MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori PeCan18 chromosome

Total Repeats: 14670

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017742	TGA	3	9	121	129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386755085
2	NC_017742	GTT	2	6	305	310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386755085
3	NC_017742	TTC	2	6	356	361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386755085
4	NC_017742	ACA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386755085
5	NC_017742	ACC	2	6	393	398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386755085
6	NC_017742	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386755086
7	NC_017742	AAC	2	6	697	702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386755086
8	NC_017742	CTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386755086
9	NC_017742	TGA	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386755086
10	NC_017742	CTA	2	6	941	946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386755087
11	NC_017742	AAC	2	6	1024	1029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386755087
12	NC_017742	CCG	4	12	1043	1054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386755087
13	NC_017742	CCA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386755087
14	NC_017742	GCT	2	6	1212	1217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386755087
15	NC_017742	CTA	2	6	1279	1284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386755087
16	NC_017742	GGC	2	6	1403	1408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386755087
17	NC_017742	GTT	2	6	1623	1628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386755087
18	NC_017742	TAG	2	6	1646	1651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386755087
19	NC_017742	CTT	2	6	1657	1662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386755087
20	NC_017742	TTC	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386755088
21	NC_017742	GTT	2	6	1897	1902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386755088
22	NC_017742	TTC	2	6	1984	1989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386755088
23	NC_017742	TGG	2	6	2043	2048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386755088
24	NC_017742	TCA	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386755088
25	NC_017742	AAT	2	6	2104	2109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386755088
26	NC_017742	TAG	2	6	2157	2162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386755088
27	NC_017742	TGA	2	6	2662	2667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386755089
28	NC_017742	GTG	2	6	2966	2971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386755089
29	NC_017742	AGA	2	6	3064	3069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386755089
30	NC_017742	GTG	2	6	3125	3130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386755089
31	NC_017742	GCC	2	6	3132	3137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386755089
32	NC_017742	TGC	2	6	3217	3222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386755090
33	NC_017742	GTT	2	6	3578	3583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386755090
34	NC_017742	ATC	2	6	3662	3667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386755090
35	NC_017742	CAG	2	6	3824	3829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386755090
36	NC_017742	ATT	2	6	3906	3911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386755090
37	NC_017742	TGT	2	6	3917	3922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386755090
38	NC_017742	GGC	2	6	3979	3984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386755090
39	NC_017742	ATT	2	6	5638	5643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386755091
40	NC_017742	TGG	2	6	5736	5741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386755091
41	NC_017742	CTT	2	6	5876	5881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386755091
42	NC_017742	GTT	2	6	5938	5943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386755091
43	NC_017742	TTA	2	6	6065	6070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386755091
44	NC_017742	GTG	2	6	6134	6139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386755091
45	NC_017742	CAA	2	6	6202	6207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386755091
46	NC_017742	TGT	2	6	6255	6260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386755091
47	NC_017742	GCG	2	6	6513	6518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386755091
48	NC_017742	CGA	2	6	6564	6569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386755091
49	NC_017742	TCA	2	6	6683	6688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386755091
50	NC_017742	TTG	2	6	6797	6802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386755091
51	NC_017742	ACT	2	6	6811	6816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386755091
52	NC_017742	CAC	2	6	6861	6866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386755091
53	NC_017742	TCG	2	6	7068	7073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386755091
54	NC_017742	AAC	2	6	7099	7104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386755091
55	NC_017742	CCG	2	6	7179	7184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386755091
56	NC_017742	GCT	2	6	7294	7299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386755091
57	NC_017742	GTT	2	6	7324	7329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386755091
58	NC_017742	CAT	2	6	7819	7824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386755092
59	NC_017742	GCC	2	6	7825	7830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386755092
60	NC_017742	TCT	2	6	7886	7891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386755092
61	NC_017742	AAT	2	6	7984	7989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386755092
62	NC_017742	CTT	2	6	7992	7997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386755092
63	NC_017742	CAT	2	6	8082	8087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386755092
64	NC_017742	ATG	2	6	8135	8140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386755092
65	NC_017742	TCA	2	6	8159	8164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386755092
66	NC_017742	CTT	2	6	8232	8237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386755092
