MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Helicobacter cinaedi PAGU611 plasmid pHci1

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017762	GCTTT	2	10	153	162	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017762	TAAAA	2	10	213	222	80 %	20 %	0 %	0 %	386829696
3	NC_017762	GTTTT	2	10	368	377	0 %	80 %	20 %	0 %	386829696
4	NC_017762	TAAAA	2	10	1510	1519	80 %	20 %	0 %	0 %	386829697
5	NC_017762	TTGGA	2	10	2184	2193	20 %	40 %	40 %	0 %	386829699
6	NC_017762	AAAAT	2	10	2709	2718	80 %	20 %	0 %	0 %	386829699
7	NC_017762	TTATC	2	10	4804	4813	20 %	60 %	0 %	20 %	386829703
8	NC_017762	ATAAA	2	10	7086	7095	80 %	20 %	0 %	0 %	386829707
9	NC_017762	TTTCT	2	10	8047	8056	0 %	80 %	0 %	20 %	386829708
10	NC_017762	ATTTT	2	10	8082	8091	20 %	80 %	0 %	0 %	386829708
11	NC_017762	CCAAA	2	10	8221	8230	60 %	0 %	0 %	40 %	386829708
12	NC_017762	TTTGT	2	10	9102	9111	0 %	80 %	20 %	0 %	386829709
13	NC_017762	TGTGT	2	10	9178	9187	0 %	60 %	40 %	0 %	386829709
14	NC_017762	GTCAT	2	10	14019	14028	20 %	40 %	20 %	20 %	386829713
15	NC_017762	ATCTT	2	10	15139	15148	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017762	TGGTT	2	10	17699	17708	0 %	60 %	40 %	0 %	386829717
17	NC_017762	ATTTT	2	10	18333	18342	20 %	80 %	0 %	0 %	386829718
18	NC_017762	GCTTG	2	10	19234	19243	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017762	TGTAT	2	10	19251	19260	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017762	CATAT	2	10	20945	20954	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017762	ATACT	2	10	21154	21163	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017762	GCTTT	2	10	21220	21229	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017762	AATGA	2	10	21556	21565	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017762	TGATT	2	10	22788	22797	20 %	60 %	20 %	0 %	386829724

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.