MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori Shi417 chromosome

Total Repeats: 4727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017739	CATT	2	8	114	121	25 %	50 %	0 %	25 %	386750445
2	NC_017739	TCTG	2	8	810	817	0 %	50 %	25 %	25 %	386750446
3	NC_017739	AAAT	2	8	912	919	75 %	25 %	0 %	0 %	386750447
4	NC_017739	GCTT	2	8	1455	1462	0 %	50 %	25 %	25 %	386750447
5	NC_017739	CCTG	2	8	1810	1817	0 %	25 %	25 %	50 %	386750448
6	NC_017739	CCAA	2	8	1834	1841	50 %	0 %	0 %	50 %	386750448
7	NC_017739	TGAA	2	8	1874	1881	50 %	25 %	25 %	0 %	386750448
8	NC_017739	TTAA	2	8	2057	2064	50 %	50 %	0 %	0 %	386750448
9	NC_017739	ATTC	2	8	2349	2356	25 %	50 %	0 %	25 %	386750448
10	NC_017739	TCTT	2	8	2558	2565	0 %	75 %	0 %	25 %	386750449
11	NC_017739	CAAA	2	8	3101	3108	75 %	0 %	0 %	25 %	386750449
12	NC_017739	GAAA	2	8	3248	3255	75 %	0 %	25 %	0 %	386750450
13	NC_017739	GAAA	2	8	3323	3330	75 %	0 %	25 %	0 %	386750450
14	NC_017739	AGTG	2	8	3344	3351	25 %	25 %	50 %	0 %	386750450
15	NC_017739	CAAG	2	8	3824	3831	50 %	0 %	25 %	25 %	386750450
16	NC_017739	ATGC	2	8	4282	4289	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017739	TAAA	2	8	4685	4692	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017739	TTCA	2	8	5684	5691	25 %	50 %	0 %	25 %	386750451
19	NC_017739	TCTT	2	8	5978	5985	0 %	75 %	0 %	25 %	386750451
20	NC_017739	AAGC	2	8	6793	6800	50 %	0 %	25 %	25 %	386750451
21	NC_017739	ATAA	2	8	7478	7485	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017739	ATTC	2	8	7681	7688	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017739	GATA	2	8	7770	7777	50 %	25 %	25 %	0 %	386750453
24	NC_017739	TCAA	2	8	7877	7884	50 %	25 %	0 %	25 %	386750453
25	NC_017739	GCTC	2	8	9320	9327	0 %	25 %	25 %	50 %	386750453
26	NC_017739	AGTG	2	8	9494	9501	25 %	25 %	50 %	0 %	386750454
27	NC_017739	ATTG	2	8	9672	9679	25 %	50 %	25 %	0 %	386750454
28	NC_017739	GCAA	2	8	9863	9870	50 %	0 %	25 %	25 %	386750454
29	NC_017739	TGCT	2	8	10068	10075	0 %	50 %	25 %	25 %	386750454
30	NC_017739	GGCC	2	8	10331	10338	0 %	0 %	50 %	50 %	386750454
31	NC_017739	TGCA	2	8	10549	10556	25 %	25 %	25 %	25 %	386750455
32	NC_017739	TCTT	2	8	11349	11356	0 %	75 %	0 %	25 %	386750456
33	NC_017739	TTAA	2	8	11497	11504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017739	AGCG	2	8	11820	11827	25 %	0 %	50 %	25 %	386750458
35	NC_017739	GATT	2	8	11928	11935	25 %	50 %	25 %	0 %	386750458
36	NC_017739	CAAA	2	8	12097	12104	75 %	0 %	0 %	25 %	386750459
37	NC_017739	GCAC	2	8	12465	12472	25 %	0 %	25 %	50 %	386750459
38	NC_017739	ATGC	2	8	12512	12519	25 %	25 %	25 %	25 %	386750459
39	NC_017739	TTGG	2	8	12794	12801	0 %	50 %	50 %	0 %	386750459
40	NC_017739	GAGC	2	8	12817	12824	25 %	0 %	50 %	25 %	386750459
41	NC_017739	TTTA	2	8	13099	13106	25 %	75 %	0 %	0 %	386750459
42	NC_017739	CAGG	2	8	14257	14264	25 %	0 %	50 %	25 %	386750459
43	NC_017739	TGAT	2	8	14301	14308	25 %	50 %	25 %	0 %	386750459
44	NC_017739	AGTT	2	8	14429	14436	25 %	50 %	25 %	0 %	386750459
45	NC_017739	GCTT	2	8	15283	15290	0 %	50 %	25 %	25 %	386750460
46	NC_017739	ATCT	2	8	15840	15847	25 %	50 %	0 %	25 %	386750460
