MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis 5008 plasmid pSHJG1

Total Repeats: 162

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017766	GACGC	2	10	20	29	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_017766	GCAGC	2	10	1901	1910	20 %	0 %	40 %	40 %	386835837
3	NC_017766	CCGGG	2	10	2714	2723	0 %	0 %	60 %	40 %	386835837
4	NC_017766	GGGAC	2	10	2801	2810	20 %	0 %	60 %	20 %	386835837
5	NC_017766	ACCCC	2	10	3196	3205	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
6	NC_017766	CGGGC	2	10	3425	3434	0 %	0 %	60 %	40 %	386835838
7	NC_017766	GGACG	2	10	4621	4630	20 %	0 %	60 %	20 %	386835841
8	NC_017766	CGGCT	2	10	4769	4778	0 %	20 %	40 %	40 %	386835841
9	NC_017766	GCCGG	2	10	4821	4830	0 %	0 %	60 %	40 %	386835841
10	NC_017766	GGCCG	2	10	5200	5209	0 %	0 %	60 %	40 %	386835842
11	NC_017766	GTGTG	2	10	7075	7084	0 %	40 %	60 %	0 %	386835844
12	NC_017766	GCCTG	2	10	7690	7699	0 %	20 %	40 %	40 %	386835844
13	NC_017766	GCCCG	2	10	8377	8386	0 %	0 %	40 %	60 %	386835844
14	NC_017766	GCGGG	2	10	9752	9761	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017766	CACGG	2	10	10956	10965	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_017766	CGCAG	2	10	11207	11216	20 %	0 %	40 %	40 %	386835848
17	NC_017766	GACCG	2	10	11232	11241	20 %	0 %	40 %	40 %	386835848
18	NC_017766	CGGGC	2	10	11323	11332	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
19	NC_017766	CGGCC	2	10	11906	11915	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
20	NC_017766	CACCG	2	10	11953	11962	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
21	NC_017766	GTGGA	2	10	12814	12823	20 %	20 %	60 %	0 %	386835851
22	NC_017766	CGTTG	2	10	14676	14685	0 %	40 %	40 %	20 %	386835852
23	NC_017766	ACCTG	2	10	15991	16000	20 %	20 %	20 %	40 %	386835855
24	NC_017766	GAGCT	2	10	16702	16711	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017766	AGCTG	2	10	18169	18178	20 %	20 %	40 %	20 %	386835857
26	NC_017766	TAAGC	2	10	18186	18195	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017766	GTGGG	2	10	18292	18301	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017766	GGGGC	2	10	19089	19098	0 %	0 %	80 %	20 %	386835859
29	NC_017766	GCCGC	2	10	21607	21616	0 %	0 %	40 %	60 %	386835864
30	NC_017766	GGACC	2	10	22318	22327	20 %	0 %	40 %	40 %	386835866
31	NC_017766	GCACC	2	10	22998	23007	20 %	0 %	20 %	60 %	386835866
32	NC_017766	CACCG	2	10	23762	23771	20 %	0 %	20 %	60 %	386835867
33	NC_017766	CGGGT	2	10	24350	24359	0 %	20 %	60 %	20 %	386835868
34	NC_017766	TCCGC	2	10	24368	24377	0 %	20 %	20 %	60 %	386835868
35	NC_017766	CGTGG	2	10	24404	24413	0 %	20 %	60 %	20 %	386835868
36	NC_017766	GCCGC	2	10	24828	24837	0 %	0 %	40 %	60 %	386835869
37	NC_017766	GGCCG	2	10	25456	25465	0 %	0 %	60 %	40 %	386835870
38	NC_017766	GCCGG	2	10	26602	26611	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
39	NC_017766	CCGTG	2	10	29449	29458	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
40	NC_017766	GCGGG	2	10	30573	30582	0 %	0 %	80 %	20 %	386835876
41	NC_017766	TCGTG	2	10	31860	31869	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017766	GTCCA	2	10	32401	32410	20 %	20 %	20 %	40 %	386835878
43	NC_017766	CGGGG	2	10	33413	33422	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
44	NC_017766	CCTGG	2	10	33792	33801	0 %	20 %	40 %	40 %	386835881
45	NC_017766	GCGCG	2	10	34762	34771	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
46	NC_017766	CGAGG	2	10	36664	36673	20 %	0 %	60 %	20 %	386835887
47	NC_017766	CCTCG	2	10	37942	37951	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
48	NC_017766	CTGGC	2	10	38362	38371	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
49	NC_017766	TCCGC	2	10	39569	39578	0 %	20 %	20 %	60 %	386835888
50	NC_017766	AGCAG	2	10	40170	40179	40 %	0 %	40 %	20 %	386835888
51	NC_017766	CGGCG	2	10	40445	40454	0 %	0 %	60 %	40 %	386835889
52	NC_017766	GGGCT	2	10	41601	41610	0 %	20 %	60 %	20 %	386835890
53	NC_017766	GGCCG	2	10	43847	43856	0 %	0 %	60 %	40 %	386835893
