MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori Shi169 chromosome

Total Repeats: 4546

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017740	GAGC	2	8	28	35	25 %	0 %	50 %	25 %	386751994
2	NC_017740	CATT	2	8	114	121	25 %	50 %	0 %	25 %	386751994
3	NC_017740	TCTG	2	8	810	817	0 %	50 %	25 %	25 %	386751995
4	NC_017740	AAAT	2	8	912	919	75 %	25 %	0 %	0 %	386751996
5	NC_017740	CTTG	2	8	1456	1463	0 %	50 %	25 %	25 %	386751996
6	NC_017740	CCTG	2	8	1810	1817	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017740	CCAA	2	8	1834	1841	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017740	TGAA	2	8	1874	1881	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017740	TTAA	2	8	2057	2064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017740	ATTC	2	8	2349	2356	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017740	TCTT	2	8	2558	2565	0 %	75 %	0 %	25 %	386751997
12	NC_017740	GAAA	2	8	3248	3255	75 %	0 %	25 %	0 %	386751998
13	NC_017740	GAAA	2	8	3323	3330	75 %	0 %	25 %	0 %	386751998
14	NC_017740	CAAG	2	8	3824	3831	50 %	0 %	25 %	25 %	386751998
15	NC_017740	ATGC	2	8	4282	4289	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017740	TAAA	2	8	4685	4692	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017740	TGGA	2	8	5336	5343	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017740	TTCA	2	8	5683	5690	25 %	50 %	0 %	25 %	386751999
19	NC_017740	TCTT	2	8	5977	5984	0 %	75 %	0 %	25 %	386751999
20	NC_017740	AAGC	2	8	6792	6799	50 %	0 %	25 %	25 %	386751999
21	NC_017740	ATAA	2	8	7476	7483	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017740	ATTC	2	8	7679	7686	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017740	GATA	2	8	7768	7775	50 %	25 %	25 %	0 %	386752001
24	NC_017740	TCAA	2	8	7875	7882	50 %	25 %	0 %	25 %	386752001
25	NC_017740	ACAA	2	8	8457	8464	75 %	0 %	0 %	25 %	386752001
26	NC_017740	GCTC	2	8	9318	9325	0 %	25 %	25 %	50 %	386752001
27	NC_017740	ATTG	2	8	9670	9677	25 %	50 %	25 %	0 %	386752002
28	NC_017740	GCAA	2	8	9861	9868	50 %	0 %	25 %	25 %	386752002
29	NC_017740	TGCT	2	8	10066	10073	0 %	50 %	25 %	25 %	386752002
30	NC_017740	GGCC	2	8	10329	10336	0 %	0 %	50 %	50 %	386752002
31	NC_017740	TGCA	2	8	10547	10554	25 %	25 %	25 %	25 %	386752003
32	NC_017740	TCTT	2	8	11347	11354	0 %	75 %	0 %	25 %	386752004
33	NC_017740	TTAA	2	8	11495	11502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017740	AGCG	2	8	11818	11825	25 %	0 %	50 %	25 %	386752006
35	NC_017740	GATT	2	8	11926	11933	25 %	50 %	25 %	0 %	386752006
36	NC_017740	CAAA	2	8	12095	12102	75 %	0 %	0 %	25 %	386752007
37	NC_017740	GCAC	2	8	12463	12470	25 %	0 %	25 %	50 %	386752007
38	NC_017740	ATGC	2	8	12510	12517	25 %	25 %	25 %	25 %	386752007
39	NC_017740	TTGG	2	8	12792	12799	0 %	50 %	50 %	0 %	386752007
40	NC_017740	GAGC	2	8	12815	12822	25 %	0 %	50 %	25 %	386752007
41	NC_017740	TTTA	2	8	13097	13104	25 %	75 %	0 %	0 %	386752007
42	NC_017740	TGAT	2	8	14299	14306	25 %	50 %	25 %	0 %	386752007
43	NC_017740	AGTT	2	8	14441	14448	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017740	GCTT	2	8	15294	15301	0 %	50 %	25 %	25 %	386752008
45	NC_017740	CGAT	2	8	15528	15535	25 %	25 %	25 %	25 %	386752008
46	NC_017740	ATCT	2	8	15851	15858	25 %	50 %	0 %	25 %	386752008
