MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Helicobacter cinaedi PAGU611

Total Repeats: 20846

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017761	ATA	2	6	11	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386760821
2	NC_017761	ATG	2	6	83	88	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386760821
3	NC_017761	GGA	2	6	192	197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386760821
4	NC_017761	CAA	2	6	397	402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386760821
5	NC_017761	TGT	2	6	422	427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386760821
6	NC_017761	TGT	2	6	480	485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386760821
7	NC_017761	GCT	2	6	528	533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386760821
8	NC_017761	ATG	2	6	617	622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386760821
9	NC_017761	AAG	2	6	653	658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386760821
10	NC_017761	TGA	2	6	707	712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386760821
11	NC_017761	AGA	2	6	747	752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386760821
12	NC_017761	ATT	2	6	826	831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386760821
13	NC_017761	ATA	2	6	1043	1048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386760821
14	NC_017761	TTG	2	6	1058	1063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386760821
15	NC_017761	GTG	2	6	1138	1143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386760821
16	NC_017761	GAT	2	6	1182	1187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386760821
17	NC_017761	GAG	2	6	1288	1293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386760821
18	NC_017761	CAG	2	6	1309	1314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386760821
19	NC_017761	ATT	2	6	1386	1391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017761	GAA	2	6	1580	1585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386760822
21	NC_017761	GTT	2	6	1645	1650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386760822
22	NC_017761	TAT	2	6	1651	1656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386760822
23	NC_017761	ATG	2	6	1826	1831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386760822
24	NC_017761	TGG	2	6	1848	1853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386760822
25	NC_017761	ATT	2	6	1857	1862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386760822
26	NC_017761	GCA	2	6	2316	2321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386760822
27	NC_017761	AAT	2	6	2420	2425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386760822
28	NC_017761	GCA	2	6	2471	2476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386760822
29	NC_017761	GGC	2	6	2549	2554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386760822
30	NC_017761	TAT	2	6	2581	2586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386760822
31	NC_017761	AAG	2	6	2630	2635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386760822
32	NC_017761	CTT	2	6	2678	2683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386760823
33	NC_017761	CTG	2	6	2764	2769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386760823
34	NC_017761	TGA	2	6	2908	2913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386760823
35	NC_017761	AAG	2	6	3003	3008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386760823
36	NC_017761	TCA	2	6	3031	3036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386760823
37	NC_017761	TCT	2	6	3148	3153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386760823
38	NC_017761	TAA	2	6	3213	3218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386760823
39	NC_017761	AAT	2	6	3240	3245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386760823
40	NC_017761	TAA	2	6	3296	3301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386760823
41	NC_017761	ATC	2	6	3313	3318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386760823
42	NC_017761	TGC	2	6	3535	3540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386760823
43	NC_017761	TCA	2	6	3541	3546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386760823
44	NC_017761	TCA	2	6	3548	3553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386760823
45	NC_017761	GAT	2	6	3606	3611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386760823
46	NC_017761	CTT	2	6	3629	3634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386760823
47	NC_017761	CTT	2	6	3701	3706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386760823
48	NC_017761	GCC	2	6	3827	3832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386760823
49	NC_017761	TGC	2	6	3883	3888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386760823
50	NC_017761	TCT	2	6	3968	3973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386760823
51	NC_017761	ATC	2	6	4168	4173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386760823
52	NC_017761	ATC	2	6	4231	4236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386760823
53	NC_017761	AGC	2	6	4348	4353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386760823
54	NC_017761	GTG	2	6	4489	4494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386760823
55	NC_017761	TGG	2	6	4516	4521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386760823
56	NC_017761	ATA	2	6	4522	4527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386760823
57	NC_017761	CAC	2	6	4669	4674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386760824
58	NC_017761	ACT	2	6	4758	4763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386760824
59	NC_017761	GTG	2	6	4846	4851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386760824
60	NC_017761	TAA	2	6	4884	4889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386760824
61	NC_017761	TTG	2	6	4982	4987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386760824
62	NC_017761	AAT	2	6	4989	4994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386760824
63	NC_017761	GCA	2	6	5005	5010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386760824
64	NC_017761	TCA	2	6	5090	5095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386760824
65	NC_017761	GTG	2	6	5292	5297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386760824
