MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis 5008 plasmid pSHJG1

Total Repeats: 204

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017766	CG	3	6	698	703	0 %	0 %	50 %	50 %	386835837
2	NC_017766	CG	3	6	713	718	0 %	0 %	50 %	50 %	386835837
3	NC_017766	GT	3	6	1099	1104	0 %	50 %	50 %	0 %	386835837
4	NC_017766	GT	3	6	1236	1241	0 %	50 %	50 %	0 %	386835837
5	NC_017766	GC	3	6	2528	2533	0 %	0 %	50 %	50 %	386835837
6	NC_017766	GC	3	6	2567	2572	0 %	0 %	50 %	50 %	386835837
7	NC_017766	AG	3	6	2612	2617	50 %	0 %	50 %	0 %	386835837
8	NC_017766	GC	3	6	2924	2929	0 %	0 %	50 %	50 %	386835837
9	NC_017766	GC	4	8	3433	3440	0 %	0 %	50 %	50 %	386835838
10	NC_017766	GC	3	6	3778	3783	0 %	0 %	50 %	50 %	386835839
11	NC_017766	GT	3	6	4239	4244	0 %	50 %	50 %	0 %	386835841
12	NC_017766	GC	3	6	4912	4917	0 %	0 %	50 %	50 %	386835841
13	NC_017766	TG	3	6	6165	6170	0 %	50 %	50 %	0 %	386835842
14	NC_017766	GC	3	6	6263	6268	0 %	0 %	50 %	50 %	386835842
15	NC_017766	TC	3	6	8030	8035	0 %	50 %	0 %	50 %	386835844
16	NC_017766	GC	3	6	9222	9227	0 %	0 %	50 %	50 %	386835846
17	NC_017766	GC	3	6	9513	9518	0 %	0 %	50 %	50 %	386835846
18	NC_017766	CT	3	6	10341	10346	0 %	50 %	0 %	50 %	386835847
19	NC_017766	GC	3	6	10762	10767	0 %	0 %	50 %	50 %	386835847
20	NC_017766	CG	3	6	13026	13031	0 %	0 %	50 %	50 %	386835851
21	NC_017766	GC	3	6	13041	13046	0 %	0 %	50 %	50 %	386835851
22	NC_017766	CG	3	6	15127	15132	0 %	0 %	50 %	50 %	386835852
23	NC_017766	CG	3	6	17989	17994	0 %	0 %	50 %	50 %	386835857
24	NC_017766	GA	3	6	18484	18489	50 %	0 %	50 %	0 %	386835858
25	NC_017766	GC	3	6	19462	19467	0 %	0 %	50 %	50 %	386835860
26	NC_017766	CG	3	6	20598	20603	0 %	0 %	50 %	50 %	386835862
27	NC_017766	CG	3	6	20638	20643	0 %	0 %	50 %	50 %	386835862
28	NC_017766	CG	3	6	21857	21862	0 %	0 %	50 %	50 %	386835865
29	NC_017766	GC	3	6	21937	21942	0 %	0 %	50 %	50 %	386835865
30	NC_017766	CG	3	6	22930	22935	0 %	0 %	50 %	50 %	386835866
31	NC_017766	CG	3	6	24379	24384	0 %	0 %	50 %	50 %	386835868
32	NC_017766	CG	3	6	26851	26856	0 %	0 %	50 %	50 %	386835872
33	NC_017766	GC	3	6	26861	26866	0 %	0 %	50 %	50 %	386835872
34	NC_017766	CG	3	6	28347	28352	0 %	0 %	50 %	50 %	386835874
35	NC_017766	GT	3	6	28634	28639	0 %	50 %	50 %	0 %	386835874
36	NC_017766	GC	3	6	28688	28693	0 %	0 %	50 %	50 %	386835874
37	NC_017766	GC	3	6	29062	29067	0 %	0 %	50 %	50 %	386835875
38	NC_017766	CG	3	6	30912	30917	0 %	0 %	50 %	50 %	386835877
39	NC_017766	CG	4	8	32219	32226	0 %	0 %	50 %	50 %	386835878
40	NC_017766	TC	3	6	33075	33080	0 %	50 %	0 %	50 %	386835880
41	NC_017766	GC	3	6	33169	33174	0 %	0 %	50 %	50 %	386835880
42	NC_017766	CG	3	6	33187	33192	0 %	0 %	50 %	50 %	386835880
43	NC_017766	CG	3	6	34473	34478	0 %	0 %	50 %	50 %	386835882
44	NC_017766	CG	3	6	34949	34954	0 %	0 %	50 %	50 %	386835883
45	NC_017766	CG	3	6	37283	37288	0 %	0 %	50 %	50 %	386835887
46	NC_017766	CG	3	6	39093	39098	0 %	0 %	50 %	50 %	386835888
47	NC_017766	GC	3	6	39505	39510	0 %	0 %	50 %	50 %	386835888
48	NC_017766	CG	3	6	39580	39585	0 %	0 %	50 %	50 %	386835888
49	NC_017766	TC	3	6	41453	41458	0 %	50 %	0 %	50 %	386835890
50	NC_017766	CG	3	6	41857	41862	0 %	0 %	50 %	50 %	386835890
