MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori PeCan18 chromosome

Total Repeats: 1072

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017742	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	386755087
2	NC_017742	CCATG	2	10	5520	5529	20 %	20 %	20 %	40 %	386755091
3	NC_017742	TTGAT	2	10	6410	6419	20 %	60 %	20 %	0 %	386755091
4	NC_017742	TTGCT	2	10	6527	6536	0 %	60 %	20 %	20 %	386755091
5	NC_017742	TTTCT	2	10	8598	8607	0 %	80 %	0 %	20 %	386755092
6	NC_017742	AATTT	2	10	9437	9446	40 %	60 %	0 %	0 %	386755092
7	NC_017742	AAAGG	2	10	11071	11080	60 %	0 %	40 %	0 %	386755094
8	NC_017742	TGCCA	2	10	12071	12080	20 %	20 %	20 %	40 %	386755095
9	NC_017742	TTTTG	2	10	12127	12136	0 %	80 %	20 %	0 %	386755095
10	NC_017742	GGGTT	2	10	12349	12358	0 %	40 %	60 %	0 %	386755095
11	NC_017742	TGGTG	2	10	12965	12974	0 %	40 %	60 %	0 %	386755096
12	NC_017742	AAACA	2	10	14758	14767	80 %	0 %	0 %	20 %	386755099
13	NC_017742	CCATG	2	10	23702	23711	20 %	20 %	20 %	40 %	386755106
14	NC_017742	CTCTT	2	10	23732	23741	0 %	60 %	0 %	40 %	386755106
15	NC_017742	CAAGC	2	10	28404	28413	40 %	0 %	20 %	40 %	386755108
16	NC_017742	GCTGG	2	10	28777	28786	0 %	20 %	60 %	20 %	386755108
17	NC_017742	TTTTA	2	10	29330	29339	20 %	80 %	0 %	0 %	386755109
18	NC_017742	TAGCG	2	10	29992	30001	20 %	20 %	40 %	20 %	386755110
19	NC_017742	TGATT	2	10	32350	32359	20 %	60 %	20 %	0 %	386755112
20	NC_017742	GTGGG	2	10	34230	34239	0 %	20 %	80 %	0 %	386755114
21	NC_017742	ATCAA	2	10	36362	36371	60 %	20 %	0 %	20 %	386755117
22	NC_017742	TTTTG	2	10	38858	38867	0 %	80 %	20 %	0 %	386755121
23	NC_017742	TGAGT	2	10	40878	40887	20 %	40 %	40 %	0 %	386755123
24	NC_017742	CAAAC	2	10	41904	41913	60 %	0 %	0 %	40 %	386755123
25	NC_017742	AGAAA	2	10	42590	42599	80 %	0 %	20 %	0 %	386755124
26	NC_017742	CCCAC	2	10	42954	42963	20 %	0 %	0 %	80 %	386755124
27	NC_017742	TTACT	2	10	43442	43451	20 %	60 %	0 %	20 %	386755125
28	NC_017742	TAAAA	2	10	45824	45833	80 %	20 %	0 %	0 %	386755127
29	NC_017742	GCTCC	2	10	47157	47166	0 %	20 %	20 %	60 %	386755128
30	NC_017742	AAAAT	2	10	47336	47345	80 %	20 %	0 %	0 %	386755128
31	NC_017742	TCGCA	2	10	47694	47703	20 %	20 %	20 %	40 %	386755128
32	NC_017742	AGGGC	2	10	47937	47946	20 %	0 %	60 %	20 %	386755128
33	NC_017742	CAATA	2	10	49262	49271	60 %	20 %	0 %	20 %	386755129
34	NC_017742	TGCCT	2	10	49949	49958	0 %	40 %	20 %	40 %	386755130
35	NC_017742	GATTG	2	10	50433	50442	20 %	40 %	40 %	0 %	386755131
36	NC_017742	AAATA	2	10	51737	51746	80 %	20 %	0 %	0 %	386755132
37	NC_017742	CCAAA	2	10	52070	52079	60 %	0 %	0 %	40 %	386755133
38	NC_017742	TAAAA	2	10	54127	54136	80 %	20 %	0 %	0 %	386755133
39	NC_017742	ATCAA	2	10	54158	54167	60 %	20 %	0 %	20 %	386755133
40	NC_017742	AATTC	2	10	54299	54308	40 %	40 %	0 %	20 %	386755133
41	NC_017742	TGAAA	2	10	54888	54897	60 %	20 %	20 %	0 %	386755134
42	NC_017742	TCAAA	2	10	55142	55151	60 %	20 %	0 %	20 %	386755134
43	NC_017742	TCGTT	2	10	55952	55961	0 %	60 %	20 %	20 %	386755134
44	NC_017742	CAGCA	2	10	56089	56098	40 %	0 %	20 %	40 %	386755135
45	NC_017742	TCAAA	2	10	58897	58906	60 %	20 %	0 %	20 %	386755135
