MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus HO 5096 0412

Total Repeats: 273

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017763	ATAAAT	2	12	3292	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017763	TTTAAA	2	12	3469	3480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017763	TAAATC	2	12	17175	17186	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017763	AAAAAT	2	12	38393	38404	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017763	GCTAAA	2	12	42933	42944	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017763	AAAAAT	2	12	58325	58336	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017763	CCAAAC	2	12	65854	65865	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017763	AATATA	2	12	91106	91117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017763	TTTTTC	2	12	99740	99751	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017763	ATTTAT	2	12	99821	99832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017763	TTAAAT	2	12	99835	99846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017763	TTAACA	2	12	101191	101202	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017763	GGTATG	2	12	126389	126400	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017763	ATTAAT	2	12	162175	162186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017763	ACCTGC	2	12	169616	169627	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017763	AAGATA	2	12	169762	169773	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017763	TTTATA	2	12	185113	185124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017763	ATTAAT	2	12	185136	185147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017763	GATTTT	2	12	211884	211895	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017763	ATATGA	2	12	232613	232624	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017763	CTTCAA	2	12	237661	237672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017763	AGTGGA	2	12	248294	248305	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017763	ATATAG	2	12	269519	269530	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017763	ATAATT	2	12	275786	275797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017763	TTAGAG	2	12	285533	285544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017763	AACGAT	2	12	285914	285925	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017763	ATCATT	2	12	286796	286807	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017763	TAACTT	2	12	294290	294301	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017763	TAAAAT	2	12	343786	343797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017763	ATATGA	2	12	343830	343841	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017763	TTCATT	2	12	348285	348296	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017763	TTGTAA	2	12	353588	353599	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017763	TAATAT	2	12	361801	361812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017763	AATTTG	2	12	391449	391460	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017763	TTTTTA	2	12	412666	412677	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017763	TAAAAT	2	12	415445	415456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017763	TGTATA	2	12	429298	429309	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017763	TTTTTA	2	12	439116	439127	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017763	AAAATG	2	12	444549	444560	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017763	ACGTTG	2	12	464951	464962	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017763	AAAATA	2	12	465675	465686	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017763	TTATAA	2	12	485100	485111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017763	AAATTT	2	12	491859	491870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017763	TTATAA	2	12	552618	552629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017763	GTTATA	2	12	553289	553300	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017763	CTTAAA	2	12	561721	561732	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017763	ACATGT	2	12	571691	571702	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017763	AATGAT	2	12	604974	604985	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017763	TAGATG	2	12	605047	605058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017763	TCAAAT	2	12	605135	605146	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017763	TAAAAT	2	12	620365	620376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017763	AAAATA	2	12	622393	622404	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017763	TTTTAA	2	12	626546	626557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017763	CATTAT	2	12	642800	642811	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017763	CATCAA	2	12	653195	653206	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017763	TAATTT	2	12	657435	657446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017763	ATAAAT	2	12	657501	657512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017763	TGAATA	2	12	673912	673923	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017763	TTAAAA	2	12	700255	700266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017763	TAGTTA	2	12	704684	704695	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017763	CATTAA	2	12	717758	717769	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017763	TTTTTA	2	12	722976	722987	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017763	TGAAAA	2	12	731219	731230	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017763	ACAAAA	2	12	799056	799067	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017763	GTTCTT	2	12	818028	818039	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017763	TTCTTT	2	12	818059	818070	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_017763	TAAAAA	2	12	821179	821190	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017763	TATCAA	2	12	827675	827686	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017763	TTTTGA	2	12	831493	831504	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017763	TCATTT	2	12	837484	837495	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017763	TAAAAA	2	12	840571	840582	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017763	AAATTA	2	12	847328	847339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017763	AAGCAC	2	12	856061	856072	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017763	ATGATT	2	12	856211	856222	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017763	TAAAAT	2	12	863910	863921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017763	TAATTT	2	12	933496	933507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017763	ATTTTT	2	12	933903	933914	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017763	TTTAAT	2	12	937461	937472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017763	ATTTTA	2	12	938804	