MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis 5008 plasmid pSHJG1

Total Repeats: 151

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017766	AGCTCA	2	12	1183	1194	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386835837
2	NC_017766	CGGAGG	2	12	1402	1413	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386835837
3	NC_017766	CGAGGA	2	12	2003	2014	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386835837
4	NC_017766	TCACCC	2	12	2692	2703	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	386835837
5	NC_017766	GACGCC	2	12	4442	4453	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386835841
6	NC_017766	GCCTTC	2	12	5228	5239	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386835842
7	NC_017766	AGCGCG	2	12	5417	5428	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386835842
8	NC_017766	CAGGAC	2	12	5515	5526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835842
9	NC_017766	TCGATC	2	12	5720	5731	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386835842
10	NC_017766	GGGGTG	2	12	6188	6199	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	386835842
11	NC_017766	GATGCT	2	12	8866	8877	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386835845
12	NC_017766	GGCCGG	2	12	11390	11401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835849
13	NC_017766	CGGGGC	2	12	11405	11416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835849
14	NC_017766	TGACGC	2	12	12228	12239	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386835851
15	NC_017766	CTACGC	2	12	13755	13766	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386835851
16	NC_017766	CGCTCA	2	12	14156	14167	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017766	ACGCTC	2	12	15792	15803	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386835854
18	NC_017766	GTCCAG	2	12	16519	16530	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017766	CGTCGG	2	12	21105	21116	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017766	GTGATG	2	12	31049	31060	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386835877
21	NC_017766	GGGCGC	2	12	31701	31712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017766	CGTCGA	2	12	32486	32497	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017766	AGGGGC	2	12	32648	32659	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017766	CGTCGA	2	12	33143	33154	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386835880
25	NC_017766	CGACCA	2	12	34548	34559	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017766	GTCGGC	2	12	34919	34930	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386835883
27	NC_017766	GGCGTC	2	12	35912	35923	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386835884
28	NC_017766	GCCGGT	2	12	39765	39776	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386835888
29	NC_017766	CCCGCG	2	12	40516	40527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835889
30	NC_017766	GCCGGT	2	12	40971	40982	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017766	CGCTTT	2	12	42286	42297	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386835891
32	NC_017766	GCCTTG	2	12	44610	44621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835893
33	NC_017766	GCAGCC	2	12	47604	47615	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386835896
34	NC_017766	GCACCG	2	12	48102	48113	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386835896
35	NC_017766	CCGCCA	2	12	48879	48890	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386835896
36	NC_017766	CCCGCG	2	12	50731	50742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_017766	CCCGCG	2	12	50792	50803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_017766	CCCGCG	2	12	50853	50864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_017766	CCCGCG	2	12	50914	50925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_017766	CCCGCG	2	12	50975	50986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_017766	CCCGCG	2	12	51036	51047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_017766	CCCGCG	2	12	51097	51108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_017766	CCCGCG	2	12	51158	51169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_017766	CCCGCG	2	12	51219	51230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_017766	ACCTTG	2	12	51546	51557	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386835897
46	NC_017766	CCCGCG	2	12	52464	52475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_017766	CCCGCG	2	12	55692	55703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_017766	CCCGCG	2	12	55977	55988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_017766	CCCGCG	2	12	56038	56049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_017766	CCCGCG	2	12	56099	56110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_017766	CCCGCG	2	12	56160	56171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_017766	CCCGCG	2	12	56221	56232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_017766	CCCGCG	2	12	56282	56293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_017766	CCCGCG	2	12	56342	56353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_017766	CCCGCG	2	12	56403	56414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_017766	CCCGCG	2	12	56464	56475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_017766	CCCGCG	2	12	56525	56536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_017766	CCCGCG	2	12	56586	56597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_017766	CCCGCG	2	12	56647	56658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_017766	CCCGCG	2	12	56708	56719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_017766	CCCGCG	2	12	57054	57065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_017766	CCCGCG	2	12	57115	57126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_017766	CCCGCG	2	12	57176	57187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_017766	CCCGCG	2	12	57237	57248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835902
65	NC_017766	CCCGCG	2	12	57299	57310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835902
66	NC_017766	CCCGCG	2	12	57360	57371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835902
67	NC_017766	CCCGCG	2	12	57421	57432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835902
68	NC_017766	CCCGCG	2	12	57543	57554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835902
69	NC_017766	CCGAGC	2	12	58870	58881	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017766	GCGCTC	2	12	59691	59702	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386835903