54	NC_017766	GCCGC	2	10	46334	46343	0 %	0 %	40 %	60 %	386835895
55	NC_017766	AGGCC	2	10	46388	46397	20 %	0 %	40 %	40 %	386835895
56	NC_017766	ACGCC	2	10	47925	47934	20 %	0 %	20 %	60 %	386835896
57	NC_017766	GCACC	2	10	48585	48594	20 %	0 %	20 %	60 %	386835896
58	NC_017766	TCCCC	2	10	49326	49335	0 %	20 %	0 %	80 %	386835896
59	NC_017766	CGACA	2	10	50264	50273	40 %	0 %	20 %	40 %	386835896
60	NC_017766	CACCC	2	10	51365	51374	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
61	NC_017766	GTCCA	2	10	52064	52073	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
62	NC_017766	GGTGC	2	10	52742	52751	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017766	GATGG	2	10	52839	52848	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017766	CCTGC	2	10	58640	58649	0 %	20 %	20 %	60 %	386835902
65	NC_017766	ACACC	2	10	61238	61247	40 %	0 %	0 %	60 %	386835903
66	NC_017766	CCGGC	2	10	63750	63759	0 %	0 %	40 %	60 %	386835906
67	NC_017766	GCCGG	2	10	64518	64527	0 %	0 %	60 %	40 %	386835907
68	NC_017766	TCCGC	2	10	66181	66190	0 %	20 %	20 %	60 %	386835909
69	NC_017766	GCCCC	2	10	67949	67958	0 %	0 %	20 %	80 %	386835912
70	NC_017766	GCGCC	2	10	69224	69233	0 %	0 %	40 %	60 %	386835914
71	NC_017766	CCCCG	2	10	70199	70208	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
72	NC_017766	CGTCC	2	10	70294	70303	0 %	20 %	20 %	60 %	386835918
73	NC_017766	CGACG	2	10	71744	71753	20 %	0 %	40 %	40 %	386835918
74	NC_017766	ACCTG	2	10	72460	72469	20 %	20 %	20 %	40 %	386835918
75	NC_017766	CGCGG	2	10	73966	73975	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
76	NC_017766	GACCC	2	10	77481	77490	20 %	0 %	20 %	60 %	386835923
77	NC_017766	TCCCC	2	10	77789	77798	0 %	20 %	0 %	80 %	386835923
78	NC_017766	CCGCG	2	10	78135	78144	0 %	0 %	40 %	60 %	386835923
79	NC_017766	GCGCC	2	10	78436	78445	0 %	0 %	40 %	60 %	386835924
80	NC_017766	ACCCC	2	10	78530	78539	20 %	0 %	0 %	80 %	386835924
81	NC_017766	CCGGA	2	10	80620	80629	20 %	0 %	40 %	40 %	386835928
82	NC_017766	CTGGC	2	10	80788	80797	0 %	20 %	40 %	40 %	386835928
83	NC_017766	TCTGG	2	10	83579	83588	0 %	40 %	40 %	20 %	386835930
84	NC_017766	GCCAG	2	10	84557	84566	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
85	NC_017766	CCGTG	2	10	87091	87100	0 %	20 %	40 %	40 %	386835931
86	NC_017766	CGAGC	2	10	87514	87523	20 %	0 %	40 %	40 %	386835932
87	NC_017766	CCCGG	2	10	88193	88202	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
88	NC_017766	ACCTC	2	10	90540	90549	20 %	20 %	0 %	60 %	386835938
89	NC_017766	CGACC	2	10	95357	95366	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
90	NC_017766	CGGCA	2	10	96613	96622	20 %	0 %	40 %	40 %	386835946
91	NC_017766	CTGCC	2	10	97069	97078	0 %	20 %	20 %	60 %	386835946
92	NC_017766	GCCGC	2	10	97303	97312	0 %	0 %	40 %	60 %	386835947
93	NC_017766	GCCGC	2	10	98190	98199	0 %	0 %	40 %	60 %	386835948
94	NC_017766	GCGCC	2	10	98515	98524	0 %	0 %	40 %	60 %	386835950
95	NC_017766	ACGAG	2	10	98773	98782	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017766	GCGCC	2	10	100971	100980	0 %	0 %	40 %	60 %	386835955
97	NC_017766	ACGCC	2	10	101102	101111	20 %	0 %	20 %	60 %	386835955
98	NC_017766	CTCGG	2	10	101745	101754	0 %	20 %	40 %	40 %	386835956
99	NC_017766	GCGCC	2	10	102265	102274	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
100	NC_017766	GGCGC	2	10	102290	102299	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
101	NC_017766	ATCCG	2	10	102350	102359	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
102	NC_017766	ACCCG	2	10	103869	103878	20 %	0 %	20 %	60 %	386835960
103	NC_017766	GGTCA	2	10	106813	106822	20 %	20 %	40 %	20 %	386835963
104	NC_017766	ACGAG	2	10	107504	107513	40 %	0 %	40 %	20 %	386835964
105	NC_017766	CCAGT	2	10	114912	114921	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_017766	ACGAC	2	10	120055	120064	40 %	0 %	20 %	40 %	386835966
107	NC_017766	CCGCC	2	10	122052	122061	0 %	0 %	20 %	80 %	386835967
108	NC_017766	GAGCA	2	10	123366	123375	40 %	0 %	40 %	20 %	386835968
