MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus HO 5096 0412

Total Repeats: 1545

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017763	GTTGAA	2	12	3191	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386829727
2	NC_017763	ATAAAT	2	12	3292	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017763	TTTAAA	2	12	3469	3480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017763	GTTATC	2	12	7297	7308	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386829731
5	NC_017763	CAGATA	2	12	8206	8217	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386829731
6	NC_017763	CAAGCT	2	12	8265	8276	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386829731
7	NC_017763	GTAATG	2	12	9253	9264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386829731
8	NC_017763	AGATGA	2	12	9656	9667	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386829731
9	NC_017763	ACAATT	2	12	11259	11270	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386829733
10	NC_017763	TTAGCA	2	12	11353	11364	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386829733
11	NC_017763	TAAATC	2	12	17175	17186	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017763	GCTTTA	2	12	17453	17464	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386829738
13	NC_017763	TTTGAA	2	12	18274	18285	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386829738
14	NC_017763	TTGGTG	2	12	19118	19129	0 %	50 %	50 %	0 %	386829739
15	NC_017763	TAAAGG	2	12	20321	20332	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386829740
16	NC_017763	TGATTG	2	12	21722	21733	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386829741
17	NC_017763	TGAAAT	2	12	22053	22064	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386829741
18	NC_017763	AAGGAA	2	12	22491	22502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386829742
19	NC_017763	TGAATT	2	12	25419	25430	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386829743
20	NC_017763	ATTTCA	2	12	27903	27914	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386829745
21	NC_017763	ATCAGC	2	12	31224	31235	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386829748
22	NC_017763	AAAAGA	2	12	33865	33876	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386829749
23	NC_017763	ACATCT	2	12	35519	35530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386829750
24	NC_017763	GTTTAA	2	12	36662	36673	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386829752
25	NC_017763	AAAAAT	2	12	38393	38404	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017763	AATGAA	2	12	39629	39640	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386829754
27	NC_017763	ACAACT	2	12	41694	41705	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386829755
28	NC_017763	GCTAAA	2	12	42933	42944	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017763	AAAAGA	2	12	56040	56051	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386829765
30	NC_017763	AAAAAT	2	12	58325	58336	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017763	TGGTAC	2	12	59915	59926	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386829769
32	NC_017763	AAGAAA	2	12	63872	63883	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386829770
33	NC_017763	CCAAAC	2	12	65854	65865	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017763	TATAGA	2	12	68335	68346	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386829774
35	NC_017763	ACCCTT	2	12	69221	69232	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386829775
36	NC_017763	GATGTC	2	12	73125	73136	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386829780
37	NC_017763	ATTTCT	2	12	73737	73748	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386829781
38	NC_017763	ATATTT	2	12	73845	73856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386829781
39	NC_017763	AAGGAA	2	12	74829	74840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386829782
40	NC_017763	TTTAGC	2	12	76638	76649	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386829784
41	NC_017763	AAATAA	2	12	76689	76700	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386829784
42	NC_017763	GTTAGA	2	12	78812	78823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386829785
43	NC_017763	AAAAGA	2	12	78866	78877	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386829785
44	NC_017763	TGAAAT	2	12	80160	80171	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386829785
45	NC_017763	TAAAAA	2	12	81192	81203	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386829787
46	NC_017763	TGATTT	2	12	82355	82366	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386829788
47	NC_017763	GCTAAA	2	12	83875	83886	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386829789
48	NC_017763	TAAAGA	2	12	85531	85542	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386829791
49	NC_017763	AACCAC	2	12	89404	89415	50 %	0 %	0 %	50 %	386829793
50	NC_017763	AATATA	2	12	91106	91117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017763	AACCGA	2	12	92718	92729	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386829795
52	NC_017763	TATCAT	2	12	95992	96003	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386829797
53	NC_017763	TTTATT	2	12	96400	96411	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386829798
54	NC_017763	TATTTG	2	12	96486	96497	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386829798
55	NC_017763	TATTTG	2	12	97882	97893	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386829798
56	NC_017763	TAAATA	2	12	97919	97930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386829798
57	NC_017763	TTTTTC	2	12	99740	99751	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017763	ATTTAT	2	12	99821	99832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017763	TTAAAT	2	12	99835	99846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017763	TTAACA	2	12	101191	101202	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017763	TAAGCC	2	12	101601	101612	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386829800
