MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori PeCan18 chromosome

Total Repeats: 4623

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017742	TGAG	2	8	27	34	25 %	25 %	50 %	0 %	386755085
2	NC_017742	TCTG	2	8	810	817	0 %	50 %	25 %	25 %	386755086
3	NC_017742	AAAT	2	8	912	919	75 %	25 %	0 %	0 %	386755087
4	NC_017742	CTTG	2	8	1456	1463	0 %	50 %	25 %	25 %	386755087
5	NC_017742	CCTG	2	8	1810	1817	0 %	25 %	25 %	50 %	386755088
6	NC_017742	CCAA	2	8	1834	1841	50 %	0 %	0 %	50 %	386755088
7	NC_017742	TGAA	2	8	1874	1881	50 %	25 %	25 %	0 %	386755088
8	NC_017742	TTAA	2	8	2057	2064	50 %	50 %	0 %	0 %	386755088
9	NC_017742	ATTC	2	8	2349	2356	25 %	50 %	0 %	25 %	386755088
10	NC_017742	CTTT	2	8	2558	2565	0 %	75 %	0 %	25 %	386755089
11	NC_017742	AAGA	2	8	3072	3079	75 %	0 %	25 %	0 %	386755089
12	NC_017742	CAAA	2	8	3100	3107	75 %	0 %	0 %	25 %	386755089
13	NC_017742	GAAA	2	8	3247	3254	75 %	0 %	25 %	0 %	386755090
14	NC_017742	GAAA	2	8	3322	3329	75 %	0 %	25 %	0 %	386755090
15	NC_017742	AGAA	2	8	3778	3785	75 %	0 %	25 %	0 %	386755090
16	NC_017742	GTTT	2	8	4930	4937	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017742	ACTA	2	8	5071	5078	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017742	CAAA	2	8	5301	5308	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017742	TCGC	2	8	5543	5550	0 %	25 %	25 %	50 %	386755091
20	NC_017742	CATT	2	8	5616	5623	25 %	50 %	0 %	25 %	386755091
21	NC_017742	TGGT	2	8	7084	7091	0 %	50 %	50 %	0 %	386755091
22	NC_017742	ATCG	2	8	7267	7274	25 %	25 %	25 %	25 %	386755091
23	NC_017742	CGTT	2	8	7302	7309	0 %	50 %	25 %	25 %	386755091
24	NC_017742	TTTG	2	8	7638	7645	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017742	TTCA	2	8	8062	8069	25 %	50 %	0 %	25 %	386755092
26	NC_017742	CGTT	2	8	8838	8845	0 %	50 %	25 %	25 %	386755092
27	NC_017742	ATAA	2	8	9859	9866	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017742	TATT	2	8	10058	10065	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017742	TCAA	2	8	10270	10277	50 %	25 %	0 %	25 %	386755094
30	NC_017742	GATT	2	8	10583	10590	25 %	50 %	25 %	0 %	386755094
31	NC_017742	ATTG	2	8	10625	10632	25 %	50 %	25 %	0 %	386755094
32	NC_017742	TTTG	2	8	11090	11097	0 %	75 %	25 %	0 %	386755094
33	NC_017742	TGCT	2	8	12461	12468	0 %	50 %	25 %	25 %	386755095
34	NC_017742	CGCT	2	8	12580	12587	0 %	25 %	25 %	50 %	386755095
35	NC_017742	GGCC	2	8	12724	12731	0 %	0 %	50 %	50 %	386755095
36	NC_017742	TGCA	2	8	12942	12949	25 %	25 %	25 %	25 %	386755096
37	NC_017742	AGCA	2	8	12997	13004	50 %	0 %	25 %	25 %	386755096
38	NC_017742	GTTT	2	8	13355	13362	0 %	75 %	25 %	0 %	386755096
39	NC_017742	TCTT	2	8	13742	13749	0 %	75 %	0 %	25 %	386755096
40	NC_017742	TTAA	2	8	13890	13897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017742	AGCG	2	8	14213	14220	25 %	0 %	50 %	25 %	386755098
42	NC_017742	GATT	2	8	14321	14328	25 %	50 %	25 %	0 %	386755098
43	NC_017742	CACT	2	8	14859	14866	25 %	25 %	0 %	50 %	386755099
44	NC_017742	TTCT	2	8	14936	14943	0 %	75 %	0 %	25 %	386755099
45	NC_017742	GAGC	2	8	15210	15217	25 %	0 %	50 %	25 %	386755099
46	NC_017742	ATTT	2	8	15571	15578	25 %	75 %	0 %	0 %	386755099