47	NC_017739	GTTT	2	8	16058	16065	0 %	75 %	25 %	0 %	386750460
48	NC_017739	TGAT	2	8	16401	16408	25 %	50 %	25 %	0 %	386750461
49	NC_017739	TGCT	2	8	16776	16783	0 %	50 %	25 %	25 %	386750461
50	NC_017739	AGCG	2	8	16948	16955	25 %	0 %	50 %	25 %	386750461
51	NC_017739	GGAA	2	8	17381	17388	50 %	0 %	50 %	0 %	386750462
52	NC_017739	ACAA	2	8	17513	17520	75 %	0 %	0 %	25 %	386750462
53	NC_017739	TAAA	2	8	18454	18461	75 %	25 %	0 %	0 %	386750463
54	NC_017739	GCGA	2	8	18463	18470	25 %	0 %	50 %	25 %	386750463
55	NC_017739	AGGC	2	8	18895	18902	25 %	0 %	50 %	25 %	386750463
56	NC_017739	TGAT	2	8	19053	19060	25 %	50 %	25 %	0 %	386750464
57	NC_017739	CTTT	2	8	19320	19327	0 %	75 %	0 %	25 %	386750464
58	NC_017739	AAGT	2	8	19632	19639	50 %	25 %	25 %	0 %	386750464
59	NC_017739	GCTT	2	8	19759	19766	0 %	50 %	25 %	25 %	386750464
60	NC_017739	TTTA	2	8	20213	20220	25 %	75 %	0 %	0 %	386750464
61	NC_017739	CTTT	2	8	20391	20398	0 %	75 %	0 %	25 %	386750464
62	NC_017739	ATCA	2	8	20530	20537	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017739	CTCC	2	8	20593	20600	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
64	NC_017739	CTTT	2	8	20751	20758	0 %	75 %	0 %	25 %	386750465
65	NC_017739	GTTT	2	8	21341	21348	0 %	75 %	25 %	0 %	386750466
66	NC_017739	ACTG	2	8	21638	21645	25 %	25 %	25 %	25 %	386750466
67	NC_017739	TTCC	2	8	22136	22143	0 %	50 %	0 %	50 %	386750466
68	NC_017739	ATTG	2	8	22305	22312	25 %	50 %	25 %	0 %	386750466
69	NC_017739	TCCC	2	8	22481	22488	0 %	25 %	0 %	75 %	386750466
70	NC_017739	GTAT	2	8	22986	22993	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017739	ATTA	2	8	23053	23060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017739	ATAA	2	8	24162	24169	75 %	25 %	0 %	0 %	386750467
73	NC_017739	AAGG	2	8	25553	25560	50 %	0 %	50 %	0 %	386750468
74	NC_017739	GATG	2	8	26134	26141	25 %	25 %	50 %	0 %	386750468
75	NC_017739	ATGA	2	8	26398	26405	50 %	25 %	25 %	0 %	386750469
76	NC_017739	CGTT	2	8	26840	26847	0 %	50 %	25 %	25 %	386750470
77	NC_017739	TGGT	2	8	27290	27297	0 %	50 %	50 %	0 %	386750470
78	NC_017739	AGTC	2	8	27571	27578	25 %	25 %	25 %	25 %	386750471
79	NC_017739	GGTT	2	8	27922	27929	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017739	TTTA	2	8	28056	28063	25 %	75 %	0 %	0 %	386750472
81	NC_017739	TGAT	2	8	28201	28208	25 %	50 %	25 %	0 %	386750472
82	NC_017739	GCGA	2	8	28254	28261	25 %	0 %	50 %	25 %	386750472
83	NC_017739	ACCC	2	8	28378	28385	25 %	0 %	0 %	75 %	386750473
84	NC_017739	CATC	2	8	28504	28511	25 %	25 %	0 %	50 %	386750473
85	NC_017739	CATG	2	8	29766	29773	25 %	25 %	25 %	25 %	386750474
86	NC_017739	TTGC	2	8	30270	30277	0 %	50 %	25 %	25 %	386750474
87	NC_017739	GCTT	2	8	30781	30788	0 %	50 %	25 %	25 %	386750474
88	NC_017739	GAAA	2	8	30840	30847	75 %	0 %	25 %	0 %	386750474
89	NC_017739	GATC	2	8	30918	30925	25 %	25 %	25 %	25 %	386750475
90	NC_017739	ATGA	2	8	31121	31128	50 %	25 %	25 %	0 %	386750475
91	NC_017739	TTGT	2	8	32733	32740	0 %	75 %	25 %	0 %	386750478
92	NC_017739	CTTT	2	8	32880	32887	0 %	75 %	0 %	25 %	386750478
93	NC_017739	AATA	2	8	33557	33564	75 %	25 %	0 %	0 %	386750478
