MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter cinaedi PAGU611

Total Repeats: 1649

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017761	GCCCT	2	10	3105	3114	0 %	20 %	20 %	60 %	386760823
2	NC_017761	AAAGC	2	10	3587	3596	60 %	0 %	20 %	20 %	386760823
3	NC_017761	TGGCG	2	10	6072	6081	0 %	20 %	60 %	20 %	386760825
4	NC_017761	ATTGT	2	10	7053	7062	20 %	60 %	20 %	0 %	386760826
5	NC_017761	CGTGT	2	10	7641	7650	0 %	40 %	40 %	20 %	386760826
6	NC_017761	TGATT	2	10	7906	7915	20 %	60 %	20 %	0 %	386760826
7	NC_017761	AGATA	2	10	9215	9224	60 %	20 %	20 %	0 %	386760828
8	NC_017761	CACAA	2	10	12563	12572	60 %	0 %	0 %	40 %	386760831
9	NC_017761	GCAAG	2	10	13437	13446	40 %	0 %	40 %	20 %	402783481
10	NC_017761	CATTT	2	10	16042	16051	20 %	60 %	0 %	20 %	386760835
11	NC_017761	TGTGG	2	10	16486	16495	0 %	40 %	60 %	0 %	386760836
12	NC_017761	AGGCA	2	10	16707	16716	40 %	0 %	40 %	20 %	386760836
13	NC_017761	ACAAT	2	10	17080	17089	60 %	20 %	0 %	20 %	386760836
14	NC_017761	TATCA	2	10	17178	17187	40 %	40 %	0 %	20 %	386760837
15	NC_017761	GATAG	2	10	17467	17476	40 %	20 %	40 %	0 %	386760838
16	NC_017761	TACTC	2	10	18770	18779	20 %	40 %	0 %	40 %	386760838
17	NC_017761	ATGGT	2	10	19809	19818	20 %	40 %	40 %	0 %	386760839
18	NC_017761	TAGCA	2	10	19912	19921	40 %	20 %	20 %	20 %	386760839
19	NC_017761	AATAG	2	10	20385	20394	60 %	20 %	20 %	0 %	386760840
20	NC_017761	GATAT	2	10	21301	21310	40 %	40 %	20 %	0 %	386760840
21	NC_017761	TTTTC	2	10	23905	23914	0 %	80 %	0 %	20 %	386760846
22	NC_017761	ACTTC	2	10	25977	25986	20 %	40 %	0 %	40 %	386760848
23	NC_017761	CCCCA	2	10	32795	32804	20 %	0 %	0 %	80 %	402783482
24	NC_017761	TTCTT	2	10	35779	35788	0 %	80 %	0 %	20 %	402783679
25	NC_017761	AGCCA	2	10	36128	36137	40 %	0 %	20 %	40 %	402783679
26	NC_017761	CAAAA	2	10	38955	38964	80 %	0 %	0 %	20 %	386760854
27	NC_017761	TTTGA	2	10	40887	40896	20 %	60 %	20 %	0 %	386760857
28	NC_017761	CGCAC	2	10	41316	41325	20 %	0 %	20 %	60 %	386760859
29	NC_017761	TAAGC	2	10	41426	41435	40 %	20 %	20 %	20 %	386760859
30	NC_017761	ACAAA	2	10	41899	41908	80 %	0 %	0 %	20 %	386760860
31	NC_017761	GAGCG	2	10	42119	42128	20 %	0 %	60 %	20 %	386760860
32	NC_017761	TTTGT	2	10	43385	43394	0 %	80 %	20 %	0 %	386760862
33	NC_017761	GCACA	2	10	45971	45980	40 %	0 %	20 %	40 %	386760863
34	NC_017761	AGAAA	2	10	46064	46073	80 %	0 %	20 %	0 %	386760863
35	NC_017761	GGAGA	2	10	47674	47683	40 %	0 %	60 %	0 %	386760864
36	NC_017761	TTACA	2	10	48002	48011	40 %	40 %	0 %	20 %	386760864
37	NC_017761	ATAGC	2	10	52034	52043	40 %	20 %	20 %	20 %	386760869
38	NC_017761	CTTAT	2	10	52914	52923	20 %	60 %	0 %	20 %	386760871
39	NC_017761	CGCTT	2	10	52973	52982	0 %	40 %	20 %	40 %	386760871
40	NC_017761	TTGCT	2	10	55983	55992	0 %	60 %	20 %	20 %	386760873
41	NC_017761	TTAGC	2	10	57205	57214	20 %	40 %	20 %	20 %	386760873
42	NC_017761	TTTGC	2	10	57234	57243	0 %	60 %	20 %	20 %	386760874
43	NC_017761	TAAAA	2	10	58417	58426	80 %	20 %	0 %	0 %	386760874
44	NC_017761	GAAAT	2	10	60523	60532	60 %	20 %	20 %	0 %	386760876
45	NC_017761	CTTTG	2	10	61486	61495	0 %	60 %	20 %	20 %	386760876
