MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Deinococcus gobiensis I-0 plasmid P3

Total Repeats: 440

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017771	CCAC	2	8	506	513	25 %	0 %	0 %	75 %	386854277
2	NC_017771	CCCG	2	8	789	796	0 %	0 %	25 %	75 %	386854278
3	NC_017771	CGCC	2	8	955	962	0 %	0 %	25 %	75 %	386854278
4	NC_017771	CGCC	2	8	1266	1273	0 %	0 %	25 %	75 %	386854278
5	NC_017771	CAGC	2	8	1359	1366	25 %	0 %	25 %	50 %	386854278
6	NC_017771	GCGG	2	8	1543	1550	0 %	0 %	75 %	25 %	386854279
7	NC_017771	GGCG	2	8	1810	1817	0 %	0 %	75 %	25 %	386854279
8	NC_017771	GCCA	2	8	2368	2375	25 %	0 %	25 %	50 %	386854280
9	NC_017771	CGCC	2	8	2626	2633	0 %	0 %	25 %	75 %	386854281
10	NC_017771	GGCC	2	8	2647	2654	0 %	0 %	50 %	50 %	386854281
11	NC_017771	CGGC	2	8	3138	3145	0 %	0 %	50 %	50 %	386854281
12	NC_017771	CCGA	2	8	3638	3645	25 %	0 %	25 %	50 %	386854281
13	NC_017771	CGCC	2	8	3946	3953	0 %	0 %	25 %	75 %	386854281
14	NC_017771	CCCT	2	8	4382	4389	0 %	25 %	0 %	75 %	386854281
15	NC_017771	GTCC	2	8	4558	4565	0 %	25 %	25 %	50 %	386854282
16	NC_017771	TTGG	2	8	4598	4605	0 %	50 %	50 %	0 %	386854282
17	NC_017771	TCGA	2	8	4678	4685	25 %	25 %	25 %	25 %	386854282
18	NC_017771	CTTC	2	8	4884	4891	0 %	50 %	0 %	50 %	386854282
19	NC_017771	TATG	2	8	5430	5437	25 %	50 %	25 %	0 %	386854282
20	NC_017771	CAGC	2	8	5607	5614	25 %	0 %	25 %	50 %	386854282
21	NC_017771	GATC	2	8	5700	5707	25 %	25 %	25 %	25 %	386854282
22	NC_017771	GTGC	2	8	5722	5729	0 %	25 %	50 %	25 %	386854282
23	NC_017771	GCTG	2	8	6365	6372	0 %	25 %	50 %	25 %	386854283
24	NC_017771	GCCG	2	8	6490	6497	0 %	0 %	50 %	50 %	386854284
25	NC_017771	CGCC	2	8	6504	6511	0 %	0 %	25 %	75 %	386854284
26	NC_017771	CCGC	2	8	6955	6962	0 %	0 %	25 %	75 %	386854284
27	NC_017771	AAGA	2	8	7253	7260	75 %	0 %	25 %	0 %	386854284
28	NC_017771	ACCG	2	8	7487	7494	25 %	0 %	25 %	50 %	386854284
29	NC_017771	GGCG	2	8	9166	9173	0 %	0 %	75 %	25 %	386854284
30	NC_017771	CGGC	2	8	9189	9196	0 %	0 %	50 %	50 %	386854284
31	NC_017771	AAGC	2	8	9383	9390	50 %	0 %	25 %	25 %	386854284
32	NC_017771	TGCT	2	8	10378	10385	0 %	50 %	25 %	25 %	386854285
33	NC_017771	GATC	2	8	10634	10641	25 %	25 %	25 %	25 %	386854285
34	NC_017771	GAGC	2	8	11543	11550	25 %	0 %	50 %	25 %	386854285
35	NC_017771	CTGG	2	8	11861	11868	0 %	25 %	50 %	25 %	386854285
36	NC_017771	GCCC	2	8	12120	12127	0 %	0 %	25 %	75 %	386854285
37	NC_017771	CCCA	2	8	12734	12741	25 %	0 %	0 %	75 %	386854285
38	NC_017771	GTTC	2	8	13130	13137	0 %	50 %	25 %	25 %	386854285
39	NC_017771	GACT	2	8	13171	13178	25 %	25 %	25 %	25 %	386854285
40	NC_017771	CGCT	2	8	13414	13421	0 %	25 %	25 %	50 %	386854285
41	NC_017771	TCCA	2	8	13921	13928	25 %	25 %	0 %	50 %	386854286
42	NC_017771	GCCA	2	8	13963	13970	25 %	0 %	25 %	50 %	386854286
43	NC_017771	AGGG	2	8	14312	14319	25 %	0 %	75 %	0 %	386854286
44	NC_017771	CGGC	2	8	14343	14350	0 %	0 %	50 %	50 %	386854286
45	NC_017771	GGCC	2	8	14490	14497	0 %	0 %	50 %	50 %	386854286
46	NC_017771	CAGC	2	8	14973	14980	25 %	0 %	25 %	50 %	386854286
47	NC_017771	AGGT	2	8	15163	15170	25 %	25 %	50 %	0 %	386854286