94	NC_017739	TAAA	2	8	33579	33586	75 %	25 %	0 %	0 %	386750478
95	NC_017739	GAAA	2	8	33709	33716	75 %	0 %	25 %	0 %	386750479
96	NC_017739	GTGA	2	8	33806	33813	25 %	25 %	50 %	0 %	386750479
97	NC_017739	ATGA	2	8	34286	34293	50 %	25 %	25 %	0 %	386750479
98	NC_017739	TTTG	2	8	34339	34346	0 %	75 %	25 %	0 %	386750479
99	NC_017739	TGAT	2	8	34829	34836	25 %	50 %	25 %	0 %	386750480
100	NC_017739	TTGT	2	8	35142	35149	0 %	75 %	25 %	0 %	386750480
101	NC_017739	AACC	2	8	35510	35517	50 %	0 %	0 %	50 %	386750481
102	NC_017739	AAAC	2	8	35724	35731	75 %	0 %	0 %	25 %	386750481
103	NC_017739	CAAA	2	8	35800	35807	75 %	0 %	0 %	25 %	386750481
104	NC_017739	ATTG	2	8	36214	36221	25 %	50 %	25 %	0 %	386750481
105	NC_017739	ATCA	2	8	36389	36396	50 %	25 %	0 %	25 %	386750481
106	NC_017739	TCAA	2	8	36402	36409	50 %	25 %	0 %	25 %	386750481
107	NC_017739	TTTC	2	8	36493	36500	0 %	75 %	0 %	25 %	386750481
108	NC_017739	GATT	2	8	36994	37001	25 %	50 %	25 %	0 %	386750482
109	NC_017739	TGTT	2	8	37176	37183	0 %	75 %	25 %	0 %	386750482
110	NC_017739	AAAC	2	8	37644	37651	75 %	0 %	0 %	25 %	386750482
111	NC_017739	CTTT	2	8	37769	37776	0 %	75 %	0 %	25 %	386750482
112	NC_017739	ATAA	2	8	38023	38030	75 %	25 %	0 %	0 %	386750482
113	NC_017739	GAAA	2	8	38043	38050	75 %	0 %	25 %	0 %	386750483
114	NC_017739	GATC	2	8	38172	38179	25 %	25 %	25 %	25 %	386750483
115	NC_017739	TTTG	2	8	38574	38581	0 %	75 %	25 %	0 %	386750483
116	NC_017739	ATGA	2	8	39179	39186	50 %	25 %	25 %	0 %	386750483
117	NC_017739	CAAA	2	8	40018	40025	75 %	0 %	0 %	25 %	386750484
118	NC_017739	TGAT	2	8	40595	40602	25 %	50 %	25 %	0 %	386750485
119	NC_017739	AAAC	2	8	40608	40615	75 %	0 %	0 %	25 %	386750485
120	NC_017739	CGCT	2	8	40749	40756	0 %	25 %	25 %	50 %	386750485
121	NC_017739	GTTT	2	8	41371	41378	0 %	75 %	25 %	0 %	386750485
122	NC_017739	CAAA	2	8	41867	41874	75 %	0 %	0 %	25 %	386750486
123	NC_017739	GGGT	2	8	42323	42330	0 %	25 %	75 %	0 %	386750486
124	NC_017739	TCGC	2	8	42682	42689	0 %	25 %	25 %	50 %	386750486
125	NC_017739	AGGG	2	8	42693	42700	25 %	0 %	75 %	0 %	386750486
126	NC_017739	GCAA	2	8	43346	43353	50 %	0 %	25 %	25 %	386750486
127	NC_017739	CAAC	2	8	43478	43485	50 %	0 %	0 %	50 %	386750486
128	NC_017739	TAAA	2	8	43615	43622	75 %	25 %	0 %	0 %	386750486
129	NC_017739	AGCG	3	12	44038	44049	25 %	0 %	50 %	25 %	386750487
130	NC_017739	TTCA	2	8	44658	44665	25 %	50 %	0 %	25 %	386750487
131	NC_017739	CTTT	2	8	45004	45011	0 %	75 %	0 %	25 %	386750488
132	NC_017739	AGGC	2	8	45700	45707	25 %	0 %	50 %	25 %	386750489
133	NC_017739	TGGT	2	8	45764	45771	0 %	50 %	50 %	0 %	386750489
134	NC_017739	AAAT	2	8	46450	46457	75 %	25 %	0 %	0 %	386750489
135	NC_017739	CTTT	2	8	46764	46771	0 %	75 %	0 %	25 %	386750490
136	NC_017739	ATCC	2	8	46872	46879	25 %	25 %	0 %	50 %	386750490
137	NC_017739	TAAA	2	8	47108	47115	75 %	25 %	0 %	0 %	386750490
138	NC_017739	GTTG	2	8	47134	47141	0 %	50 %	50 %	0 %	386750490
139	NC_017739	TGAG	2	8	47383	47390	25 %	25 %	50 %	0 %	386750490
140	NC_017739	AAAC	2	8	47992	47999	75 %	0 %	0 %	25 %	386750492
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