46	NC_017761	ATTTT	2	10	61865	61874	20 %	80 %	0 %	0 %	386760877
47	NC_017761	GCAAG	2	10	62061	62070	40 %	0 %	40 %	20 %	386760877
48	NC_017761	ATTTG	2	10	63561	63570	20 %	60 %	20 %	0 %	386760878
49	NC_017761	GCGTG	2	10	64432	64441	0 %	20 %	60 %	20 %	402783484
50	NC_017761	AAGAG	2	10	65248	65257	60 %	0 %	40 %	0 %	402783484
51	NC_017761	TCTCA	2	10	68630	68639	20 %	40 %	0 %	40 %	402783485
52	NC_017761	TCAAA	2	10	68727	68736	60 %	20 %	0 %	20 %	402783485
53	NC_017761	ATTTA	2	10	69170	69179	40 %	60 %	0 %	0 %	402783485
54	NC_017761	GGGAA	2	10	69374	69383	40 %	0 %	60 %	0 %	402783485
55	NC_017761	AAGTG	2	10	69768	69777	40 %	20 %	40 %	0 %	402783485
56	NC_017761	ATGCA	2	10	70759	70768	40 %	20 %	20 %	20 %	386760880
57	NC_017761	CATAT	2	10	71285	71294	40 %	40 %	0 %	20 %	386760880
58	NC_017761	AAAGC	2	10	72156	72165	60 %	0 %	20 %	20 %	386760880
59	NC_017761	CTACA	2	10	72472	72481	40 %	20 %	0 %	40 %	386760881
60	NC_017761	GCTAT	2	10	73638	73647	20 %	40 %	20 %	20 %	386760882
61	NC_017761	CTTCT	2	10	79253	79262	0 %	60 %	0 %	40 %	386760885
62	NC_017761	AATGG	2	10	81844	81853	40 %	20 %	40 %	0 %	386760886
63	NC_017761	TCTAT	2	10	82579	82588	20 %	60 %	0 %	20 %	386760887
64	NC_017761	GGGCA	2	10	83917	83926	20 %	0 %	60 %	20 %	386760888
65	NC_017761	GCAAA	2	10	84579	84588	60 %	0 %	20 %	20 %	402783486
66	NC_017761	TAAAT	2	10	84983	84992	60 %	40 %	0 %	0 %	402783486
67	NC_017761	GGAGA	2	10	88030	88039	40 %	0 %	60 %	0 %	386760891
68	NC_017761	TGAAG	2	10	89506	89515	40 %	20 %	40 %	0 %	386760892
69	NC_017761	CATAT	2	10	90123	90132	40 %	40 %	0 %	20 %	386760893
70	NC_017761	CAAGC	2	10	90779	90788	40 %	0 %	20 %	40 %	386760894
71	NC_017761	GTGGG	2	10	92559	92568	0 %	20 %	80 %	0 %	386760895
72	NC_017761	CAAAG	2	10	93255	93264	60 %	0 %	20 %	20 %	386760895
73	NC_017761	TGGTG	2	10	93492	93501	0 %	40 %	60 %	0 %	386760895
74	NC_017761	GCTAG	2	10	93931	93940	20 %	20 %	40 %	20 %	386760896
75	NC_017761	GATGA	2	10	95607	95616	40 %	20 %	40 %	0 %	386760898
76	NC_017761	AAGAA	2	10	96155	96164	80 %	0 %	20 %	0 %	386760899
77	NC_017761	TTTGA	2	10	97105	97114	20 %	60 %	20 %	0 %	402783488
78	NC_017761	AAACA	2	10	97460	97469	80 %	0 %	0 %	20 %	402783488
79	NC_017761	ATTGC	2	10	98101	98110	20 %	40 %	20 %	20 %	402783489
80	NC_017761	CATTG	2	10	100085	100094	20 %	40 %	20 %	20 %	386760900
81	NC_017761	GCTCT	2	10	102053	102062	0 %	40 %	20 %	40 %	386760902
82	NC_017761	TTGAT	2	10	103054	103063	20 %	60 %	20 %	0 %	386760903
83	NC_017761	TTACC	2	10	103267	103276	20 %	40 %	0 %	40 %	386760903
84	NC_017761	ACGCA	2	10	103758	103767	40 %	0 %	20 %	40 %	386760903
85	NC_017761	ACGCA	2	10	104888	104897	40 %	0 %	20 %	40 %	386760904
86	NC_017761	GATAA	2	10	104984	104993	60 %	20 %	20 %	0 %	386760904
87	NC_017761	AAAAT	2	10	106474	106483	80 %	20 %	0 %	0 %	386760905
88	NC_017761	GCTTG	2	10	106729	106738	0 %	40 %	40 %	20 %	386760906
89	NC_017761	TCTTT	2	10	112356	112365	0 %	80 %	0 %	20 %	386760913
90	NC_017761	TTGCG	2	10	112774	112783	0 %	40 %	40 %	20 %	386760913
91	NC_017761	TTGGC	2	10	115380	115389	0 %	40 %	40 %	20 %	386760915