62	NC_017763	ATCGCA	2	12	102816	102827	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386829801
63	NC_017763	TTTGAA	2	12	103847	103858	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386829802
64	NC_017763	TGAAGA	2	12	113639	113650	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386829809
65	NC_017763	TTTCAT	2	12	114320	114331	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386829810
66	NC_017763	ATGAGC	2	12	115931	115942	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386829812
67	NC_017763	TGTATA	2	12	118996	119007	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386829816
68	NC_017763	TCGAAA	2	12	120497	120508	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386829818
69	NC_017763	CTATTG	2	12	123083	123094	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386829820
70	NC_017763	CATATG	2	12	124286	124297	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386829821
71	NC_017763	GGTATG	2	12	126389	126400	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017763	CAGATT	2	12	128988	128999	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386829824
73	NC_017763	AGATAT	2	12	136387	136398	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386829831
74	NC_017763	GATATG	2	12	145320	145331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386829838
75	NC_017763	ATTTGA	2	12	149226	149237	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386829841
76	NC_017763	GATTTT	2	12	153737	153748	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386829846
77	NC_017763	ACAAAG	2	12	158257	158268	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386829850
78	NC_017763	TGTAAT	2	12	159281	159292	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386829851
79	NC_017763	AAAGAT	2	12	160269	160280	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386829853
80	NC_017763	ATTAAT	2	12	162175	162186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017763	CAATAT	2	12	162741	162752	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386829854
82	NC_017763	TTGGTA	2	12	166596	166607	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386829859
83	NC_017763	GCGATT	2	12	166616	166627	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386829859
84	NC_017763	AAATTT	2	12	166714	166725	50 %	50 %	0 %	0 %	386829859
85	NC_017763	ACCTGC	2	12	169616	169627	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017763	AAGATA	2	12	169762	169773	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017763	CGTTAA	2	12	172696	172707	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386829862
88	NC_017763	CTATTA	2	12	174547	174558	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386829862
89	NC_017763	TATGAT	2	12	176081	176092	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386829862
90	NC_017763	TTGAAA	2	12	176533	176544	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386829862
91	NC_017763	AACATT	2	12	178973	178984	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386829862
92	NC_017763	AGCAAC	2	12	182460	182471	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386829866
93	NC_017763	TGTTTG	2	12	182508	182519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386829866
94	NC_017763	CACCTT	2	12	184512	184523	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386829868
95	NC_017763	ACCTTT	2	12	185017	185028	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386829868
96	NC_017763	TTTATA	2	12	185113	185124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017763	ATTAAT	2	12	185136	185147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017763	GTAAAT	2	12	188753	188764	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386829871
99	NC_017763	ATTTTA	2	12	190348	190359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386829872
100	NC_017763	TATCTT	2	12	194962	194973	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386829875
101	NC_017763	ATTTGG	2	12	195975	195986	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386829876
102	NC_017763	GAGTTT	2	12	199886	199897	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386829878
103	NC_017763	CCCTGA	2	12	204458	204469	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386829882
104	NC_017763	TCCTGA	2	12	205277	205288	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386829882
105	NC_017763	TCAATT	2	12	207428	207439	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386829884
106	NC_017763	AATATG	2	12	208728	208739	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386829885
107	NC_017763	GATTTT	2	12	211884	211895	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017763	AAAAAT	2	12	212235	212246	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386829887
109	NC_017763	AGGACA	2	12	214096	214107	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386829889
110	NC_017763	ACATTT	2	12	214432	214443	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386829889
111	NC_017763	TTCTTG	2	12	219360	219371	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386829893
112	NC_017763	GGACGT	2	12	229862	229873	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386829902
113	NC_017763	ATATGA	2	12	232613	232624	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017763	CTTCAA	2	12	237661	237672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017763	AGTGGA	2	12	248294	248305	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017763	TGGTAT	2	12	259871	259882	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386829923
117	NC_017763	TATAGA	2	12	263225	263236	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386829927
118	NC_017763	ATATAG	2	12	269519	269530	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017763	ACGATG	2	12	269855	269866	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386829932
