MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis 5008 plasmid pSHJG1

Total Repeats: 114

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017766	GCAGC	2	10	1901	1910	20 %	0 %	40 %	40 %	386835837
2	NC_017766	CCGGG	2	10	2714	2723	0 %	0 %	60 %	40 %	386835837
3	NC_017766	GGGAC	2	10	2801	2810	20 %	0 %	60 %	20 %	386835837
4	NC_017766	CGGGC	2	10	3425	3434	0 %	0 %	60 %	40 %	386835838
5	NC_017766	GGACG	2	10	4621	4630	20 %	0 %	60 %	20 %	386835841
6	NC_017766	CGGCT	2	10	4769	4778	0 %	20 %	40 %	40 %	386835841
7	NC_017766	GCCGG	2	10	4821	4830	0 %	0 %	60 %	40 %	386835841
8	NC_017766	GGCCG	2	10	5200	5209	0 %	0 %	60 %	40 %	386835842
9	NC_017766	GTGTG	2	10	7075	7084	0 %	40 %	60 %	0 %	386835844
10	NC_017766	GCCTG	2	10	7690	7699	0 %	20 %	40 %	40 %	386835844
11	NC_017766	GCCCG	2	10	8377	8386	0 %	0 %	40 %	60 %	386835844
12	NC_017766	CGCAG	2	10	11207	11216	20 %	0 %	40 %	40 %	386835848
13	NC_017766	GACCG	2	10	11232	11241	20 %	0 %	40 %	40 %	386835848
14	NC_017766	GTGGA	2	10	12814	12823	20 %	20 %	60 %	0 %	386835851
15	NC_017766	CGTTG	2	10	14676	14685	0 %	40 %	40 %	20 %	386835852
16	NC_017766	ACCTG	2	10	15991	16000	20 %	20 %	20 %	40 %	386835855
17	NC_017766	AGCTG	2	10	18169	18178	20 %	20 %	40 %	20 %	386835857
18	NC_017766	GGGGC	2	10	19089	19098	0 %	0 %	80 %	20 %	386835859
19	NC_017766	GCCGC	2	10	21607	21616	0 %	0 %	40 %	60 %	386835864
20	NC_017766	GGACC	2	10	22318	22327	20 %	0 %	40 %	40 %	386835866
21	NC_017766	GCACC	2	10	22998	23007	20 %	0 %	20 %	60 %	386835866
22	NC_017766	CACCG	2	10	23762	23771	20 %	0 %	20 %	60 %	386835867
23	NC_017766	CGGGT	2	10	24350	24359	0 %	20 %	60 %	20 %	386835868
24	NC_017766	TCCGC	2	10	24368	24377	0 %	20 %	20 %	60 %	386835868
25	NC_017766	CGTGG	2	10	24404	24413	0 %	20 %	60 %	20 %	386835868
26	NC_017766	GCCGC	2	10	24828	24837	0 %	0 %	40 %	60 %	386835869
27	NC_017766	GGCCG	2	10	25456	25465	0 %	0 %	60 %	40 %	386835870
28	NC_017766	GCGGG	2	10	30573	30582	0 %	0 %	80 %	20 %	386835876
29	NC_017766	GTCCA	2	10	32401	32410	20 %	20 %	20 %	40 %	386835878
30	NC_017766	CCTGG	2	10	33792	33801	0 %	20 %	40 %	40 %	386835881
31	NC_017766	CGAGG	2	10	36664	36673	20 %	0 %	60 %	20 %	386835887
32	NC_017766	TCCGC	2	10	39569	39578	0 %	20 %	20 %	60 %	386835888
33	NC_017766	AGCAG	2	10	40170	40179	40 %	0 %	40 %	20 %	386835888
34	NC_017766	CGGCG	2	10	40445	40454	0 %	0 %	60 %	40 %	386835889
35	NC_017766	GGGCT	2	10	41601	41610	0 %	20 %	60 %	20 %	386835890
36	NC_017766	GGCCG	2	10	43847	43856	0 %	0 %	60 %	40 %	386835893
37	NC_017766	GCCGC	2	10	46334	46343	0 %	0 %	40 %	60 %	386835895
38	NC_017766	AGGCC	2	10	46388	46397	20 %	0 %	40 %	40 %	386835895