47	NC_017742	CAGG	2	8	16650	16657	25 %	0 %	50 %	25 %	386755099
48	NC_017742	TGAT	2	8	16694	16701	25 %	50 %	25 %	0 %	386755099
49	NC_017742	AGTT	2	8	16822	16829	25 %	50 %	25 %	0 %	386755099
50	NC_017742	AACG	2	8	17501	17508	50 %	0 %	25 %	25 %	386755100
51	NC_017742	GCTT	2	8	17673	17680	0 %	50 %	25 %	25 %	386755100
52	NC_017742	TGAT	2	8	17907	17914	25 %	50 %	25 %	0 %	386755100
53	NC_017742	GTTT	2	8	18448	18455	0 %	75 %	25 %	0 %	386755100
54	NC_017742	TTGA	2	8	18800	18807	25 %	50 %	25 %	0 %	386755101
55	NC_017742	AGCG	2	8	19348	19355	25 %	0 %	50 %	25 %	386755101
56	NC_017742	GATA	2	8	20355	20362	50 %	25 %	25 %	0 %	386755102
57	NC_017742	TAAA	2	8	20881	20888	75 %	25 %	0 %	0 %	386755103
58	NC_017742	GCGA	2	8	20890	20897	25 %	0 %	50 %	25 %	386755103
59	NC_017742	TAAA	2	8	21641	21648	75 %	25 %	0 %	0 %	386755104
60	NC_017742	CTTT	2	8	21747	21754	0 %	75 %	0 %	25 %	386755104
61	NC_017742	AAGT	2	8	22059	22066	50 %	25 %	25 %	0 %	386755104
62	NC_017742	GCTT	2	8	22192	22199	0 %	50 %	25 %	25 %	386755104
63	NC_017742	CTTT	2	8	22824	22831	0 %	75 %	0 %	25 %	386755104
64	NC_017742	ATCA	2	8	22963	22970	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017742	AAAG	2	8	23144	23151	75 %	0 %	25 %	0 %	386755105
66	NC_017742	GCTT	2	8	23341	23348	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017742	GTTT	2	8	24059	24066	0 %	75 %	25 %	0 %	386755106
68	NC_017742	ACTG	2	8	24356	24363	25 %	25 %	25 %	25 %	386755106
69	NC_017742	ATTG	2	8	25029	25036	25 %	50 %	25 %	0 %	386755106
70	NC_017742	TCCC	2	8	25205	25212	0 %	25 %	0 %	75 %	386755106
71	NC_017742	GATT	2	8	25688	25695	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017742	ATTA	2	8	25784	25791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017742	TTTG	2	8	25942	25949	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017742	ATAA	2	8	26956	26963	75 %	25 %	0 %	0 %	386755107
75	NC_017742	ATGG	2	8	28930	28937	25 %	25 %	50 %	0 %	386755108
76	NC_017742	GAAT	2	8	29187	29194	50 %	25 %	25 %	0 %	386755109
77	NC_017742	TGGC	2	8	29410	29417	0 %	25 %	50 %	25 %	386755109
78	NC_017742	TTTA	2	8	29563	29570	25 %	75 %	0 %	0 %	386755109
79	NC_017742	TGCT	2	8	30470	30477	0 %	50 %	25 %	25 %	386755111
80	NC_017742	AGCA	2	8	30581	30588	50 %	0 %	25 %	25 %	386755111
81	NC_017742	GCTT	2	8	30671	30678	0 %	50 %	25 %	25 %	386755111
82	NC_017742	TTGA	2	8	31091	31098	25 %	50 %	25 %	0 %	386755111
83	NC_017742	GGTT	2	8	32076	32083	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017742	TTTA	2	8	32210	32217	25 %	75 %	0 %	0 %	386755112
85	NC_017742	GCGA	2	8	32408	32415	25 %	0 %	50 %	25 %	386755112
86	NC_017742	ACCC	2	8	32519	32526	25 %	0 %	0 %	75 %	386755113
87	NC_017742	CATC	2	8	32645	32652	25 %	25 %	0 %	50 %	386755113
88	NC_017742	TGAA	2	8	32799	32806	50 %	25 %	25 %	0 %	386755114
89	NC_017742	TCGT	2	8	33157	33164	0 %	50 %	25 %	25 %	386755114
90	NC_017742	CATG	2	8	33910	33917	25 %	25 %	25 %	25 %	386755114
91	NC_017742	CGCT	2	8	34026	34033	0 %	25 %	25 %	50 %	386755114
92	NC_017742	GCTT	2	8	34925	34932	0 %	50 %	25 %	25 %	386755114
93	NC_017742	GAAA	2	8	34984	34991	75 %	0 %	25 %	0 %	386755114
