MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori Shi169 chromosome

Total Repeats: 1299

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017740	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	386751996
2	NC_017740	GATTA	2	10	2248	2257	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017740	GAAAC	2	10	4645	4654	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017740	TAAAA	2	10	5248	5257	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017740	ATAAA	2	10	5267	5276	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017740	TTTCT	2	10	6219	6228	0 %	80 %	0 %	20 %	386751999
7	NC_017740	TTGAA	2	10	9716	9725	40 %	40 %	20 %	0 %	386752002
8	NC_017740	TTTTG	2	10	9732	9741	0 %	80 %	20 %	0 %	386752002
9	NC_017740	TGGTG	2	10	10570	10579	0 %	40 %	60 %	0 %	386752004
10	NC_017740	GCTTT	2	10	11397	11406	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017740	AGTTT	2	10	13080	13089	20 %	60 %	20 %	0 %	386752007
12	NC_017740	CAAAA	2	10	16447	16456	80 %	0 %	0 %	20 %	386752009
13	NC_017740	CATCA	2	10	17823	17832	40 %	20 %	0 %	40 %	386752010
14	NC_017740	TGAAA	2	10	18791	18800	60 %	20 %	20 %	0 %	386752011
15	NC_017740	CCATG	2	10	20988	20997	20 %	20 %	20 %	40 %	386752014
16	NC_017740	CTCTT	2	10	21018	21027	0 %	60 %	0 %	40 %	386752014
17	NC_017740	CAAGC	2	10	25629	25638	40 %	0 %	20 %	40 %	386752016
18	NC_017740	TTTTA	2	10	26559	26568	20 %	80 %	0 %	0 %	386752017
19	NC_017740	GATAA	2	10	28639	28648	60 %	20 %	20 %	0 %	386752021
20	NC_017740	GTGGG	2	10	30098	30107	0 %	20 %	80 %	0 %	386752022
21	NC_017740	TGGGG	2	10	31349	31358	0 %	20 %	80 %	0 %	386752024
22	NC_017740	AAGCC	2	10	37115	37124	40 %	0 %	20 %	40 %	386752031
23	NC_017740	AGAAA	2	10	38415	38424	80 %	0 %	20 %	0 %	386752032
24	NC_017740	AAAGT	2	10	38612	38621	60 %	20 %	20 %	0 %	386752032
25	NC_017740	TAAAA	2	10	41134	41143	80 %	20 %	0 %	0 %	386752034
26	NC_017740	TCCCA	2	10	42146	42155	20 %	20 %	0 %	60 %	386752035
27	NC_017740	GCTCC	2	10	42467	42476	0 %	20 %	20 %	60 %	386752035
28	NC_017740	TCGCA	2	10	43004	43013	20 %	20 %	20 %	40 %	386752035
29	NC_017740	AGGCT	2	10	44884	44893	20 %	20 %	40 %	20 %	386752037
30	NC_017740	TGCCT	2	10	45259	45268	0 %	40 %	20 %	40 %	386752037
31	NC_017740	GCTTT	2	10	47543	47552	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017740	TAAAA	2	10	48734	48743	80 %	20 %	0 %	0 %	386752039
33	NC_017740	ATTTC	2	10	48809	48818	20 %	60 %	0 %	20 %	386752039
34	NC_017740	TGAAA	2	10	50952	50961	60 %	20 %	20 %	0 %	386752043
35	NC_017740	TCAAA	2	10	51206	51215	60 %	20 %	0 %	20 %	386752043
36	NC_017740	TCGCC	2	10	53949	53958	0 %	20 %	20 %	60 %	386752044
37	NC_017740	TCAAA	2	10	54961	54970	60 %	20 %	0 %	20 %	386752044
38	NC_017740	AGCTT	2	10	55956	55965	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017740	TTAAA	2	10	55982	55991	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017740	ACAAA	2	10	56011	56020	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017740	AAAGA	2	10	56612	56621	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017740	GGTGG	2	10	59172	59181	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017740	GCGTT	2	10	61439	61448	0 %	40 %	40 %	20 %	386752050
44	NC_017740	TCAAT	2	10	62293	62302	40 %	40 %	0 %	20 %	386752051
45	NC_017740	TGCCT	2	10	63209	63218	0 %	40 %	20 %	40 %	386752052
