MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Shi112 chromosome

Total Repeats: 567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017741	ATGC	2	8	4281	4288	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017741	TAAA	2	8	4689	4696	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017741	CATT	2	8	5282	5289	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017741	GTGC	2	8	5860	5867	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017741	TTGT	2	8	6331	6338	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017741	TGGT	2	8	6631	6638	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017741	ATCG	2	8	6805	6812	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017741	CGTT	2	8	6840	6847	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017741	ATAA	2	8	9382	9389	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017741	ATTC	2	8	9585	9592	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017741	TTAA	2	8	13401	13408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017741	AGTT	2	8	16349	16356	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017741	AATC	3	12	22454	22465	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017741	GATT	2	8	24896	24903	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017741	ATTA	2	8	24992	24999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017741	GGTT	2	8	29872	29879	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017741	GATT	2	8	42250	42257	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017741	TTAA	2	8	48184	48191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017741	TTTA	2	8	53312	53319	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017741	GCGG	2	8	53350	53357	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017741	TAAT	2	8	53412	53419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017741	TTGT	2	8	53490	53497	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017741	CAAG	2	8	56195	56202	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017741	AAAG	2	8	56493	56500	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017741	TGCT	2	8	56664	56671	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017741	GAGC	3	12	57196	57207	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017741	GAAA	2	8	57467	57474	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017741	AGAT	2	8	57768	57775	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017741	CATT	2	8	57966	57973	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017741	ACTT	2	8	58348	58355	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017741	CAAA	2	8	59358	59365	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017741	TGGG	2	8	59541	59548	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017741	GGAG	2	8	59754	59761	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017741	GATA	2	8	59847	59854	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017741	TCTG	2	8	66542	66549	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017741	CAAA	2	8	67672	67679	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017741	TTTA	2	8	74165	74172	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017741	CATG	2	8	74310	74317	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017741	CCCA	2	8	77122	77129	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
40	NC_017741	TTAG	2	8	77327	77334	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017741	CTTT	2	8	77342	77349	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017741	GGTG	2	8	87697	87704	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017741	TCCC	2	8	87767	87774	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
44	NC_017741	CTAA	2	8	92280	92287	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017741	CATT	2	8	92290	92297	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017741	TTCA	2	8	93268	93275	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017741	TTTA	2	8	93297	93304	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017741	AATC	2	8	101549	101556	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017741	CCAA	2	8	103618	103625	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017741	GAAA	2	8	106297	106304	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017741	CCGC	2	8	106983	106990	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
52	NC_017741	CTTT	2	8	108885	108892	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017741	AAAT	2	8	108895	108902	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017741	ATTT	2	8	110427	110434	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017741	TCAT	2	8	115112	115119	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017741	TTAG	2	8	122264	122271	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017741	AAAG	2	8	125170	125177	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017741	AAAG	2	8	125666	125673	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017741	GAAG	2	8	125723	125730	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017741	AATC	2	8	126899	126906	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017741	AAAT	2	8	128682	128689	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017741	TAAG	2	8	137325	137332	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017741	ATTT	2	8	155802	155809	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017741	TCAA	2	8	157200	157207	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017741	TTTC	2	8	168468	168475	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017741	TAAC	2	8	168488	168495	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017741	AAAT	2	8	168499	168506	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017741	AATA	2	8	168509	168516	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017741	GAAT	2	8	168560	168567	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017741	TTTA	2	8	171193	171200	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017741	GCGT	2	8	171217	171224	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017741	TTGA	2	8	171331	171338	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017741	GATT	2	8	174665	174672	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017741	CATT	2	8	179885	179892	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017741	TTTG	2	8	179904	179911	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017741	GTGG	2	8	180076	180083	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017741	TCTT	2	8	180308	180315	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017741	CTTG	2	8	181486	181493	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017741	TCGT	2	8	181546	181553	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017741	TGCA	2	8	181784	181791	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017741	GCTT	2	8	190573	190580	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017741	GCGT	2	8	190627	190634	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017741	TAAG	2	8	204633	204640	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017741	TTAG	2	8	207801	207808	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017741	CTTT	2	8	207816	207823	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017741	CTAG	2	8	207850	207857	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017741	CAAA	2	8	208372	208379	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017741	AATA	2	8	208482	208489	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017741	TTTG	2	8	208525	208532	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017741	CTGT	2	8	208698	208705	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017741	TGGC	2	8	209122	209129	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017741	ATTT	2	8	209486	209493	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017741	TAAA	2	8	209494	209501	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017741	AATG	2	8	209952	209959	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017741	TTTG	2	8	210058	210065	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017741	TCTT	2	8	210594	210601	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017741	TTTG	2	8	210776	210783	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017741	GTTT	2	8	213931	213938	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017741	TTTA	2	8	215366	215373	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017741	ATCC	2	8	225381	225388	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017741	TATT	2	8	226893	226900	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017741	CGCT	2	8	232844	232851	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_017741	ATTT	2	8	232853	232860	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017741	ATCA	2	8	235517	235524	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017741	TCTT	2	8	235640	235647	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017741	TCAA	2	8	235676	235683	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017741	AAAT	2	8	241690	241697	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017741	TGCT	2	8	244625	244632	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017741	ATTT	2	8	252856	252863	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017741	AAAG	2	8	260914	260921	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017741	ATTA	2	8	266139	266146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017741	AAAT	2	8	266239	266246	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017741	GACA	2	8	266697	266704	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017741	AGAA	2	8	268312	268319	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017741	AAAT	2	8	268456	268463	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017741	AAAC	2	8	268524	268531	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017741	CAAA	2	8	268756	268763	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017741	ATGA	2	8	268843	268850	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017741	AATC	2	8	268994	269001	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017741	AAAG	2	8	269368	269375	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017741	AATC	2	8	272638	272645	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017741	AATA	2	8	272828	272835	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017741	GCAA	2	8	272931	272938	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017741	GATT	2	8	273040	273047	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017741	CAAG	2	8	273078	273085	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017741	AAAC	2	8	273664	273671	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017741	AGTT	2	8	274462	274469	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017741	CAAA	2	8	275367	275374	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017741	TAAG	2	8	276182	276189	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017741	TATT	2	8	276396	276403	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017741	AAAT	2	8	277551	277558	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017741	GTGC	2	8	277667	277674	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017741	GAAA	2	8	277735	277742	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017741	CTTT	2	8	277750	277757	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017741	TTTC	2	8	278523	278530	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017741	TTTG	2	8	278661	278668	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017741	GTTT	2	8	278867	278874	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017741	CTTT	2	8	279008	279015	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017741	TAGG	2	8	279092	279099	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017741	CTTA	2	8	279343	279350	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017741	CTTT	2	8	279541	279548	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017741	CTTT	2	8	279572	279579	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017741	AAAC	2	8	279891	279898	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017741	ATTG	2	8	280377	280384	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017741	TGTA	2	8	280717	280724	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017741	ACTT	2	8	280879	280886	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017741	AAAT	2	8	281682	281689	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017741	TGAT	2	8	281748	281755	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017741	GAAA	2	8	285160	285167	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017741	TTTA	2	8	288072	288079	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017741	TCAA	2	8	293796	293803	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_017741	TAAA	2	8	306359	306366	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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