120	NC_017763	ATAATT	2	12	275786	275797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017763	GCAATT	2	12	281290	281301	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386829941
122	NC_017763	CAATTG	2	12	281852	281863	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386829941
123	NC_017763	ATAAAG	2	12	284568	284579	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386829944
124	NC_017763	TTAGAG	2	12	285533	285544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017763	AACGAT	2	12	285914	285925	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_017763	GACATT	2	12	286267	286278	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386829945
127	NC_017763	ATCATT	2	12	286796	286807	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_017763	GATTTC	2	12	288086	288097	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386829947
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134	NC_017763	TCTTCA	2	12	299160	299171	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386829957
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235	NC_017763	GCAAGA	2	12	496613	496624	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386830142
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238	NC_017763	ATTTAG	2	12	499154	499165	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386830145
239	NC_017763	CGTATT	2	12	499261	499272	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386830145
240	NC_017763	GAAACT	2	12	500679	500690	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386830146
241	NC_017763	TTTATA	2	12	503314	503325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386830147
242	NC_017763	ATTAAA	2	12	507658	507669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386830152
243	NC_017763	AGCATT	2	12	511464	511475	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386830155
244	NC_017763	AGCACA	2	12	514092	514103	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386830157
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250	NC_017763	CAGGTA	2	12	531921	531932	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386830162
251	NC_017763	AAAGTT	2	12	535014	535025	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386830166
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257	NC_017763	AGCTAA	2	12	551200	551211	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386830182
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259	NC_017763	TTATAA	2	12	552618	552629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_017763	GTTATA	2	12	553289	553300	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
261	NC_017763	ACGATG	2	12	556472	556483	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386830186
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266	NC_017763	CTTAAA	2	12	561721	561732	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
267	NC_017763	ACGACT	2	12	562427	562438	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386830191
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273	NC_017763	ACATGT	2	12	571691	571702	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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285	NC_017763	GACTCA	2	12	581483	581494	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386830205
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287	NC_017763	TCAGAT	2	12	581522	581533	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386830205
288	NC_017763	GATTCA	2	12	581537	581548	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386830205
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290	NC_017763	GATTCA	2	12	581573	581584	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386830205
291	NC_017763	TCAGAT	2	12	581594	581605	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386830205
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299	NC_017763	TAAAAT	2	12	583741	583752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386830206
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304	NC_017763	GACTCA	2	12	585767	585778	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386830206
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332	NC_017763	GACTCA	2	12	589959	589970	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386830207
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334	NC_017763	GACTCA	2	12	589995	590006	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386830207
335	NC_017763	GACTCA	2	12	590085	590096	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386830207
336	NC_017763	GACTCA	2	12	590121	590132	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386830207
337	NC_017763	AAAGCA	2	12	590208	590219	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386830207
338	NC_017763	TTTTGA	2	12	598183	598194	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386830216
339	NC_017763	TATATT	2	12	600340	600351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386830217
340	NC_017763	ATTGCG	2	12	601056	601067	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386830218
341	NC_017763	GATCAC	2	12	602165	602176	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386830219
342	NC_017763	TATTTA	2	12	602297	602308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386830219
343	NC_017763	AATGAT	2	12	604974	604985	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
344	NC_017763	TAGATG	2	12	605047	605058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
345	NC_017763	TCAAAT	2	12	605135	605146	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
346	NC_017763	GCAATT	2	12	608836	608847	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386830228
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348	NC_017763	TTGATA	2	12	613644	613655	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386830234
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465	NC_017763	GATTCA	2	12	824789	824800	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386830429
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