MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Helicobacter cinaedi PAGU611 plasmid pHci1

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017762	TGTT	2	8	360	367	0 %	75 %	25 %	0 %	386829696
2	NC_017762	TTTG	2	8	411	418	0 %	75 %	25 %	0 %	386829696
3	NC_017762	TAAG	2	8	771	778	50 %	25 %	25 %	0 %	386829696
4	NC_017762	CTTG	2	8	986	993	0 %	50 %	25 %	25 %	386829696
5	NC_017762	TTCT	2	8	1018	1025	0 %	75 %	0 %	25 %	386829696
6	NC_017762	AGGA	2	8	1066	1073	50 %	0 %	50 %	0 %	386829696
7	NC_017762	TAAA	2	8	1179	1186	75 %	25 %	0 %	0 %	386829696
8	NC_017762	TTCT	2	8	1977	1984	0 %	75 %	0 %	25 %	386829698
9	NC_017762	ATAA	2	8	3777	3784	75 %	25 %	0 %	0 %	386829701
10	NC_017762	GATA	2	8	3849	3856	50 %	25 %	25 %	0 %	386829702
11	NC_017762	GTTT	2	8	3907	3914	0 %	75 %	25 %	0 %	386829702
12	NC_017762	TGAT	2	8	3983	3990	25 %	50 %	25 %	0 %	386829702
13	NC_017762	TACC	2	8	4115	4122	25 %	25 %	0 %	50 %	386829702
14	NC_017762	CATA	2	8	4167	4174	50 %	25 %	0 %	25 %	386829702
15	NC_017762	TAAT	2	8	4304	4311	50 %	50 %	0 %	0 %	386829702
16	NC_017762	CCAA	2	8	4334	4341	50 %	0 %	0 %	50 %	386829702
17	NC_017762	CATT	2	8	4642	4649	25 %	50 %	0 %	25 %	386829703
18	NC_017762	TTGT	2	8	5393	5400	0 %	75 %	25 %	0 %	386829704
19	NC_017762	ACTT	2	8	5843	5850	25 %	50 %	0 %	25 %	386829705
20	NC_017762	CTTT	2	8	6164	6171	0 %	75 %	0 %	25 %	386829706
21	NC_017762	CAAT	2	8	6426	6433	50 %	25 %	0 %	25 %	386829706
22	NC_017762	ATCA	2	8	6648	6655	50 %	25 %	0 %	25 %	386829707
23	NC_017762	AAAT	2	8	6710	6717	75 %	25 %	0 %	0 %	386829707
24	NC_017762	CAGT	2	8	6770	6777	25 %	25 %	25 %	25 %	386829707
25	NC_017762	GATA	2	8	7630	7637	50 %	25 %	25 %	0 %	386829707
26	NC_017762	ATTC	2	8	8772	8779	25 %	50 %	0 %	25 %	386829709
27	NC_017762	TCTG	2	8	8864	8871	0 %	50 %	25 %	25 %	386829709
28	NC_017762	ACTA	2	8	9943	9950	50 %	25 %	0 %	25 %	386829709
29	NC_017762	GATA	2	8	10479	10486	50 %	25 %	25 %	0 %	386829709
30	NC_017762	TTGT	2	8	11367	11374	0 %	75 %	25 %	0 %	386829710
31	NC_017762	TCAT	2	8	11409	11416	25 %	50 %	0 %	25 %	386829710
32	NC_017762	AGAT	2	8	11562	11569	50 %	25 %	25 %	0 %	386829710
33	NC_017762	TAAA	2	8	12280	12287	75 %	25 %	0 %	0 %	386829710
34	NC_017762	ATAA	2	8	12848	12855	75 %	25 %	0 %	0 %	386829711
35	NC_017762	ATTT	2	8	13276	13283	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017762	CATT	2	8	13800	13807	25 %	50 %	0 %	25 %	386829712
37	NC_017762	ACTA	2	8	14042	14049	50 %	25 %	0 %	25 %	386829713
38	NC_017762	TTTG	2	8	14236	14243	0 %	75 %	25 %	0 %	386829713
39	NC_017762	ATAA	2	8	14254	14261	75 %	25 %	0 %	0 %	386829713
40	NC_017762	AATA	2	8	14288	14295	75 %	25 %	0 %	0 %	386829713
41	NC_017762	TATT	2	8	14503	14510	25 %	75 %	0 %	0 %	386829714
42	NC_017762	TATG	2	8	15125	15132	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017762	TCTT	2	8	15715	15722	0 %	75 %	0 %	25 %	386829716
44	NC_017762	TCTT	2	8	16567	16574	0 %	75 %	0 %	25 %	386829716
45	NC_017762	TTTC	2	8	16593	16600	0 %	75 %	0 %	25 %	386829716
46	NC_017762	TACA	2	8	16888	16895	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017762	CTTG	2	8	17518	17525	0 %	50 %	25 %	25 %	386829717
48	NC_017762	GTTT	2	8	18541	18548	0 %	75 %	25 %	0 %	386829718
49	NC_017762	AAAC	2	8	19221	19228	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017762	GTAT	2	8	20385	20392	25 %	50 %	25 %	0 %	386829720
51	NC_017762	GATA	2	8	20493	20500	50 %	25 %	25 %	0 %	386829720
52	NC_017762	ATAG	2	8	20668	20675	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017762	GTGG	2	8	20682	20689	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017762	TGTA	2	8	21062	21069	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017762	AAAT	2	8	21750	21757	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017762	TTAA	2	8	21955	21962	50 %	50 %	0 %	0 %	386829722
57	NC_017762	TTGC	2	8	22079	22086	0 %	50 %	25 %	25 %	386829722
58	NC_017762	AATA	2	8	22175	22182	75 %	25 %	0 %	0 %	386829723
59	NC_017762	ATTG	2	8	22629	22636	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017762	ATGA	2	8	23007	23014	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.