MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori PeCan18 chromosome

Total Repeats: 774

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017742	ATTATA	2	12	1795	1806	50 %	50 %	0 %	0 %	386755088
2	NC_017742	GTTAGT	2	12	4768	4779	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017742	CGCTTG	2	12	6439	6450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386755091
4	NC_017742	TGCCAT	2	12	7125	7136	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386755091
5	NC_017742	GAAACC	2	12	7934	7945	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386755092
6	NC_017742	ATTATA	2	12	9953	9964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017742	AACGAT	2	12	10653	10664	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386755094
8	NC_017742	ACCAAA	2	12	14436	14447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386755098
9	NC_017742	AAACAC	2	12	18521	18532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017742	AGAAAA	2	12	18871	18882	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386755101
11	NC_017742	GATAAA	2	12	22460	22471	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386755104
12	NC_017742	CAATTC	2	12	27193	27204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386755107
13	NC_017742	TAGCCC	2	12	28149	28160	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386755108
14	NC_017742	TATCAA	2	12	30382	30393	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386755111
15	NC_017742	ACTTTT	2	12	30683	30694	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386755111
16	NC_017742	GCGTGG	2	12	33072	33083	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386755114
17	NC_017742	TAATGA	2	12	33208	33219	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386755114
18	NC_017742	TTGAAT	2	12	34268	34279	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386755114
19	NC_017742	TAAGGA	2	12	34567	34578	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386755114
20	NC_017742	GCTAGG	2	12	36075	36086	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386755117
21	NC_017742	CAAAAT	2	12	41523	41534	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386755123
22	NC_017742	GGATAA	2	12	43482	43493	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386755125
23	NC_017742	CACTAC	2	12	44908	44919	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386755126
24	NC_017742	ACTTAG	2	12	45039	45050	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017742	CGCAAA	2	12	45889	45900	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386755127
26	NC_017742	GGCTAG	2	12	50131	50142	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386755131
27	NC_017742	CTTTTT	2	12	52242	52253	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386755133
28	NC_017742	TTTATC	2	12	53659	53670	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386755133
29	NC_017742	CCACGC	2	12	57724	57735	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386755135
30	NC_017742	CTAAAG	2	12	59011	59022	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386755135
31	NC_017742	AGAAAG	2	12	60690	60701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386755137
32	NC_017742	AGACAA	2	12	60717	60728	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386755137
33	NC_017742	AATTTT	2	12	61246	61257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386755137
34	NC_017742	GATGTG	2	12	62684	62695	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386755138
35	NC_017742	AGCCAA	2	12	62762	62773	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386755138
36	NC_017742	CCAACA	2	12	64629	64640	50 %	0 %	0 %	50 %	386755138
37	NC_017742	TTTTGT	2	12	64967	64978	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017742	AAAGAG	2	12	65245	65256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017742	ACAGAA	2	12	67119	67130	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386755140
40	NC_017742	AGCGGG	2	12	68917	68928	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017742	ACGCCC	2	12	76770	76781	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386755151
42	NC_017742	TAAGGG	2	12	79499	79510	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386755154
43	NC_017742	CGCTAA	2	12	79862	79873	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386755154
44	NC_017742	CAACGA	2	12	81726	81737	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386755156
45	NC_017742	GCGCAT	2	12	82939	82950	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386755157
46	NC_017742	GGCATG	2	12	83251	83262	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386755157
47	NC_017742	CTAACA	2	12	84047	84058	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386755157
48	NC_017742	ATACCG	2	12	84212	84223	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386755157
49	NC_017742	GCAACG	2	12	84293	84304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386755157
50	NC_017742	CTTTAG	2	12	93077	93088	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386755166
51	NC_017742	TTGTTT	2	12	93118	93129	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	386755166
52	NC_017742	TACAAA	2	12	95407	95418	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017742	AAAAAT	2	12	95612	95623	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017742	ATTAGA	2	12	97115	97126	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386755169
55	NC_017742	CAAGAT	2	12	97453	97464	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017742	GATTTT	2	12	98877	98888	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386755171
57	NC_017742	AAACTC	2	12	98994	99005	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386755171
58	NC_017742	TCAAAA	2	12	100309	100320	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386755172
59	NC_017742	TATCGT	2	12	100888	100899	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386755173
60	NC_017742	GCGGTG	2	12	101007	101018	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386755173
61	NC_017742	TAATAT	2	12	104213	104224	50 %	50 %	0 %	0 %	386755174
62	NC_017742	ATAAAA	2	12	109075	109086	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017742	AATAAC	2	12	113579	113590	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_017742	TTTTCT	2	12	116500	116511	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386755184
