MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori Shi112 chromosome

Total Repeats: 1356

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017741	GCATT	2	10	584	593	20 %	40 %	20 %	20 %	386753521
2	NC_017741	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	386753522
3	NC_017741	GATTA	2	10	2248	2257	40 %	40 %	20 %	0 %	386753523
4	NC_017741	GAAAC	2	10	4649	4658	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017741	TTTTA	2	10	4922	4931	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017741	TAAAT	2	10	7059	7068	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017741	TTTCT	2	10	8124	8133	0 %	80 %	0 %	20 %	386753526
8	NC_017741	TTGAA	2	10	11622	11631	40 %	40 %	20 %	0 %	386753529
9	NC_017741	TTTTG	2	10	11638	11647	0 %	80 %	20 %	0 %	386753529
10	NC_017741	TGGTG	2	10	12476	12485	0 %	40 %	60 %	0 %	386753530
11	NC_017741	GCTTT	2	10	13303	13312	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017741	CAAAA	2	10	18355	18364	80 %	0 %	0 %	20 %	386753535
13	NC_017741	CATCA	2	10	19731	19740	40 %	20 %	0 %	40 %	386753536
14	NC_017741	TGAAA	2	10	20699	20708	60 %	20 %	20 %	0 %	386753537
15	NC_017741	GCATG	2	10	22598	22607	20 %	20 %	40 %	20 %	386753539
16	NC_017741	AAAAG	2	10	22731	22740	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017741	CCATG	2	10	22919	22928	20 %	20 %	20 %	40 %	386753540
18	NC_017741	CTCTT	2	10	22949	22958	0 %	60 %	0 %	40 %	386753540
19	NC_017741	CAAGC	2	10	27560	27569	40 %	0 %	20 %	40 %	386753543
20	NC_017741	TTTTA	2	10	28490	28499	20 %	80 %	0 %	0 %	386753544
21	NC_017741	GATAA	2	10	30577	30586	60 %	20 %	20 %	0 %	386753548
22	NC_017741	GTGGG	2	10	32036	32045	0 %	20 %	80 %	0 %	386753549
23	NC_017741	TGGGG	2	10	33287	33296	0 %	20 %	80 %	0 %	386753551
24	NC_017741	AAGCC	2	10	39032	39041	40 %	0 %	20 %	40 %	386753557
25	NC_017741	AGAAA	2	10	40332	40341	80 %	0 %	20 %	0 %	386753558
26	NC_017741	AAAGT	2	10	40529	40538	60 %	20 %	20 %	0 %	386753558
27	NC_017741	TACTC	2	10	41185	41194	20 %	40 %	0 %	40 %	386753559
28	NC_017741	TAAAA	2	10	43026	43035	80 %	20 %	0 %	0 %	386753561
29	NC_017741	TCCCA	2	10	44038	44047	20 %	20 %	0 %	60 %	386753562
30	NC_017741	GCTCC	2	10	44359	44368	0 %	20 %	20 %	60 %	386753562
31	NC_017741	TCGCA	2	10	44896	44905	20 %	20 %	20 %	40 %	386753562
32	NC_017741	AGGCT	2	10	46776	46785	20 %	20 %	40 %	20 %	386753564
33	NC_017741	TGCCT	2	10	47151	47160	0 %	40 %	20 %	40 %	386753564
34	NC_017741	TGAAA	2	10	48551	48560	60 %	20 %	20 %	0 %	386753566
35	NC_017741	TCAAA	2	10	48805	48814	60 %	20 %	0 %	20 %	386753566
36	NC_017741	TCGCC	2	10	51548	51557	0 %	20 %	20 %	60 %	386753567
37	NC_017741	TAAAA	2	10	51844	51853	80 %	20 %	0 %	0 %	386753567
38	NC_017741	TCAAA	2	10	52560	52569	60 %	20 %	0 %	20 %	386753567
39	NC_017741	TTAAA	2	10	53581	53590	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017741	ACAAA	2	10	53610	53619	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017741	TATCC	2	10	57061	57070	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_017741	ATTGG	2	10	59635	59644	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017741	CTACT	2	10	59718	59727	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_017741	CAATA	2	10	59857	59866	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_017741	AAGAT	2	10	60291	60300	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017741	AATGA	2	10	62029	62038	60 %	20 %	20 %	0 %	386753576
