MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Shi169 chromosome

Total Repeats: 563

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017740	CCTG	2	8	1810	1817	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017740	CCAA	2	8	1834	1841	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017740	TGAA	2	8	1874	1881	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017740	TTAA	2	8	2057	2064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017740	ATTC	2	8	2349	2356	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017740	ATGC	2	8	4282	4289	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017740	TAAA	2	8	4685	4692	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017740	TGGA	2	8	5336	5343	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017740	ATAA	2	8	7476	7483	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017740	ATTC	2	8	7679	7686	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017740	TTAA	2	8	11495	11502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017740	AGTT	2	8	14441	14448	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017740	ATCA	2	8	20547	20554	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017740	CTCC	2	8	20614	20621	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
15	NC_017740	GATT	2	8	22974	22981	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017740	ATTA	2	8	23070	23077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017740	TTAA	2	8	23426	23433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017740	GGTT	2	8	27941	27948	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017740	TCAA	2	8	46576	46583	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017740	CTTT	2	8	46766	46773	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017740	ATCC	2	8	46874	46881	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017740	TAAA	2	8	47110	47117	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017740	GTTG	2	8	47136	47143	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017740	TTGA	2	8	50264	50271	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017740	TTTA	2	8	55713	55720	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017740	GCGG	2	8	55751	55758	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017740	TAAT	2	8	55813	55820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017740	GATC	2	8	56724	56731	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017740	TTGC	2	8	58448	58455	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017740	TTTA	2	8	58645	58652	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017740	TCTG	2	8	62808	62815	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017740	CAAA	2	8	63938	63945	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017740	TAGA	2	8	68758	68765	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017740	TCAC	2	8	69163	69170	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017740	TTTA	2	8	70432	70439	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017740	CATG	2	8	70583	70590	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017740	GTTT	2	8	72266	72273	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017740	TTAG	2	8	74461	74468	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017740	TCCT	2	8	74474	74481	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017740	GATA	2	8	76728	76735	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017740	GGTG	2	8	84919	84926	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017740	TCCC	2	8	84989	84996	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
43	NC_017740	AAAG	2	8	87326	87333	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017740	CTAA	2	8	89506	89513	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017740	TTCA	2	8	90495	90502	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017740	TTTA	2	8	90524	90531	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017740	ATTT	2	8	92068	92075	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017740	AATC	2	8	98779	98786	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017740	AGCA	2	8	104212	104219	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017740	CTTT	2	8	106137	106144	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017740	AAAT	2	8	106147	106154	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017740	ATTT	2	8	107679	107686	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017740	TCAT	2	8	112367	112374	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017740	ACTG	2	8	116871	116878	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017740	TTAG	2	8	120803	120810	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017740	AAAG	2	8	123708	123715	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017740	AAAG	2	8	124204	124211	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017740	GAAG	2	8	124261	124268	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017740	AATC	2	8	125427	125434	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017740	ATCT	2	8	125445	125452	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017740	AAAT	2	8	127232	127239	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017740	TAAA	2	8	127906	127913	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017740	CAAA	2	8	132566	132573	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017740	TAAG	2	8	136128	136135	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017740	TCAA	2	8	156004	156011	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017740	CTTG	2	8	156336	156343	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017740	TTTC	2	8	167279	167286	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017740	TAAC	2	8	167299	167306	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017740	AAAT	2	8	167310	167317	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017740	AATA	2	8	167320	167327	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017740	GAAT	2	8	167371	167378	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017740	TTTG	2	8	170016	170023	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017740	GCGT	2	8	170026	170033	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017740	GATT	2	8	173066	173073	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017740	CATT	2	8	178300	178307	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017740	TTTG	2	8	178319	178326	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017740	TCTT	2	8	178679	178686	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017740	CTTG	2	8	179857	179864	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017740	TCGT	2	8	179917	179924	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017740	TTCA	2	8	180141	180148	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017740	TGCA	2	8	180161	180168	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017740	TAAG	2	8	190525	190532	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017740	TTAG	2	8	193677	193684	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017740	CTTT	2	8	193692	193699	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017740	CTAG	2	8	193726	193733	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017740	CTTT	2	8	194228	194235	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017740	AATA	2	8	194353	194360	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017740	CTGG	2	8	194989	194996	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017740	TGGC	2	8	195011	195018	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017740	ATAA	2	8	195030	195037	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017740	TTTG	2	8	195851	195858	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017740	TCTT	2	8	196386	196393	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017740	TTTG	2	8	196568	196575	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017740	TTTG	2	8	196614	196621	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017740	GTTT	2	8	199717	199724	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017740	CCAT	2	8	220676	220683	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017740	TTCT	2	8	221005	221012	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017740	TTTC	2	8	221099	221106	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017740	TCTT	2	8	221429	221436	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017740	TTTC	2	8	221866	221873	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017740	TTGC	2	8	223791	223798	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017740	ATTC	2	8	224242	224249	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017740	TCTT	2	8	224480	224487	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017740	GTTC	2	8	224731	224738	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017740	TTCT	2	8	224744	224751	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017740	TCAA	2	8	225021	225028	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017740	CTTT	2	8	225444	225451	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017740	GCTT	2	8	225766	225773	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017740	TTGA	2	8	225965	225972	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017740	TTGA	2	8	226853	226860	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017740	TGAT	2	8	227049	227056	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017740	CGTT	2	8	227577	227584	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017740	ATTT	2	8	227741	227748	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017740	GCTT	2	8	228222	228229	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017740	ACCC	2	8	228796	228803	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
116	NC_017740	TTAA	2	8	228942	228949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017740	GCTT	2	8	229925	229932	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017740	AATA	2	8	230102	230109	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017740	TTCT	2	8	230245	230252	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017740	TTCA	2	8	230450	230457	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017740	TATC	2	8	230827	230834	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017740	TTCT	2	8	231058	231065	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017740	ATCA	2	8	231251	231258	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017740	CTTT	2	8	231321	231328	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017740	TTGT	2	8	231519	231526	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017740	TAAA	2	8	231553	231560	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017740	CTTT	2	8	231580	231587	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017740	TTAT	2	8	240100	240107	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017740	TTTA	2	8	240380	240387	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017740	AATG	2	8	242335	242342	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017740	TATT	2	8	252083	252090	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017740	CGCT	2	8	258050	258057	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017740	ATTT	2	8	258059	258066	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017740	AAAT	2	8	258343	258350	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017740	TGAT	2	8	258408	258415	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017740	TCAA	2	8	270453	270460	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017740	TAAA	2	8	282989	282996	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017740	TAAT	2	8	285615	285622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017740	AATA	2	8	285657	285664	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017740	GCTT	2	8	297458	297465	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017740	TGAT	2	8	297503	297510	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017740	AACA	2	8	341015	341022	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017740	TTTG	2	8	358747	358754	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017740	TGAG	2	8	358863	358870	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017740	TTGG	2	8	361578	361585	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017740	AAAT	2	8	369903	369910	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017740	CAAG	2	8	373386	373393	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_017740	CAAT	2	8	377705	377712	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_017740	TGAA	2	8	382005	382012	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017740	CTAA	2	8	382013	382020	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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152	NC_017740	TAAA	2	8	392589	392596	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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