MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis 5008 plasmid pSHJG1

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017766	GC	3	6	1	6	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017766	CG	4	8	3155	3162	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017766	CG	3	6	3173	3178	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017766	GC	3	6	3718	3723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017766	TC	3	6	9051	9056	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017766	TG	4	8	14143	14150	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017766	CG	4	8	14246	14253	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017766	GT	3	6	15730	15735	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017766	GC	3	6	16883	16888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017766	AG	3	6	18274	18279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017766	CG	3	6	19132	19137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017766	CG	3	6	19218	19223	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017766	TG	3	6	20290	20295	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017766	GC	3	6	21212	21217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017766	TG	3	6	21300	21305	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017766	CG	4	8	23238	23245	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017766	GC	4	8	31953	31960	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017766	CG	3	6	32013	32018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017766	GC	3	6	32610	32615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017766	AC	3	6	33634	33639	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017766	GC	3	6	34376	34381	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017766	GC	3	6	35116	35121	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017766	AC	3	6	35248	35253	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017766	GC	3	6	36176	36181	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017766	GC	3	6	38134	38139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017766	CG	4	8	38401	38408	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017766	CG	3	6	40642	40647	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017766	CG	3	6	40703	40708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017766	CG	3	6	40764	40769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017766	CG	3	6	40825	40830	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017766	GT	3	6	41088	41093	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017766	CA	3	6	50939	50944	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017766	GC	3	6	51127	51132	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017766	CG	3	6	51465	51470	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017766	GC	3	6	52189	52194	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017766	GC	3	6	52320	52325	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017766	CG	3	6	52989	52994	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017766	CG	3	6	53050	53055	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017766	CG	3	6	53172	53177	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017766	GC	3	6	58990	58995	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017766	AC	3	6	61694	61699	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017766	CG	3	6	61732	61737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017766	CA	3	6	65954	65959	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017766	AC	3	6	67430	67435	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017766	CA	3	6	72484	72489	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017766	GC	3	6	73389	73394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017766	GA	3	6	73470	73475	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017766	GC	3	6	73949	73954	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017766	AC	3	6	78298	78303	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017766	CG	3	6	88693	88698	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017766	AG	3	6	92778	92783	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017766	CG	3	6	94768	94773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017766	AC	3	6	97510	97515	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017766	CG	3	6	103631	103636	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017766	GC	3	6	106404	106409	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017766	CT	3	6	124409	124414	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017766	GC	3	6	127776	127781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017766	TC	3	6	129150	129155	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017766	TC	3	6	133954	133959	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017766	CG	3	6	135470	135475	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017766	GC	3	6	135567	135572	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017766	CG	3	6	137236	137241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017766	CG	3	6	137699	137704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017766	GC	3	6	137873	137878	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017766	GC	3	6	138910	138915	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017766	CT	3	6	140644	140649	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017766	GT	3	6	143373	143378	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017766	CA	3	6	146387	146392	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017766	CT	3	6	148064	148069	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017766	CG	3	6	149513	149518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017766	TC	3	6	150742	150747	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017766	GC	3	6	152983	152988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017766	CG	3	6	154961	154966	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017766	GC	3	6	156936	156941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017766	GC	3	6	157198	157203	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017766	GC	4	8	164224	164231	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.