46	NC_017742	TATCC	2	10	63378	63387	20 %	40 %	0 %	40 %	386755138
47	NC_017742	AAGGG	2	10	70868	70877	40 %	0 %	60 %	0 %	386755143
48	NC_017742	TTTCT	2	10	72621	72630	0 %	80 %	0 %	20 %	386755146
49	NC_017742	CTTGG	2	10	72884	72893	0 %	40 %	40 %	20 %	386755146
50	NC_017742	CTTCT	2	10	72938	72947	0 %	60 %	0 %	40 %	386755146
51	NC_017742	TGCCT	2	10	73015	73024	0 %	40 %	20 %	40 %	386755146
52	NC_017742	TCCAA	2	10	73427	73436	40 %	20 %	0 %	40 %	386755147
53	NC_017742	TTTTG	2	10	76726	76735	0 %	80 %	20 %	0 %	386755151
54	NC_017742	ACGCC	2	10	77032	77041	20 %	0 %	20 %	60 %	386755151
55	NC_017742	AAAGC	2	10	77798	77807	60 %	0 %	20 %	20 %	386755152
56	NC_017742	TTTTC	2	10	86064	86073	0 %	80 %	0 %	20 %	386755159
57	NC_017742	TCTTG	2	10	86218	86227	0 %	60 %	20 %	20 %	386755159
58	NC_017742	ATGCC	2	10	87202	87211	20 %	20 %	20 %	40 %	386755161
59	NC_017742	TTGAT	2	10	88288	88297	20 %	60 %	20 %	0 %	386755163
60	NC_017742	GGCGT	2	10	90102	90111	0 %	20 %	60 %	20 %	386755165
61	NC_017742	CTTTC	2	10	93666	93675	0 %	60 %	0 %	40 %	386755167
62	NC_017742	CACAC	2	10	94625	94634	40 %	0 %	0 %	60 %	386755168
63	NC_017742	TGATT	2	10	96461	96470	20 %	60 %	20 %	0 %	386755169
64	NC_017742	TCTTT	2	10	96670	96679	0 %	80 %	0 %	20 %	386755169
65	NC_017742	ACGAT	2	10	102754	102763	40 %	20 %	20 %	20 %	386755174
66	NC_017742	TTTTC	2	10	102949	102958	0 %	80 %	0 %	20 %	386755174
67	NC_017742	GAATT	2	10	104595	104604	40 %	40 %	20 %	0 %	386755175
68	NC_017742	TCGTT	2	10	106397	106406	0 %	60 %	20 %	20 %	386755176
69	NC_017742	TTAGA	2	10	107408	107417	40 %	40 %	20 %	0 %	386755178
70	NC_017742	CCACC	2	10	111639	111648	20 %	0 %	0 %	80 %	386755181
71	NC_017742	AAAGC	2	10	112454	112463	60 %	0 %	20 %	20 %	386755181
72	NC_017742	CAAAT	2	10	115021	115030	60 %	20 %	0 %	20 %	386755183
73	NC_017742	ACCCT	2	10	116449	116458	20 %	20 %	0 %	60 %	386755184
74	NC_017742	ATGCC	2	10	116581	116590	20 %	20 %	20 %	40 %	386755184
75	NC_017742	TGATT	2	10	118572	118581	20 %	60 %	20 %	0 %	386755186
76	NC_017742	CTAAA	2	10	119043	119052	60 %	20 %	0 %	20 %	386755188
77	NC_017742	GAATT	2	10	119192	119201	40 %	40 %	20 %	0 %	386755188
78	NC_017742	GATCG	2	10	123054	123063	20 %	20 %	40 %	20 %	386755190
79	NC_017742	AAGCC	2	10	124958	124967	40 %	0 %	20 %	40 %	386755191
80	NC_017742	TTGAT	2	10	126778	126787	20 %	60 %	20 %	0 %	386755192
81	NC_017742	TGATC	2	10	126954	126963	20 %	40 %	20 %	20 %	386755192
82	NC_017742	TTTGA	2	10	128021	128030	20 %	60 %	20 %	0 %	386755193
83	NC_017742	ATCTC	2	10	129306	129315	20 %	40 %	0 %	40 %	386755193
84	NC_017742	CGCTT	2	10	129464	129473	0 %	40 %	20 %	40 %	386755193
85	NC_017742	TTTGT	2	10	129820	129829	0 %	80 %	20 %	0 %	386755194
86	NC_017742	TGCGT	2	10	131852	131861	0 %	40 %	40 %	20 %	386755196
87	NC_017742	GAAAA	2	10	132013	132022	80 %	0 %	20 %	0 %	386755196
88	NC_017742	CGTTT	2	10	132280	132289	0 %	60 %	20 %	20 %	386755196
89	NC_017742	ATTTT	2	10	135440	135449	20 %	80 %	0 %	0 %	386755201
90	NC_017742	ATGTT	2	10	135522	135531	20 %	60 %	20 %	0 %	386755201
91	NC_017742	AAAAG	2	10	135934	135943	80 %	0 %	20 %	0 %	386755201
