017771	CTCGCC	2	12	44366	44377	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386854319
23	NC_017771	GATTCG	2	12	56965	56976	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386854338
24	NC_017771	TCTTCG	2	12	59884	59895	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386854341
25	NC_017771	GGAAGC	2	12	61407	61418	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386854344
26	NC_017771	GGGTCC	2	12	68500	68511	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386854355
27	NC_017771	CTTCGA	2	12	71025	71036	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386854357
28	NC_017771	ACCCTG	2	12	72011	72022	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386854358
29	NC_017771	CCAATC	2	12	73073	73084	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386854359
30	NC_017771	ACCGTC	2	12	73414	73425	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386854359
31	NC_017771	CTGCGT	2	12	75261	75272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386854360
32	NC_017771	CGAACG	2	12	75834	75845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386854360
33	NC_017771	TCTGGC	2	12	79250	79261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386854362
34	NC_017771	CGCGTC	2	12	87079	87090	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386854372
35	NC_017771	CACGGA	2	12	94125	94136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386854384
36	NC_017771	CACGAC	2	12	94481	94492	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386854385
37	NC_017771	ACCTCG	2	12	97200	97211	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386854392
38	NC_017771	GCACCA	2	12	99172	99183	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386854395
39	NC_017771	TCACCC	2	12	100194	100205	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	386854396
40	NC_017771	GGCCGG	2	12	105518	105529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386854406
41	NC_017771	CGCCAT	2	12	106706	106717	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386854407
42	NC_017771	GTCCCT	2	12	107268	107279	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386854408
43	NC_017771	TGCTCC	2	12	108381	108392	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386854409
44	NC_017771	TTGGAG	2	12	108460	108471	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386854409
45	NC_017771	TGCCGG	2	12	112222	112233	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386854413
46	NC_017771	CTGATC	2	12	119699	119710	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386854424
47	NC_017771	ACCCTG	2	12	124117	124128	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386854430
48	NC_017771	CCAGCC	2	12	125421	125432	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386854430
49	NC_017771	GGGGCT	2	12	133457	133468	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386854439
50	NC_017771	CCGCTC	2	12	133489	133500	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386854439
51	NC_017771	CCCTCC	2	12	136650	136661	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	386854441
52	NC_017771	AGGCGG	2	12	137139	137150	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386854442
53	NC_017771	GCCTCG	2	12	137266	137277	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386854442
54	NC_017771	CGACTT	2	12	137789	137800	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386854443
55	NC_017771	GCGTTG	2	12	137864	137875	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386854443
56	NC_017771	CCCTGA	2	12	143564	143575	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386854449
57	NC_017771	CATCTT	2	12	146157	146168	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386854450
58	NC_017771	TTCCAG	2	12	154253	154264	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386854463
59	NC_017771	ATGGGC	2	12	156842	156853	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386854466
60	NC_017771	TTGACC	2	12	157001	157012	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386854467
61	NC_017771	TGGCGA	2	12	157901	157912	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386854468
62	NC_017771	GAGGGC	2	12	162038	162049	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386854474
63	NC_017771	CGGTGG	2	12	162579	162590	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386854475
64	NC_017771	CAATGG	2	12	165617	165628	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386854478
65	NC_017771	AGGCTC	2	12	166213	166224	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386854478
66	NC_017771	GTATCC	2	12	167468	167479	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386854481
67	NC_017771	AGGCAC	2	12	171263	171274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386854486
68	NC_017771	CCTGAC	2	12	173073	173084	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386854488
69	NC_017771	GACGTG	2	12	177391	177402	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386854494
70	NC_017771	TCAGAG	2	12	179387	179398	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386854498
71	NC_017771	CTCGTC	2	12	180282	180293	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386854501
72	NC_017771	CTGGCC	2	12	181521	181532	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386854501
73	NC_017771	CTCCGT	2	12	185121	185132	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386854505
74	NC_017771	CGCCCT	2	12	186948	186959	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386854507
75	NC_017771	CAAGCG	2	12	188589	188600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386854507
76	NC_017771	GGCCGC	2	12	190623	190634	0 %	0 %	50 %	50 %	386854507
77	NC_017771	CTATCC	2	12	191317	191328	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386854508
78	NC_017771	GGAACT	2	12	191958	191969	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386854509
79	NC_017771	CTGGCG	2	12	198628	198639	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386854517
80	NC_017771	GTCCAG	2	12	199520	199531	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386854518
81	NC_017771	GCCTGG	2	12	201906	201917	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386854521
82	NC_017771	TACAAA	2	12	208455	208466	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386854531
83	NC_017771	GGCGGT	2	12	209359	209370	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386854532
84	NC_017771	CACCGC	2	12	217125	217136	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386854543
85	NC_017771	GACCCT	2	12	219429	219440	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386854546
86	NC_017771	CCGACC	2	12	222811	222822	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386854552
87	NC_017771	AGGACG	2	12	223852	223863	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386854552
88	NC_017771	CGTGGG	2	12	225414	225425	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386854553

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.