938815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017763	ACAATA	2	12	955604	955615	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_017763	AACGGA	2	12	970129	970140	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017763	AAAAGC	2	12	974644	974655	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_017763	AAAGAA	2	12	977356	977367	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017763	TGCATT	2	12	982041	982052	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017763	AAAATA	2	12	982425	982436	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017763	ATCATA	2	12	1002368	1002379	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_017763	TCAAAA	2	12	1008672	1008683	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017763	TTTTCT	2	12	1022340	1022351	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_017763	TTTATA	2	12	1058329	1058340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017763	GAATTA	2	12	1064901	1064912	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017763	ATTTTA	2	12	1065223	1065234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017763	ATCTTT	2	12	1075289	1075300	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_017763	ATTTTT	2	12	1082273	1082284	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017763	ATAATT	2	12	1083070	1083081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017763	TCATTA	2	12	1088155	1088166	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_017763	TAATGA	2	12	1096246	1096257	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017763	ATATTT	2	12	1103566	1103577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017763	ATTTAT	2	12	1116876	1116887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017763	AAATTT	2	12	1121597	1121608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017763	AAGTAA	2	12	1143293	1143304	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017763	TCGTTT	2	12	1146491	1146502	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_017763	TTAATT	2	12	1157207	1157218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017763	AATTAA	2	12	1159943	1159954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017763	GAAATT	2	12	1205082	1205093	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017763	AATGAT	2	12	1217857	1217868	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017763	TAAAGA	2	12	1232332	1232343	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017763	TTTCAT	2	12	1248139	1248150	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_017763	TATATT	2	12	1252796	1252807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017763	CATATT	2	12	1279314	1279325	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_017763	AAAGAA	2	12	1280167	1280178	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017763	TTAAAG	2	12	1283749	1283760	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017763	TTAAAG	2	12	1289494	1289505	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017763	ATTAAA	2	12	1318132	1318143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017763	ATATAA	2	12	1326057	1326068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017763	TTAATT	2	12	1330521	1330532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017763	GTTTTA	2	12	1357533	1357544	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017763	ATTTAT	2	12	1367788	1367799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017763	AAGAAT	2	12	1367941	1367952	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017763	TGTTTT	2	12	1368689	1368700	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017763	TTTTTA	2	12	1368918	1368929	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017763	ATTAAT	2	12	1375605	1375616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017763	TAAAAT	2	12	1388229	1388240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017763	TATCTT	2	12	1409466	1409477	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_017763	TTGATT	2	12	1409529	1409540	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017763	AATAAA	2	12	1419963	1419974	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017763	TTTCTT	2	12	1430303	1430314	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_017763	GCTTTT	2	12	1432173	1432184	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_017763	TTTTCT	2	12	1434732	1434743	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_017763	GTGCTT	2	12	1435321	1435332	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_017763	GTGCTT	2	12	1435699	1435710	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_017763	TGCTTC	2	12	1437077	1437088	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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133	NC_017763	GGTGTT	2	12	1438566	1438577	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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253	NC_017763	TAAACC	2	12	2774223	2774234	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
254	NC_017763	TGAACC	2	12	2774727	2774738	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
255	NC_017763	TGTCGA	2	12	2774802	2774813	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
256	NC_017763	GATTCT	2	12	2774872	2774883	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
257	NC_017763	CATTGA	2	12	2774994	2775005	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
258	NC_017763	ACTTGT	2	12	2775039	2775050	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
259	NC_017763	GATACA	2	12	2775952	2775963	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
260	NC_017763	TACTTG	2	12	2776292	2776303	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
261	NC_017763	CACTTG	2	12	2776346	2776357	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
262	NC_017763	TCACTC	2	12	2776765	2776776	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
263	NC_017763	ACGTTG	2	12	2776979	2776990	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
264	NC_017763	TAATGA	2	12	2777611	2777622	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
265	NC_017763	TACAGT	2	12	2779057	2779068	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
266	NC_017763	TTGAAG	2	12	2780232	2780243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
267	NC_017763	TGTTGA	2	12	2780437	2780448	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
268	NC_017763	ATTTCT	2	12	2780687	2780698	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
269	NC_017763	ATTTTA	2	12	2804871	2804882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_017763	ATTCGA	2	12	2805094	2805105	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
271	NC_017763	ATTGGC	2	12	2806011	2806022	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
272	NC_017763	GATTTT	2	12	2822605	2822616	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
273	NC_017763	ATATAA	2	12	2825558	2825569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.