MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori Shi112 chromosome

Total Repeats: 16650

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017741	GAT	3	9	122	130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386753520
2	NC_017741	GTT	2	6	305	310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386753520
3	NC_017741	TTC	2	6	356	361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753520
4	NC_017741	ACA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386753520
5	NC_017741	ACC	2	6	393	398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386753520
6	NC_017741	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386753521
7	NC_017741	TAA	2	6	650	655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386753521
8	NC_017741	AAC	2	6	697	702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386753521
9	NC_017741	CTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753521
10	NC_017741	TGA	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386753521
11	NC_017741	CTA	2	6	941	946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386753522
12	NC_017741	AAC	2	6	1024	1029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386753522
13	NC_017741	CCG	4	12	1043	1054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386753522
14	NC_017741	CCA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386753522
15	NC_017741	GCT	2	6	1212	1217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386753522
16	NC_017741	CTA	2	6	1279	1284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386753522
17	NC_017741	GGC	2	6	1403	1408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386753522
18	NC_017741	GTT	2	6	1623	1628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386753522
19	NC_017741	TAG	2	6	1646	1651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386753522
20	NC_017741	CTT	2	6	1657	1662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753522
21	NC_017741	TTC	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753523
22	NC_017741	ATG	2	6	1823	1828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386753523
23	NC_017741	TCA	2	6	1860	1865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386753523
24	NC_017741	GTT	2	6	1897	1902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386753523
25	NC_017741	CTG	2	6	1958	1963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386753523
26	NC_017741	CTT	2	6	1986	1991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753523
27	NC_017741	TGG	2	6	2043	2048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386753523
28	NC_017741	TCA	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386753523
29	NC_017741	AAT	2	6	2104	2109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386753523
30	NC_017741	TAG	2	6	2157	2162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386753523
31	NC_017741	AGG	2	6	2188	2193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386753523
32	NC_017741	AGC	2	6	2777	2782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386753524
33	NC_017741	GTG	2	6	2966	2971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386753524
34	NC_017741	AGA	2	6	3064	3069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386753524
35	NC_017741	GTG	2	6	3125	3130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386753524
36	NC_017741	GCC	2	6	3132	3137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386753524
37	NC_017741	GTT	2	6	3578	3583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386753525
38	NC_017741	ATC	2	6	3662	3667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386753525
39	NC_017741	ATT	2	6	3906	3911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386753525
40	NC_017741	GGC	2	6	3979	3984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386753525
41	NC_017741	GGT	2	6	4085	4090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017741	TAT	2	6	4133	4138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017741	TGG	2	6	4177	4182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017741	TGG	2	6	4297	4302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017741	GTG	2	6	4413	4418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017741	ACC	2	6	4445	4450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_017741	GGT	2	6	4458	4463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017741	AAT	2	6	4620	4625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017741	ATT	2	6	4814	4819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017741	TGT	2	6	4898	4903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017741	ATT	2	6	5304	5309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017741	TGG	2	6	5402	5407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017741	GTT	2	6	5604	5609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017741	TAA	2	6	5673	5678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017741	TTA	2	6	5731	5736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017741	GTG	2	6	5800	5805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017741	GTT	2	6	5820	5825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017741	TCT	2	6	5944	5949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017741	ATG	2	6	6020	6025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017741	AGT	2	6	6029	6034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017741	AGA	2	6	6150	6155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017741	CTT	2	6	6387	6392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017741	TAG	4	12	6414	6425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017741	TGT	2	6	6448	6453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017741	GTT	2	6	6481	6486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017741	TTG	2	6	6514	6519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017741	GTT	2	6	6832	6837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017741	TGT	2	6	7169	7174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017741	TGT	2	6	7256	7261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017741	CAT	2	6	7345	7350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386753526
