MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori Shi417 chromosome

Total Repeats: 1111

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017739	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	386750447
2	NC_017739	GATTA	2	10	2248	2257	40 %	40 %	20 %	0 %	386750448
3	NC_017739	TTTCT	2	10	6220	6229	0 %	80 %	0 %	20 %	386750451
4	NC_017739	TTGAA	2	10	9718	9727	40 %	40 %	20 %	0 %	386750454
5	NC_017739	TTTTG	2	10	9734	9743	0 %	80 %	20 %	0 %	386750454
6	NC_017739	TGGTG	2	10	10572	10581	0 %	40 %	60 %	0 %	386750456
7	NC_017739	TCGAT	2	10	15520	15529	20 %	40 %	20 %	20 %	386750460
8	NC_017739	CAAAA	2	10	16436	16445	80 %	0 %	0 %	20 %	386750461
9	NC_017739	CATCA	2	10	17812	17821	40 %	20 %	0 %	40 %	386750462
10	NC_017739	TGAAA	2	10	18780	18789	60 %	20 %	20 %	0 %	386750463
11	NC_017739	AAAAG	2	10	20796	20805	80 %	0 %	20 %	0 %	386750465
12	NC_017739	CCATG	2	10	20984	20993	20 %	20 %	20 %	40 %	386750466
13	NC_017739	CTCTT	2	10	21014	21023	0 %	60 %	0 %	40 %	386750466
14	NC_017739	CAAGC	2	10	25609	25618	40 %	0 %	20 %	40 %	386750468
15	NC_017739	TTTTA	2	10	26539	26548	20 %	80 %	0 %	0 %	386750469
16	NC_017739	GATAA	2	10	28627	28636	60 %	20 %	20 %	0 %	386750473
17	NC_017739	GTGGG	2	10	30086	30095	0 %	20 %	80 %	0 %	386750474
18	NC_017739	TGGGG	2	10	31337	31346	0 %	20 %	80 %	0 %	386750476
19	NC_017739	AAGCC	2	10	37112	37121	40 %	0 %	20 %	40 %	386750482
20	NC_017739	AGAAA	2	10	38412	38421	80 %	0 %	20 %	0 %	386750483
21	NC_017739	TACTC	2	10	39265	39274	20 %	40 %	0 %	40 %	386750484
22	NC_017739	TAAAA	2	10	41137	41146	80 %	20 %	0 %	0 %	386750485
23	NC_017739	TCCCA	2	10	42149	42158	20 %	20 %	0 %	60 %	386750486
24	NC_017739	GCTCC	2	10	42470	42479	0 %	20 %	20 %	60 %	386750486
25	NC_017739	TCGCA	2	10	43007	43016	20 %	20 %	20 %	40 %	386750486
26	NC_017739	TGCCT	2	10	45262	45271	0 %	40 %	20 %	40 %	386750488
27	NC_017739	GCTTT	2	10	47541	47550	0 %	60 %	20 %	20 %	386750490
28	NC_017739	TGAAA	2	10	48244	48253	60 %	20 %	20 %	0 %	386750492
29	NC_017739	TCAAA	2	10	48498	48507	60 %	20 %	0 %	20 %	386750492
30	NC_017739	TCGCC	2	10	51241	51250	0 %	20 %	20 %	60 %	386750493
31	NC_017739	TAAAA	2	10	51537	51546	80 %	20 %	0 %	0 %	386750493
32	NC_017739	TCAAA	2	10	52253	52262	60 %	20 %	0 %	20 %	386750493
33	NC_017739	GACAG	2	10	62285	62294	40 %	0 %	40 %	20 %	386750502
34	NC_017739	GGTGG	2	10	62488	62497	0 %	20 %	80 %	0 %	386750502
35	NC_017739	TCAAT	2	10	65670	65679	40 %	40 %	0 %	20 %	386750505
36	NC_017739	CTTCT	2	10	66512	66521	0 %	60 %	0 %	40 %	386750506
37	NC_017739	TGCCT	2	10	66589	66598	0 %	40 %	20 %	40 %	386750506
38	NC_017739	TCCAA	2	10	67001	67010	40 %	20 %	0 %	40 %	386750507
39	NC_017739	TTTTG	2	10	70311	70320	0 %	80 %	20 %	0 %	386750510
40	NC_017739	ACGCC	2	10	70617	70626	20 %	0 %	20 %	60 %	386750510
41	NC_017739	AAAGC	2	10	71383	71392	60 %	0 %	20 %	20 %	386750511
42	NC_017739	ATCTT	2	10	79484	79493	20 %	60 %	0 %	20 %	386750516
43	NC_017739	TGGCT	2	10	80025	80034	0 %	40 %	40 %	20 %	386750516
44	NC_017739	ATGCC	2	10	80448	80457	20 %	20 %	20 %	40 %	386750517
