MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus sp. JS chromosome

Total Repeats: 476

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017743	TCGTG	2	10	10827	10836	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017743	GGACG	2	10	11700	11709	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017743	AATAA	2	10	18903	18912	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017743	TCGTG	2	10	31292	31301	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017743	GGACG	2	10	32164	32173	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017743	ATAGG	2	10	48410	48419	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017743	GAAAA	2	10	52157	52166	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017743	ATGAA	2	10	75702	75711	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017743	AAAGT	2	10	79108	79117	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017743	TCGTG	2	10	91665	91674	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017743	GGACG	2	10	92361	92370	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017743	AATAG	2	10	96094	96103	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017743	TCGTG	2	10	97523	97532	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017743	GGACG	2	10	98218	98227	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017743	TATAA	2	10	101339	101348	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017743	ACATG	2	10	111076	111085	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017743	TGACA	2	10	119870	119879	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017743	TTACG	2	10	119991	120000	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017743	TATAA	2	10	135215	135224	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017743	TTGTG	2	10	153831	153840	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017743	TTCAT	2	10	154890	154899	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017743	TCGTG	2	10	162018	162027	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017743	GGACG	2	10	162714	162723	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017743	AATAG	2	10	166207	166216	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017743	TCGTG	2	10	167634	167643	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017743	GGACG	2	10	168330	168339	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017743	AAGTT	2	10	171308	171317	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017743	TCGTG	2	10	172638	172647	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017743	GGACG	2	10	173334	173343	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017743	CAATA	2	10	181253	181262	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_017743	CAATA	2	10	181332	181341	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017743	CCCCT	2	10	195466	195475	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
33	NC_017743	TGCTT	2	10	198340	198349	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017743	ATAAA	2	10	198359	198368	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017743	ACAAG	2	10	204153	204162	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017743	CTTGT	2	10	204250	204259	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017743	ACTTA	2	10	209249	209258	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017743	TAAAA	2	10	209448	209457	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017743	TTATT	2	10	249442	249451	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017743	TTCAT	2	10	271370	271379	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017743	TTGCT	2	10	271520	271529	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017743	AGCTG	2	10	271933	271942	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017743	GCGCA	2	10	334890	334899	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
44	NC_017743	TTTTA	2	10	370392	370401	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017743	TGAAA	2	10	408168	408177	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017743	GAAGC	2	10	408739	408748	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017743	GACAT	2	10	441607	441616	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017743	TCACC	2	10	451408	451417	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
49	NC_017743	ATTTT	2	10	481481	481490	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017743	GGAAG	2	10	489065	489074	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017743	TGTTT	2	10	489962	489971	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017743	ATAAA	2	10	504938	504947	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017743	TTTCC	2	10	532884	532893	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_017743	CCTTA	2	10	534697	534706	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_017743	TTCAA	2	10	534970	534979	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017743	ATAAA	2	10	535606	535615	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017743	TAGGG	2	10	548315	548324	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017743	TGGTG	2	10	550451	550460	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017743	CCAAA	2	10	556884	556893	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
60	NC_017743	TAATA	2	10	559806	559815	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017743	ATAAA	2	10	579151	579160	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017743	CATTC	2	10	583454	583463	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
63	NC_017743	CTAAA	2	10	583506	583515	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017743	TATCA	2	10	585018	585027	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_017743	CTCTT	2	10	591695	591704	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