94	NC_017742	TTCT	2	8	36687	36694	0 %	75 %	0 %	25 %	386755118
95	NC_017742	CTTT	2	8	37016	37023	0 %	75 %	0 %	25 %	386755118
96	NC_017742	CTCA	2	8	37505	37512	25 %	25 %	0 %	50 %	386755118
97	NC_017742	TAAA	2	8	37715	37722	75 %	25 %	0 %	0 %	386755118
98	NC_017742	GAAA	2	8	37845	37852	75 %	0 %	25 %	0 %	386755119
99	NC_017742	TGAA	2	8	38423	38430	50 %	25 %	25 %	0 %	386755120
100	NC_017742	TTTG	2	8	38475	38482	0 %	75 %	25 %	0 %	386755120
101	NC_017742	TGAT	2	8	38580	38587	25 %	50 %	25 %	0 %	386755120
102	NC_017742	CGAA	2	8	38665	38672	50 %	0 %	25 %	25 %	386755121
103	NC_017742	ATTA	2	8	38772	38779	50 %	50 %	0 %	0 %	386755121
104	NC_017742	GATA	2	8	38966	38973	50 %	25 %	25 %	0 %	386755121
105	NC_017742	ACAA	2	8	39361	39368	75 %	0 %	0 %	25 %	386755121
106	NC_017742	AACC	2	8	39667	39674	50 %	0 %	0 %	50 %	386755122
107	NC_017742	CAAA	2	8	39951	39958	75 %	0 %	0 %	25 %	386755122
108	NC_017742	ATTG	2	8	40365	40372	25 %	50 %	25 %	0 %	386755122
109	NC_017742	ATTG	2	8	40431	40438	25 %	50 %	25 %	0 %	386755122
110	NC_017742	ATCA	2	8	40540	40547	50 %	25 %	0 %	25 %	386755122
111	NC_017742	TCAA	2	8	40553	40560	50 %	25 %	0 %	25 %	386755122
112	NC_017742	TGTT	2	8	41327	41334	0 %	75 %	25 %	0 %	386755123
113	NC_017742	CTTT	2	8	41920	41927	0 %	75 %	0 %	25 %	386755123
114	NC_017742	ACAG	2	8	42155	42162	50 %	0 %	25 %	25 %	386755123
115	NC_017742	GATC	2	8	42350	42357	25 %	25 %	25 %	25 %	386755124
116	NC_017742	TTTG	2	8	42752	42759	0 %	75 %	25 %	0 %	386755124
117	NC_017742	ATGA	2	8	43357	43364	50 %	25 %	25 %	0 %	386755124
118	NC_017742	TATT	2	8	43474	43481	25 %	75 %	0 %	0 %	386755125
119	NC_017742	CAAA	2	8	44196	44203	75 %	0 %	0 %	25 %	386755125
120	NC_017742	CAAA	2	8	44383	44390	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017742	GTTT	2	8	44612	44619	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017742	GATT	2	8	44803	44810	25 %	50 %	25 %	0 %	386755126
123	NC_017742	TTGA	2	8	45281	45288	25 %	50 %	25 %	0 %	386755127
124	NC_017742	CGCT	2	8	45436	45443	0 %	25 %	25 %	50 %	386755127
125	NC_017742	GTTT	2	8	46058	46065	0 %	75 %	25 %	0 %	386755127
126	NC_017742	CAAA	2	8	46554	46561	75 %	0 %	0 %	25 %	386755128
127	NC_017742	CGCT	2	8	46902	46909	0 %	25 %	25 %	50 %	386755128
128	NC_017742	TCGC	2	8	47369	47376	0 %	25 %	25 %	50 %	386755128
129	NC_017742	AGGG	2	8	47380	47387	25 %	0 %	75 %	0 %	386755128
130	NC_017742	GCAA	2	8	48033	48040	50 %	0 %	25 %	25 %	386755128
131	NC_017742	TTTA	2	8	48714	48721	25 %	75 %	0 %	0 %	386755129
132	NC_017742	CGAG	2	8	48727	48734	25 %	0 %	50 %	25 %	386755129
133	NC_017742	CTTT	2	8	49691	49698	0 %	75 %	0 %	25 %	386755130
134	NC_017742	TTGC	2	8	50167	50174	0 %	50 %	25 %	25 %	386755131
135	NC_017742	TAGC	2	8	50770	50777	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017742	ATCA	2	8	51050	51057	50 %	25 %	0 %	25 %	386755132
137	NC_017742	TAAA	2	8	51084	51091	75 %	25 %	0 %	0 %	386755132
138	NC_017742	AATC	2	8	51598	51605	50 %	25 %	0 %	25 %	386755132
139	NC_017742	GTTT	2	8	51656	51663	0 %	75 %	25 %	0 %	386755132
140	NC_017742	CATG	2	8	51796	51803	25 %	25 %	25 %	25 %	386755132
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