51	NC_017766	GT	3	6	42409	42414	0 %	50 %	50 %	0 %	386835891
52	NC_017766	CG	3	6	44126	44131	0 %	0 %	50 %	50 %	386835893
53	NC_017766	GC	3	6	44823	44828	0 %	0 %	50 %	50 %	386835893
54	NC_017766	CA	3	6	45823	45828	50 %	0 %	0 %	50 %	386835895
55	NC_017766	CG	3	6	46069	46074	0 %	0 %	50 %	50 %	386835895
56	NC_017766	CG	3	6	46274	46279	0 %	0 %	50 %	50 %	386835895
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58	NC_017766	CG	3	6	47029	47034	0 %	0 %	50 %	50 %	386835895
59	NC_017766	GC	3	6	48745	48750	0 %	0 %	50 %	50 %	386835896
60	NC_017766	AC	3	6	48792	48797	50 %	0 %	0 %	50 %	386835896
61	NC_017766	GC	3	6	49106	49111	0 %	0 %	50 %	50 %	386835896
62	NC_017766	CA	3	6	50296	50301	50 %	0 %	0 %	50 %	386835896
63	NC_017766	AC	4	8	53542	53549	50 %	0 %	0 %	50 %	386835898
64	NC_017766	CT	3	6	53726	53731	0 %	50 %	0 %	50 %	386835898
65	NC_017766	CG	3	6	54175	54180	0 %	0 %	50 %	50 %	386835898
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67	NC_017766	CG	3	6	58683	58688	0 %	0 %	50 %	50 %	386835902
68	NC_017766	CG	3	6	58744	58749	0 %	0 %	50 %	50 %	386835902
69	NC_017766	GC	3	6	58837	58842	0 %	0 %	50 %	50 %	386835902
70	NC_017766	GC	3	6	59420	59425	0 %	0 %	50 %	50 %	386835903
71	NC_017766	CG	3	6	59751	59756	0 %	0 %	50 %	50 %	386835903
72	NC_017766	CG	4	8	60449	60456	0 %	0 %	50 %	50 %	386835903
73	NC_017766	GC	3	6	62343	62348	0 %	0 %	50 %	50 %	386835904
74	NC_017766	GT	3	6	62414	62419	0 %	50 %	50 %	0 %	386835904
75	NC_017766	CG	3	6	62833	62838	0 %	0 %	50 %	50 %	386835905
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81	NC_017766	CG	3	6	64397	64402	0 %	0 %	50 %	50 %	386835907
82	NC_017766	CG	3	6	64654	64659	0 %	0 %	50 %	50 %	386835907
83	NC_017766	GC	3	6	65455	65460	0 %	0 %	50 %	50 %	386835908
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90	NC_017766	CG	3	6	70545	70550	0 %	0 %	50 %	50 %	386835918
91	NC_017766	CG	3	6	70734	70739	0 %	0 %	50 %	50 %	386835918
92	NC_017766	CG	3	6	70848	70853	0 %	0 %	50 %	50 %	386835918
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102	NC_017766	GC	3	6	78162	78167	0 %	0 %	50 %	50 %	386835923
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109	NC_017766	CG	3	6	81319	81324	0 %	0 %	50 %	50 %	386835928
110	NC_017766	TG	3	6	81930	81935	0 %	50 %	50 %	0 %	386835929
111	NC_017766	CG	3	6	82065	82070	0 %	0 %	50 %	50 %	386835929
112	NC_017766	CG	3	6	82363	82368	0 %	0 %	50 %	50 %	386835930
113	NC_017766	GC	3	6	82910	82915	0 %	0 %	50 %	50 %	386835930
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119	NC_017766	GC	3	6	83605	83610	0 %	0 %	50 %	50 %	386835930
120	NC_017766	CA	3	6	84146	84151	50 %	0 %	0 %	50 %	386835930
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122	NC_017766	CG	3	6	87618	87623	0 %	0 %	50 %	50 %	386835932
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128	NC_017766	GC	3	6	91396	91401	0 %	0 %	50 %	50 %	386835938
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132	NC_017766	CA	3	6	92737	92742	50 %	0 %	0 %	50 %	386835938
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139	NC_017766	AG	3	6	98387	98392	50 %	0 %	50 %	0 %	386835949
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.