MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus HO 5096 0412

Total Repeats: 1272

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017763	GTTGAA	2	12	3191	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386829727
2	NC_017763	GTTATC	2	12	7297	7308	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386829731
3	NC_017763	CAGATA	2	12	8206	8217	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386829731
4	NC_017763	CAAGCT	2	12	8265	8276	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386829731
5	NC_017763	GTAATG	2	12	9253	9264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386829731
6	NC_017763	AGATGA	2	12	9656	9667	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386829731
7	NC_017763	ACAATT	2	12	11259	11270	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386829733
8	NC_017763	TTAGCA	2	12	11353	11364	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386829733
9	NC_017763	GCTTTA	2	12	17453	17464	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386829738
10	NC_017763	TTTGAA	2	12	18274	18285	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386829738
11	NC_017763	TTGGTG	2	12	19118	19129	0 %	50 %	50 %	0 %	386829739
12	NC_017763	TAAAGG	2	12	20321	20332	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386829740
13	NC_017763	TGATTG	2	12	21722	21733	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386829741
14	NC_017763	TGAAAT	2	12	22053	22064	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386829741
15	NC_017763	AAGGAA	2	12	22491	22502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386829742
16	NC_017763	TGAATT	2	12	25419	25430	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386829743
17	NC_017763	ATTTCA	2	12	27903	27914	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386829745
18	NC_017763	ATCAGC	2	12	31224	31235	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386829748
19	NC_017763	AAAAGA	2	12	33865	33876	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386829749
20	NC_017763	ACATCT	2	12	35519	35530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386829750
21	NC_017763	GTTTAA	2	12	36662	36673	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386829752
22	NC_017763	AATGAA	2	12	39629	39640	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386829754
23	NC_017763	ACAACT	2	12	41694	41705	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386829755
24	NC_017763	AAAAGA	2	12	56040	56051	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386829765
25	NC_017763	TGGTAC	2	12	59915	59926	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386829769
26	NC_017763	AAGAAA	2	12	63872	63883	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386829770
27	NC_017763	TATAGA	2	12	68335	68346	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386829774
28	NC_017763	ACCCTT	2	12	69221	69232	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386829775
29	NC_017763	GATGTC	2	12	73125	73136	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386829780
30	NC_017763	ATTTCT	2	12	73737	73748	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386829781
31	NC_017763	ATATTT	2	12	73845	73856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386829781
32	NC_017763	AAGGAA	2	12	74829	74840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386829782
33	NC_017763	TTTAGC	2	12	76638	76649	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386829784
34	NC_017763	AAATAA	2	12	76689	76700	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386829784
35	NC_017763	GTTAGA	2	12	78812	78823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386829785
36	NC_017763	AAAAGA	2	12	78866	78877	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386829785
37	NC_017763	TGAAAT	2	12	80160	80171	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386829785
38	NC_017763	TAAAAA	2	12	81192	81203	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386829787
39	NC_017763	TGATTT	2	12	82355	82366	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386829788
40	NC_017763	GCTAAA	2	12	83875	83886	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386829789
41	NC_017763	TAAAGA	2	12	85531	85542	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386829791
42	NC_017763	AACCAC	2	12	89404	89415	50 %	0 %	0 %	50 %	386829793
43	NC_017763	AACCGA	2	12	92718	92729	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386829795
44	NC_017763	TATCAT	2	12	95992	96003	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386829797
45	NC_017763	TTTATT	2	12	96400	96411	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386829798
46	NC_017763	TATTTG	2	12	96486	96497	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386829798
47	NC_017763	TATTTG	2	12	97882	97893	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386829798
48	NC_017763	TAAATA	2	12	97919	97930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386829798
49	NC_017763	TAAGCC	2	12	101601	101612	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386829800
50	NC_017763	ATCGCA	2	12	102816	102827	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386829801
51	NC_017763	TTTGAA	2	12	103847	103858	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386829802
52	NC_017763	TGAAGA	2	12	113639	113650	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386829809
53	NC_017763	TTTCAT	2	12	114320	114331	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386829810
54	NC_017763	ATGAGC	2	12	115931	115942	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386829812
55	NC_017763	TGTATA	2	12	118996	119007	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386829816
56	NC_017763	TCGAAA	2	12	120497	120508	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386829818
57	NC_017763	CTATTG	2	12	123083	123094	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386829820
58	NC_017763	CATATG	2	12	124286	124297	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386829821
59	NC_017763	CAGATT	2	12	128988	128999	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386829824
60	NC_017763	AGATAT	2	12	136387	136398	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386829831
61	NC_017763	GATATG	2	12	145320	145331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386829838
62	NC_017763	ATTTGA	2	12	149226	149237	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386829841
63	NC_017763	GATTTT	2	12	153737	153748	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386829846
64	NC_017763	ACAAAG	2	12	158257	158268	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386829850
