MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Helicobacter cinaedi PAGU611 plasmid pHci1

Total Repeats: 17

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017762	AAGAGT	2	12	468	479	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386829696
2	NC_017762	TATGGA	2	12	812	823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386829696
3	NC_017762	TTATAA	2	12	1090	1101	50 %	50 %	0 %	0 %	386829696
4	NC_017762	TTGTCT	2	12	3133	3144	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386829700
5	NC_017762	GTTATT	2	12	4595	4606	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386829702
6	NC_017762	TTGTCT	2	12	4980	4991	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386829703
7	NC_017762	AAAAAC	2	12	5669	5680	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	386829704
8	NC_017762	TTGTCT	2	12	7323	7334	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386829707
9	NC_017762	TTGTCT	2	12	9241	9252	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386829709
10	NC_017762	AGTAGA	2	12	11500	11511	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386829710
11	NC_017762	TAAATC	2	12	12785	12796	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386829711
12	NC_017762	ATAAAT	2	12	13642	13653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386829712
13	NC_017762	ATTCCA	2	12	13967	13978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386829713
14	NC_017762	CCAAAG	2	12	18852	18863	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386829718
15	NC_017762	TATTAA	2	12	21620	21631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017762	TATTTC	2	12	22002	22013	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386829722
17	NC_017762	AACAAA	2	12	22322	22333	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	386829723

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.