MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Shi112 chromosome

Total Repeats: 330

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017741	TC	3	6	4967	4972	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017741	AC	3	6	6280	6285	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017741	GA	7	14	7013	7026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017741	CA	3	6	16410	16415	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017741	TA	3	6	26816	26821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017741	AG	3	6	38512	38517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017741	TC	3	6	54166	54171	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017741	CT	3	6	56670	56675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017741	AG	4	8	57105	57112	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017741	GC	3	6	57551	57556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017741	AG	3	6	58102	58107	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017741	GT	3	6	58394	58399	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017741	CG	3	6	59445	59450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017741	AG	3	6	59503	59508	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017741	AG	4	8	59734	59741	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017741	GC	3	6	60655	60660	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017741	GA	3	6	61042	61047	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017741	AG	3	6	67805	67810	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017741	TA	5	10	74134	74143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017741	AG	3	6	79638	79643	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017741	GA	3	6	79699	79704	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017741	AG	3	6	87905	87910	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017741	AT	3	6	87950	87955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017741	TA	3	6	91221	91226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017741	GT	3	6	93310	93315	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017741	TG	4	8	98190	98197	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017741	CT	3	6	106900	106905	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017741	AG	3	6	127726	127731	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017741	TA	3	6	127765	127770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017741	CT	3	6	128732	128737	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017741	TG	3	6	155865	155870	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017741	TC	3	6	159268	159273	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017741	AC	3	6	168681	168686	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017741	AG	3	6	179791	179796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017741	AG	3	6	179989	179994	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017741	AG	3	6	180041	180046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017741	GC	3	6	180050	180055	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017741	TC	3	6	181062	181067	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017741	TA	3	6	190614	190619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017741	GT	3	6	202898	202903	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017741	CT	3	6	209312	209317	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017741	AG	3	6	209502	209507	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017741	TC	3	6	209925	209930	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017741	CT	3	6	210020	210025	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017741	AT	3	6	210700	210705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017741	AC	3	6	210856	210861	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017741	AG	3	6	211014	211019	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017741	TC	3	6	211045	211050	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017741	GC	3	6	215337	215342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017741	AT	3	6	218204	218209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017741	TG	3	6	230197	230202	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017741	CA	3	6	235564	235569	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017741	AG	3	6	235856	235861	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017741	CT	3	6	235872	235877	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017741	GT	3	6	236044	236049	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017741	TG	3	6	236323	236328	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017741	AC	3	6	244952	244957	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017741	AG	3	6	245160	245165	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017741	AG	3	6	245607	245612	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017741	GT	3	6	264542	264547	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017741	CT	3	6	264670	264675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017741	TG	3	6	266550	266555	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017741	TG	3	6	266604	266609	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017741	CA	3	6	266612	266617	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017741	AG	3	6	267988	267993	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017741	AG	3	6	268498	268503	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017741	CT	3	6	268543	268548	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017741	CT	3	6	268612	268617	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017741	AC	3	6	268659	268664	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017741	AG	3	6	268812	268817	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017741	TA	3	6	269047	269052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017741	AC	3	6	269291	269296	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017741	AG	3	6	272755	272760	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017741	AG	3	6	273639	273644	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017741	AT	3	6	274418	274423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017741	GC	3	6	278252	278257	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017741	CT	3	6	278945	278950	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017741	TG	3	6	279251	279256	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017741	TC	3	6	279390	279395	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017741	GT	3	6	280015	280020	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017741	AG	3	6	280815	280820	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017741	GT	3	6	286470	286475	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017741	AT	3	6	318756	318761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017741	AG	3	6	356008	356013	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017741	AT	3	6	375590	375595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017741	TG	3	6	380089	380094	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017741	AG	3	6	386771	386776	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017741	CT	3	6	395585	395590	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017741	AG	3	6	395616	395621	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017741	AT	3	6	396665	396670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017741	CT	3	6	410583	410588	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017741	AC	3	6	410710	410715	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017741	