66	NC_017743	TTTTA	2	10	591734	591743	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017743	CAATT	2	10	616260	616269	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017743	AACAG	2	10	618704	618713	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017743	TATCA	2	10	619319	619328	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017743	GTACA	2	10	623040	623049	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_017743	ATCAA	2	10	632413	632422	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017743	GCTAG	2	10	633731	633740	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_017743	GAAGG	2	10	633950	633959	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017743	ACAAA	2	10	654495	654504	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_017743	TCGTG	2	10	656096	656105	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017743	GGACG	2	10	656792	656801	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017743	AAACG	2	10	660162	660171	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017743	GAGAA	2	10	668398	668407	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017743	AAATC	2	10	671895	671904	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017743	TAATT	2	10	671931	671940	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017743	GCATA	2	10	672443	672452	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017743	GGGAA	2	10	673158	673167	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017743	AATCT	2	10	673681	673690	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_017743	TTGTA	2	10	673762	673771	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017743	AATAT	2	10	676910	676919	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017743	ATTTT	2	10	677348	677357	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017743	AGATT	2	10	677459	677468	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017743	TTTTC	2	10	701745	701754	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017743	GAAAT	2	10	704881	704890	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017743	TGACT	2	10	723163	723172	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_017743	TGCAA	2	10	725612	725621	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_017743	AGGAA	2	10	748661	748670	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017743	TATTT	2	10	797118	797127	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017743	TATAT	2	10	811055	811064	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017743	TTATT	2	10	811461	811470	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017743	AACCA	2	10	818519	818528	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
97	NC_017743	GAAAG	2	10	850510	850519	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017743	TTTGA	2	10	853795	853804	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017743	CATTT	2	10	866151	866160	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017743	CTAAT	2	10	870794	870803	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_017743	AGGTC	2	10	876412	876421	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_017743	AGGAA	2	10	877683	877692	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017743	GAAAA	2	10	930881	930890	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017743	TAAAA	2	10	931801	931810	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017743	ATCTT	2	10	932465	932474	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017743	ACGGG	2	10	945280	945289	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
107	NC_017743	ATGTT	2	10	949196	949205	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017743	TAAAA	2	10	951921	951930	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017743	CGCTC	2	10	972034	972043	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
110	NC_017743	TCGTG	2	10	1000564	1000573	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
111	NC_017743	GGACG	2	10	1001260	1001269	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
112	NC_017743	CTACT	2	10	1013935	1013944	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_017743	GTATA	2	10	1019674	1019683	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017743	GTTTC	2	10	1019922	1019931	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_017743	AAAAG	2	10	1041469	1041478	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017743	ATCAT	2	10	1051458	1051467	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_017743	ATATT	2	10	1075333	1075342	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017743	AAATA	2	10	1077629	1077638	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017743	AGTGG	2	10	1109027	1109036	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017743	AAATT	2	10	1125595	1125604	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017743	ATTAC	2	10	1126295	1126304	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017743	AATAA	2	10	1128083	1128092	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017743	AAATA	2	10	1130823	1130832	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017743	ATTGA	2	10	1144004	1144013	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017743	ACCTA	2	10	1152376	1152385	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
126	NC_017743	CATAA	2	10	1170050	1170059	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_017743	ATTTT	2	10	1199716	1199725	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017743	AAGCC	2	10	1214652	1214661	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
129	NC_017743	TTTTC	2	10	1219570	1219579	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_017743	GTAAA	2	10	1238346	1238355	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017743	ATTCT	2	10	1252839	1252848	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_017743	CATAC	2	10	1252858	1252867	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
133	NC_017743	TTTCT	2	10	1253009	1253018	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017743	TGTTT	2	10	1253840	1253849	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017743	AATAT	2	10	1265019	1265028	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017743	CTTTT	2	10	1267271	1267280	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_017743	GGCAT	2	10	1268000	1268009	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_017743	GAATG	2	10	1269019	1269028	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017743	CAATT	2	10	1273450	1273459	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_017743	TTCAG	2	10	1276086	1276095	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_017743	GAAGG	2	10	1277157	1277166	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017743	TCATA	2	10	1283192	1283201	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_017743	TGATA	2	10	1284666	1284675	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017743	TATGA	2	10	1295820	1295829	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017743	CCTTG	2	10	1301388	1301397	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
146	NC_017743	TATCA	2	10	1304136	1304145	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.