48	NC_017771	CGAA	2	8	16174	16181	50 %	0 %	25 %	25 %	386854287
49	NC_017771	CCGG	2	8	17181	17188	0 %	0 %	50 %	50 %	386854288
50	NC_017771	CGCC	2	8	17524	17531	0 %	0 %	25 %	75 %	386854288
51	NC_017771	CCAT	2	8	17861	17868	25 %	25 %	0 %	50 %	386854288
52	NC_017771	CAGC	2	8	17959	17966	25 %	0 %	25 %	50 %	386854288
53	NC_017771	CCTG	2	8	18488	18495	0 %	25 %	25 %	50 %	386854289
54	NC_017771	ATGG	2	8	19077	19084	25 %	25 %	50 %	0 %	386854290
55	NC_017771	TCGG	2	8	20003	20010	0 %	25 %	50 %	25 %	386854290
56	NC_017771	GGTC	2	8	20266	20273	0 %	25 %	50 %	25 %	386854290
57	NC_017771	GGGC	2	8	20390	20397	0 %	0 %	75 %	25 %	386854290
58	NC_017771	CCTG	2	8	20987	20994	0 %	25 %	25 %	50 %	386854291
59	NC_017771	CGCT	2	8	21380	21387	0 %	25 %	25 %	50 %	386854292
60	NC_017771	GACG	2	8	21496	21503	25 %	0 %	50 %	25 %	386854292
61	NC_017771	GCCC	2	8	21574	21581	0 %	0 %	25 %	75 %	386854292
62	NC_017771	CGAG	2	8	21708	21715	25 %	0 %	50 %	25 %	386854292
63	NC_017771	AGGC	2	8	21798	21805	25 %	0 %	50 %	25 %	386854292
64	NC_017771	CAGC	2	8	21937	21944	25 %	0 %	25 %	50 %	386854292
65	NC_017771	GCCG	2	8	22318	22325	0 %	0 %	50 %	50 %	386854292
66	NC_017771	ACCC	2	8	22361	22368	25 %	0 %	0 %	75 %	386854292
67	NC_017771	TCCC	2	8	23578	23585	0 %	25 %	0 %	75 %	386854295
68	NC_017771	CTCC	2	8	23724	23731	0 %	25 %	0 %	75 %	386854296
69	NC_017771	CTCC	2	8	24510	24517	0 %	25 %	0 %	75 %	386854296
70	NC_017771	TGGA	2	8	25853	25860	25 %	25 %	50 %	0 %	386854298
71	NC_017771	CTGG	2	8	26459	26466	0 %	25 %	50 %	25 %	386854299
72	NC_017771	CACG	2	8	26715	26722	25 %	0 %	25 %	50 %	386854299
73	NC_017771	TGCT	2	8	26977	26984	0 %	50 %	25 %	25 %	386854299
74	NC_017771	CAGC	2	8	27955	27962	25 %	0 %	25 %	50 %	386854300
75	NC_017771	CCTC	2	8	28098	28105	0 %	25 %	0 %	75 %	386854300
76	NC_017771	GGCC	2	8	28162	28169	0 %	0 %	50 %	50 %	386854300
77	NC_017771	ACCC	2	8	28781	28788	25 %	0 %	0 %	75 %	386854300
78	NC_017771	GCCT	2	8	29385	29392	0 %	25 %	25 %	50 %	386854301
79	NC_017771	GCCA	2	8	30235	30242	25 %	0 %	25 %	50 %	386854301
80	NC_017771	AAGG	2	8	30416	30423	50 %	0 %	50 %	0 %	386854301
81	NC_017771	GACG	2	8	30478	30485	25 %	0 %	50 %	25 %	386854301
82	NC_017771	CCCT	2	8	30830	30837	0 %	25 %	0 %	75 %	386854301
83	NC_017771	CGCC	2	8	30981	30988	0 %	0 %	25 %	75 %	386854301
84	NC_017771	CACG	2	8	32754	32761	25 %	0 %	25 %	50 %	386854303
85	NC_017771	GGCG	2	8	32983	32990	0 %	0 %	75 %	25 %	386854303
86	NC_017771	GAAC	2	8	33109	33116	50 %	0 %	25 %	25 %	386854303
87	NC_017771	GATG	2	8	33663	33670	25 %	25 %	50 %	0 %	386854303
88	NC_017771	CGTG	2	8	34191	34198	0 %	25 %	50 %	25 %	386854303
89	NC_017771	CGGG	2	8	34269	34276	0 %	0 %	75 %	25 %	386854303
90	NC_017771	TCGG	2	8	34382	34389	0 %	25 %	50 %	25 %	386854304
91	NC_017771	CGAC	2	8	35480	35487	25 %	0 %	25 %	50 %	386854306
92	NC_017771	TGGA	2	8	35565	35572	25 %	25 %	50 %	0 %	386854306
93	NC_017771	CGCC	2	8	35588	35595	0 %	0 %	25 %	75 %	386854306
94	NC_017771	GGGC	2	8	35946	35953	0 %	0 %	75 %	25 %	386854306
95	NC_017771	GCCC	2	8	36021	36028	0 %	0 %	25 %	75 %	386854306