92	NC_017761	AGGGC	2	10	115763	115772	20 %	0 %	60 %	20 %	386760915
93	NC_017761	AGCAA	2	10	116102	116111	60 %	0 %	20 %	20 %	386760916
94	NC_017761	AAAAG	2	10	116524	116533	80 %	0 %	20 %	0 %	386760916
95	NC_017761	AGATA	2	10	117457	117466	60 %	20 %	20 %	0 %	386760917
96	NC_017761	ATAAA	2	10	119228	119237	80 %	20 %	0 %	0 %	386760919
97	NC_017761	CTTAT	2	10	120528	120537	20 %	60 %	0 %	20 %	386760920
98	NC_017761	GGCAG	2	10	120744	120753	20 %	0 %	60 %	20 %	386760920
99	NC_017761	AGGCA	2	10	121280	121289	40 %	0 %	40 %	20 %	386760920
100	NC_017761	TGTTT	2	10	122246	122255	0 %	80 %	20 %	0 %	386760921
101	NC_017761	AGCAC	2	10	122776	122785	40 %	0 %	20 %	40 %	386760921
102	NC_017761	GATAG	2	10	123693	123702	40 %	20 %	40 %	0 %	386760922
103	NC_017761	ACCAC	2	10	124119	124128	40 %	0 %	0 %	60 %	386760923
104	NC_017761	CAGCA	2	10	124451	124460	40 %	0 %	20 %	40 %	386760923
105	NC_017761	AATCT	2	10	124554	124563	40 %	40 %	0 %	20 %	386760923
106	NC_017761	GCTTT	2	10	125780	125789	0 %	60 %	20 %	20 %	386760923
107	NC_017761	TTTGG	2	10	126991	127000	0 %	60 %	40 %	0 %	386760925
108	NC_017761	CTTTG	2	10	128966	128975	0 %	60 %	20 %	20 %	386760927
109	NC_017761	TGAGA	2	10	130163	130172	40 %	20 %	40 %	0 %	386760928
110	NC_017761	CCATA	2	10	130481	130490	40 %	20 %	0 %	40 %	386760928
111	NC_017761	CAGCA	2	10	131084	131093	40 %	0 %	20 %	40 %	386760929
112	NC_017761	TGAGA	2	10	131732	131741	40 %	20 %	40 %	0 %	386760929
113	NC_017761	AATCA	2	10	132157	132166	60 %	20 %	0 %	20 %	386760930
114	NC_017761	GGCGA	2	10	132188	132197	20 %	0 %	60 %	20 %	386760930
115	NC_017761	ATTCC	2	10	133191	133200	20 %	40 %	0 %	40 %	386760930
116	NC_017761	AAGCA	2	10	133990	133999	60 %	0 %	20 %	20 %	386760930
117	NC_017761	CATTT	2	10	134572	134581	20 %	60 %	0 %	20 %	386760931
118	NC_017761	ATAGA	2	10	136155	136164	60 %	20 %	20 %	0 %	386760931
119	NC_017761	TTTGC	2	10	137137	137146	0 %	60 %	20 %	20 %	386760932
120	NC_017761	GCTGT	2	10	139141	139150	0 %	40 %	40 %	20 %	386760934
121	NC_017761	ATGTG	2	10	140117	140126	20 %	40 %	40 %	0 %	386760936
122	NC_017761	TCATA	2	10	140495	140504	40 %	40 %	0 %	20 %	386760936
123	NC_017761	TTTTA	2	10	141087	141096	20 %	80 %	0 %	0 %	386760937
124	NC_017761	GGTAA	2	10	142023	142032	40 %	20 %	40 %	0 %	386760937
125	NC_017761	AGGCT	2	10	143232	143241	20 %	20 %	40 %	20 %	386760938
126	NC_017761	AGCTT	2	10	145532	145541	20 %	40 %	20 %	20 %	386760939
127	NC_017761	ATCTT	2	10	146428	146437	20 %	60 %	0 %	20 %	386760940
128	NC_017761	TGCAA	2	10	146904	146913	40 %	20 %	20 %	20 %	386760941
129	NC_017761	GGAGC	2	10	150083	150092	20 %	0 %	60 %	20 %	386760947
130	NC_017761	TATAG	2	10	150766	150775	40 %	40 %	20 %	0 %	402783492
131	NC_017761	GCTTT	2	10	151000	151009	0 %	60 %	20 %	20 %	386760948
132	NC_017761	GCTTT	2	10	162960	162969	0 %	60 %	20 %	20 %	386760949
133	NC_017761	TAAAA	2	10	164545	164554	80 %	20 %	0 %	0 %	386760950
134	NC_017761	ATCTT	2	10	164995	165004	20 %	60 %	0 %	20 %	386760951
135	NC_017761	ATACA	2	10	166298	166307	60 %	20 %	0 %	20 %	386760952
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