MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Helicobacter cinaedi PAGU611 plasmid pHci1

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017762	AT	3	6	50	55	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017762	AG	3	6	174	179	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017762	AG	4	8	452	459	50 %	0 %	50 %	0 %	386829696
4	NC_017762	CT	3	6	715	720	0 %	50 %	0 %	50 %	386829696
5	NC_017762	AT	3	6	1146	1151	50 %	50 %	0 %	0 %	386829696
6	NC_017762	TA	3	6	1361	1366	50 %	50 %	0 %	0 %	386829697
7	NC_017762	TA	3	6	4123	4128	50 %	50 %	0 %	0 %	386829702
8	NC_017762	AT	3	6	4310	4315	50 %	50 %	0 %	0 %	386829702
9	NC_017762	AT	3	6	4829	4834	50 %	50 %	0 %	0 %	386829703
10	NC_017762	TC	3	6	4930	4935	0 %	50 %	0 %	50 %	386829703
11	NC_017762	TA	4	8	5981	5988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017762	GT	3	6	6592	6597	0 %	50 %	50 %	0 %	386829707
13	NC_017762	AT	3	6	6735	6740	50 %	50 %	0 %	0 %	386829707
14	NC_017762	AT	3	6	6874	6879	50 %	50 %	0 %	0 %	386829707
15	NC_017762	TG	3	6	7404	7409	0 %	50 %	50 %	0 %	386829707
16	NC_017762	AT	3	6	7680	7685	50 %	50 %	0 %	0 %	386829707
17	NC_017762	AG	3	6	7689	7694	50 %	0 %	50 %	0 %	386829707
18	NC_017762	TA	3	6	8255	8260	50 %	50 %	0 %	0 %	386829708
19	NC_017762	AT	3	6	8693	8698	50 %	50 %	0 %	0 %	386829709
20	NC_017762	AT	3	6	8725	8730	50 %	50 %	0 %	0 %	386829709
21	NC_017762	AT	3	6	8994	8999	50 %	50 %	0 %	0 %	386829709
22	NC_017762	TG	3	6	9322	9327	0 %	50 %	50 %	0 %	386829709
23	NC_017762	AT	3	6	9563	9568	50 %	50 %	0 %	0 %	386829709
24	NC_017762	AG	3	6	9607	9612	50 %	0 %	50 %	0 %	386829709
25	NC_017762	TA	4	8	9744	9751	50 %	50 %	0 %	0 %	386829709
26	NC_017762	TC	4	8	10274	10281	0 %	50 %	0 %	50 %	386829709
27	NC_017762	TA	3	6	10650	10655	50 %	50 %	0 %	0 %	386829709
28	NC_017762	TA	3	6	10939	10944	50 %	50 %	0 %	0 %	386829710
29	NC_017762	CT	3	6	11723	11728	0 %	50 %	0 %	50 %	386829710
30	NC_017762	AT	3	6	12243	12248	50 %	50 %	0 %	0 %	386829710
31	NC_017762	AT	3	6	12897	12902	50 %	50 %	0 %	0 %	386829711
32	NC_017762	CT	3	6	13014	13019	0 %	50 %	0 %	50 %	386829711
33	NC_017762	AT	3	6	13167	13172	50 %	50 %	0 %	0 %	386829711
34	NC_017762	TA	3	6	13345	13350	50 %	50 %	0 %	0 %	386829712
35	NC_017762	TA	3	6	13450	13455	50 %	50 %	0 %	0 %	386829712
36	NC_017762	GT	3	6	13475	13480	0 %	50 %	50 %	0 %	386829712
37	NC_017762	TA	3	6	13498	13503	50 %	50 %	0 %	0 %	386829712
38	NC_017762	TC	3	6	13562	13567	0 %	50 %	0 %	50 %	386829712
39	NC_017762	TA	3	6	13672	13677	50 %	50 %	0 %	0 %	386829712
40	NC_017762	TA	3	6	14060	14065	50 %	50 %	0 %	0 %	386829713
41	NC_017762	TA	3	6	14473	14478	50 %	50 %	0 %	0 %	386829714
42	NC_017762	TG	3	6	15014	15019	0 %	50 %	50 %	0 %	386829714
43	NC_017762	AG	3	6	15041	15046	50 %	0 %	50 %	0 %	386829714
44	NC_017762	AT	3	6	15279	15284	50 %	50 %	0 %	0 %	386829715
45	NC_017762	AG	3	6	15425	15430	50 %	0 %	50 %	0 %	386829716
46	NC_017762	TG	3	6	15662	15667	0 %	50 %	50 %	0 %	386829716
47	NC_017762	CT	3	6	15745	15750	0 %	50 %	0 %	50 %	386829716
48	NC_017762	TC	4	8	15773	15780	0 %	50 %	0 %	50 %	386829716
49	NC_017762	TC	3	6	15898	15903	0 %	50 %	0 %	50 %	386829716
50	NC_017762	TA	3	6	16030	16035	50 %	50 %	0 %	0 %	386829716
51	NC_017762	TA	3	6	16326	16331	50 %	50 %	0 %	0 %	386829716
52	NC_017762	CA	3	6	17158	17163	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017762	TC	3	6	17311	17316	0 %	50 %	0 %	50 %	386829717
54	NC_017762	TC	4	8	17326	17333	0 %	50 %	0 %	50 %	386829717
55	NC_017762	AT	3	6	17755	17760	50 %	50 %	0 %	0 %	386829717
56	NC_017762	TA	3	6	17906	17911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017762	TC	3	6	18155	18160	0 %	50 %	0 %	50 %	386829718
58	NC_017762	TG	3	6	18255	18260	0 %	50 %	50 %	0 %	386829718
59	NC_017762	AC	3	6	18700	18705	50 %	0 %	0 %	50 %	386829718
60	NC_017762	AG	3	6	18728	18733	50 %	0 %	50 %	0 %	386829718
61	NC_017762	CT	3	6	18786	18791	0 %	50 %	0 %	50 %	386829718
62	NC_017762	GT	3	6	18839	18844	0 %	50 %	50 %	0 %	386829718
63	NC_017762	CT	3	6	18907	18912	0 %	50 %	0 %	50 %	386829718
64	NC_017762	AT	3	6	19350	19355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017762	AT	3	6	19379	19384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017762	TA	3	6	19627	19632	50 %	50 %	0 %	0 %	386829719
67	NC_017762	TA	3	6	19956	19961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017762	AC	3	6	20045	20050	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017762	TA	3	6	20117	20122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017762	AG	3	6	20329	20334	50 %	0 %	50 %	0 %	386829720
71	NC_017762	TA	3	6	20347	20352	50 %	50 %	0 %	0 %	386829720
72	NC_017762	TA	3	6	20570	20575	50 %	50 %	0 %	0 %	386829720
73	NC_017762	TA	3	6	21093	21098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017762	GT	4	8	21334	21341	0 %	50 %	50 %	0 %	386829721
75	NC_017762	CA	3	6	22216	22221	50 %	0 %	0 %	50 %	386829723
76	NC_017762	AT	3	6	22335	22340	50 %	50 %	0 %	0 %	386829723
77	NC_017762	AT	3	6	22342	22347	50 %	50 %	0 %	0 %	386829723
78	NC_017762	TA	3	6	22740	22745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017762	TA	3	6	22886	22891	50 %	50 %	0 %	0 %	386829724

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.