MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis 5008 chromosome

Total Repeats: 884

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017765	TGGCTG	2	12	5005	5016	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017765	GATCAG	2	12	7216	7227	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017765	GACCAA	2	12	7660	7671	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017765	CACCGG	2	12	12920	12931	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017765	TCCCGC	2	12	13263	13274	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_017765	GGTCTC	2	12	16189	16200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017765	TGGCCA	2	12	16805	16816	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017765	CGCTGC	2	12	23057	23068	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017765	CACCCA	2	12	24285	24296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_017765	AGGGCG	2	12	33508	33519	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017765	GGGTGC	2	12	35670	35681	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017765	ATCCCG	2	12	36203	36214	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017765	CGCGGG	2	12	40193	40204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017765	TCGCCG	2	12	49485	49496	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017765	CCTGGC	2	12	57183	57194	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017765	GCGCGA	2	12	63459	63470	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017765	GAGACG	2	12	72187	72198	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017765	CATGTA	2	12	79301	79312	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017765	CCGTCA	2	12	81924	81935	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017765	GCTCCG	2	12	83931	83942	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017765	GCTTGC	2	12	87870	87881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017765	ATGGCC	2	12	88335	88346	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017765	GGCATC	2	12	101491	101502	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017765	CATCGA	2	12	104020	104031	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017765	GGACGA	2	12	105069	105080	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017765	GACTTC	2	12	108326	108337	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017765	GCCGCG	2	12	116774	116785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017765	CTACCT	2	12	129744	129755	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017765	TCCCGA	2	12	130376	130387	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017765	CATCCT	2	12	130600	130611	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017765	TGCGAC	2	12	132443	132454	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017765	TCGCCC	2	12	135319	135330	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_017765	GCGTCG	2	12	135582	135593	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017765	GTCGCT	2	12	136633	136644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017765	CCATGC	2	12	151642	151653	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017765	AGTGAA	2	12	156366	156377	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017765	ACGTGA	2	12	156565	156576	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017765	CATCGT	2	12	163894	163905	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017765	GTTATG	3	18	165503	165520	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017765	TGGTTA	2	12	165567	165578	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017765	GCTCAC	2	12	166264	166275	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017765	GCCAGC	2	12	174592	174603	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017765	GATCGG	2	12	183472	183483	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017765	CCCGGA	2	12	195022	195033	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017765	CGTCAA	2	12	199789	199800	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017765	CGGCAG	2	12	200135	200146	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017765	TACTCC	2	12	200617	200628	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017765	GATGTG	2	12	201260	201271	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017765	CGCAGA	2	12	205225	205236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017765	AAGTGC	2	12	214773	214784	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017765	CGAGGC	2	12	245350	245361	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017765	GCCGGT	2	12	256884	256895	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017765	CCGTCA	2	12	258641	258652	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017765	GGGGAC	2	12	271722	271733	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017765	GGTCGG	2	12	288252	288263	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017765	CTGGTC	2	12	292364	292375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017765	GCCCGG	2	12	294844	294855	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017765	TCGGCG	2	12	297166	297177	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017765	CGGCAC	2	12	298621	298632	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017765	TGCAGG	2	12	304815	304826	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017765	GTGGCG	2	12	344173	344184	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017765	GCCCCG	2	12	347150	347161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_017765	GATGCA	2	12	352487	352498	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_017765	CGCCGT	2	12	381563	381574	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017765	CCATGC	2	12	384271	384282	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017765	CTGTCC	2	12	385293	385304	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017765	GGCCGA	2	12	385566	385577	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017765	GAGCGC	2	12	386733	386744	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017765	TGGACG	2	12	387529	387540	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017765	GCTCGT	2	12	388168	388179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017765	CGCTGT	3	18	394104	394121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017765	CCGGAC	2	12	403071	403082	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017765	GAGCGC	2	12	403579	403590	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017765	TTCGCC	2	12	403702	403713	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017765	GGGCCG	2	12	438191	438202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017765	CGTGTC	2	12	438606	438617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017765	GCGGGG	2	12	443447	443458	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017765	GGCCGG	2	12	444776	444787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017765	CCGGGC	2	12	474385	474396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017765	CCGGGT	2	12	499166	499177	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017765	GGTGCG	2	12	500231	500242	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017765	CGTCAC	2	12	501187	501198	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017765	CCCGCA	2	12	504645	504656	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_017765	GCTGGC	2	12	504951	504962	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017765	CGTTGC	2	12	505859	505870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017765	GGGTGG	2	12	516358	516369	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017765	CATCCC	2	12	516933	516944	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_017765	GTCCCG	2	12	517348	517359	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017765	CGCCGT	2	12	580467	580478	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017765	CGCGCC	2	12	588120	588131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_017765	GGCCCT	2	12	592829	592840	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017765	CCACGG	2	12	598626	598637	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017765	TGGTCG	2	12	612392	612403	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017765	CGGAGC	2	12	633625	633636	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017765	ACCCCG	2	12	645826	645837	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_017765	CGGGAG	3	18	646113	646130	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_017765	CGACAA	2	12	656124	656135	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017765	CGGCGC	2	12	657794	657805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017765	GTTCCG	2	12	672089	672100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017765	GCGACG	2	12	679769	679780	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017765	CGGGAG	2	12	708497	708508	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_017765	ACGCCA	2	12	712081	712092	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