66	NC_017761	TTA	2	6	5374	5379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386760824
67	NC_017761	ATG	2	6	5682	5687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017761	TAT	2	6	5885	5890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386760825
69	NC_017761	GTG	2	6	5955	5960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386760825
70	NC_017761	GCG	2	6	6169	6174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386760825
71	NC_017761	TTA	2	6	6293	6298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386760825
72	NC_017761	TCA	2	6	6377	6382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386760825
73	NC_017761	GAG	2	6	6390	6395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386760825
74	NC_017761	TGG	2	6	6412	6417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386760825
75	NC_017761	GGC	2	6	6778	6783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386760826
76	NC_017761	TAT	2	6	6844	6849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386760826
77	NC_017761	CTG	3	9	6871	6879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386760826
78	NC_017761	ATA	2	6	6951	6956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386760826
79	NC_017761	TGA	2	6	7042	7047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386760826
80	NC_017761	ATA	2	6	7064	7069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386760826
81	NC_017761	TGA	2	6	7070	7075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386760826
82	NC_017761	CTT	2	6	7097	7102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386760826
83	NC_017761	TCA	2	6	7173	7178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386760826
84	NC_017761	AGC	2	6	7284	7289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386760826
85	NC_017761	CTT	2	6	7297	7302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386760826
86	NC_017761	TCA	2	6	7362	7367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386760826
87	NC_017761	ATT	2	6	7388	7393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386760826
88	NC_017761	TCA	2	6	7396	7401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386760826
89	NC_017761	CCA	2	6	7431	7436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386760826
90	NC_017761	ATT	2	6	7466	7471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386760826
91	NC_017761	TAG	2	6	7593	7598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386760826
92	NC_017761	TCA	2	6	7656	7661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386760826
93	NC_017761	CAG	2	6	7735	7740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386760826
94	NC_017761	TAT	2	6	7837	7842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386760826
95	NC_017761	ATA	2	6	7952	7957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386760826
96	NC_017761	CTG	2	6	8011	8016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386760826
97	NC_017761	CAA	3	9	8095	8103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386760826
98	NC_017761	CTT	2	6	8161	8166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386760826
99	NC_017761	TCT	2	6	8172	8177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386760826
100	NC_017761	GCA	2	6	8190	8195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386760826
101	NC_017761	TAA	2	6	8285	8290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386760826
102	NC_017761	AAG	2	6	8345	8350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386760826
103	NC_017761	TGC	2	6	8366	8371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386760826
104	NC_017761	TCC	2	6	8418	8423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386760826
105	NC_017761	AAT	2	6	8567	8572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017761	CCA	3	9	8855	8863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386760827
107	NC_017761	TTG	2	6	8871	8876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386760827
108	NC_017761	ATA	2	6	8971	8976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386760828
109	NC_017761	ATA	2	6	9229	9234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386760828
110	NC_017761	CAC	2	6	9255	9260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386760828
111	NC_017761	TGC	3	9	9309	9317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386760828
112	NC_017761	CCG	2	6	9349	9354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386760828
113	NC_017761	TGC	3	9	9513	9521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386760828
114	NC_017761	ACT	2	6	9610	9615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386760828
115	NC_017761	CCA	2	6	9617	9622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386760828
116	NC_017761	AAG	2	6	9633	9638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386760828
117	NC_017761	TAA	2	6	9677	9682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386760828
118	NC_017761	GAT	2	6	9749	9754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386760828
119	NC_017761	TGC	2	6	9791	9796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386760828
120	NC_017761	AAT	2	6	9810	9815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386760828
121	NC_017761	GGA	2	6	9843	9848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386760828
122	NC_017761	AGC	2	6	9880	9885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386760828
123	NC_017761	TCA	2	6	9914	9919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386760828
124	NC_017761	GTT	2	6	10049	10054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017761	GAG	2	6	10076	10081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017761	AAG	2	6	10180	10185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017761	TGA	2	6	10198	10203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386760829
128	NC_017761	TAG	2	6	10253	10258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386760829
129	NC_017761	TCT	2	6	10439	10444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017761	TTC	2	6	10456	10461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017761	TGA	2	6	10510	10515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386760830
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