MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Helicobacter cinaedi PAGU611

Total Repeats: 943

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017761	TCTTAT	2	12	1780	1791	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386760822
2	NC_017761	AAACTC	2	12	2715	2726	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386760823
3	NC_017761	CTAGTC	2	12	2921	2932	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386760823
4	NC_017761	ATCAAT	2	12	4779	4790	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386760824
5	NC_017761	AGGCAC	2	12	4896	4907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386760824
6	NC_017761	CAATAA	2	12	7696	7707	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386760826
7	NC_017761	ATAGGA	2	12	8494	8505	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386760826
8	NC_017761	TGGCGA	2	12	15754	15765	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386760835
9	NC_017761	TTCTCT	2	12	15869	15880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386760835
10	NC_017761	GATTTT	2	12	16690	16701	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386760836
11	NC_017761	AAAATA	2	12	21533	21544	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017761	GCAATG	2	12	22098	22109	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017761	TGAAAG	2	12	25384	25395	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017761	ATATGA	2	12	27072	27083	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386760850
15	NC_017761	TCAGAT	2	12	27481	27492	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017761	TAGAGC	2	12	29332	29343	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402783482
17	NC_017761	AAAGAC	2	12	31503	31514	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	402783482
18	NC_017761	ATAAAA	2	12	32992	33003	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	402783482
19	NC_017761	AAGGCT	2	12	35912	35923	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402783679
20	NC_017761	GCATTG	2	12	39137	39148	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386760854
21	NC_017761	CAACTA	2	12	46297	46308	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386760863
22	NC_017761	TGGCAA	2	12	50574	50585	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386760868
23	NC_017761	GGTGAG	2	12	50612	50623	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	386760868
24	NC_017761	CAAGCA	2	12	52350	52361	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386760869
25	NC_017761	GCTTTG	2	12	52897	52908	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386760871
26	NC_017761	TCTTGC	2	12	55323	55334	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386760873
27	NC_017761	AAATGA	2	12	55509	55520	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386760873
28	NC_017761	CTTATA	2	12	57685	57696	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386760874
29	NC_017761	TTCTAT	2	12	58015	58026	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386760874
30	NC_017761	CCCTTG	2	12	58821	58832	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386760874
31	NC_017761	TGCTTA	2	12	59112	59123	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386760874
32	NC_017761	GAGTTT	2	12	60249	60260	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386760876
33	NC_017761	TGGCAA	2	12	61264	61275	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386760876
34	NC_017761	AAGATT	2	12	62844	62855	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017761	GATATG	2	12	64582	64593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402783484
36	NC_017761	CGACCC	2	12	67336	67347	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386760879
37	NC_017761	AAAAGA	2	12	71399	71410	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386760880
38	NC_017761	TCTTAA	2	12	79645	79656	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386760886
39	NC_017761	TAGCAA	2	12	82412	82423	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386760887
40	NC_017761	TTTTGC	2	12	83331	83342	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017761	CAAGCA	2	12	86121	86132	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386760889
42	NC_017761	ATTTGA	2	12	87753	87764	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386760891
43	NC_017761	ATGAAA	2	12	89586	89597	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386760892
44	NC_017761	ATAAGC	2	12	91628	91639	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386760895
45	NC_017761	GAATCT	2	12	94398	94409	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017761	AAATCT	2	12	95487	95498	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386760898
47	NC_017761	ACTTTG	2	12	98306	98317	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	402783489
48	NC_017761	GCAAAA	2	12	99275	99286	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	402783490
49	NC_017761	TTATAT	2	12	103364	103375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386760903
50	NC_017761	CAATCT	2	12	107615	107626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386760908
51	NC_017761	ATTTGC	2	12	108085	108096	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386760908
52	NC_017761	AATCTG	2	12	108567	108578	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386760909
53	NC_017761	GTGGGA	2	12	109172	109183	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	386760910
54	NC_017761	TATGAA	2	12	109846	109857	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386760910
55	NC_017761	CATAGA	2	12	111088	111099	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386760911
56	NC_017761	TGGCGG	2	12	112240	112251	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386760913
57	NC_017761	ATTTTT	2	12	112554	112565	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386760913
58	NC_017761	CAAAGC	2	12	113586	113597	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386760914
59	NC_017761	CTTTTA	2	12	114964	114975	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017761	CCAAGC	2	12	127692	127703	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386760925
61	NC_017761	AAGATT	2	12	132814	132825	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386760930
62	NC_017761	TTTCTA	2	12	134210	134221	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386760931
63	NC_017761	AGCCTT	2	12	135310	135321	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386760931
64	NC_017761	GCTCAA	2	12	136323	136334	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386760931
65	NC_017761	GTGTAG	2	12	137235	137246	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386760932
66	NC_017761	TGAGCT	2	12	138971	138982	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386760934
67	NC_017761	TCAAAG	2	12	141391	141402	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386760937
68	NC_017761	TTAAGA	2	12	141700	141711	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386760937
69	NC_017761	CGCCCA	2	12	146931	146942	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386760941