67	NC_017742	CCG	2	6	8241	8246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386755092
68	NC_017742	CAT	2	6	8436	8441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386755092
69	NC_017742	GTG	2	6	8468	8473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386755092
70	NC_017742	TTC	2	6	8548	8553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386755092
71	NC_017742	CCG	2	6	8567	8572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386755092
72	NC_017742	CAC	2	6	8668	8673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386755092
73	NC_017742	GAT	2	6	8710	8715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386755092
74	NC_017742	TAG	2	6	8749	8754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386755092
75	NC_017742	GGA	2	6	8757	8762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386755092
76	NC_017742	TCT	2	6	9032	9037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386755092
77	NC_017742	CTT	2	6	9153	9158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386755092
78	NC_017742	CTT	2	6	9231	9236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386755092
79	NC_017742	TCT	2	6	9588	9593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386755093
80	NC_017742	GAT	3	9	9758	9766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386755093
81	NC_017742	TCT	2	6	9786	9791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386755093
82	NC_017742	CTA	2	6	9802	9807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386755093
83	NC_017742	TTG	2	6	10229	10234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386755094
84	NC_017742	GAA	2	6	10245	10250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386755094
85	NC_017742	TTA	2	6	10424	10429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386755094
86	NC_017742	AGA	2	6	10439	10444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386755094
87	NC_017742	ACC	2	6	10447	10452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386755094
88	NC_017742	AAG	2	6	10480	10485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386755094
89	NC_017742	ATT	2	6	10513	10518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386755094
90	NC_017742	CAT	2	6	10694	10699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386755094
91	NC_017742	ATG	2	6	11008	11013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386755094
92	NC_017742	GGC	2	6	11033	11038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386755094
93	NC_017742	AAC	2	6	11100	11105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386755094
94	NC_017742	ATC	2	6	11131	11136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386755094
95	NC_017742	AGA	2	6	11486	11491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386755094
96	NC_017742	GAC	2	6	11586	11591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386755094
97	NC_017742	TTA	3	9	11607	11615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386755094
98	NC_017742	TTG	2	6	11664	11669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386755094
99	NC_017742	TGT	2	6	11850	11855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386755095
100	NC_017742	ACG	2	6	12012	12017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386755095
101	NC_017742	TGT	2	6	12018	12023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386755095
102	NC_017742	AAG	2	6	12177	12182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386755095
103	NC_017742	TAA	2	6	12487	12492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386755095
104	NC_017742	TGG	3	9	12588	12596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386755095
105	NC_017742	GAA	3	9	12605	12613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386755095
106	NC_017742	AGA	2	6	12709	12714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386755095
107	NC_017742	TTA	2	6	13021	13026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386755096
108	NC_017742	GAA	2	6	13038	13043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386755096
109	NC_017742	GTT	2	6	13061	13066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386755096
110	NC_017742	GTT	2	6	13105	13110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386755096
111	NC_017742	TAA	2	6	13115	13120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386755096
112	NC_017742	ATT	2	6	13128	13133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386755096
113	NC_017742	AAT	2	6	13377	13382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386755096
114	NC_017742	AAT	2	6	13410	13415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386755096
115	NC_017742	ACC	2	6	13504	13509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386755096
116	NC_017742	CTA	2	6	13567	13572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386755096
117	NC_017742	GGT	2	6	13646	13651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386755096
118	NC_017742	AGA	2	6	13706	13711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386755096
119	NC_017742	AGT	2	6	13768	13773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386755096
120	NC_017742	GTG	2	6	14131	14136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386755097
121	NC_017742	GAA	2	6	14222	14227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386755098
122	NC_017742	ATT	2	6	14409	14414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386755098
123	NC_017742	ATT	2	6	14507	14512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386755099
124	NC_017742	GAA	2	6	14548	14553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386755099
125	NC_017742	ATG	2	6	14573	14578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386755099
126	NC_017742	TCC	2	6	14618	14623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386755099
127	NC_017742	AAG	2	6	14819	14824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386755099
128	NC_017742	TAG	2	6	15086	15091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386755099
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130	NC_017742	GCT	2	6	15366	15371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386755099
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