MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Shi417 chromosome

Total Repeats: 601

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017739	ATGC	2	8	4282	4289	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017739	TAAA	2	8	4685	4692	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017739	ATAA	2	8	7478	7485	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017739	ATTC	2	8	7681	7688	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017739	TTAA	2	8	11497	11504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017739	ATCA	2	8	20530	20537	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017739	CTCC	2	8	20593	20600	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8	NC_017739	GTAT	2	8	22986	22993	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017739	ATTA	2	8	23053	23060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017739	GGTT	2	8	27922	27929	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017739	TTTA	2	8	53005	53012	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017739	GCGG	2	8	53043	53050	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017739	TAAT	2	8	53105	53112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017739	TTGT	2	8	53183	53190	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017739	AGAA	2	8	53961	53968	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017739	CTGA	2	8	54016	54023	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017739	CTAA	2	8	54100	54107	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017739	ACTG	2	8	54162	54169	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017739	ACTG	2	8	54330	54337	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017739	CAAG	2	8	55845	55852	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017739	AAAG	2	8	56143	56150	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017739	TGCT	2	8	56314	56321	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017739	GAGC	3	12	56846	56857	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017739	GAAA	2	8	57117	57124	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017739	AGAT	2	8	57418	57425	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017739	CATT	2	8	57616	57623	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017739	ACTT	2	8	57998	58005	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017739	CAAA	2	8	59008	59015	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017739	TGGG	2	8	59191	59198	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017739	GGAG	2	8	59404	59411	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017739	GATA	2	8	59497	59504	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017739	TACT	2	8	60732	60739	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017739	TCTG	2	8	66188	66195	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017739	CAAA	2	8	67318	67325	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017739	TCAC	2	8	72549	72556	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017739	TTTA	2	8	73819	73826	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017739	CATG	2	8	73964	73971	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017739	ATCA	2	8	74455	74462	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017739	GAGC	2	8	74642	74649	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017739	CTAG	2	8	74712	74719	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017739	ATGG	2	8	75192	75199	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017739	TTTA	2	8	75491	75498	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017739	CCAA	2	8	75499	75506	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017739	AAAG	2	8	75513	75520	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017739	TCTA	2	8	75564	75571	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017739	GGTG	2	8	88379	88386	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017739	TCCC	2	8	88449	88456	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
48	NC_017739	AAAG	2	8	90789	90796	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017739	TGGG	2	8	90855	90862	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017739	TTTC	2	8	91076	91083	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017739	CTAA	2	8	92991	92998	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017739	CATT	2	8	93001	93008	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017739	TTCA	2	8	93980	93987	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017739	TTTA	2	8	94007	94014	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017739	AATA	2	8	102434	102441	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017739	AAGC	2	8	107685	107692	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017739	CCGC	2	8	107708	107715	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
58	NC_017739	CTTT	2	8	109610	109617	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017739	AAAT	2	8	109620	109627	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017739	ATTT	2	8	111152	111159	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017739	TCAT	2	8	115837	115844	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017739	ACTG	2	8	120547	120554	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017739	TTAG	2	8	124443	124450	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017739	AAAG	2	8	127348	127355	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017739	AAAG	2	8	127843	127850	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017739	GAAG	2	8	127900	127907	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017739	AATC	2	8	129066	129073	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017739	ATCT	2	8	129084	129091	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017739	AAAT	2	8	130846	130853	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017739	TAAA	2	8	131522	131529	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017739	TCTT	2	8	135842	135849	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017739	TAAG	2	8	139746	139753	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017739	ATTA	2	8	159265	159272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017739	TCAA	2	8	159625	159632	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017739	CTTG	2	8	159957	159964	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017739	TTTC	2	8	170905	170912	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017739	TAAC	2	8	170925	170932	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017739	AAAT	2	8	170936	170943	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017739	AATA	2	8	170946	170953	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017739	GAAT	2	8	170997	171004	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017739	TTTG	2	8	173643	173650	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017739	GCGT	2	8	173653	173660	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017739	GATT	2	8	176693	176700	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017739	CATT	2	8	181912	181919	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017739	TTTG	2	8	181931	181938	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017739	TCTT	2	8	182334	182341	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017739	CTTG	2	8	183505	183512	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017739	TCGT	2	8	183565	183572	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017739	TTCA	2	8	183789	183796	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017739	TGCA	2	8	183809	183816	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017739	TAAG	2	8	194169	194176	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017739	TTAG	2	8	197320	197327	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017739	CTTT	2	8	197335	197342	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017739	CTAG	2	8	197369	197376	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017739	CTTT	2	8	197871	197878	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017739	TTTG	2	8	198037	198044	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017739	CTGG	2	8	198629	198636	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017739	TGGC	2	8	198651	198658	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017739	ATAA	2	8	198670	198677	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017739	TTTG	2	8	199506	199513	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017739	TCTT	2	8	200041	200048	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017739	TTTG	2	8	200223	200230	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017739	GTTT	2	8	203369	203376	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017739	AATG	2	8	206811	206818	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017739	TATT	2	8	216379	216386	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017739	CGCT	2	8	222337	222344	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017739	ATTT	2	8	222346	222353	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017739	AAAT	2	8	222627	222634	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017739	TGAT	2	8	222692	222699	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017739	TTTA	2	8	229013	229020	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017739	TCAA	2	8	234728	234735	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017739	TAAA	2	8	247265	247272	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017739	TAAT	2	8	249891	249898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017739	AAAG	2	8	249936	249943	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017739	ATTT	2	8	259610	259617	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017739	GCTT	2	8	259692	259699	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017739	TGAT	2	8	259738	259745	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017739	AGAA	2	8	298138	298145	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017739	ATTT	2	8	298293	298300	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017739	TCAA	2	8	298629	298636	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017739	AACA	2	8	303401	303408	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017739	TTTG	2	8	319199	319206	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017739	TGAG	2	8	319315	319322	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017739	TTGG	2	8	324397	324404	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017739	AAAT	2	8	330538	330545	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017739	CAAT	2	8	338341	338348	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017739	TGAA	2	8	342640	342647	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017739	CTAA	2	8	342648	342655	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017739	AGAA	2	8	352062	352069	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017739	TAAA	2	8	353216	353223	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017739	TTAA	2	8	364749	364756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017739	TAAA	2	8	364760	364767	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017739	AAAT	2	8	369284	369291	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017739	AGAA	2	8	372530	372537	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017739	TTGT	2	8	373172	373179	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017739	TTCG	2	8	373197	373204	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017739	ATCT	2	8	373218	373225	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017739	CTTT	2	8	373235	373242	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017739	CAAA	2	8	373373	373380	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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142	NC_017739	GGGT	2	8	386568	386575	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017739	AACA	2	8	386638	386645	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017739	CCAA	2	8	398659	398666	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_017739	AGGT	2	8	403190	403197	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017739	TCAA	2	8	416540	416547	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017739	AAGC	2	8	417944	417951	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_017739	CAAT	2	8	418768	418775	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_017739	GCTT	2	8	418964	418971	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_017739	CACC	2	8	431781	431788	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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