70	NC_017761	ATAAAA	2	12	149440	149451	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386760946
71	NC_017761	TGGCGT	2	12	153559	153570	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017761	ACAGGC	2	12	154271	154282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402783494
73	NC_017761	TTGGTT	2	12	154322	154333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402783494
74	NC_017761	GTTTAA	2	12	160637	160648	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017761	GATAAA	2	12	164822	164833	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386760950
76	NC_017761	AAAATA	2	12	165689	165700	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386760951
77	NC_017761	AGAGAT	2	12	166422	166433	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386760952
78	NC_017761	TAATTA	2	12	171014	171025	50 %	50 %	0 %	0 %	402783495
79	NC_017761	AGATTC	2	12	171266	171277	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402783495
80	NC_017761	AAGTGC	2	12	171969	171980	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386760957
81	NC_017761	TTGCTA	2	12	172128	172139	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386760957
82	NC_017761	TGCTTT	2	12	174846	174857	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386760960
83	NC_017761	CTTGTG	2	12	175085	175096	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386760960
84	NC_017761	CATTGT	2	12	175114	175125	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386760960
85	NC_017761	AAGCAA	2	12	177912	177923	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386760963
86	NC_017761	ATAAAA	2	12	181459	181470	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	402783496
87	NC_017761	TGCTAT	2	12	182770	182781	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386760967
88	NC_017761	AAGGCT	2	12	184154	184165	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386760968
89	NC_017761	CTTAAA	2	12	185574	185585	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_017761	ATTCAT	2	12	186260	186271	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386760971
91	NC_017761	ATATCA	2	12	187930	187941	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386760971
92	NC_017761	ATCTCT	2	12	188149	188160	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386760971
93	NC_017761	ATTGCT	2	12	191150	191161	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386760973
94	NC_017761	AAATTG	2	12	193540	193551	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386760975
95	NC_017761	AGTGCG	2	12	193683	193694	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386760975
96	NC_017761	TAAAGC	2	12	194072	194083	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386760975
97	NC_017761	TAAGCT	2	12	194511	194522	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386760976
98	NC_017761	TGCTAA	2	12	196353	196364	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386760979
99	NC_017761	GCTATC	2	12	198050	198061	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386760982
100	NC_017761	GAATCT	2	12	201092	201103	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386760985
101	NC_017761	TATCTC	2	12	202003	202014	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386760986
102	NC_017761	CATCTT	2	12	202557	202568	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386760986
103	NC_017761	AGTGTG	2	12	213417	213428	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	402783497
104	NC_017761	GCAATG	2	12	221519	221530	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_017761	AGATTA	2	12	225612	225623	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386761007
106	NC_017761	AACCAC	2	12	228833	228844	50 %	0 %	0 %	50 %	386761009
107	NC_017761	AGACAT	2	12	231614	231625	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386761011
108	NC_017761	AGCGAT	2	12	232252	232263	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386761012
109	NC_017761	TGCGGA	2	12	232533	232544	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386761013
110	NC_017761	ATAAAG	2	12	233493	233504	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386761015
111	NC_017761	TCAATG	2	12	234467	234478	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386761017
112	NC_017761	AAAATC	2	12	234643	234654	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386761017
113	NC_017761	TGTGCT	2	12	235086	235097	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386761018
114	NC_017761	TGAGCT	2	12	245471	245482	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386761026
115	NC_017761	ATTCTT	2	12	246207	246218	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_017761	CTTTTT	2	12	250644	250655	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_017761	TAAAAT	2	12	250668	250679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017761	CTTGTC	2	12	252025	252036	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386761039
119	NC_017761	TTATCA	2	12	258522	258533	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386761049
120	NC_017761	TTGCCT	2	12	261467	261478	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386761052
121	NC_017761	GCCCAA	2	12	262303	262314	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017761	ACAAGC	2	12	265148	265159	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386761056
123	NC_017761	GGCTTT	2	12	265477	265488	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386761056
124	NC_017761	TATTTT	2	12	266392	266403	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017761	AGCCAA	2	12	271826	271837	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386761061
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127	NC_017761	AAGTCC	2	12	274219	274230	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386761064
128	NC_017761	TTTTGT	2	12	275563	275574	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	386761064
129	NC_017761	CACCGC	2	12	276043	276054	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386761064
130	NC_017761	ATTTTT	2	12	276218	276229	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386761064
131	NC_017761	CAAGCC	2	12	276315	276326	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386761064
132	NC_017761	TAAACA	2	12	276708	276719	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386761064
133	NC_017761	CAAAGC	2	12	280867	280878	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386761067
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135	NC_017761	TCAATG	2	12	290746	290757	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386761077
136	NC_017761	TTATAA	2	12	290817	290828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017761	CTTGCC	2	12	295927	295938	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386761085
138	NC_017761	TTTGGA	2	12	298450	298461	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402783509
139	NC_017761	CTTTGG	2	12	304472	304483	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	402783510