47	NC_017741	TCAAT	2	10	66027	66036	40 %	40 %	0 %	20 %	386753580
48	NC_017741	CTTCT	2	10	66866	66875	0 %	60 %	0 %	40 %	386753581
49	NC_017741	TGCCT	2	10	66943	66952	0 %	40 %	20 %	40 %	386753581
50	NC_017741	TCCAA	2	10	67355	67364	40 %	20 %	0 %	40 %	386753582
51	NC_017741	TTTTA	2	10	70626	70635	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017741	TTTTG	2	10	70657	70666	0 %	80 %	20 %	0 %	386753585
53	NC_017741	ACGCC	2	10	70963	70972	20 %	0 %	20 %	60 %	386753585
54	NC_017741	AAAGC	2	10	71729	71738	60 %	0 %	20 %	20 %	386753586
55	NC_017741	TTACA	2	10	72511	72520	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017741	GTATG	2	10	75893	75902	20 %	40 %	40 %	0 %	386753590
57	NC_017741	ATCTT	2	10	78903	78912	20 %	60 %	0 %	20 %	386753592
58	NC_017741	TGGCT	2	10	79444	79453	0 %	40 %	40 %	20 %	386753592
59	NC_017741	ATGCC	2	10	79866	79875	20 %	20 %	20 %	40 %	386753593
60	NC_017741	TTGAT	2	10	80790	80799	20 %	60 %	20 %	0 %	386753595
61	NC_017741	GGCGT	2	10	82604	82613	0 %	20 %	60 %	20 %	386753597
62	NC_017741	TAAGA	2	10	85785	85794	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017741	TAAAA	2	10	85856	85865	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017741	CTTTC	2	10	86138	86147	0 %	60 %	0 %	40 %	386753599
65	NC_017741	GAAAT	2	10	88087	88096	60 %	20 %	20 %	0 %	386753601
66	NC_017741	TTTGA	2	10	88928	88937	20 %	60 %	20 %	0 %	386753602
67	NC_017741	TCTTT	2	10	89139	89148	0 %	80 %	0 %	20 %	386753602
68	NC_017741	GGCTT	2	10	90243	90252	0 %	40 %	40 %	20 %	386753603
69	NC_017741	CGGCA	2	10	92901	92910	20 %	0 %	40 %	40 %	386753606
70	NC_017741	CTTCT	2	10	93778	93787	0 %	60 %	0 %	40 %	386753607
71	NC_017741	AATTT	2	10	94934	94943	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017741	ACGAT	2	10	95382	95391	40 %	20 %	20 %	20 %	386753608
73	NC_017741	TTTTC	2	10	95577	95586	0 %	80 %	0 %	20 %	386753608
74	NC_017741	AATTG	2	10	97233	97242	40 %	40 %	20 %	0 %	386753609
75	NC_017741	TCGTT	2	10	99033	99042	0 %	60 %	20 %	20 %	386753610
76	NC_017741	CAAAA	2	10	101623	101632	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017741	TCTTT	2	10	102341	102350	0 %	80 %	0 %	20 %	386753613
78	NC_017741	TTTAT	2	10	104106	104115	20 %	80 %	0 %	0 %	386753615
79	NC_017741	AAAGC	2	10	105086	105095	60 %	0 %	20 %	20 %	386753615
80	NC_017741	GAATG	2	10	106307	106316	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017741	TTTTG	2	10	107122	107131	0 %	80 %	20 %	0 %	386753617
82	NC_017741	CAAAT	2	10	107518	107527	60 %	20 %	0 %	20 %	386753617
83	NC_017741	ACCCT	2	10	108947	108956	20 %	20 %	0 %	60 %	386753618
84	NC_017741	ATGCC	2	10	109079	109088	20 %	20 %	20 %	40 %	386753618
85	NC_017741	TTAAT	2	10	110465	110474	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017741	TGATT	2	10	111083	111092	20 %	60 %	20 %	0 %	386753620
87	NC_017741	GAATT	2	10	111702	111711	40 %	40 %	20 %	0 %	386753622
88	NC_017741	TCTGA	2	10	113566	113575	20 %	40 %	20 %	20 %	386753623
89	NC_017741	GGATC	2	10	115578	115587	20 %	20 %	40 %	20 %	386753624
90	NC_017741	AAGCC	2	10	117486	117495	40 %	0 %	20 %	40 %	386753625
91	NC_017741	GTTTG	2	10	118844	118853	0 %	60 %	40 %	0 %	386753626
92	NC_017741	TGATC	2	10	119471	119480	20 %	40 %	20 %	20 %	386753626