92	NC_017742	AAATC	2	10	137955	137964	60 %	20 %	0 %	20 %	386755202
93	NC_017742	AAAAT	2	10	139427	139436	80 %	20 %	0 %	0 %	386755203
94	NC_017742	TTTTC	2	10	141981	141990	0 %	80 %	0 %	20 %	386755206
95	NC_017742	TCAAT	2	10	142233	142242	40 %	40 %	0 %	20 %	386755207
96	NC_017742	TTCTT	2	10	143937	143946	0 %	80 %	0 %	20 %	386755208
97	NC_017742	TCTTT	2	10	144431	144440	0 %	80 %	0 %	20 %	386755209
98	NC_017742	GTTTT	2	10	145590	145599	0 %	80 %	20 %	0 %	386755210
99	NC_017742	AATTC	2	10	146225	146234	40 %	40 %	0 %	20 %	386755210
100	NC_017742	GCGAT	2	10	146384	146393	20 %	20 %	40 %	20 %	386755210
101	NC_017742	TTTTG	2	10	147292	147301	0 %	80 %	20 %	0 %	386755211
102	NC_017742	CCAAA	2	10	149132	149141	60 %	0 %	0 %	40 %	386755212
103	NC_017742	TACTT	2	10	152420	152429	20 %	60 %	0 %	20 %	386755214
104	NC_017742	ACGCC	2	10	152654	152663	20 %	0 %	20 %	60 %	386755214
105	NC_017742	ATTTG	2	10	155893	155902	20 %	60 %	20 %	0 %	386755221
106	NC_017742	AAAAC	2	10	159037	159046	80 %	0 %	0 %	20 %	386755224
107	NC_017742	AGATT	2	10	160936	160945	40 %	40 %	20 %	0 %	386755226
108	NC_017742	AAGCC	2	10	162274	162283	40 %	0 %	20 %	40 %	386755229
109	NC_017742	ATTCA	2	10	165977	165986	40 %	40 %	0 %	20 %	386755232
110	NC_017742	CACTT	2	10	166181	166190	20 %	40 %	0 %	40 %	386755232
111	NC_017742	AAAAC	2	10	168314	168323	80 %	0 %	0 %	20 %	386755234
112	NC_017742	ATCTT	2	10	169377	169386	20 %	60 %	0 %	20 %	386755235
113	NC_017742	TAATT	2	10	173855	173864	40 %	60 %	0 %	0 %	386755241
114	NC_017742	CGCAC	2	10	177269	177278	20 %	0 %	20 %	60 %	386755244
115	NC_017742	TATCA	2	10	177746	177755	40 %	40 %	0 %	20 %	386755244
116	NC_017742	AGCGG	2	10	178403	178412	20 %	0 %	60 %	20 %	386755245
117	NC_017742	ATTTG	2	10	178754	178763	20 %	60 %	20 %	0 %	386755245
118	NC_017742	AAATG	2	10	180514	180523	60 %	20 %	20 %	0 %	386755247
119	NC_017742	ATAAA	2	10	182799	182808	80 %	20 %	0 %	0 %	386755249
120	NC_017742	AAAAG	2	10	183954	183963	80 %	0 %	20 %	0 %	386755250
121	NC_017742	ATTCA	2	10	191464	191473	40 %	40 %	0 %	20 %	386755256
122	NC_017742	GCGAA	2	10	194038	194047	40 %	0 %	40 %	20 %	386755258
123	NC_017742	TAATT	2	10	196843	196852	40 %	60 %	0 %	0 %	386755260
124	NC_017742	TCATT	2	10	197076	197085	20 %	60 %	0 %	20 %	386755260
125	NC_017742	CTATT	2	10	197965	197974	20 %	60 %	0 %	20 %	386755262
126	NC_017742	TTTTC	2	10	199126	199135	0 %	80 %	0 %	20 %	386755263
127	NC_017742	ATTAG	2	10	201105	201114	40 %	40 %	20 %	0 %	386755265
128	NC_017742	TATTT	2	10	202887	202896	20 %	80 %	0 %	0 %	386755268
129	NC_017742	TTTCA	2	10	203550	203559	20 %	60 %	0 %	20 %	386755269
130	NC_017742	TGGGG	2	10	210832	210841	0 %	20 %	80 %	0 %	386755275
131	NC_017742	ATTCT	2	10	213265	213274	20 %	60 %	0 %	20 %	386755276
132	NC_017742	GCAAA	2	10	216230	216239	60 %	0 %	20 %	20 %	386755278
133	NC_017742	CCACC	2	10	219950	219959	20 %	0 %	0 %	80 %	386755280
134	NC_017742	TTACA	2	10	220137	220146	40 %	40 %	0 %	20 %	386755281
135	NC_017742	GTGGG	2	10	225207	225216	0 %	20 %	80 %	0 %	386755287
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