MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori Shi112 chromosome

Total Repeats: 2495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017741	CT	3	6	703	708	0 %	50 %	0 %	50 %	386753521
2	NC_017741	CA	3	6	1226	1231	50 %	0 %	0 %	50 %	386753522
3	NC_017741	TC	3	6	1285	1290	0 %	50 %	0 %	50 %	386753522
4	NC_017741	CT	3	6	1561	1566	0 %	50 %	0 %	50 %	386753522
5	NC_017741	GC	3	6	2790	2795	0 %	0 %	50 %	50 %	386753524
6	NC_017741	AG	3	6	2947	2952	50 %	0 %	50 %	0 %	386753524
7	NC_017741	TG	3	6	3429	3434	0 %	50 %	50 %	0 %	386753525
8	NC_017741	TC	3	6	4967	4972	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017741	AC	3	6	6280	6285	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017741	GA	7	14	7013	7026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017741	GC	3	6	7655	7660	0 %	0 %	50 %	50 %	386753526
12	NC_017741	CG	3	6	7720	7725	0 %	0 %	50 %	50 %	386753526
13	NC_017741	AG	3	6	7867	7872	50 %	0 %	50 %	0 %	386753526
14	NC_017741	GA	3	6	8384	8389	50 %	0 %	50 %	0 %	386753526
15	NC_017741	AG	3	6	10052	10057	50 %	0 %	50 %	0 %	386753528
16	NC_017741	AG	3	6	10869	10874	50 %	0 %	50 %	0 %	386753528
17	NC_017741	AG	3	6	11447	11452	50 %	0 %	50 %	0 %	386753529
18	NC_017741	AG	3	6	11507	11512	50 %	0 %	50 %	0 %	386753529
19	NC_017741	AG	3	6	12334	12339	50 %	0 %	50 %	0 %	386753529
20	NC_017741	AG	3	6	12344	12349	50 %	0 %	50 %	0 %	386753529
21	NC_017741	GA	3	6	12517	12522	50 %	0 %	50 %	0 %	386753530
22	NC_017741	TG	3	6	13592	13597	0 %	50 %	50 %	0 %	386753531
23	NC_017741	GC	3	6	14235	14240	0 %	0 %	50 %	50 %	386753533
24	NC_017741	CT	3	6	14451	14456	0 %	50 %	0 %	50 %	386753533
25	NC_017741	AG	3	6	14837	14842	50 %	0 %	50 %	0 %	386753533
26	NC_017741	CA	3	6	16410	16415	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017741	GC	3	6	16918	16923	0 %	0 %	50 %	50 %	386753534
28	NC_017741	CG	3	6	17024	17029	0 %	0 %	50 %	50 %	386753534
29	NC_017741	AG	3	6	18301	18306	50 %	0 %	50 %	0 %	386753535
30	NC_017741	CT	3	6	18664	18669	0 %	50 %	0 %	50 %	386753535
31	NC_017741	AG	3	6	19100	19105	50 %	0 %	50 %	0 %	386753536
32	NC_017741	GA	3	6	19291	19296	50 %	0 %	50 %	0 %	386753536
33	NC_017741	GC	3	6	20682	20687	0 %	0 %	50 %	50 %	386753537
34	NC_017741	TC	3	6	23678	23683	0 %	50 %	0 %	50 %	386753540
35	NC_017741	AC	3	6	23769	23774	50 %	0 %	0 %	50 %	386753540
36	NC_017741	GT	3	6	24434	24439	0 %	50 %	50 %	0 %	386753540
37	NC_017741	AG	3	6	25192	25197	50 %	0 %	50 %	0 %	386753541
38	NC_017741	AT	3	6	25784	25789	50 %	50 %	0 %	0 %	386753542
39	NC_017741	AG	3	6	26266	26271	50 %	0 %	50 %	0 %	386753542
40	NC_017741	CA	3	6	26417	26422	50 %	0 %	0 %	50 %	386753542
41	NC_017741	TA	3	6	26816	26821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017741	TG	3	6	27275	27280	0 %	50 %	50 %	0 %	386753543
43	NC_017741	AG	3	6	27515	27520	50 %	0 %	50 %	0 %	386753543
44	NC_017741	AG	3	6	28630	28635	50 %	0 %	50 %	0 %	386753544
45	NC_017741	CT	3	6	29535	29540	0 %	50 %	0 %	50 %	386753546