45	NC_017739	TTGAT	2	10	81489	81498	20 %	60 %	20 %	0 %	386750519
46	NC_017739	GGCGT	2	10	83303	83312	0 %	20 %	60 %	20 %	386750521
47	NC_017739	ATTTT	2	10	86347	86356	20 %	80 %	0 %	0 %	386750522
48	NC_017739	CTTTC	2	10	86820	86829	0 %	60 %	0 %	40 %	386750523
49	NC_017739	TTTGA	2	10	89610	89619	20 %	60 %	20 %	0 %	386750526
50	NC_017739	TCTTT	2	10	89821	89830	0 %	80 %	0 %	20 %	386750526
51	NC_017739	CGGCA	2	10	93613	93622	20 %	0 %	40 %	40 %	386750529
52	NC_017739	ACGAT	2	10	96092	96101	40 %	20 %	20 %	20 %	386750531
53	NC_017739	TTTTC	2	10	96287	96296	0 %	80 %	0 %	20 %	386750531
54	NC_017739	AATTG	2	10	97943	97952	40 %	40 %	20 %	0 %	386750532
55	NC_017739	TCGTT	2	10	99743	99752	0 %	60 %	20 %	20 %	386750533
56	NC_017739	TCTTT	2	10	103047	103056	0 %	80 %	0 %	20 %	386750536
57	NC_017739	AAAGC	2	10	105814	105823	60 %	0 %	20 %	20 %	386750538
58	NC_017739	GAATG	2	10	107035	107044	40 %	20 %	40 %	0 %	386750540
59	NC_017739	TTTTG	2	10	107847	107856	0 %	80 %	20 %	0 %	386750541
60	NC_017739	CAAAT	2	10	108243	108252	60 %	20 %	0 %	20 %	386750541
61	NC_017739	ACCCT	2	10	109672	109681	20 %	20 %	0 %	60 %	386750542
62	NC_017739	ATGCC	2	10	109804	109813	20 %	20 %	20 %	40 %	386750542
63	NC_017739	TGATT	2	10	111808	111817	20 %	60 %	20 %	0 %	386750544
64	NC_017739	CTAAA	2	10	112278	112287	60 %	20 %	0 %	20 %	386750546
65	NC_017739	GAATT	2	10	112427	112436	40 %	40 %	20 %	0 %	386750546
66	NC_017739	GGATC	2	10	116302	116311	20 %	20 %	40 %	20 %	386750548
67	NC_017739	AGCTC	2	10	116322	116331	20 %	20 %	20 %	40 %	386750548
68	NC_017739	AAGCC	2	10	118210	118219	40 %	0 %	20 %	40 %	386750549
69	NC_017739	GTTTG	2	10	119571	119580	0 %	60 %	40 %	0 %	386750550
70	NC_017739	GTTTG	2	10	121020	121029	0 %	60 %	40 %	0 %	386750551
71	NC_017739	TGATC	2	10	121647	121656	20 %	40 %	20 %	20 %	386750551
72	NC_017739	CGCTG	2	10	122549	122558	0 %	20 %	40 %	40 %	386750552
73	NC_017739	TTTGA	2	10	122696	122705	20 %	60 %	20 %	0 %	386750552
74	NC_017739	GACTT	2	10	123230	123239	20 %	40 %	20 %	20 %	386750552
75	NC_017739	ATCTC	2	10	123981	123990	20 %	40 %	0 %	40 %	386750552
76	NC_017739	CGCTT	2	10	124139	124148	0 %	40 %	20 %	40 %	386750552
77	NC_017739	TTTGT	2	10	124499	124508	0 %	80 %	20 %	0 %	386750553
78	NC_017739	TGCGT	2	10	126532	126541	0 %	40 %	40 %	20 %	386750555
79	NC_017739	GAAAA	2	10	126693	126702	80 %	0 %	20 %	0 %	386750555
80	NC_017739	GAAAA	2	10	127011	127020	80 %	0 %	20 %	0 %	386750555
81	NC_017739	ATTTT	2	10	129961	129970	20 %	80 %	0 %	0 %	386750561
82	NC_017739	ATGTT	2	10	130043	130052	20 %	60 %	20 %	0 %	386750561
83	NC_017739	AAAAG	2	10	130455	130464	80 %	0 %	20 %	0 %	386750561
84	NC_017739	TAGGG	2	10	131450	131459	20 %	20 %	60 %	0 %	386750562
85	NC_017739	AAATC	2	10	132715	132724	60 %	20 %	0 %	20 %	386750563
86	NC_017739	AAAAT	2	10	134187	134196	80 %	20 %	0 %	0 %	386750564
87	NC_017739	TTTTC	2	10	136539	136548	0 %	80 %	0 %	20 %	386750569
88	NC_017739	GTAAA	2	10	137091	137100	60 %	20 %	20 %	0 %	386750570
89	NC_017739	TTCTT	2	10	138495	138504	0 %	80 %	0 %	20 %	386750571
90	NC_017739	TCTTT	2	10	138989	138998	0 %	80 %	0 %	20 %	386750572