65	NC_017742	ATTGCC	2	12	120580	120591	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386755188
66	NC_017742	GTTAAG	2	12	121411	121422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386755189
67	NC_017742	TAGGCA	2	12	124024	124035	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386755190
68	NC_017742	TGAATT	2	12	128536	128547	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386755193
69	NC_017742	TTTCAA	2	12	128695	128706	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386755193
70	NC_017742	CTTTAG	2	12	130098	130109	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386755195
71	NC_017742	TCGCTA	2	12	130299	130310	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386755195
72	NC_017742	AGCAAA	2	12	132041	132052	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386755196
73	NC_017742	GTTTTA	2	12	133052	133063	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017742	TCATGA	2	12	134971	134982	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386755200
75	NC_017742	ATCCCC	2	12	136738	136749	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_017742	AAAAAT	2	12	141482	141493	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386755205
77	NC_017742	TTGGCT	2	12	142769	142780	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386755207
78	NC_017742	ACGATT	2	12	146137	146148	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386755210
79	NC_017742	TTAGCG	2	12	146506	146517	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386755210
80	NC_017742	TATCGC	2	12	146718	146729	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386755210
81	NC_017742	TTTTAG	2	12	147833	147844	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386755211
82	NC_017742	ATCGCT	2	12	148426	148437	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386755211
83	NC_017742	TTCTAT	2	12	151809	151820	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386755214
84	NC_017742	TTGTTT	2	12	154797	154808	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	386755219
85	NC_017742	TTGGGT	2	12	160767	160778	0 %	50 %	50 %	0 %	386755226
86	NC_017742	GATTTT	2	12	161280	161291	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386755227
87	NC_017742	GATGGC	2	12	164526	164537	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386755231
88	NC_017742	GGCGTG	2	12	164745	164756	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386755231
89	NC_017742	CTTTCT	2	12	164778	164789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386755231
90	NC_017742	TATTTT	2	12	165547	165558	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017742	TTTCAC	2	12	165842	165853	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017742	CCGCTC	2	12	166669	166680	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386755233
93	NC_017742	TAAAAA	2	12	169752	169763	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017742	TAGTGG	2	12	170862	170873	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386755238
95	NC_017742	TTCTAA	2	12	171415	171426	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386755238
96	NC_017742	GGGGGA	2	12	172426	172437	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	386755239
97	NC_017742	ATCGTT	2	12	173526	173537	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386755240
98	NC_017742	AATTTC	2	12	173877	173888	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386755241
99	NC_017742	TTCTTT	2	12	175811	175822	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386755242
100	NC_017742	ATTTTG	2	12	177210	177221	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386755244
101	NC_017742	GTTTAA	2	12	178472	178483	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386755245
102	NC_017742	TGGTTA	2	12	181146	181157	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386755247
103	NC_017742	ATTTTT	2	12	181194	181205	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386755247
104	NC_017742	CCGCTC	2	12	181727	181738	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386755248
105	NC_017742	TGGTAG	2	12	183377	183388	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386755250
106	NC_017742	GAAAAA	2	12	185365	185376	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386755251
107	NC_017742	AGGCAT	2	12	185454	185465	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386755251
108	NC_017742	GCATTT	2	12	187166	187177	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386755253
109	NC_017742	ATAAAG	2	12	187894	187905	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386755254
110	NC_017742	ATTCTT	2	12	188217	188228	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_017742	TTAAAG	2	12	190765	190776	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386755255
112	NC_017742	GGTATT	2	12	191667	191678	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386755256
113	NC_017742	TCTAAA	2	12	191897	191908	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386755256
114	NC_017742	GGCATG	2	12	192968	192979	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386755257
115	NC_017742	TTCTAA	2	12	193445	193456	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386755258
116	NC_017742	ATTTTC	2	12	195390	195401	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386755258
117	NC_017742	TGGGGC	2	12	202902	202913	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386755268
118	NC_017742	AAATCC	2	12	204742	204753	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386755270
119	NC_017742	CTGTAT	2	12	206673	206684	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386755271
120	NC_017742	TATAAT	2	12	214897	214908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017742	GGCGTT	2	12	215257	215268	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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349	NC_017742	AAGAAA	2	12	695801	695812	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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468	NC_017742	TTGAAA	2	12	956486	956497	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386755931
469	NC_017742	GCAAAA	2	12	958069	958080	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386755933
470	NC_017742	CATCAC	2	12	959226	959237	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386755935
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