MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter cinaedi PAGU611

Total Repeats: 866

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017761	TCTTAT	2	12	1780	1791	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386760822
2	NC_017761	AAACTC	2	12	2715	2726	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386760823
3	NC_017761	CTAGTC	2	12	2921	2932	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386760823
4	NC_017761	ATCAAT	2	12	4779	4790	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386760824
5	NC_017761	AGGCAC	2	12	4896	4907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386760824
6	NC_017761	CAATAA	2	12	7696	7707	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386760826
7	NC_017761	ATAGGA	2	12	8494	8505	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386760826
8	NC_017761	TGGCGA	2	12	15754	15765	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386760835
9	NC_017761	TTCTCT	2	12	15869	15880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386760835
10	NC_017761	GATTTT	2	12	16690	16701	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386760836
11	NC_017761	ATATGA	2	12	27072	27083	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386760850
12	NC_017761	TAGAGC	2	12	29332	29343	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402783482
13	NC_017761	AAAGAC	2	12	31503	31514	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	402783482
14	NC_017761	ATAAAA	2	12	32992	33003	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	402783482
15	NC_017761	AAGGCT	2	12	35912	35923	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402783679
16	NC_017761	GCATTG	2	12	39137	39148	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386760854
17	NC_017761	CAACTA	2	12	46297	46308	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386760863
18	NC_017761	TGGCAA	2	12	50574	50585	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386760868
19	NC_017761	GGTGAG	2	12	50612	50623	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	386760868
20	NC_017761	CAAGCA	2	12	52350	52361	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386760869
21	NC_017761	GCTTTG	2	12	52897	52908	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386760871
22	NC_017761	TCTTGC	2	12	55323	55334	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386760873
23	NC_017761	AAATGA	2	12	55509	55520	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386760873
24	NC_017761	CTTATA	2	12	57685	57696	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386760874
25	NC_017761	TTCTAT	2	12	58015	58026	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386760874
26	NC_017761	CCCTTG	2	12	58821	58832	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386760874
27	NC_017761	TGCTTA	2	12	59112	59123	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386760874
28	NC_017761	GAGTTT	2	12	60249	60260	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386760876
29	NC_017761	TGGCAA	2	12	61264	61275	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386760876
30	NC_017761	GATATG	2	12	64582	64593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402783484
31	NC_017761	CGACCC	2	12	67336	67347	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386760879
32	NC_017761	AAAAGA	2	12	71399	71410	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386760880
33	NC_017761	TCTTAA	2	12	79645	79656	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386760886
34	NC_017761	TAGCAA	2	12	82412	82423	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386760887
35	NC_017761	CAAGCA	2	12	86121	86132	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386760889
36	NC_017761	ATTTGA	2	12	87753	87764	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386760891
37	NC_017761	ATGAAA	2	12	89586	89597	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386760892
38	NC_017761	ATAAGC	2	12	91628	91639	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386760895
39	NC_017761	AAATCT	2	12	95487	95498	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386760898
40	NC_017761	ACTTTG	2	12	98306	98317	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	402783489
41	NC_017761	GCAAAA	2	12	99275	99286	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	402783490
42	NC_017761	TTATAT	2	12	103364	103375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386760903
43	NC_017761	CAATCT	2	12	107615	107626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386760908
44	NC_017761	ATTTGC	2	12	108085	108096	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386760908
45	NC_017761	AATCTG	2	12	108567	108578	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386760909
46	NC_017761	GTGGGA	2	12	109172	109183	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	386760910
47	NC_017761	TATGAA	2	12	109846	109857	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386760910
48	NC_017761	CATAGA	2	12	111088	111099	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386760911
49	NC_017761	TGGCGG	2	12	112240	112251	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386760913
50	NC_017761	ATTTTT	2	12	112554	112565	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386760913
51	NC_017761	CAAAGC	2	12	113586	113597	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386760914
52	NC_017761	CCAAGC	2	12	127692	127703	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386760925
53	NC_017761	AAGATT	2	12	132814	132825	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386760930
54	NC_017761	TTTCTA	2	12	134210	134221	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386760931
55	NC_017761	AGCCTT	2	12	135310	135321	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386760931
56	NC_017761	GCTCAA	2	12	136323	136334	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386760931
57	NC_017761	GTGTAG	2	12	137235	137246	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386760932
58	NC_017761	TGAGCT	2	12	138971	138982	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386760934
59	NC_017761	TCAAAG	2	12	141391	141402	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386760937
60	NC_017761	TTAAGA	2	12	141700	141711	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386760937
61	NC_017761	CGCCCA	2	12	146931	146942	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386760941
62	NC_017761	ATAAAA	2	12	149440	149451	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386760946
63	NC_017761	ACAGGC	2	12	154271	154282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402783494
64	NC_017761	TTGGTT	2	12	154322	154333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402783494
65	NC_017761	GATAAA	2	12	164822	164833	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386760950
66	NC_017761	AAAATA	2	12	165689	165700	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386760951
67	NC_017761	AGAGAT	2	12	166422	166433	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386760952
68	NC_017761	TAATTA	2	12	171014	171025	50 %	50 %	0 %	0 %	402783495
69	NC_017761	AGATTC	2	12	171266	171277	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402783495
70	NC_017761	AAGTGC	2	12	171969	171980	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386760957
71	NC_017761	TTGCTA	2	12	172128	172139	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386760957
