MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Deinococcus gobiensis I-0 plasmid P3

Total Repeats: 97

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017771	GGCG	2	8	73	80	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017771	CCAC	2	8	546	553	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3	NC_017771	CAGC	2	8	2212	2219	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017771	CCGC	2	8	18250	18257	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5	NC_017771	ATGC	2	8	21174	21181	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017771	CCCG	2	8	21279	21286	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7	NC_017771	CCGA	2	8	22564	22571	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017771	CTCC	2	8	23175	23182	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
9	NC_017771	GCGG	2	8	23644	23651	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017771	GGAC	2	8	24729	24736	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017771	TCCC	2	8	25297	25304	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
12	NC_017771	CTTG	2	8	27089	27096	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017771	CAGG	2	8	27106	27113	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017771	ACTC	2	8	27677	27684	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017771	GTTT	2	8	34684	34691	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017771	AGCG	2	8	34978	34985	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017771	GGGT	2	8	45629	45636	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017771	GAAA	2	8	46174	46181	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017771	GCCG	2	8	46468	46475	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017771	CCAC	2	8	52657	52664	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
21	NC_017771	CAGG	2	8	52760	52767	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017771	CCTC	2	8	53066	53073	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
23	NC_017771	CCGG	2	8	53594	53601	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017771	GAGT	2	8	57069	57076	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017771	GCCG	2	8	57199	57206	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017771	CCGT	2	8	58194	58201	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017771	TTTG	2	8	66272	66279	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017771	CCCG	2	8	66386	66393	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
29	NC_017771	GCGG	2	8	72522	72529	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017771	CGCC	2	8	72593	72600	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
31	NC_017771	CGCC	2	8	72704	72711	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
32	NC_017771	ACCT	2	8	77469	77476	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017771	CAAT	2	8	83636	83643	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017771	CTGC	2	8	85566	85573	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017771	CCTC	2	8	86416	86423	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
36	NC_017771	TCCC	2	8	89331	89338	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
37	NC_017771	GAGC	2	8	90936	90943	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017771	CCCA	2	8	91817	91824	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
39	NC_017771	CGCA	2	8	94377	94384	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017771	TCCC	2	8	97034	97041	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
41	NC_017771	ACCA	2	8	101218	101225	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017771	TGCC	2	8	103443	103450	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017771	GGAG	2	8	105880	105887	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017771	ACCC	2	8	109369	109376	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
45	NC_017771	TAGA	2	8	110203	110210	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017771	TCTA	2	8	110225	110232	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017771	GCCG	2	8	111707	111714	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017771	GGGT	2	8	112704	112711	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017771	CCTG	2	8	130146	130153	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017771	CTCC	2	8	130444	130451	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
51	NC_017771	TCCC	2	8	132228	132235	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
52	NC_017771	AAGG	2	8	141474	141481	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017771	TCTT	2	8	141504	141511	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017771	AGTC	2	8	145470	145477	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017771	GCGT	2	8	145538	145545	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017771	TGTC	2	8	151715	151722	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017771	CCAC	2	8	151745	151752	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
58	NC_017771	CGCC	2	8	155840	155847	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
59	NC_017771	TCCG	2	8	156094	156101	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017771	GCCA	2	8	156121	156128	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017771	GGCG	2	8	156324	156331	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017771	GCCG	2	8	156957	156964	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017771	CCGG	2	8	158113	158120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017771	CCCG	2	8	158293	158300	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
65	NC_017771	GGCC	2	8	158398	158405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017771	TGAG	2	8	158474	158481	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017771	ATCG	2	8	158656	158663	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017771	TGGC	2	8	159741	159748	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017771	GTCT	2	8	168949	168956	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017771	CGCT	2	8	170511	170518	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017771	TGGC	2	8	173868	173875	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017771	GCAA	2	8	182124	182131	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017771	TGCA	2	8	182598	182605	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017771	GTCA	2	8	183186	183193	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017771	TGAT	2	8	183427	183434	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017771	ATTA	2	8	183741	183748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017771	CGGC	2	8	184308	184315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017771	CCTT	2	8	185285	185292	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017771	CTGC	2	8	201944	201951	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017771	ATTT	2	8	206543	206550	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017771	CGAA	2	8	211184	211191	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017771	GGCG	2	8	212317	212324	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017771	GATG	2	8	213309	213316	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017771	CGAA	2	8	213338	213345	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017771	CAGC	2	8	213767	213774	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017771	CACG	2	8	214248	214255	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017771	AGGA	2	8	214385	214392	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017771	GCTG	2	8	214527	214534	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017771	TGCC	2	8	214617	214624	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017771	TCCC	2	8	215685	215692	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
91	NC_017771	GGGT	2	8	221778	221785	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017771	CCCG	2	8	227967	227974	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
93	NC_017771	GGAC	2	8	229912	229919	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017771	GCAC	2	8	231070	231077	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017771	ACCG	2	8	231080	231087	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017771	CTCC	2	8	231358	231365	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
97	NC_017771	CCAC	2	8	231399	231406	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.