93	NC_017741	CGCTG	2	10	120373	120382	0 %	20 %	40 %	40 %	386753627
94	NC_017741	TTTGA	2	10	120520	120529	20 %	60 %	20 %	0 %	386753627
95	NC_017741	GACTT	2	10	121054	121063	20 %	40 %	20 %	20 %	386753627
96	NC_017741	ATCTC	2	10	121805	121814	20 %	40 %	0 %	40 %	386753627
97	NC_017741	CGCTT	2	10	121963	121972	0 %	40 %	20 %	40 %	386753627
98	NC_017741	TTTGT	2	10	122320	122329	0 %	80 %	20 %	0 %	386753628
99	NC_017741	TGCGT	2	10	124354	124363	0 %	40 %	40 %	20 %	386753630
100	NC_017741	GAAAA	2	10	124515	124524	80 %	0 %	20 %	0 %	386753630
101	NC_017741	GAAAA	2	10	124833	124842	80 %	0 %	20 %	0 %	386753630
102	NC_017741	ATTTT	2	10	127797	127806	20 %	80 %	0 %	0 %	386753636
103	NC_017741	ATGTT	2	10	127879	127888	20 %	60 %	20 %	0 %	386753636
104	NC_017741	AAAAG	2	10	128291	128300	80 %	0 %	20 %	0 %	386753636
105	NC_017741	TAGGG	2	10	129028	129037	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017741	AAATC	2	10	130295	130304	60 %	20 %	0 %	20 %	386753637
107	NC_017741	AAAAT	2	10	131767	131776	80 %	20 %	0 %	0 %	386753638
108	NC_017741	TTTTC	2	10	134118	134127	0 %	80 %	0 %	20 %	386753643
109	NC_017741	GTAAA	2	10	134670	134679	60 %	20 %	20 %	0 %	386753644
110	NC_017741	TTCTT	2	10	136074	136083	0 %	80 %	0 %	20 %	386753645
111	NC_017741	TCTTT	2	10	136568	136577	0 %	80 %	0 %	20 %	386753646
112	NC_017741	TTTTG	2	10	137731	137740	0 %	80 %	20 %	0 %	386753647
113	NC_017741	AATTC	2	10	138365	138374	40 %	40 %	0 %	20 %	386753647
114	NC_017741	GCGAT	2	10	138524	138533	20 %	20 %	40 %	20 %	386753647
115	NC_017741	GCTTG	2	10	138780	138789	0 %	40 %	40 %	20 %	386753647
116	NC_017741	TTTTG	2	10	139432	139441	0 %	80 %	20 %	0 %	386753648
117	NC_017741	CCAAA	2	10	141272	141281	60 %	0 %	0 %	40 %	386753649
118	NC_017741	ACGCC	2	10	144794	144803	20 %	0 %	20 %	60 %	386753651
119	NC_017741	TTATT	2	10	146690	146699	20 %	80 %	0 %	0 %	386753655
120	NC_017741	GCGTT	2	10	147048	147057	0 %	40 %	40 %	20 %	386753657
121	NC_017741	ATTTG	2	10	148023	148032	20 %	60 %	20 %	0 %	386753658
122	NC_017741	CAAAT	2	10	149919	149928	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017741	AAAAC	2	10	150643	150652	80 %	0 %	0 %	20 %	386753661
124	NC_017741	GCAAA	2	10	152482	152491	60 %	0 %	20 %	20 %	386753663
125	NC_017741	AAGCC	2	10	153879	153888	40 %	0 %	20 %	40 %	386753666
126	NC_017741	GGGTG	2	10	156289	156298	0 %	20 %	80 %	0 %	386753668
127	NC_017741	AACAA	2	10	157180	157189	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017741	ATTCA	2	10	157658	157667	40 %	40 %	0 %	20 %	386753670
129	NC_017741	ATCTT	2	10	161060	161069	20 %	60 %	0 %	20 %	386753673
130	NC_017741	ATTTG	2	10	170431	170440	20 %	60 %	20 %	0 %	386753683
131	NC_017741	TTTCT	2	10	171253	171262	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_017741	AAATC	2	10	171602	171611	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_017741	CAAAA	2	10	171620	171629	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017741	AAATG	2	10	171998	172007	60 %	20 %	20 %	0 %	386753685
135	NC_017741	TGTAA	2	10	172788	172797	40 %	40 %	20 %	0 %	386753686
136	NC_017741	AGCTT	2	10	173826	173835	20 %	40 %	20 %	20 %	386753687
137	NC_017741	ATAAA	2	10	174284	174293	80 %	20 %	0 %	0 %	386753687
138	NC_017741	GAATA	2	10	174581	174590	60 %	20 %	20 %	0 %	386753687
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