72	NC_017761	TGCTTT	2	12	174846	174857	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386760960
73	NC_017761	CTTGTG	2	12	175085	175096	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386760960
74	NC_017761	CATTGT	2	12	175114	175125	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386760960
75	NC_017761	AAGCAA	2	12	177912	177923	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386760963
76	NC_017761	ATAAAA	2	12	181459	181470	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	402783496
77	NC_017761	TGCTAT	2	12	182770	182781	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386760967
78	NC_017761	AAGGCT	2	12	184154	184165	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386760968
79	NC_017761	ATTCAT	2	12	186260	186271	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386760971
80	NC_017761	ATATCA	2	12	187930	187941	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386760971
81	NC_017761	ATCTCT	2	12	188149	188160	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386760971
82	NC_017761	ATTGCT	2	12	191150	191161	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386760973
83	NC_017761	AAATTG	2	12	193540	193551	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386760975
84	NC_017761	AGTGCG	2	12	193683	193694	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386760975
85	NC_017761	TAAAGC	2	12	194072	194083	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386760975
86	NC_017761	TAAGCT	2	12	194511	194522	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386760976
87	NC_017761	TGCTAA	2	12	196353	196364	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386760979
88	NC_017761	GCTATC	2	12	198050	198061	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386760982
89	NC_017761	GAATCT	2	12	201092	201103	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386760985
90	NC_017761	TATCTC	2	12	202003	202014	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386760986
91	NC_017761	CATCTT	2	12	202557	202568	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386760986
92	NC_017761	AGTGTG	2	12	213417	213428	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	402783497
93	NC_017761	AGATTA	2	12	225612	225623	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386761007
94	NC_017761	AACCAC	2	12	228833	228844	50 %	0 %	0 %	50 %	386761009
95	NC_017761	AGACAT	2	12	231614	231625	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386761011
96	NC_017761	AGCGAT	2	12	232252	232263	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386761012
97	NC_017761	TGCGGA	2	12	232533	232544	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386761013
98	NC_017761	ATAAAG	2	12	233493	233504	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386761015
99	NC_017761	TCAATG	2	12	234467	234478	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386761017
100	NC_017761	AAAATC	2	12	234643	234654	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386761017
101	NC_017761	TGTGCT	2	12	235086	235097	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386761018
102	NC_017761	TGAGCT	2	12	245471	245482	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386761026
103	NC_017761	CTTGTC	2	12	252025	252036	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386761039
104	NC_017761	TTATCA	2	12	258522	258533	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386761049
105	NC_017761	TTGCCT	2	12	261467	261478	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386761052
106	NC_017761	ACAAGC	2	12	265148	265159	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386761056
107	NC_017761	GGCTTT	2	12	265477	265488	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386761056
108	NC_017761	AGCCAA	2	12	271826	271837	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386761061
109	NC_017761	CAAGCC	2	12	272334	272345	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386761061
110	NC_017761	AAGTCC	2	12	274219	274230	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386761064
111	NC_017761	TTTTGT	2	12	275563	275574	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	386761064
112	NC_017761	CACCGC	2	12	276043	276054	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386761064
113	NC_017761	ATTTTT	2	12	276218	276229	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386761064
114	NC_017761	CAAGCC	2	12	276315	276326	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386761064
115	NC_017761	TAAACA	2	12	276708	276719	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386761064
116	NC_017761	CAAAGC	2	12	280867	280878	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386761067
117	NC_017761	TGCTTA	2	12	289062	289073	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386761076
118	NC_017761	TCAATG	2	12	290746	290757	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386761077
119	NC_017761	CTTGCC	2	12	295927	295938	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386761085
120	NC_017761	TTTGGA	2	12	298450	298461	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402783509
121	NC_017761	CTTTGG	2	12	304472	304483	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	402783510
122	NC_017761	ATAGTC	2	12	307825	307836	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386761094
123	NC_017761	GCCCAC	2	12	309711	309722	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386761095
124	NC_017761	AAACTC	2	12	315596	315607	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386761100
125	NC_017761	CAAGGG	2	12	315895	315906	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386761100
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130	NC_017761	GCTCAA	2	12	335853	335864	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386761116
131	NC_017761	AGTGGT	2	12	338648	338659	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386761118
132	NC_017761	CACAGC	2	12	339445	339456	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386761119
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135	NC_017761	ACAAGC	2	12	349341	349352	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386761128
136	NC_017761	TTGTTT	2	12	350277	350288	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	386761129
137	NC_017761	ACTTGC	2	12	354564	354575	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	402783680
138	NC_017761	GCTTAG	2	12	355393	355404	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386761133
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140	NC_017761	TGGGCT	2	12	363769	363780	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386761140
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145	NC_017761	GCAGGG	2	12	373405	373416	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386761151
146	NC_017761	ATCACT	2	12	374216	374227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386761152
147	NC_017761	TGGCTA	2	12	374757	374768	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386761152
148	NC_017761	CTCCCT	2	12	378311	378322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386761156
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231	NC_017761	TCATTG	2	12	585809	585820	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386761329
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342	NC_017761	AATATA	2	12	831545	831556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386761554
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