MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter cinaedi PAGU611 plasmid pHci1

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017762	T	6	6	1789	1794	0 %	100 %	0 %	0 %	386829697
2	NC_017762	T	6	6	1880	1885	0 %	100 %	0 %	0 %	386829697
3	NC_017762	T	6	6	2082	2087	0 %	100 %	0 %	0 %	386829698
4	NC_017762	T	7	7	2223	2229	0 %	100 %	0 %	0 %	386829699
5	NC_017762	T	6	6	2486	2491	0 %	100 %	0 %	0 %	386829699
6	NC_017762	A	6	6	2526	2531	100 %	0 %	0 %	0 %	386829699
7	NC_017762	T	6	6	3413	3418	0 %	100 %	0 %	0 %	386829701
8	NC_017762	A	6	6	3608	3613	100 %	0 %	0 %	0 %	386829701
9	NC_017762	T	6	6	3668	3673	0 %	100 %	0 %	0 %	386829701
10	NC_017762	T	7	7	3687	3693	0 %	100 %	0 %	0 %	386829701
11	NC_017762	T	7	7	3719	3725	0 %	100 %	0 %	0 %	386829701
12	NC_017762	T	7	7	3799	3805	0 %	100 %	0 %	0 %	386829701
13	NC_017762	T	6	6	4412	4417	0 %	100 %	0 %	0 %	386829702
14	NC_017762	T	6	6	5260	5265	0 %	100 %	0 %	0 %	386829704
15	NC_017762	A	6	6	5449	5454	100 %	0 %	0 %	0 %	386829704
16	NC_017762	T	6	6	5487	5492	0 %	100 %	0 %	0 %	386829704
17	NC_017762	T	6	6	5689	5694	0 %	100 %	0 %	0 %	386829704
18	NC_017762	T	6	6	5913	5918	0 %	100 %	0 %	0 %	386829705
19	NC_017762	T	6	6	6476	6481	0 %	100 %	0 %	0 %	386829707
20	NC_017762	T	7	7	6488	6494	0 %	100 %	0 %	0 %	386829707
21	NC_017762	T	6	6	6634	6639	0 %	100 %	0 %	0 %	386829707
22	NC_017762	T	6	6	6746	6751	0 %	100 %	0 %	0 %	386829707
23	NC_017762	A	6	6	6900	6905	100 %	0 %	0 %	0 %	386829707
24	NC_017762	T	7	7	7170	7176	0 %	100 %	0 %	0 %	386829707
25	NC_017762	T	6	6	7909	7914	0 %	100 %	0 %	0 %	386829708
26	NC_017762	T	6	6	8040	8045	0 %	100 %	0 %	0 %	386829708
27	NC_017762	A	6	6	8241	8246	100 %	0 %	0 %	0 %	386829708
28	NC_017762	T	6	6	8923	8928	0 %	100 %	0 %	0 %	386829709
29	NC_017762	A	7	7	10379	10385	100 %	0 %	0 %	0 %	386829709
30	NC_017762	A	6	6	10567	10572	100 %	0 %	0 %	0 %	386829709
31	NC_017762	T	7	7	11087	11093	0 %	100 %	0 %	0 %	386829710
32	NC_017762	A	6	6	11289	11294	100 %	0 %	0 %	0 %	386829710
33	NC_017762	T	6	6	11337	11342	0 %	100 %	0 %	0 %	386829710
34	NC_017762	T	6	6	12578	12583	0 %	100 %	0 %	0 %	386829710
35	NC_017762	T	6	6	12703	12708	0 %	100 %	0 %	0 %	386829711
36	NC_017762	T	7	7	12868	12874	0 %	100 %	0 %	0 %	386829711
37	NC_017762	A	6	6	13503	13508	100 %	0 %	0 %	0 %	386829712
38	NC_017762	A	6	6	13756	13761	100 %	0 %	0 %	0 %	386829712
39	NC_017762	T	6	6	13789	13794	0 %	100 %	0 %	0 %	386829712
40	NC_017762	T	7	7	14100	14106	0 %	100 %	0 %	0 %	386829713
41	NC_017762	A	6	6	14315	14320	100 %	0 %	0 %	0 %	386829713
42	NC_017762	T	6	6	16191	16196	0 %	100 %	0 %	0 %	386829716
43	NC_017762	A	6	6	16404	16409	100 %	0 %	0 %	0 %	386829716
44	NC_017762	A	6	6	16628	16633	100 %	0 %	0 %	0 %	386829716
45	NC_017762	A	6	6	17580	17585	100 %	0 %	0 %	0 %	386829717
46	NC_017762	T	6	6	18639	18644	0 %	100 %	0 %	0 %	386829718
47	NC_017762	T	6	6	18932	18937	0 %	100 %	0 %	0 %	386829718
48	NC_017762	T	6	6	19507	19512	0 %	100 %	0 %	0 %	386829719
49	NC_017762	A	6	6	19684	19689	100 %	0 %	0 %	0 %	386829719
50	NC_017762	A	6	6	20627	20632	100 %	0 %	0 %	0 %	386829720
51	NC_017762	A	6	6	21353	21358	100 %	0 %	0 %	0 %	386829721
52	NC_017762	T	6	6	21778	21783	0 %	100 %	0 %	0 %	386829722
53	NC_017762	A	7	7	22191	22197	100 %	0 %	0 %	0 %	386829723
54	NC_017762	T	6	6	22210	22215	0 %	100 %	0 %	0 %	386829723
55	NC_017762	A	6	6	22549	22554	100 %	0 %	0 %	0 %	386829723
56	NC_017762	T	7	7	22598	22604	0 %	100 %	0 %	0 %	386829723
57	NC_017762	A	8	8	22801	22808	100 %	0 %	0 %	0 %	386829724
58	NC_017762	A	6	6	22967	22972	100 %	0 %	0 %	0 %	386829724

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.