46	NC_017741	AG	3	6	30539	30544	50 %	0 %	50 %	0 %	386753548
47	NC_017741	AT	3	6	31466	31471	50 %	50 %	0 %	0 %	386753549
48	NC_017741	AG	3	6	32434	32439	50 %	0 %	50 %	0 %	386753549
49	NC_017741	GC	4	8	32775	32782	0 %	0 %	50 %	50 %	386753549
50	NC_017741	AG	3	6	32912	32917	50 %	0 %	50 %	0 %	386753550
51	NC_017741	GC	3	6	33675	33680	0 %	0 %	50 %	50 %	386753552
52	NC_017741	CT	3	6	34771	34776	0 %	50 %	0 %	50 %	386753553
53	NC_017741	TG	3	6	34884	34889	0 %	50 %	50 %	0 %	386753553
54	NC_017741	TG	3	6	34968	34973	0 %	50 %	50 %	0 %	386753553
55	NC_017741	AT	3	6	35325	35330	50 %	50 %	0 %	0 %	386753553
56	NC_017741	AG	3	6	35768	35773	50 %	0 %	50 %	0 %	386753554
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59	NC_017741	AG	3	6	38512	38517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017741	TG	3	6	38695	38700	0 %	50 %	50 %	0 %	386753557
61	NC_017741	AG	3	6	38737	38742	50 %	0 %	50 %	0 %	386753557
62	NC_017741	AG	3	6	38776	38781	50 %	0 %	50 %	0 %	386753557
63	NC_017741	AG	3	6	38832	38837	50 %	0 %	50 %	0 %	386753557
64	NC_017741	CT	3	6	39348	39353	0 %	50 %	0 %	50 %	386753557
65	NC_017741	AG	3	6	39418	39423	50 %	0 %	50 %	0 %	386753557
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67	NC_017741	AG	3	6	41458	41463	50 %	0 %	50 %	0 %	386753559
68	NC_017741	CT	3	6	41519	41524	0 %	50 %	0 %	50 %	386753559
69	NC_017741	AC	3	6	43619	43624	50 %	0 %	0 %	50 %	386753562
70	NC_017741	CT	3	6	43701	43706	0 %	50 %	0 %	50 %	386753562
71	NC_017741	AG	3	6	44908	44913	50 %	0 %	50 %	0 %	386753562
72	NC_017741	CA	3	6	45247	45252	50 %	0 %	0 %	50 %	386753562
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81	NC_017741	CG	3	6	50299	50304	0 %	0 %	50 %	50 %	386753567
82	NC_017741	CT	3	6	52931	52936	0 %	50 %	0 %	50 %	386753567
83	NC_017741	TC	3	6	54166	54171	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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85	NC_017741	AG	3	6	55977	55982	50 %	0 %	50 %	0 %	386753571
86	NC_017741	CT	3	6	56670	56675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017741	AG	4	8	57105	57112	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017741	GC	3	6	57551	57556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017741	AG	3	6	58102	58107	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017741	GT	3	6	58394	58399	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017741	AG	3	6	58854	58859	50 %	0 %	50 %	0 %	386753572
92	NC_017741	GA	3	6	59193	59198	50 %	0 %	50 %	0 %	386753573
93	NC_017741	AG	3	6	59283	59288	50 %	0 %	50 %	0 %	386753573
94	NC_017741	CG	3	6	59445	59450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017741	AG	3	6	59503	59508	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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97	NC_017741	GC	3	6	60655	60660	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017741	GA	3	6	61042	61047	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017741	AG	3	6	61935	61940	50 %	0 %	50 %	0 %	386753576