91	NC_017739	TTTTG	2	10	140151	140160	0 %	80 %	20 %	0 %	386750573
92	NC_017739	AATTC	2	10	140785	140794	40 %	40 %	0 %	20 %	386750573
93	NC_017739	GCGAT	2	10	140944	140953	20 %	20 %	40 %	20 %	386750573
94	NC_017739	GCTTG	2	10	141200	141209	0 %	40 %	40 %	20 %	386750573
95	NC_017739	TTTTG	2	10	141852	141861	0 %	80 %	20 %	0 %	386750574
96	NC_017739	CCAAA	2	10	143692	143701	60 %	0 %	0 %	40 %	386750575
97	NC_017739	TACGC	2	10	147213	147222	20 %	20 %	20 %	40 %	386750577
98	NC_017739	TTATT	2	10	149110	149119	20 %	80 %	0 %	0 %	386750581
99	NC_017739	GCGTT	2	10	149468	149477	0 %	40 %	40 %	20 %	386750583
100	NC_017739	AAAAC	2	10	153066	153075	80 %	0 %	0 %	20 %	386750587
101	NC_017739	GGGGA	2	10	153166	153175	20 %	0 %	80 %	0 %	386750587
102	NC_017739	AAGCC	2	10	156302	156311	40 %	0 %	20 %	40 %	386750592
103	NC_017739	GGGTG	2	10	158703	158712	0 %	20 %	80 %	0 %	386750594
104	NC_017739	ATTCA	2	10	160088	160097	40 %	40 %	0 %	20 %	386750596
105	NC_017739	AAAAC	2	10	162425	162434	80 %	0 %	0 %	20 %	386750598
106	NC_017739	ATCTT	2	10	163490	163499	20 %	60 %	0 %	20 %	386750599
107	NC_017739	TATCA	2	10	171861	171870	40 %	40 %	0 %	20 %	386750608
108	NC_017739	AGCAG	2	10	172518	172527	40 %	0 %	40 %	20 %	386750609
109	NC_017739	ATTTG	2	10	172869	172878	20 %	60 %	20 %	0 %	386750609
110	NC_017739	AATTG	2	10	173025	173034	40 %	40 %	20 %	0 %	386750610
111	NC_017739	TTTCT	2	10	173689	173698	0 %	80 %	0 %	20 %	386750611
112	NC_017739	AAATG	2	10	174026	174035	60 %	20 %	20 %	0 %	386750611
113	NC_017739	TGTAA	2	10	174816	174825	40 %	40 %	20 %	0 %	386750612
114	NC_017739	ATAAA	2	10	176312	176321	80 %	20 %	0 %	0 %	386750613
115	NC_017739	GAATA	2	10	176609	176618	60 %	20 %	20 %	0 %	386750613
116	NC_017739	AAAAG	2	10	177481	177490	80 %	0 %	20 %	0 %	386750615
117	NC_017739	ACCCC	2	10	177546	177555	20 %	0 %	0 %	80 %	386750615
118	NC_017739	ATTCA	2	10	184966	184975	40 %	40 %	0 %	20 %	386750621
119	NC_017739	GCGAA	2	10	187540	187549	40 %	0 %	40 %	20 %	386750623
120	NC_017739	TCATT	2	10	190578	190587	20 %	60 %	0 %	20 %	386750625
121	NC_017739	CATAA	2	10	191138	191147	60 %	20 %	0 %	20 %	386750626
122	NC_017739	CTATT	2	10	191467	191476	20 %	60 %	0 %	20 %	386750627
123	NC_017739	TTTTC	2	10	192527	192536	0 %	80 %	0 %	20 %	386750628
124	NC_017739	ATTAG	2	10	194505	194514	40 %	40 %	20 %	0 %	386750630
125	NC_017739	TATTT	2	10	196278	196287	20 %	80 %	0 %	0 %	386750633
126	NC_017739	TGGGG	2	10	203658	203667	0 %	20 %	80 %	0 %	386750639
127	NC_017739	GATCA	2	10	205564	205573	40 %	20 %	20 %	20 %	386750640
128	NC_017739	GCAAA	2	10	208697	208706	60 %	0 %	20 %	20 %	386750642
129	NC_017739	CTTTT	2	10	208753	208762	0 %	80 %	0 %	20 %	386750642
130	NC_017739	ATATT	2	10	209196	209205	40 %	60 %	0 %	0 %	386750643
131	NC_017739	TCGGC	2	10	209541	209550	0 %	20 %	40 %	40 %	386750643
132	NC_017739	AATCA	2	10	209588	209597	60 %	20 %	0 %	20 %	386750643
133	NC_017739	ATCTT	2	10	209991	210000	20 %	60 %	0 %	20 %	386750643
134	NC_017739	TAAAA	2	10	210919	210928	80 %	20 %	0 %	0 %	386750644
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