71	NC_017741	TCT	2	6	7412	7417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753526
72	NC_017741	AAT	2	6	7510	7515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386753526
73	NC_017741	CTT	2	6	7518	7523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753526
74	NC_017741	CAT	2	6	7608	7613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386753526
75	NC_017741	ATG	2	6	7661	7666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386753526
76	NC_017741	TCA	2	6	7685	7690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386753526
77	NC_017741	CCG	2	6	7739	7744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386753526
78	NC_017741	CTT	2	6	7758	7763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753526
79	NC_017741	TCA	2	6	7793	7798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386753526
80	NC_017741	CAT	2	6	7962	7967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386753526
81	NC_017741	TTC	2	6	8074	8079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753526
82	NC_017741	TAA	2	6	8082	8087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386753526
83	NC_017741	CCG	2	6	8093	8098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386753526
84	NC_017741	CAC	2	6	8194	8199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386753526
85	NC_017741	GAT	2	6	8236	8241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386753526
86	NC_017741	TAG	2	6	8275	8280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386753526
87	NC_017741	CTT	2	6	8448	8453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753526
88	NC_017741	TCT	2	6	8558	8563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753526
89	NC_017741	TAA	2	6	8601	8606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386753526
90	NC_017741	GCA	2	6	8732	8737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386753526
91	NC_017741	CTT	2	6	8757	8762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753526
92	NC_017741	TAA	2	6	8993	8998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017741	ACA	2	6	9077	9082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386753527
94	NC_017741	TCT	2	6	9111	9116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753527
95	NC_017741	CTT	2	6	9193	9198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753527
96	NC_017741	GAT	3	9	9281	9289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386753527
97	NC_017741	TCT	2	6	9309	9314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753527
98	NC_017741	CTA	2	6	9325	9330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386753527
99	NC_017741	TAA	2	6	9472	9477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017741	ATT	2	6	9491	9496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017741	CAA	2	6	9559	9564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017741	ACA	2	6	9602	9607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017741	GAA	2	6	9620	9625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017741	TTG	2	6	9740	9745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386753528
105	NC_017741	GAA	2	6	9756	9761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386753528
106	NC_017741	TTA	2	6	9935	9940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386753528
107	NC_017741	AGA	2	6	9950	9955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386753528
108	NC_017741	ACC	2	6	9958	9963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386753528
109	NC_017741	AAG	2	6	9991	9996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386753528
110	NC_017741	ATT	2	6	10024	10029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386753528
111	NC_017741	CAT	2	6	10205	10210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386753528
112	NC_017741	GTG	2	6	10239	10244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386753528
113	NC_017741	ATG	2	6	10519	10524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386753528
114	NC_017741	AGG	2	6	10584	10589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386753528
115	NC_017741	AAC	2	6	10611	10616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386753528
116	NC_017741	AGA	2	6	10997	11002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386753528
117	NC_017741	TTG	2	6	11010	11015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386753528
118	NC_017741	GAC	2	6	11097	11102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386753528
119	NC_017741	TTA	3	9	11118	11126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386753528
120	NC_017741	TTG	2	6	11175	11180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386753528
121	NC_017741	TGT	2	6	11361	11366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386753529
122	NC_017741	TGT	2	6	11529	11534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386753529
123	NC_017741	AAG	2	6	11688	11693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386753529
124	NC_017741	GTT	2	6	11803	11808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386753529
125	NC_017741	TGG	3	9	12099	12107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386753529
126	NC_017741	GAA	3	9	12116	12124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386753529
127	NC_017741	TGG	2	6	12198	12203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386753529
128	NC_017741	AGA	2	6	12220	12225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386753529
129	NC_017741	AGG	2	6	12445	12450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017741	TTA	2	6	12532	12537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386753530
131	NC_017741	GAA	2	6	12549	12554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386753530
132	NC_017741	GTT	2	6	12616	12621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386753530
133	NC_017741	ATT	2	6	12639	12644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386753530
134	NC_017741	GAA	2	6	12845	12850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386753530
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