39	NC_017766	ACGCC	2	10	47925	47934	20 %	0 %	20 %	60 %	386835896
40	NC_017766	GCACC	2	10	48585	48594	20 %	0 %	20 %	60 %	386835896
41	NC_017766	TCCCC	2	10	49326	49335	0 %	20 %	0 %	80 %	386835896
42	NC_017766	CGACA	2	10	50264	50273	40 %	0 %	20 %	40 %	386835896
43	NC_017766	CCTGC	2	10	58640	58649	0 %	20 %	20 %	60 %	386835902
44	NC_017766	ACACC	2	10	61238	61247	40 %	0 %	0 %	60 %	386835903
45	NC_017766	CCGGC	2	10	63750	63759	0 %	0 %	40 %	60 %	386835906
46	NC_017766	GCCGG	2	10	64518	64527	0 %	0 %	60 %	40 %	386835907
47	NC_017766	TCCGC	2	10	66181	66190	0 %	20 %	20 %	60 %	386835909
48	NC_017766	GCCCC	2	10	67949	67958	0 %	0 %	20 %	80 %	386835912
49	NC_017766	GCGCC	2	10	69224	69233	0 %	0 %	40 %	60 %	386835914
50	NC_017766	CGTCC	2	10	70294	70303	0 %	20 %	20 %	60 %	386835918
51	NC_017766	CGACG	2	10	71744	71753	20 %	0 %	40 %	40 %	386835918
52	NC_017766	ACCTG	2	10	72460	72469	20 %	20 %	20 %	40 %	386835918
53	NC_017766	GACCC	2	10	77481	77490	20 %	0 %	20 %	60 %	386835923
54	NC_017766	TCCCC	2	10	77789	77798	0 %	20 %	0 %	80 %	386835923
55	NC_017766	CCGCG	2	10	78135	78144	0 %	0 %	40 %	60 %	386835923
56	NC_017766	GCGCC	2	10	78436	78445	0 %	0 %	40 %	60 %	386835924
57	NC_017766	ACCCC	2	10	78530	78539	20 %	0 %	0 %	80 %	386835924
58	NC_017766	CCGGA	2	10	80620	80629	20 %	0 %	40 %	40 %	386835928
59	NC_017766	CTGGC	2	10	80788	80797	0 %	20 %	40 %	40 %	386835928
60	NC_017766	TCTGG	2	10	83579	83588	0 %	40 %	40 %	20 %	386835930
61	NC_017766	CCGTG	2	10	87091	87100	0 %	20 %	40 %	40 %	386835931
62	NC_017766	CGAGC	2	10	87514	87523	20 %	0 %	40 %	40 %	386835932
63	NC_017766	ACCTC	2	10	90540	90549	20 %	20 %	0 %	60 %	386835938
64	NC_017766	CGGCA	2	10	96613	96622	20 %	0 %	40 %	40 %	386835946
65	NC_017766	CTGCC	2	10	97069	97078	0 %	20 %	20 %	60 %	386835946
66	NC_017766	GCCGC	2	10	97303	97312	0 %	0 %	40 %	60 %	386835947
67	NC_017766	GCCGC	2	10	98190	98199	0 %	0 %	40 %	60 %	386835948
68	NC_017766	GCGCC	2	10	98515	98524	0 %	0 %	40 %	60 %	386835950
69	NC_017766	GCGCC	2	10	100971	100980	0 %	0 %	40 %	60 %	386835955
70	NC_017766	ACGCC	2	10	101102	101111	20 %	0 %	20 %	60 %	386835955
71	NC_017766	CTCGG	2	10	101745	101754	0 %	20 %	40 %	40 %	386835956
72	NC_017766	ACCCG	2	10	103869	103878	20 %	0 %	20 %	60 %	386835960
73	NC_017766	GGTCA	2	10	106813	106822	20 %	20 %	40 %	20 %	386835963
74	NC_017766	ACGAG	2	10	107504	107513	40 %	0 %	40 %	20 %	386835964
75	NC_017766	ACGAC	2	10	120055	120064	40 %	0 %	20 %	40 %	386835966
76	NC_017766	CCGCC	2	10	122052	122061	0 %	0 %	20 %	80 %	386835967
77	NC_017766	GAGCA	2	10	123366	123375	40 %	0 %	40 %	20 %	386835968