140	NC_017761	ATAGTC	2	12	307825	307836	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386761094
141	NC_017761	GCCCAC	2	12	309711	309722	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386761095
142	NC_017761	GTTTAT	2	12	311938	311949	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017761	AAACTC	2	12	315596	315607	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386761100
144	NC_017761	CAAGGG	2	12	315895	315906	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386761100
145	NC_017761	ATCAAT	2	12	316219	316230	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386761101
146	NC_017761	GCTTTA	2	12	318671	318682	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386761102
147	NC_017761	AAATGG	2	12	322526	322537	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386761106
148	NC_017761	TACACC	2	12	330614	330625	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386761112
149	NC_017761	GCTCAA	2	12	335853	335864	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386761116
150	NC_017761	AGTGGT	2	12	338648	338659	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386761118
151	NC_017761	CACAGC	2	12	339445	339456	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386761119
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153	NC_017761	ACACCT	2	12	348805	348816	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386761127
154	NC_017761	ACAAGC	2	12	349341	349352	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386761128
155	NC_017761	TTGTTT	2	12	350277	350288	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	386761129
156	NC_017761	ACTTGC	2	12	354564	354575	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	402783680
157	NC_017761	GCTTAG	2	12	355393	355404	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386761133
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159	NC_017761	TGGGCT	2	12	363769	363780	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386761140
160	NC_017761	ATACAT	2	12	369695	369706	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386761148
161	NC_017761	AAGCCA	2	12	369831	369842	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386761148
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164	NC_017761	GCAGGG	2	12	373405	373416	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386761151
165	NC_017761	ATCACT	2	12	374216	374227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386761152
166	NC_017761	TGGCTA	2	12	374757	374768	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386761152
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171	NC_017761	ATGCAA	2	12	391630	391641	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402783516
172	NC_017761	AGTGAA	2	12	393518	393529	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386761163
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176	NC_017761	CCACTT	2	12	401968	401979	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386761172
177	NC_017761	CCTTAT	2	12	403203	403214	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
178	NC_017761	AGATTC	2	12	403791	403802	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386761174
179	NC_017761	AAAATC	2	12	406704	406715	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386761176
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182	NC_017761	AATGCT	2	12	412525	412536	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402783518
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185	NC_017761	ATAAGG	2	12	418430	418441	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386761187
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187	NC_017761	TATAAG	2	12	425825	425836	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
188	NC_017761	AAAAAG	2	12	437295	437306	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386761205
189	NC_017761	TTGCCA	2	12	440679	440690	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386761207
190	NC_017761	TAAACT	2	12	445344	445355	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
191	NC_017761	AGGGCT	2	12	448050	448061	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386761211
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198	NC_017761	TATCTT	2	12	468341	468352	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
199	NC_017761	GCAAAG	2	12	469852	469863	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386761223
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215	NC_017761	CCTATG	2	12	501811	501822	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386761251
216	NC_017761	TTTTCA	2	12	502799	502810	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386761252
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218	NC_017761	ATGCAA	2	12	509922	509933	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
219	NC_017761	CTGGGG	2	12	514009	514020	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386761263
220	NC_017761	GCTTTG	2	12	514336	514347	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386761263
221	NC_017761	GACTTT	2	12	519318	519329	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386761268
222	NC_017761	GAGATT	2	12	519550	519561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386761268
223	NC_017761	TGCTAA	2	12	519913	519924	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386761269
224	NC_017761	TCACAA	2	12	521569	521580	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386761272
225	NC_017761	AAAGCC	2	12	524072	524083	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386761276
226	NC_017761	TGCGTT	2	12	529203	529214	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386761281
227	NC_017761	TGTATT	2	12	529524	529535	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386761281
228	NC_017761	AAAGAC	2	12	530955	530966	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386761283
229	NC_017761	ATCCAA	2	12	532120	532131	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386761283
230	NC_017761	AGCAAA	2	12	532411	532422	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386761283
231	NC_017761	TGAAGA	2	12	532520	532531	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386761283
232	NC_017761	AAAATA	2	12	532641	532652	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386761283
233	NC_017761	GATATT	2	12	534863	534874	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386761286
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334	NC_017761	GCATTA	2	12	739251	739262	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402783557
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338	NC_017761	ACTCTC	2	12	741255	741266	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386761470
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344	NC_017761	TTTGCA	2	12	765600	765611	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386761495
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489	NC_017761	ATTTTC	2	12	1109409	1109420	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386761789
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