96	NC_017771	CCGT	2	8	37891	37898	0 %	25 %	25 %	50 %	386854309
97	NC_017771	GCGG	2	8	37986	37993	0 %	0 %	75 %	25 %	386854309
98	NC_017771	TAAT	2	8	39096	39103	50 %	50 %	0 %	0 %	386854312
99	NC_017771	GCCC	2	8	40174	40181	0 %	0 %	25 %	75 %	386854313
100	NC_017771	GCGT	2	8	40696	40703	0 %	25 %	50 %	25 %	386854313
101	NC_017771	CCTT	2	8	40807	40814	0 %	50 %	0 %	50 %	386854313
102	NC_017771	ACCC	2	8	41486	41493	25 %	0 %	0 %	75 %	386854314
103	NC_017771	TCCC	2	8	42061	42068	0 %	25 %	0 %	75 %	386854315
104	NC_017771	ACCC	2	8	42609	42616	25 %	0 %	0 %	75 %	386854316
105	NC_017771	CCTC	2	8	42875	42882	0 %	25 %	0 %	75 %	386854317
106	NC_017771	CGCT	2	8	42914	42921	0 %	25 %	25 %	50 %	386854317
107	NC_017771	CGTG	2	8	43181	43188	0 %	25 %	50 %	25 %	386854317
108	NC_017771	GACG	2	8	45233	45240	25 %	0 %	50 %	25 %	386854320
109	NC_017771	GTCC	2	8	45950	45957	0 %	25 %	25 %	50 %	386854321
110	NC_017771	GACC	2	8	46725	46732	25 %	0 %	25 %	50 %	386854322
111	NC_017771	GCGG	2	8	48611	48618	0 %	0 %	75 %	25 %	386854324
112	NC_017771	TCGG	2	8	48675	48682	0 %	25 %	50 %	25 %	386854324
113	NC_017771	CGTC	2	8	49330	49337	0 %	25 %	25 %	50 %	386854325
114	NC_017771	TGGC	2	8	50637	50644	0 %	25 %	50 %	25 %	386854327
115	NC_017771	GCCG	2	8	51216	51223	0 %	0 %	50 %	50 %	386854327
116	NC_017771	CGAG	2	8	51467	51474	25 %	0 %	50 %	25 %	386854328
117	NC_017771	AGGA	2	8	51652	51659	50 %	0 %	50 %	0 %	386854328
118	NC_017771	CCCG	2	8	51983	51990	0 %	0 %	25 %	75 %	386854329
119	NC_017771	CCTG	2	8	52001	52008	0 %	25 %	25 %	50 %	386854329
120	NC_017771	CTCA	2	8	53621	53628	25 %	25 %	0 %	50 %	386854334
121	NC_017771	GAGC	2	8	53640	53647	25 %	0 %	50 %	25 %	386854334
122	NC_017771	GGCG	2	8	53757	53764	0 %	0 %	75 %	25 %	386854334
123	NC_017771	TCCT	2	8	54250	54257	0 %	50 %	0 %	50 %	386854336
124	NC_017771	CAAC	2	8	54475	54482	50 %	0 %	0 %	50 %	386854337
125	NC_017771	CTTT	2	8	54827	54834	0 %	75 %	0 %	25 %	386854337
126	NC_017771	TTCC	2	8	54856	54863	0 %	50 %	0 %	50 %	386854337
127	NC_017771	ACGA	2	8	55213	55220	50 %	0 %	25 %	25 %	386854337
128	NC_017771	CCCT	2	8	56517	56524	0 %	25 %	0 %	75 %	386854338
129	NC_017771	CATT	2	8	57432	57439	25 %	50 %	0 %	25 %	386854339
130	NC_017771	TCCG	2	8	57571	57578	0 %	25 %	25 %	50 %	386854339
131	NC_017771	TCCC	2	8	57660	57667	0 %	25 %	0 %	75 %	386854339
132	NC_017771	ATAG	2	8	57865	57872	50 %	25 %	25 %	0 %	386854339
133	NC_017771	CCTT	2	8	58012	58019	0 %	50 %	0 %	50 %	386854339
134	NC_017771	CTCA	2	8	58816	58823	25 %	25 %	0 %	50 %	386854340
135	NC_017771	CCGG	2	8	59803	59810	0 %	0 %	50 %	50 %	386854341
136	NC_017771	CCTG	2	8	61358	61365	0 %	25 %	25 %	50 %	386854344
137	NC_017771	TCAG	2	8	62076	62083	25 %	25 %	25 %	25 %	386854345
138	NC_017771	CTGG	2	8	62381	62388	0 %	25 %	50 %	25 %	386854345
139	NC_017771	AGTC	2	8	62554	62561	25 %	25 %	25 %	25 %	386854346
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439	NC_017771	AGGC	2	8	229655	229662	25 %	0 %	50 %	25 %	386854556
440	NC_017771	GCCA	2	8	230395	230402	25 %	0 %	25 %	50 %	386854557

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.