47	NC_017740	GTTT	2	8	16069	16076	0 %	75 %	25 %	0 %	386752008
48	NC_017740	TTGA	2	8	16411	16418	25 %	50 %	25 %	0 %	386752009
49	NC_017740	TGCT	2	8	16787	16794	0 %	50 %	25 %	25 %	386752009
50	NC_017740	AGCG	2	8	16959	16966	25 %	0 %	50 %	25 %	386752009
51	NC_017740	GGAA	2	8	17392	17399	50 %	0 %	50 %	0 %	386752010
52	NC_017740	ACAA	2	8	17524	17531	75 %	0 %	0 %	25 %	386752010
53	NC_017740	TAAA	2	8	18465	18472	75 %	25 %	0 %	0 %	386752011
54	NC_017740	GCGA	2	8	18474	18481	25 %	0 %	50 %	25 %	386752011
55	NC_017740	AGGC	2	8	18906	18913	25 %	0 %	50 %	25 %	386752011
56	NC_017740	TGAT	2	8	19064	19071	25 %	50 %	25 %	0 %	386752012
57	NC_017740	CTTT	2	8	19331	19338	0 %	75 %	0 %	25 %	386752012
58	NC_017740	AAGT	2	8	19643	19650	50 %	25 %	25 %	0 %	386752012
59	NC_017740	GCTT	2	8	19776	19783	0 %	50 %	25 %	25 %	386752012
60	NC_017740	TTTA	2	8	20230	20237	25 %	75 %	0 %	0 %	386752012
61	NC_017740	CTTT	2	8	20408	20415	0 %	75 %	0 %	25 %	386752012
62	NC_017740	ATCA	2	8	20547	20554	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017740	CTCC	2	8	20614	20621	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
64	NC_017740	TTAG	2	8	20757	20764	25 %	50 %	25 %	0 %	386752013
65	NC_017740	CTTT	2	8	20772	20779	0 %	75 %	0 %	25 %	386752013
66	NC_017740	GTTT	2	8	21345	21352	0 %	75 %	25 %	0 %	386752014
67	NC_017740	TCCC	2	8	22491	22498	0 %	25 %	0 %	75 %	386752014
68	NC_017740	GATT	2	8	22974	22981	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017740	ATTA	2	8	23070	23077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017740	TTAA	2	8	23426	23433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017740	CATC	2	8	23716	23723	25 %	25 %	0 %	50 %	386752015
72	NC_017740	ATAA	2	8	24182	24189	75 %	25 %	0 %	0 %	386752015
73	NC_017740	GCTC	2	8	25707	25714	0 %	25 %	25 %	50 %	386752016
74	NC_017740	ATGG	2	8	26155	26162	25 %	25 %	50 %	0 %	386752016
75	NC_017740	ATGA	2	8	26418	26425	50 %	25 %	25 %	0 %	386752017
76	NC_017740	TTTA	2	8	26792	26799	25 %	75 %	0 %	0 %	386752017
77	NC_017740	CGTT	2	8	26860	26867	0 %	50 %	25 %	25 %	386752018
78	NC_017740	TGGT	2	8	27310	27317	0 %	50 %	50 %	0 %	386752018
79	NC_017740	AGTC	2	8	27591	27598	25 %	25 %	25 %	25 %	386752019
80	NC_017740	GGTT	2	8	27941	27948	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017740	TTTA	2	8	28075	28082	25 %	75 %	0 %	0 %	386752020
82	NC_017740	CAGA	2	8	28111	28118	50 %	0 %	25 %	25 %	386752020
83	NC_017740	GCGA	2	8	28273	28280	25 %	0 %	50 %	25 %	386752020
84	NC_017740	ACCC	2	8	28390	28397	25 %	0 %	0 %	75 %	386752021
85	NC_017740	CATC	2	8	28516	28523	25 %	25 %	0 %	50 %	386752021
86	NC_017740	TCAA	2	8	28658	28665	50 %	25 %	0 %	25 %	386752022
87	NC_017740	CATG	2	8	29778	29785	25 %	25 %	25 %	25 %	386752022
88	NC_017740	TTGC	2	8	30282	30289	0 %	50 %	25 %	25 %	386752022
89	NC_017740	GCTT	2	8	30793	30800	0 %	50 %	25 %	25 %	386752022
90	NC_017740	GAAA	2	8	30825	30832	75 %	0 %	25 %	0 %	386752022
91	NC_017740	GAAA	2	8	30852	30859	75 %	0 %	25 %	0 %	386752022
92	NC_017740	GATC	2	8	30930	30937	25 %	25 %	25 %	25 %	386752023
93	NC_017740	ATGA	2	8	31133	31140	50 %	25 %	25 %	0 %	386752023
94	NC_017740	CTTT	2	8	32892	32899	0 %	75 %	0 %	25 %	386752026
95	NC_017740	AATA	2	8	33569	33576	75 %	25 %	0 %	0 %	386752026
