MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Solitalea canadensis DSM 3403 chromosome

Total Repeats: 268

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017770	CATAAT	2	12	1761	1772	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017770	AAAAGG	2	12	7472	7483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017770	AAGCGA	2	12	10304	10315	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017770	AAAAGG	2	12	38388	38399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017770	AAGCGA	2	12	41220	41231	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017770	GGAACA	2	12	43715	43726	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017770	ATTTGA	2	12	46410	46421	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017770	GTTGAA	2	12	48313	48324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017770	TTGCAA	2	12	51712	51723	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017770	ATTAAT	2	12	168568	168579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017770	AGTTTG	2	12	216563	216574	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017770	TTTCTT	2	12	217193	217204	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017770	ATTTGA	2	12	235611	235622	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017770	CTTACA	2	12	235958	235969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017770	TTTTCA	2	12	253360	253371	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017770	GCTGTT	2	12	253545	253556	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017770	TAAAAG	2	12	267927	267938	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017770	CAACCC	2	12	307906	307917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_017770	TAACGA	2	12	313471	313482	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017770	AAATAG	2	12	323460	323471	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017770	ATTTTA	2	12	342898	342909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017770	ATGATA	2	12	352490	352501	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017770	AACAAA	2	12	370277	370288	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017770	TTTCAA	2	12	388524	388535	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017770	ACAAAC	2	12	393073	393084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017770	TTAGTT	2	12	433235	433246	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017770	ACTATC	2	12	438712	438723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017770	ATTATA	2	12	457577	457588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017770	ATTCTT	2	12	497604	497615	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017770	TCAAAG	2	12	513908	513919	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017770	GTTATT	2	12	538350	538361	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017770	TTTTAA	2	12	625989	626000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017770	GCTTGC	2	12	641140	641151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017770	TAGATT	2	12	647628	647639	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017770	AGCAGG	2	12	698580	698591	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017770	AAGCGA	2	12	739192	739203	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017770	AAAGAA	2	12	798899	798910	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017770	AGCAAA	2	12	811488	811499	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017770	TTTCTA	2	12	813564	813575	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017770	CAAAAA	2	12	830523	830534	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017770	CTTAAT	2	12	914114	914125	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017770	TTAAAA	2	12	914395	914406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017770	AATTGA	2	12	932753	932764	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017770	AACTTG	2	12	1001651	1001662	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017770	ATTGCA	2	12	1046847	1046858	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017770	ATTTTT	2	12	1097048	1097059	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017770	CTCCGG	2	12	1109506	1109517	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017770	AAATAT	2	12	1110847	1110858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017770	AACAAT	2	12	1150160	1150171	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017770	GGGTTA	2	12	1161336	1161347	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017770	ATCTTA	2	12	1166837	1166848	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017770	TTTGTC	2	12	1179317	1179328	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017770	AGCATT	2	12	1183880	1183891	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017770	TCGGAT	2	12	1184129	1184140	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017770	AAAATC	2	12	1201581	1201592	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017770	TTAGTT	2	12	1210838	1210849	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017770	TGTTTT	2	12	1218246	1218257	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017770	TGCATT	2	12	1239185	1239196	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017770	AAAAAC	2	12	1240739	1240750	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017770	TCAGCT	2	12	1274577	1274588	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017770	GATGTT	2	12	1279786	1279797	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017770	CTTTAA	2	12	1280306	1280317	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017770	TAAATA	2	12	1302903	1302914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017770	AGTTTA	2	12	1306407	1306418	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017770	TTTAGT	2	12	1306739	1306750	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017770	TGAAAT	2	12	1311623	1311634	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017770	TTTTAA	2	12	1360829	1360840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017770	TAATTT	2	12	1370841	1370852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017770	AATAAA	2	12	1372914	1372925	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017770	CAAAGT	2	12	1392081	1392092	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017770	AAGCGA	2	12	1466725	1466736	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017770	CATTTA	2	12	1469377	1469388	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017770	GAAATG	2	12	1494375	1494386	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017770	GAGAAA	2	12	1506730	1506741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017770	GTATTT	2	12	1506934	1506945	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017770	CTCAGA	2	12	1516667	1516678	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017770	TGTAAT	2	12	1540531	1540542	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017770	CAAAAT	2	12	1573393	1573404	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017770	AAAATA	2	12	1593804	1593815	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017770	TGTTGG	2	12	1601686	1601697	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017770	ATTAGT	2	12	1617860	1617871	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017770	TGTAAA	2	12	1646985	1646996	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017770	TAAAAT	2	12	1653701	1653712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017770	TATTAA	2	12	1667140	1667151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017770	TCAATT	2	12	1696773	1696784	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_017770	ATTTAA	2	12	1703956	1703967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017770	CACAAA	2	12	1705756	1705767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017770	CCAATG	2	12	1706315	1706326	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017770	GGAACA	2	12	1751265	1751276	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_017770	ACTTGC	2	12	1785214	1785225	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017770	AAAATA	2	12	1790352	1790363	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017770	ATATTT	2	12	1814334	1814345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017770	TTTAAA	2	12	1825092	1825103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017770	ACTACA	2	12	1862355	1862366	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017770	AGCATT	2	12	1870568	1870579	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_017770	AAAGTA	2	12	1872578	1872589	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017770	AGCATT	2	12	1876975	1876986	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_017770	ACTATT	2	12	1892706	1892717	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_017770	CTAATG	2	12	1893026	1893037	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_017770	ATAAGT	2	12	1907927	1907938	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017770	TATATT	2	12	1928484	1928495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017770	TAGAGT	2	12	1980600	1980611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017770	AAAAAC	2	12	2034933	2034944	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_017770	CAAAGA	2	12	2044875	2044886	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_017770	AAAAAC	2	12	2046706	2046717	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_017770	TAAAAA	2	12	2084861	2084872	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017770	GTTTTA	2	12	2085136	2085147	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017770	TTTATT	2	12	2097306	2097317	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017770	AAAAGA	2	12	2099047	2099058	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017770	TTTTCC	2	12	2102702	2102713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017770	TATTTT	2	12	2106486	2106497	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017770	ATCATT	2	12	2111247	2111258	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_017770	TTTCTA	2	12	2146132	2146143	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_017770	CTTTTA	2	12	2157332	2157343	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_017770	TTATAA	2	12	2183469	2183480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017770	TTAATT	2	12	2184868	2184879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017770	AGTAAT	2	12	2223483	2223494	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017770	TTGAGA	2	12	2228168	2228179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017770	TGTTTG	2	12	2236411	2236422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017770	AATTAA	2	12	2294105	2294116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017770	AGTTAT	2	12	2314239	2314250	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017770	TCACTA	2	12	2317943	2317954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017770	TATAAA	2	12	2321377	2321388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017770	CAATTA	2	12	2337850	2337861	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_017770	CTTTTA	2	12	2392253	2392264	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_017770	ATTAAG	2	12	2446513	2446524	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017770	AGATTT	2	12	2467960	2467971	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.