78	NC_017766	GGCCT	2	10	124147	124156	0 %	20 %	40 %	40 %	386835968
79	NC_017766	GCACG	2	10	128543	128552	20 %	0 %	40 %	40 %	386835973
80	NC_017766	GGATC	2	10	129599	129608	20 %	20 %	40 %	20 %	386835974
81	NC_017766	TCGAC	2	10	129628	129637	20 %	20 %	20 %	40 %	386835974
82	NC_017766	GTGGA	2	10	133110	133119	20 %	20 %	60 %	0 %	386835979
83	NC_017766	GGTGC	2	10	136533	136542	0 %	20 %	60 %	20 %	386835985
84	NC_017766	CTGCA	2	10	136555	136564	20 %	20 %	20 %	40 %	386835985
85	NC_017766	CACCG	2	10	137729	137738	20 %	0 %	20 %	60 %	386835987
86	NC_017766	GTGCG	2	10	139366	139375	0 %	20 %	60 %	20 %	386835989
87	NC_017766	CAGCA	2	10	139907	139916	40 %	0 %	20 %	40 %	386835990
88	NC_017766	AGCCG	2	10	139955	139964	20 %	0 %	40 %	40 %	386835990
89	NC_017766	CCGCC	2	10	141549	141558	0 %	0 %	20 %	80 %	386835992
90	NC_017766	ACCGG	2	10	141748	141757	20 %	0 %	40 %	40 %	386835992
91	NC_017766	GGTGA	2	10	142000	142009	20 %	20 %	60 %	0 %	386835993
92	NC_017766	CGGAC	2	10	142080	142089	20 %	0 %	40 %	40 %	386835993
93	NC_017766	GCTGC	2	10	143718	143727	0 %	20 %	40 %	40 %	386835995
94	NC_017766	TGCGG	2	10	143859	143868	0 %	20 %	60 %	20 %	386835996
95	NC_017766	GGCGC	2	10	146504	146513	0 %	0 %	60 %	40 %	386836000
96	NC_017766	GTGCG	2	10	148158	148167	0 %	20 %	60 %	20 %	386836002
97	NC_017766	TTGCC	2	10	150432	150441	0 %	40 %	20 %	40 %	386836006
98	NC_017766	GGGGA	2	10	150575	150584	20 %	0 %	80 %	0 %	386836006
99	NC_017766	GCCGG	2	10	151539	151548	0 %	0 %	60 %	40 %	386836008
100	NC_017766	GGCCC	2	10	151899	151908	0 %	0 %	40 %	60 %	386836009
101	NC_017766	AGCGA	2	10	152018	152027	40 %	0 %	40 %	20 %	386836009
102	NC_017766	GGACC	2	10	152719	152728	20 %	0 %	40 %	40 %	386836009
103	NC_017766	CGCCC	2	10	153976	153985	0 %	0 %	20 %	80 %	386836012
104	NC_017766	GCACC	2	10	154099	154108	20 %	0 %	20 %	60 %	386836012
105	NC_017766	ACCGC	2	10	154365	154374	20 %	0 %	20 %	60 %	386836012
106	NC_017766	TCCCC	2	10	154836	154845	0 %	20 %	0 %	80 %	386836013
107	NC_017766	GGACC	2	10	155102	155111	20 %	0 %	40 %	40 %	386836014
108	NC_017766	GCGAG	2	10	155476	155485	20 %	0 %	60 %	20 %	386836015
109	NC_017766	AGCCG	2	10	155650	155659	20 %	0 %	40 %	40 %	386836015
110	NC_017766	CGTCC	2	10	155798	155807	0 %	20 %	20 %	60 %	386836015
111	NC_017766	GCCCC	2	10	156515	156524	0 %	0 %	20 %	80 %	386836016
112	NC_017766	TTCCG	2	10	159371	159380	0 %	40 %	20 %	40 %	386836019
113	NC_017766	CCTGA	2	10	160137	160146	20 %	20 %	20 %	40 %	386836019
114	NC_017766	CTGGC	2	10	160719	160728	0 %	20 %	40 %	40 %	386836019

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.