96	NC_017740	TAAA	2	8	33591	33598	75 %	25 %	0 %	0 %	386752026
97	NC_017740	GAAA	2	8	33721	33728	75 %	0 %	25 %	0 %	386752027
98	NC_017740	GTGA	2	8	33818	33825	25 %	25 %	50 %	0 %	386752028
99	NC_017740	ATGA	2	8	34298	34305	50 %	25 %	25 %	0 %	386752028
100	NC_017740	AAAC	2	8	34306	34313	75 %	0 %	0 %	25 %	386752028
101	NC_017740	TTTG	2	8	34351	34358	0 %	75 %	25 %	0 %	386752028
102	NC_017740	TGAT	2	8	34841	34848	25 %	50 %	25 %	0 %	386752029
103	NC_017740	AACC	2	8	35513	35520	50 %	0 %	0 %	50 %	386752030
104	NC_017740	AAAC	2	8	35727	35734	75 %	0 %	0 %	25 %	386752030
105	NC_017740	CAAA	2	8	35803	35810	75 %	0 %	0 %	25 %	386752030
106	NC_017740	ATTG	2	8	36217	36224	25 %	50 %	25 %	0 %	386752030
107	NC_017740	ATCA	2	8	36392	36399	50 %	25 %	0 %	25 %	386752030
108	NC_017740	TCAA	2	8	36405	36412	50 %	25 %	0 %	25 %	386752030
109	NC_017740	GATT	2	8	36997	37004	25 %	50 %	25 %	0 %	386752031
110	NC_017740	TGTT	2	8	37179	37186	0 %	75 %	25 %	0 %	386752031
111	NC_017740	CTTT	2	8	37772	37779	0 %	75 %	0 %	25 %	386752031
112	NC_017740	GAGC	2	8	37798	37805	25 %	0 %	50 %	25 %	386752031
113	NC_017740	ATAA	2	8	38026	38033	75 %	25 %	0 %	0 %	386752031
114	NC_017740	GAAA	2	8	38046	38053	75 %	0 %	25 %	0 %	386752032
115	NC_017740	GATC	2	8	38175	38182	25 %	25 %	25 %	25 %	386752032
116	NC_017740	ATGA	2	8	39182	39189	50 %	25 %	25 %	0 %	386752032
117	NC_017740	CAAA	2	8	40021	40028	75 %	0 %	0 %	25 %	386752033
118	NC_017740	TGAT	2	8	40592	40599	25 %	50 %	25 %	0 %	386752034
119	NC_017740	AAAC	2	8	40605	40612	75 %	0 %	0 %	25 %	386752034
120	NC_017740	CGCT	2	8	40746	40753	0 %	25 %	25 %	50 %	386752034
121	NC_017740	GTTT	2	8	41368	41375	0 %	75 %	25 %	0 %	386752034
122	NC_017740	CAAA	2	8	41864	41871	75 %	0 %	0 %	25 %	386752035
123	NC_017740	GGGT	2	8	42320	42327	0 %	25 %	75 %	0 %	386752035
124	NC_017740	TCGC	2	8	42679	42686	0 %	25 %	25 %	50 %	386752035
125	NC_017740	AGGG	2	8	42690	42697	25 %	0 %	75 %	0 %	386752035
126	NC_017740	GCAA	2	8	43343	43350	50 %	0 %	25 %	25 %	386752035
127	NC_017740	CAAC	2	8	43475	43482	50 %	0 %	0 %	50 %	386752035
128	NC_017740	TAAA	2	8	43612	43619	75 %	25 %	0 %	0 %	386752035
129	NC_017740	AGCG	2	8	44035	44042	25 %	0 %	50 %	25 %	386752036
130	NC_017740	TTCA	2	8	44655	44662	25 %	50 %	0 %	25 %	386752036
131	NC_017740	CTTT	2	8	45001	45008	0 %	75 %	0 %	25 %	386752037
132	NC_017740	TGGT	2	8	45761	45768	0 %	50 %	50 %	0 %	386752038
133	NC_017740	AAAT	2	8	46447	46454	75 %	25 %	0 %	0 %	386752038
134	NC_017740	TCAA	2	8	46576	46583	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017740	CTTT	2	8	46766	46773	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017740	ATCC	2	8	46874	46881	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_017740	TAAA	2	8	47110	47117	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017740	GTTG	2	8	47136	47143	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017740	TCAA	2	8	48488	48495	50 %	25 %	0 %	25 %	386752039
140	NC_017740	TGTA	2	8	48883	48890	25 %	50 %	25 %	0 %	386752039
141	NC_017740	ATAG	2	8	48892	48899	50 %	25 %	25 %	0 %	386752039
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143	NC_017740	GATT	2	8	49692	49699	25 %	50 %	25 %	0 %	386752040
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