71	NC_017766	AGGTGA	2	12	60544	60555	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386835903
72	NC_017766	CAGCAC	2	12	61368	61379	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386835903
73	NC_017766	AGGTCG	2	12	64857	64868	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386835908
74	NC_017766	CCGCGC	2	12	67963	67974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835912
75	NC_017766	GCGGCC	2	12	69633	69644	0 %	0 %	50 %	50 %	386835915
76	NC_017766	CCCGGC	2	12	70340	70351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835918
77	NC_017766	GAGCCT	2	12	70367	70378	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386835918
78	NC_017766	ACGCGG	2	12	70984	70995	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386835918
79	NC_017766	GCCCGC	2	12	71325	71336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835918
80	NC_017766	GCACGG	2	12	72151	72162	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386835918
81	NC_017766	GGTCGC	2	12	75319	75330	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386835921
82	NC_017766	GACGGC	2	12	78093	78104	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386835923
83	NC_017766	CACCCC	2	12	78240	78251	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
84	NC_017766	GGACCA	2	12	80297	80308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835927
85	NC_017766	GTCGAC	2	12	80316	80327	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386835927
86	NC_017766	CAAGCA	2	12	82472	82483	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386835930
87	NC_017766	ACCGCC	2	12	84178	84189	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386835930
88	NC_017766	CGAAGC	2	12	88786	88797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017766	GCCCCG	2	12	95190	95201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835943
90	NC_017766	CGGCCG	3	18	95743	95760	0 %	0 %	50 %	50 %	386835944
91	NC_017766	TGGCGG	2	12	96934	96945	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386835946
92	NC_017766	GACCAG	2	12	98377	98388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835949
93	NC_017766	GCTGCC	2	12	99813	99824	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386835952
94	NC_017766	AAGGCC	2	12	101020	101031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835955
95	NC_017766	CCCGCC	2	12	101119	101130	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	386835955
96	NC_017766	GACACA	2	12	101607	101618	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386835956
97	NC_017766	GCATCC	2	12	101713	101724	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386835956
98	NC_017766	ACCTGC	2	12	102377	102388	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017766	CTGCCC	2	12	102978	102989	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386835958
100	NC_017766	CCTGCC	2	12	104063	104074	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386835960
101	NC_017766	GGCGTT	2	12	108387	108398	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386835965
102	NC_017766	TGTCGC	2	12	108752	108763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835965
103	NC_017766	GCGCAG	2	12	108834	108845	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386835965
104	NC_017766	GTAGGT	2	12	109005	109016	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386835965
105	NC_017766	GCCGGT	2	12	109905	109916	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386835965
106	NC_017766	AGTCGT	2	12	110927	110938	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386835965
107	NC_017766	CCACTG	2	12	111500	111511	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386835965
108	NC_017766	AGGAGA	2	12	111998	112009	50 %	0 %	50 %	0 %	386835965
109	NC_017766	GTAGTT	2	12	112734	112745	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386835965
110	NC_017766	TCGGTG	2	12	113200	113211	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386835965
111	NC_017766	TCACCC	2	12	113719	113730	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	386835965
112	NC_017766	GACGCC	2	12	114100	114111	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386835965
113	NC_017766	CGGCGT	2	12	115393	115404	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386835966
114	NC_017766	GGGTGA	2	12	115775	115786	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	386835966
115	NC_017766	CACCGA	2	12	116294	116305	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386835966
116	NC_017766	AACTAC	2	12	116760	116771	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386835966
117	NC_017766	TCTCCT	2	12	117496	117507	0 %	50 %	0 %	50 %	386835966
118	NC_017766	GCAGTG	2	12	117993	118004	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386835966
119	NC_017766	TACGAC	2	12	118566	118577	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386835966
120	NC_017766	CACCGG	2	12	119588	119599	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386835966
121	NC_017766	CCTGCG	2	12	120659	120670	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386835966
122	NC_017766	CGGCAG	2	12	120689	120700	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386835966
123	NC_017766	CGACAG	2	12	120737	120748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835966
124	NC_017766	CAACGC	2	12	121106	121117	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386835966
125	NC_017766	GGCGTC	2	12	122098	122109	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386835967
126	NC_017766	GCGGTC	2	12	125353	125364	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017766	CAGTGG	2	12	125739	125750	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386835971
128	NC_017766	CCCGCG	2	12	125751	125762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835971
129	NC_017766	GCACCG	2	12	126517	126528	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386835971
130	NC_017766	GCCAGC	2	12	127300	127311	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017766	GAAGCC	2	12	128132	128143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017766	GCCGTG	2	12	129315	129326	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017766	TGGGCG	2	12	132905	132916	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386835979
134	NC_017766	GGGAGT	2	12	133901	133912	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017766	CGAAGC	2	12	134916	134927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835983
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151	NC_017766	GGAGCG	2	12	164488	164499	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.