TC	3	6	413089	413094	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017741	CT	3	6	414114	414119	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017741	CG	3	6	415280	415285	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017741	AT	3	6	429584	429589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017741	AG	3	6	431268	431273	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017741	GA	4	8	440607	440614	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017741	CT	3	6	444451	444456	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017741	AC	3	6	446693	446698	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017741	GA	3	6	459379	459384	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017741	AT	3	6	483097	483102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017741	TA	3	6	495917	495922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017741	GC	3	6	496008	496013	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017741	AT	3	6	510498	510503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017741	AG	3	6	513789	513794	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017741	AT	3	6	515552	515557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017741	CT	4	8	516352	516359	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017741	AG	3	6	528155	528160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017741	AG	3	6	551169	551174	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017741	CA	3	6	557217	557222	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017741	AT	3	6	577284	577289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017741	GA	3	6	590584	590589	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017741	AC	3	6	599912	599917	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017741	GA	3	6	602246	602251	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017741	GA	3	6	604913	604918	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017741	TC	3	6	617104	617109	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017741	AG	3	6	634401	634406	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017741	GC	3	6	634421	634426	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017741	TC	3	6	654670	654675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017741	TC	3	6	661368	661373	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017741	AG	3	6	665072	665077	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017741	GA	3	6	665277	665282	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017741	GA	3	6	665420	665425	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017741	AG	3	6	666522	666527	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017741	AG	3	6	666767	666772	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017741	TG	3	6	676964	676969	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017741	TA	3	6	677169	677174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017741	AG	3	6	683314	683319	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017741	CT	3	6	687369	687374	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017741	AT	13	26	704674	704699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017741	TA	3	6	710897	710902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017741	AT	3	6	724789	724794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017741	CT	3	6	724830	724835	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_017741	CT	3	6	725294	725299	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017741	CT	3	6	725691	725696	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_017741	TG	4	8	725729	725736	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017741	TA	3	6	750475	750480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017741	TA	3	6	750482	750487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017741	TC	4	8	750596	750603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_017741	GA	3	6	792342	792347	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017741	TG	3	6	803795	803800	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017741	AT	3	6	820580	820585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017741	GA	3	6	822337	822342	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017741	TA	3	6	846300	846305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017741	GT	3	6	850276	850281	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017741	TA	3	6	851706	851711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017741	TG	3	6	855768	855773	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017741	AC	4	8	856268	856275	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_017741	TC	3	6	862623	862628	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_017741	TG	4	8	866044	866051	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017741	GT	4	8	866067	866074	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017741	CA	3	6	868033	868038	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_017741	TC	3	6	879322	879327	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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304	NC_017741	TA	3	6	1513212	1513217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
305	NC_017741	AG	3	6	1538794	1538799	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
306	NC_017741	AT	3	6	1545407	1545412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
307	NC_017741	CG	3	6	1576536	1576541	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
308	NC_017741	CT	3	6	1584511	1584516	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
309	NC_017741	GC	3	6	1584842	1584847	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
310	NC_017741	CT	3	6	1584959	1584964	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
311	NC_017741	GC	3	6	1585786	1585791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
312	NC_017741	AC	3	6	1592794	1592799	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
313	NC_017741	AC	3	6	1592824	1592829	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
314	NC_017741	AG	3	6	1595859	1595864	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
315	NC_017741	AG	3	6	1595880	1595885	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
316	NC_017741	TG	3	6	1596530	1596535	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
317	NC_017741	CT	3	6	1596940	1596945	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
318	NC_017741	CT	3	6	1610580	1610585	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
319	NC_017741	CT	3	6	1612162	1612167	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
320	NC_017741	AG	3	6	1631193	1631198	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
321	NC_017741	TC	3	6	1634023	1634028	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
322	NC_017741	AG	3	6	1634260	1634265	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
323	NC_017741	CA	3	6	1634430	1634435	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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325	NC_017741	TA	3	6	1634978	1634983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
326	NC_017741	GA	9	18	1635044	1635061	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
327	NC_017741	CT	3	6	1637783	1637788	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
328	NC_017741	TG	3	6	1644675	1644680	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
329	NC_017741	AC	3	6	1651284	1651289	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
330	NC_017741	AC	3	6	1661994	1661999	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.