109	NC_017766	GGCCT	2	10	124147	124156	0 %	20 %	40 %	40 %	386835968
110	NC_017766	CTGGG	2	10	125549	125558	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
111	NC_017766	GCACG	2	10	128543	128552	20 %	0 %	40 %	40 %	386835973
112	NC_017766	GGATC	2	10	129599	129608	20 %	20 %	40 %	20 %	386835974
113	NC_017766	TCGAC	2	10	129628	129637	20 %	20 %	20 %	40 %	386835974
114	NC_017766	CCGGC	2	10	130709	130718	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
115	NC_017766	GTGGA	2	10	133110	133119	20 %	20 %	60 %	0 %	386835979
116	NC_017766	CGGGC	2	10	135483	135492	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
117	NC_017766	AGGCC	2	10	135698	135707	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
118	NC_017766	CAGCG	2	10	135903	135912	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
119	NC_017766	GGTGC	2	10	136533	136542	0 %	20 %	60 %	20 %	386835985
120	NC_017766	CTGCA	2	10	136555	136564	20 %	20 %	20 %	40 %	386835985
121	NC_017766	ACTCC	2	10	137612	137621	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
122	NC_017766	CGGTG	2	10	137629	137638	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017766	GGTGC	2	10	137673	137682	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
124	NC_017766	CACCG	2	10	137729	137738	20 %	0 %	20 %	60 %	386835987
125	NC_017766	TCCCG	2	10	137892	137901	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
126	NC_017766	GGTGG	2	10	137956	137965	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017766	GGCTG	2	10	138186	138195	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017766	CGCGG	2	10	138961	138970	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
129	NC_017766	GTGCG	2	10	139366	139375	0 %	20 %	60 %	20 %	386835989
130	NC_017766	CAGCA	2	10	139907	139916	40 %	0 %	20 %	40 %	386835990
131	NC_017766	AGCCG	2	10	139955	139964	20 %	0 %	40 %	40 %	386835990
132	NC_017766	CCGCC	2	10	141549	141558	0 %	0 %	20 %	80 %	386835992
133	NC_017766	ACCGG	2	10	141748	141757	20 %	0 %	40 %	40 %	386835992
134	NC_017766	GGTGA	2	10	142000	142009	20 %	20 %	60 %	0 %	386835993
135	NC_017766	CGGAC	2	10	142080	142089	20 %	0 %	40 %	40 %	386835993
136	NC_017766	GCTGC	2	10	143718	143727	0 %	20 %	40 %	40 %	386835995
137	NC_017766	TGCGG	2	10	143859	143868	0 %	20 %	60 %	20 %	386835996
138	NC_017766	CGGGG	2	10	145627	145636	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
139	NC_017766	CTCGT	2	10	145717	145726	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
140	NC_017766	GGCGC	2	10	145743	145752	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
141	NC_017766	GGCGC	2	10	146504	146513	0 %	0 %	60 %	40 %	386836000
142	NC_017766	GTGCG	2	10	148158	148167	0 %	20 %	60 %	20 %	386836002
143	NC_017766	TTGCC	2	10	150432	150441	0 %	40 %	20 %	40 %	386836006
144	NC_017766	GGGGA	2	10	150575	150584	20 %	0 %	80 %	0 %	386836006
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148	NC_017766	GGACC	2	10	152719	152728	20 %	0 %	40 %	40 %	386836009
149	NC_017766	CGCCC	2	10	153976	153985	0 %	0 %	20 %	80 %	386836012
150	NC_017766	GCACC	2	10	154099	154108	20 %	0 %	20 %	60 %	386836012
151	NC_017766	ACCGC	2	10	154365	154374	20 %	0 %	20 %	60 %	386836012
152	NC_017766	TCCCC	2	10	154836	154845	0 %	20 %	0 %	80 %	386836013
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154	NC_017766	GCGAG	2	10	155476	155485	20 %	0 %	60 %	20 %	386836015
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156	NC_017766	CGTCC	2	10	155798	155807	0 %	20 %	20 %	60 %	386836015
157	NC_017766	CGGAA	2	10	156172	156181	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
158	NC_017766	GCCCC	2	10	156515	156524	0 %	0 %	20 %	80 %	386836016
159	NC_017766	CCGGG	2	10	156998	157007	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
160	NC_017766	TTCCG	2	10	159371	159380	0 %	40 %	20 %	40 %	386836019
161	NC_017766	CCTGA	2	10	160137	160146	20 %	20 %	20 %	40 %	386836019
162	NC_017766	CTGGC	2	10	160719	160728	0 %	20 %	40 %	40 %	386836019

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.