46	NC_017740	TCCAA	2	10	63621	63630	40 %	20 %	0 %	40 %	386752053
47	NC_017740	TTTTA	2	10	66894	66903	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017740	ACGCC	2	10	67231	67240	20 %	0 %	20 %	60 %	386752056
49	NC_017740	AAAGC	2	10	67997	68006	60 %	0 %	20 %	20 %	386752057
50	NC_017740	TTACA	2	10	68779	68788	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_017740	ATCTT	2	10	76038	76047	20 %	60 %	0 %	20 %	386752064
52	NC_017740	TGGCT	2	10	76580	76589	0 %	40 %	40 %	20 %	386752065
53	NC_017740	ATGCC	2	10	77004	77013	20 %	20 %	20 %	40 %	386752066
54	NC_017740	TTGAT	2	10	78043	78052	20 %	60 %	20 %	0 %	386752068
55	NC_017740	GGCGT	2	10	79856	79865	0 %	20 %	60 %	20 %	386752070
56	NC_017740	TAAGA	2	10	83007	83016	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017740	TAAAA	2	10	83078	83087	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017740	CTTTC	2	10	83360	83369	0 %	60 %	0 %	40 %	386752072
59	NC_017740	TTTGA	2	10	86150	86159	20 %	60 %	20 %	0 %	386752075
60	NC_017740	TCTTT	2	10	86361	86370	0 %	80 %	0 %	20 %	386752075
61	NC_017740	TGGCT	2	10	87466	87475	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017740	CGGCA	2	10	90128	90137	20 %	0 %	40 %	40 %	386752078
63	NC_017740	AATTT	2	10	92165	92174	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017740	ACGAT	2	10	92612	92621	40 %	20 %	20 %	20 %	386752080
65	NC_017740	TTTTC	2	10	92807	92816	0 %	80 %	0 %	20 %	386752080
66	NC_017740	AATTG	2	10	94463	94472	40 %	40 %	20 %	0 %	386752081
67	NC_017740	TCGTT	2	10	96263	96272	0 %	60 %	20 %	20 %	386752082
68	NC_017740	CAAAA	2	10	98855	98864	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017740	TCTTT	2	10	99573	99582	0 %	80 %	0 %	20 %	386752085
70	NC_017740	TTTAT	2	10	101338	101347	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017740	AAAGC	2	10	102339	102348	60 %	0 %	20 %	20 %	386752087
72	NC_017740	GAATG	2	10	103560	103569	40 %	20 %	40 %	0 %	386752089
73	NC_017740	TGTCT	2	10	104377	104386	0 %	60 %	20 %	20 %	386752090
74	NC_017740	ACCCT	2	10	106199	106208	20 %	20 %	0 %	60 %	386752091
75	NC_017740	ATGCC	2	10	106331	106340	20 %	20 %	20 %	40 %	386752091
76	NC_017740	TTAAT	2	10	107717	107726	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017740	TGATT	2	10	108337	108346	20 %	60 %	20 %	0 %	386752093
78	NC_017740	GAATT	2	10	108957	108966	40 %	40 %	20 %	0 %	386752095
79	NC_017740	GGATC	2	10	112832	112841	20 %	20 %	40 %	20 %	386752097
80	NC_017740	AGCTC	2	10	112852	112861	20 %	20 %	20 %	40 %	386752097
81	NC_017740	AAGCC	2	10	114740	114749	40 %	0 %	20 %	40 %	386752098
82	NC_017740	GTTTG	2	10	116099	116108	0 %	60 %	40 %	0 %	386752099
83	NC_017740	CAATC	2	10	116753	116762	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_017740	GTTTG	2	10	117342	117351	0 %	60 %	40 %	0 %	386752100
85	NC_017740	TGATC	2	10	117969	117978	20 %	40 %	20 %	20 %	386752100
86	NC_017740	CGCTG	2	10	118909	118918	0 %	20 %	40 %	40 %	386752101
87	NC_017740	TTTGA	2	10	119056	119065	20 %	60 %	20 %	0 %	386752101
88	NC_017740	GACTT	2	10	119590	119599	20 %	40 %	20 %	20 %	386752101
89	NC_017740	ATCTC	2	10	120341	120350	20 %	40 %	0 %	40 %	386752101
90	NC_017740	CGCTT	2	10	120499	120508	0 %	40 %	20 %	40 %	386752101
91	NC_017740	TTTGT	2	10	120859	120868	0 %	80 %	20 %	0 %	386752102
