MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus mutans LJ23

Total Repeats: 134

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017768	TTTTGT	2	12	1	12	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017768	GGAATA	2	12	14696	14707	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017768	TTACGT	2	12	19443	19454	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017768	TTTTAG	2	12	42525	42536	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017768	TGGATT	2	12	67910	67921	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017768	AATAAG	2	12	88582	88593	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017768	ACACTT	2	12	98124	98135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017768	ATGAGA	2	12	127553	127564	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017768	TCTTTT	2	12	150358	150369	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017768	ATCGTT	2	12	155991	156002	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017768	TTTAAG	2	12	226612	226623	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017768	TTACGT	2	12	229508	229519	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017768	CTTACT	2	12	237045	237056	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017768	TAATGC	2	12	308280	308291	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017768	TATTTT	2	12	310852	310863	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017768	AGTAAA	2	12	312372	312383	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017768	TGCCTA	2	12	317935	317946	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017768	TTTGAT	2	12	324737	324748	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017768	TAAGAA	2	12	340688	340699	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017768	ATTCAA	2	12	361322	361333	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017768	AATAGA	2	12	387478	387489	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017768	TTACGT	2	12	405292	405303	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017768	ATTGAA	2	12	431234	431245	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017768	GGCTGA	2	12	431592	431603	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017768	TTACGT	2	12	435291	435302	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017768	TATTTT	2	12	441220	441231	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017768	CGTAGA	2	12	460901	460912	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017768	GAAATT	2	12	482689	482700	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017768	GAAAGT	2	12	486930	486941	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017768	CTTTTT	2	12	487358	487369	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017768	TAAAAA	2	12	531689	531700	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017768	AAAAAT	2	12	539702	539713	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017768	AAAAAG	2	12	541158	541169	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017768	TGTAAA	2	12	542882	542893	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017768	TTGATT	2	12	556684	556695	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017768	TTTTCT	2	12	565003	565014	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017768	TTATTG	2	12	580625	580636	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017768	GTGATT	2	12	603771	603782	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017768	TCTTTT	2	12	607853	607864	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017768	ATGGCA	2	12	616547	616558	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017768	AAAACG	2	12	666169	666180	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017768	TATAAA	2	12	697432	697443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017768	TAGATT	2	12	700641	700652	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017768	AATTTT	2	12	703840	703851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017768	TTTTAA	2	12	746654	746665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017768	TTATAA	2	12	749382	749393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017768	TAAAGA	2	12	772277	772288	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017768	GCTTTA	2	12	772289	772300	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017768	TAACAA	2	12	781990	782001	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017768	ATATGG	2	12	783256	783267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017768	ATGAAT	2	12	793425	793436	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017768	CTTTCA	2	12	804586	804597	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017768	TGAAAG	2	12	804611	804622	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017768	TAGAAA	2	12	842188	842199	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017768	TTCGGG	2	12	896417	896428	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017768	TTTAAG	2	12	908142	908153	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017768	TTTTTA	2	12	908180	908191	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017768	TTATCT	2	12	976996	977007	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017768	TAATTT	2	12	991528	991539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017768	ATTTTA	2	12	1014133	1014144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017768	AAGGTG	2	12	1019723	1019734	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017768	CATGTA	2	12	1021238	1021249	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017768	TGATTA	2	12	1027362	1027373	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017768	TGGTTC	2	12	1056175	1056186	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017768	GACTGT	2	12	1056248	1056259	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017768	AGTTAG	2	12	1081508	1081519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017768	TAAAAA	2	12	1086223	1086234	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017768	AATAGT	2	12	1099469	1099480	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017768	ATCTAC	2	12	1104925	1104936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017768	AGTGAA	2	12	1105773	1105784	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017768	CATCTC	2	12	1137899	1137910	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017768	AGTTAT	2	12	1186218	1186229	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017768	ATAACT	2	12	1209202	1209213	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_017768	ATTAAT	2	12	1209448	1209459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017768	AACAAA	2	12	1269398	1269409	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017768	AAAATT	2	12	1289807	1289818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017768	GCCTTA	2	12	1293442	1293453	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017768	GAAGAC	2	12	1307934	1307945	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017768	AAAATC	2	12	1309667	1309678	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017768	AAAAGA	2	12	1323430	1323441	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017768	CATTCT	2	12	1326732	1326743	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017768	GTAACC	2	12	1327385	1327396	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017768	GGACTT	2	12	1337836	1337847	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017768	AAATCA	2	12	1345845	1345856	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017768	AAAAGA	2	12	1348603	1348614	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017768	ATTGTT	2	12	1390547	1390558	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017768	AAAATT	2	12	1391819	1391830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017768	TGATAA	2	12	1407150	1407161	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017768	TATAAA	2	12	1412858	1412869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017768	AAAAAT	2	12	1426629	1426640	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017768	AAAAAG	2	12	1431587	1431598	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017768	CGATCT	2	12	1449095	1449106	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017768	AAAGAA	2	12	1449228	1449239	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017768	ACCTTC	2	12	1450957	1450968	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017768	TCGTTA	2	12	1477250	1477261	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_017768	AAAATT	2	12	1512186	1512197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017768	CTATTA	2	12	1521678	1521689	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_017768	TATAGT	2	12	1538438	1538449	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017768	AAATGT	2	12	1539361	1539372	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017768	AAAATT	2	12	1540993	1541004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017768	TATCAG	2	12	1551496	1551507	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_017768	AGAAAA	2	12	1568353	1568364	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017768	TAAAGA	2	12	1587175	1587186	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017768	GTTTCT	2	12	1595876	1595887	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_017768	GCAAAG	2	12	1609816	1609827	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_017768	TAAAAG	2	12	1615425	1615436	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017768	GAATTA	2	12	1629624	1629635	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017768	AAAAAT	2	12	1638290	1638301	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017768	AAATTA	2	12	1655843	1655854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017768	AGAATG	2	12	1676950	1676961	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017768	CTAAGC	2	12	1694587	1694598	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017768	TAGTAA	2	12	1695397	1695408	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017768	TATTTA	2	12	1705644	1705655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017768	ATTTCA	2	12	1710669	1710680	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_017768	TGAAAA	2	12	1720990	1721001	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017768	TGACTT	2	12	1730187	1730198	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_017768	AAAATT	2	12	1741814	1741825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017768	AAATCG	2	12	1796313	1796324	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_017768	CCTTTA	2	12	1805055	1805066	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017768	GATGTA	2	12	1829645	1829656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017768	CCCGAA	2	12	1833983	1833994	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017768	ACGTAA	2	12	1837241	1837252	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_017768	AAAAGA	2	12	1876566	1876577	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017768	GCTTTT	2	12	1891679	1891690	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_017768	CTCCTG	2	12	1908534	1908545	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017768	GTCTTT	2	12	1909039	1909050	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_017768	AAAAAG	2	12	1919329	1919340	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.