65	NC_017763	TGTAAT	2	12	159281	159292	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386829851
66	NC_017763	AAAGAT	2	12	160269	160280	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386829853
67	NC_017763	CAATAT	2	12	162741	162752	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386829854
68	NC_017763	TTGGTA	2	12	166596	166607	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386829859
69	NC_017763	GCGATT	2	12	166616	166627	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386829859
70	NC_017763	AAATTT	2	12	166714	166725	50 %	50 %	0 %	0 %	386829859
71	NC_017763	CGTTAA	2	12	172696	172707	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386829862
72	NC_017763	CTATTA	2	12	174547	174558	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386829862
73	NC_017763	TATGAT	2	12	176081	176092	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386829862
74	NC_017763	TTGAAA	2	12	176533	176544	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386829862
75	NC_017763	AACATT	2	12	178973	178984	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386829862
76	NC_017763	AGCAAC	2	12	182460	182471	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386829866
77	NC_017763	TGTTTG	2	12	182508	182519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386829866
78	NC_017763	CACCTT	2	12	184512	184523	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386829868
79	NC_017763	ACCTTT	2	12	185017	185028	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386829868
80	NC_017763	GTAAAT	2	12	188753	188764	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386829871
81	NC_017763	ATTTTA	2	12	190348	190359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386829872
82	NC_017763	TATCTT	2	12	194962	194973	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386829875
83	NC_017763	ATTTGG	2	12	195975	195986	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386829876
84	NC_017763	GAGTTT	2	12	199886	199897	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386829878
85	NC_017763	CCCTGA	2	12	204458	204469	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386829882
86	NC_017763	TCCTGA	2	12	205277	205288	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386829882
87	NC_017763	TCAATT	2	12	207428	207439	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386829884
88	NC_017763	AATATG	2	12	208728	208739	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386829885
89	NC_017763	AAAAAT	2	12	212235	212246	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386829887
90	NC_017763	AGGACA	2	12	214096	214107	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386829889
91	NC_017763	ACATTT	2	12	214432	214443	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386829889
92	NC_017763	TTCTTG	2	12	219360	219371	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386829893
93	NC_017763	GGACGT	2	12	229862	229873	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386829902
94	NC_017763	TGGTAT	2	12	259871	259882	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386829923
95	NC_017763	TATAGA	2	12	263225	263236	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386829927
96	NC_017763	ACGATG	2	12	269855	269866	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386829932
97	NC_017763	GCAATT	2	12	281290	281301	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386829941
98	NC_017763	CAATTG	2	12	281852	281863	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386829941
99	NC_017763	ATAAAG	2	12	284568	284579	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386829944
100	NC_017763	GACATT	2	12	286267	286278	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386829945
101	NC_017763	GATTTC	2	12	288086	288097	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386829947
102	NC_017763	TTCATA	2	12	288656	288667	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386829948
103	NC_017763	GATTAT	2	12	293064	293075	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386829952
104	NC_017763	ATGGTG	2	12	293197	293208	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386829952
105	NC_017763	CAGCAA	2	12	293584	293595	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386829952
106	NC_017763	TCTTCA	2	12	299160	299171	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386829957
107	NC_017763	TTATCT	2	12	299256	299267	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386829957
108	NC_017763	ATAAGT	2	12	300722	300733	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386829958
109	NC_017763	GAAAAA	2	12	301518	301529	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386829960
110	NC_017763	GATACA	2	12	302683	302694	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386829960
111	NC_017763	AATCAA	2	12	303689	303700	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386829960
112	NC_017763	TAATTA	2	12	305010	305021	50 %	50 %	0 %	0 %	386829962
113	NC_017763	ACAAGA	2	12	305850	305861	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386829963
114	NC_017763	AGGACA	2	12	306228	306239	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386829963
115	NC_017763	ATTATC	2	12	307538	307549	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386829964
116	NC_017763	TAAATT	2	12	309078	309089	50 %	50 %	0 %	0 %	386829964
117	NC_017763	TGAAGA	2	12	309339	309350	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386829964
118	NC_017763	GATCAA	2	12	310046	310057	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386829964
119	NC_017763	ATTATG	2	12	311741	311752	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386829965
120	NC_017763	ATTTTG	2	12	313558	313569	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386829967
121	NC_017763	AAAATT	2	12	313656	313667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386829967
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125	NC_017763	CTGAAT	2	12	322555	322566	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386829980
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224	NC_017763	TACAGC	2	12	566167	566178	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386830193
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228	NC_017763	TTTCTT	2	12	576404	576415	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386830201
229	NC_017763	AAGCAC	2	12	577332	577343	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386830203
230	NC_017763	ACTGCA	2	12	579338	579349	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386830205
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