92	NC_017740	TGCGT	2	10	122892	122901	0 %	40 %	40 %	20 %	386752104
93	NC_017740	GAAAA	2	10	123053	123062	80 %	0 %	20 %	0 %	386752104
94	NC_017740	GAAAA	2	10	123371	123380	80 %	0 %	20 %	0 %	386752104
95	NC_017740	ATTTT	2	10	126343	126352	20 %	80 %	0 %	0 %	386752110
96	NC_017740	ATGTT	2	10	126425	126434	20 %	60 %	20 %	0 %	386752110
97	NC_017740	AAAAG	2	10	126837	126846	80 %	0 %	20 %	0 %	386752110
98	NC_017740	TAGGG	2	10	127833	127842	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017740	AAATC	2	10	129099	129108	60 %	20 %	0 %	20 %	386752111
100	NC_017740	AAAAT	2	10	130571	130580	80 %	20 %	0 %	0 %	386752112
101	NC_017740	GAGTT	2	10	130633	130642	20 %	40 %	40 %	0 %	386752112
102	NC_017740	TTTTC	2	10	132921	132930	0 %	80 %	0 %	20 %	386752116
103	NC_017740	GTAAA	2	10	133473	133482	60 %	20 %	20 %	0 %	386752117
104	NC_017740	TTCTT	2	10	134877	134886	0 %	80 %	0 %	20 %	386752118
105	NC_017740	TCTTT	2	10	135371	135380	0 %	80 %	0 %	20 %	386752119
106	NC_017740	TTTTG	2	10	136534	136543	0 %	80 %	20 %	0 %	386752120
107	NC_017740	AATTC	2	10	137168	137177	40 %	40 %	0 %	20 %	386752120
108	NC_017740	GCGAT	2	10	137327	137336	20 %	20 %	40 %	20 %	386752120
109	NC_017740	GCTTG	2	10	137583	137592	0 %	40 %	40 %	20 %	386752120
110	NC_017740	TTTTG	2	10	138235	138244	0 %	80 %	20 %	0 %	386752121
111	NC_017740	CCAAA	2	10	140075	140084	60 %	0 %	0 %	40 %	386752122
112	NC_017740	ATAGT	2	10	142003	142012	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017740	ACGCC	2	10	143599	143608	20 %	0 %	20 %	60 %	386752124
114	NC_017740	TTATT	2	10	145495	145504	20 %	80 %	0 %	0 %	386752128
115	NC_017740	GAAAT	2	10	145652	145661	60 %	20 %	20 %	0 %	386752128
116	NC_017740	GCGTT	2	10	145853	145862	0 %	40 %	40 %	20 %	386752130
117	NC_017740	ATTTG	2	10	146828	146837	20 %	60 %	20 %	0 %	386752131
118	NC_017740	CAAAT	2	10	148724	148733	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_017740	AAAAC	2	10	149448	149457	80 %	0 %	0 %	20 %	386752134
120	NC_017740	AAGCC	2	10	152684	152693	40 %	0 %	20 %	40 %	386752139
121	NC_017740	GGGTG	2	10	155093	155102	0 %	20 %	80 %	0 %	386752141
122	NC_017740	AACAA	2	10	155984	155993	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017740	ATTCA	2	10	156467	156476	40 %	40 %	0 %	20 %	386752143
124	NC_017740	AAAAC	2	10	158804	158813	80 %	0 %	0 %	20 %	386752145
125	NC_017740	ATCTT	2	10	159869	159878	20 %	60 %	0 %	20 %	386752146
126	NC_017740	TATCA	2	10	168234	168243	40 %	40 %	0 %	20 %	386752155
127	NC_017740	AGCAG	2	10	168891	168900	40 %	0 %	40 %	20 %	386752156
128	NC_017740	ATTTG	2	10	169242	169251	20 %	60 %	20 %	0 %	386752156
129	NC_017740	AATTG	2	10	169398	169407	40 %	40 %	20 %	0 %	386752157
130	NC_017740	TTTCT	2	10	170062	170071	0 %	80 %	0 %	20 %	386752158
131	NC_017740	AAATG	2	10	170399	170408	60 %	20 %	20 %	0 %	386752158
132	NC_017740	TGTAA	2	10	171189	171198	40 %	40 %	20 %	0 %	386752159
133	NC_017740	ATAAA	2	10	172685	172694	80 %	20 %	0 %	0 %	386752160
134	NC_017740	GAATA	2	10	172982	172991	60 %	20 %	20 %	0 %	386752160
135	NC_017740	TTTAA	2	10	173048	173057	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017740	AAAAG	2	10	173854	173863	80 %	0 %	20 %	0 %	386752162
137	NC_017740	ACCCC	2	10	173919	173928	20 %	0 %	0 %	80 %	386752162
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