MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori PeCan18 chromosome

Total Repeats: 113

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017742	GTTAGT	2	12	4768	4779	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017742	ATTATA	2	12	9953	9964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017742	AAACAC	2	12	18521	18532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017742	ACTTAG	2	12	45039	45050	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017742	TTTTGT	2	12	64967	64978	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017742	AAAGAG	2	12	65245	65256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017742	AGCGGG	2	12	68917	68928	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017742	TACAAA	2	12	95407	95418	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017742	AAAAAT	2	12	95612	95623	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017742	CAAGAT	2	12	97453	97464	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017742	ATAAAA	2	12	109075	109086	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017742	AATAAC	2	12	113579	113590	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017742	GTTTTA	2	12	133052	133063	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017742	ATCCCC	2	12	136738	136749	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_017742	TATTTT	2	12	165547	165558	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017742	TTTCAC	2	12	165842	165853	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017742	TAAAAA	2	12	169752	169763	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017742	ATTCTT	2	12	188217	188228	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017742	TATAAT	2	12	214897	214908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017742	GGCGTT	2	12	215257	215268	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017742	AAAAAC	2	12	215269	215280	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017742	ATTAAA	2	12	228666	228677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017742	ATTTTA	2	12	251529	251540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017742	ATTTCA	2	12	306624	306635	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017742	TAGAAA	2	12	330201	330212	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017742	AAAATA	2	12	434090	434101	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017742	AAATAA	2	12	434142	434153	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017742	ATCGTT	2	12	444668	444679	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017742	TAAAAA	2	12	448228	448239	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017742	AACCAA	2	12	463092	463103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017742	ACTTTA	2	12	467187	467198	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017742	AAATTT	2	12	471531	471542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017742	TAAAAA	2	12	482231	482242	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017742	TTTAAT	2	12	485506	485517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017742	AAAAAC	2	12	494197	494208	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017742	TTTTAA	2	12	500473	500484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017742	TTGTAA	2	12	525245	525256	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017742	ATTTAA	2	12	531442	531453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017742	TGTTAT	2	12	532300	532311	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017742	TTTAAA	2	12	549956	549967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017742	AGCTAA	2	12	556804	556815	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017742	ATTTTA	2	12	583449	583460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017742	AAGAAA	2	12	695801	695812	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017742	AAAAAT	2	12	701630	701641	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017742	ATGGTA	2	12	734275	734286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017742	AATAAG	2	12	734472	734483	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017742	AAATTA	2	12	739514	739525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017742	CAAACC	2	12	754170	754181	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017742	CGGCTT	2	12	766075	766086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017742	CATGCT	2	12	771440	771451	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017742	TCTTTT	2	12	785009	785020	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017742	GAAAAA	2	12	831361	831372	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017742	GCTCCC	2	12	868341	868352	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_017742	TTTGTT	2	12	869058	869069	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017742	ATTTTT	2	12	890896	890907	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017742	AAAATA	2	12	906986	906997	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017742	AAAAAG	2	12	912685	912696	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017742	ATTATA	2	12	937524	937535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017742	ATTGAA	2	12	945095	945106	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017742	ACCCCC	2	12	964765	964776	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
61	NC_017742	GCTGAA	2	12	1003848	1003859	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017742	ACGCTC	2	12	1012220	1012231	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017742	AAAAAC	2	12	1018662	1018673	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_017742	ATTTTG	2	12	1018989	1019000	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017742	AGATTT	2	12	1019498	1019509	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017742	TTGGTT	2	12	1022100	1022111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017742	ATTACA	2	12	1037278	1037289	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017742	TCTTAT	2	12	1037313	1037324	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017742	GCTGGA	2	12	1065379	1065390	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017742	AAACAA	2	12	1067628	1067639	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017742	ATTCGC	2	12	1070288	1070299	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017742	AATTAA	2	12	1112880	1112891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017742	TCATTT	2	12	1112927	1112938	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_017742	TTCCTT	2	12	1194571	1194582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017742	AAAACT	2	12	1197604	1197615	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017742	GCATTT	2	12	1223434	1223445	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_017742	TAAAAT	2	12	1225064	1225075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017742	TTTTAA	2	12	1229852	1229863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017742	ATTGGT	2	12	1234471	1234482	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017742	CTTCTA	2	12	1249604	1249615	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017742	ATCCTT	2	12	1250756	1250767	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017742	TTGTAT	2	12	1253177	1253188	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017742	ACTTAA	2	12	1271382	1271393	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017742	AAACTT	2	12	1293962	1293973	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017742	ATTTTT	2	12	1326126	1326137	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017742	ATAAAA	2	12	1356166	1356177	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017742	CAAAGC	2	12	1359468	1359479	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017742	GCTGAT	2	12	1441161	1441172	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_017742	ACAAAA	2	12	1442295	1442306	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_017742	CTTATA	2	12	1483117	1483128	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017742	TAAACA	2	12	1539007	1539018	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_017742	AGTTTT	2	12	1545084	1545095	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017742	TTTGAT	2	12	1545234	1545245	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017742	TTATCT	2	12	1545589	1545600	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_017742	ACTTAG	2	12	1547485	1547496	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_017742	TAACGC	2	12	1552008	1552019	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017742	GCCAAA	2	12	1552084	1552095	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017742	ATTTTT	2	12	1558773	1558784	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017742	CTAAAA	2	12	1559561	1559572	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_017742	TAATCA	2	12	1567297	1567308	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_017742	AGAAAA	2	12	1567586	1567597	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017742	TCCCGC	2	12	1569694	1569705	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_017742	ACTAAT	2	12	1572789	1572800	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_017742	TTTTAG	2	12	1573455	1573466	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017742	CAATAA	2	12	1573600	1573611	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_017742	AAAGAA	2	12	1574751	1574762	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017742	GCGAAT	2	12	1579109	1579120	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_017742	TTAAAG	2	12	1581497	1581508	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017742	AAAGAA	2	12	1584287	1584298	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017742	TAAAAC	2	12	1584336	1584347	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_017742	TCGCTC	2	12	1600211	1600222	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017742	ACCTTA	2	12	1601468	1601479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017742	TAAATA	2	12	1636818	1636829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.