100	NC_017741	TA	3	6	62149	62154	50 %	50 %	0 %	0 %	386753576
101	NC_017741	AG	3	6	62785	62790	50 %	0 %	50 %	0 %	386753576
102	NC_017741	GT	3	6	62863	62868	0 %	50 %	50 %	0 %	386753577
103	NC_017741	AG	4	8	63270	63277	50 %	0 %	50 %	0 %	386753577
104	NC_017741	GA	3	6	63867	63872	50 %	0 %	50 %	0 %	386753577
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107	NC_017741	TG	3	6	64678	64683	0 %	50 %	50 %	0 %	386753578
108	NC_017741	GC	3	6	64711	64716	0 %	0 %	50 %	50 %	386753578
109	NC_017741	TC	3	6	64869	64874	0 %	50 %	0 %	50 %	386753578
110	NC_017741	AC	3	6	65855	65860	50 %	0 %	0 %	50 %	386753580
111	NC_017741	AG	3	6	66316	66321	50 %	0 %	50 %	0 %	386753580
112	NC_017741	GA	4	8	66895	66902	50 %	0 %	50 %	0 %	386753581
113	NC_017741	AG	3	6	67805	67810	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017741	TG	3	6	68814	68819	0 %	50 %	50 %	0 %	386753583
115	NC_017741	GA	3	6	69137	69142	50 %	0 %	50 %	0 %	386753583
116	NC_017741	TG	4	8	69152	69159	0 %	50 %	50 %	0 %	386753583
117	NC_017741	CG	3	6	71746	71751	0 %	0 %	50 %	50 %	386753586
118	NC_017741	TA	5	10	74134	74143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017741	GT	3	6	74406	74411	0 %	50 %	50 %	0 %	386753589
120	NC_017741	GA	3	6	74853	74858	50 %	0 %	50 %	0 %	386753589
121	NC_017741	GA	3	6	76418	76423	50 %	0 %	50 %	0 %	386753590
122	NC_017741	GA	3	6	77584	77589	50 %	0 %	50 %	0 %	386753592
123	NC_017741	GA	3	6	77947	77952	50 %	0 %	50 %	0 %	386753592
124	NC_017741	GC	3	6	79030	79035	0 %	0 %	50 %	50 %	386753592
125	NC_017741	AG	3	6	79295	79300	50 %	0 %	50 %	0 %	386753592
126	NC_017741	CA	3	6	79522	79527	50 %	0 %	0 %	50 %	386753592
127	NC_017741	AG	3	6	79638	79643	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017741	GA	3	6	79699	79704	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017741	AG	3	6	81183	81188	50 %	0 %	50 %	0 %	386753596
130	NC_017741	TG	3	6	82548	82553	0 %	50 %	50 %	0 %	386753597
131	NC_017741	GA	3	6	83262	83267	50 %	0 %	50 %	0 %	386753597
132	NC_017741	CT	3	6	83519	83524	0 %	50 %	0 %	50 %	386753597
133	NC_017741	CT	3	6	85609	85614	0 %	50 %	0 %	50 %	386753598
134	NC_017741	CT	3	6	85639	85644	0 %	50 %	0 %	50 %	386753598
135	NC_017741	CA	3	6	86043	86048	50 %	0 %	0 %	50 %	386753599
136	NC_017741	CA	3	6	86071	86076	50 %	0 %	0 %	50 %	386753599
137	NC_017741	CA	3	6	86633	86638	50 %	0 %	0 %	50 %	386753600
138	NC_017741	AC	3	6	86733	86738	50 %	0 %	0 %	50 %	386753600
139	NC_017741	CT	3	6	87392	87397	0 %	50 %	0 %	50 %	386753600
140	NC_017741	AG	3	6	87905	87910	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017741	AT	3	6	87950	87955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017741	TG	3	6	89350	89355	0 %	50 %	50 %	0 %	386753602
143	NC_017741	CT	3	6	90882	90887	0 %	50 %	0 %	50 %	386753604
144	NC_017741	TA	3	6	91221	91226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017741	CG	3	6	91893	91898	0 %	0 %	50 %	50 %	386753605
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