103	NC_017765	CACCGC	2	12	718375	718386	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_017765	ATCCGG	2	12	732848	732859	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017765	GCGACC	2	12	767680	767691	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
106	NC_017765	ACGCGA	2	12	769774	769785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017765	GGACGC	2	12	770138	770149	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017765	TGACAT	2	12	804249	804260	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_017765	CGGGGG	2	12	809655	809666	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_017765	CGCGGG	2	12	817288	817299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017765	GCGCCG	2	12	819710	819721	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017765	CCGGCC	2	12	819758	819769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_017765	GGAGCG	2	12	826022	826033	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_017765	GTCCCG	2	12	833951	833962	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017765	CGACCG	2	12	843647	843658	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017765	TGACCG	2	12	868460	868471	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017765	GGCCGG	2	12	880472	880483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017765	ACCTGG	2	12	886879	886890	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017765	CCGGCC	2	12	888039	888050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_017765	GACGGT	2	12	909100	909111	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_017765	GACGGT	2	12	909149	909160	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_017765	CATCCC	2	12	923797	923808	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_017765	GTAGCC	2	12	924031	924042	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017765	ACTCTC	2	12	942957	942968	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017765	CGTCCC	2	12	947468	947479	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_017765	AGTCGC	2	12	962234	962245	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017765	GGCGCC	2	12	976625	976636	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017765	CATCGT	2	12	990455	990466	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017765	CCCCGT	2	12	1001888	1001899	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_017765	CCGGAC	2	12	1010158	1010169	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017765	GCCGAC	2	12	1017205	1017216	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
132	NC_017765	GGGGGA	2	12	1034898	1034909	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017765	GCCGAT	2	12	1038579	1038590	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017765	GGGGCC	2	12	1047130	1047141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017765	GCCCCG	2	12	1069768	1069779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_017765	GTCGGC	2	12	1072549	1072560	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017765	GCCCCG	2	12	1082640	1082651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_017765	GCCATG	2	12	1107423	1107434	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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141	NC_017765	CCGCTC	2	12	1128776	1128787	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
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151	NC_017765	CGGCCG	2	12	1215448	1215459	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_017765	CGGGCG	2	12	1220222	1220233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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235	NC_017765	ACAGGT	2	12	1762219	1762230	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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237	NC_017765	CGAGAT	2	12	1797957	1797968	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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239	NC_017765	GCTCTT	2	12	1812206	1812217	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
240	NC_017765	CGACCA	2	12	1817519	1817530	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
241	NC_017765	GTGGCC	2	12	1827799	1827810	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
242	NC_017765	GGGGGA	2	12	1839817	1839828	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
243	NC_017765	TCTGAC	2	12	1842096	1842107	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
244	NC_017765	GGCCTG	2	12	1846621	1846632	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
245	NC_017765	GCCCCC	2	12	1847806	1847817	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
246	NC_017765	CACCGC	4	24	1849708	1849731	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
247	NC_017765	TGAACT	2	12	1867817	1867828	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
248	NC_017765	GTACAT	2	12	1872551	1872562	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
249	NC_017765	GGGTCA	2	12	1874848	1874859	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
250	NC_017765	GGTCGG	2	12	1875121	1875132	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
251	NC_017765	CGGCCG	3	18	1875970	1875987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
252	NC_017765	GGGACG	2	12	1876627	1876638	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
253	NC_017765	TGGGCG	2	12	1881758	1881769	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
254	NC_017765	GCGGGC	2	12	1884179	1884190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
255	NC_017765	GGCGGG	2	12	1884482	1884493	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
256	NC_017765	GGGCAC	2	12	1894196	1894207	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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258	NC_017765	CCAACA	2	12	1895502	1895513	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
259	NC_017765	CGCGGA	2	12	1895858	1895869	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
260	NC_017765	GTCACC	2	12	1906570	1906581	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
261	NC_017765	CCGGGC	2	12	1911870	1911881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
262	NC_017765	CTGCCG	2	12	1916446	1916457	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
263	NC_017765	GTGCGA	2	12	1929747	1929758	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
264	NC_017765	TCCTGC	2	12	1930343	1930354	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
265	NC_017765	CGACTC	2	12	1937099	1937110	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
266	NC_017765	CGTTGC	2	12	1945568	1945579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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269	NC_017765	GCGCCG	2	12	1959854	1959865	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
270	NC_017765	GTCCAT	2	12	1962947	1962958	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
271	NC_017765	TCGGCG	2	12	1985349	1985360	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
272	NC_017765	CGGGTG	2	12	1998105	1998116	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
273	NC_017765	CGCCCC	2	12	2010807	2010818	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
274	NC_017765	ACGGGG	2	12	2015207	2015218	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
275	NC_017765	TCCGGG	2	12	2015367	2015378	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
276	NC_017765	GTGACG	2	12	2039950	2039961	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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278	NC_017765	GCGACC	2	12	2055587	2055598	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
279	NC_017765	GATCGA	2	12	2057110	2057121	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
280	NC_017765	GCTGGC	2	12	2059542	2059553	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_017765	GGCTGC	2	12	2063067	2063078	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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352	NC_017765	CCCGCC	2	12	3005112	3005123	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
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496	NC_017765	CCCGCA	2	12	5290719	5290730	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
497	NC_017765	CCTGCG	2	12	5290785	5290796	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
498	NC_017765	TCCCGC	2	12	5367897	5367908	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
499	NC_017765	GGTGCG	2	12	5368087	5368098	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
500	NC_017765	CGCCTC	2	12	5378766	5378777	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding

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